MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Isosphaera pallida ATCC 43644 chromosome

Total Repeats: 19715

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014962	A	6	6	875833	875838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_014962	GGAC	2	8	875867	875874	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3003	NC_014962	TCTG	2	8	877583	877590	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3004	NC_014962	AATTG	2	10	877618	877627	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_014962	GTTGA	2	10	877665	877674	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_014962	CAC	2	6	877687	877692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3007	NC_014962	GT	3	6	877727	877732	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_014962	CCTC	2	8	877782	877789	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3009	NC_014962	CCCGA	2	10	877823	877832	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
3010	NC_014962	CGC	2	6	884066	884071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3011	NC_014962	CGAAG	2	10	884077	884086	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3012	NC_014962	ACG	2	6	884836	884841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_014962	GC	3	6	885672	885677	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3014	NC_014962	CAC	2	6	885771	885776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3015	NC_014962	CGT	2	6	885794	885799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3016	NC_014962	GTA	2	6	885829	885834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3017	NC_014962	CG	3	6	885841	885846	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3018	NC_014962	GTC	2	6	886857	886862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_014962	CAC	2	6	886889	886894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3020	NC_014962	GCTGG	2	10	886938	886947	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3021	NC_014962	CGCC	2	8	886993	887000	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3022	NC_014962	CCCG	2	8	889048	889055	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3023	NC_014962	CACCCC	2	12	889074	889085	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
3024	NC_014962	TTC	2	6	890298	890303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_014962	TGGTC	2	10	890349	890358	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3026	NC_014962	GGA	2	6	893348	893353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_014962	CTC	2	6	894060	894065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3028	NC_014962	CGAC	2	8	894100	894107	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3029	NC_014962	GAT	2	6	894156	894161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_014962	CGA	2	6	894181	894186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3031	NC_014962	TTC	2	6	894215	894220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_014962	ATG	3	9	894249	894257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3033	NC_014962	GATG	2	8	894286	894293	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_014962	GAC	2	6	896081	896086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_014962	CAAGAT	2	12	896096	896107	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3036	NC_014962	ATC	2	6	896149	896154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3037	NC_014962	AAGAC	2	10	897325	897334	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3038	NC_014962	CAG	2	6	897373	897378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_014962	CG	3	6	897401	897406	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3040	NC_014962	AAC	2	6	897479	897484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_014962	AAC	2	6	900776	900781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_014962	TCAA	2	8	900782	900789	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3043	NC_014962	GGC	2	6	900808	900813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3044	NC_014962	TCGA	2	8	900850	900857	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3045	NC_014962	TGGT	2	8	900861	900868	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_014962	AGT	2	6	900903	900908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3049	NC_014962	TCG	2	6	902496	902501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3050	NC_014962	CT	3	6	902624	902629	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3051	NC_014962	TCG	2	6	902645	902650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_014962	CCG	2	6	902670	902675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3053	NC_014962	CTC	2	6	903235	903240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3054	NC_014962	GTC	2	6	903252	903257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_014962	CGC	2	6	903290	903295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3056	NC_014962	GGGTC	2	10	903306	903315	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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3059	NC_014962	TGAT	2	8	904123	904130	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_014962	TCG	2	6	904644	904649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_014962	GAG	2	6	904660	904665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_014962	GAA	2	6	905235	905240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_014962	ATCAT	2	10	905277	905286	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3064	NC_014962	GGAAA	2	10	906033	906042	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_014962	CG	3	6	906432	906437	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3066	NC_014962	CGG	2	6	906469	906474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3067	NC_014962	CGT	2	6	906497	906502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3069	NC_014962	GGGAT	2	10	906552	906561	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_014962	CG	3	6	907598	907603	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3071	NC_014962	ATCAA	2	10	907604	907613	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3072	NC_014962	CAAT	2	8	907616	907623	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3073	NC_014962	GAGAC	2	10	907629	907638	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3074	NC_014962	CGA	2	6	907682	907687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3075	NC_014962	GAC	2	6	907717	907722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3076	NC_014962	ACG	2	6	907773	907778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3080	NC_014962	GGCTT	6	30	907938	907967	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3081	NC_014962	GAGG	2	8	907988	907995	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_014962	TGGTT	2	10	907996	908005	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_014962	GAA	2	6	909276	909281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3084	NC_014962	CCATC	2	10	909317	909326	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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3089	NC_014962	CGACG	2	10	909497	909506	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3090	NC_014962	CG	3	6	910484	910489	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3091	NC_014962	CGAGT	2	10	910510	910519	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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3095	NC_014962	ACG	2	6	910571	910576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3102	NC_014962	TCG	3	9	912265	912273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3105	NC_014962	CG	3	6	913562	913567	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3106	NC_014962	GTT	2	6	913587	913592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3109	NC_014962	CGC	2	6	916182	916187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3110	NC_014962	GCT	2	6	916229	916234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3113	NC_014962	TTG	2	6	916337	916342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_014962	TGA	2	6	916371	916376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_014962	GAT	2	6	916396	916401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_014962	GTC	2	6	916438	916443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_014962	ACC	2	6	916504	916509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3118	NC_014962	GTGGCG	2	12	916525	916536	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
3119	NC_014962	CCGC	2	8	916604	916611	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3120	NC_014962	ACA	2	6	916618	916623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_014962	GTCT	2	8	918175	918182	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3122	NC_014962	GGT	2	6	918203	918208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3124	NC_014962	TTGG	2	8	920420	920427	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_014962	GCG	2	6	920436	920441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3127	NC_014962	GGC	2	6	920902	920907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3128	NC_014962	GGT	2	6	920934	920939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_014962	C	6	6	921002	921007	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3130	NC_014962	CCGA	2	8	921010	921017	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3131	NC_014962	TCGG	2	8	921041	921048	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3132	NC_014962	TC	3	6	921064	921069	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3133	NC_014962	AGG	3	9	921156	921164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3134	NC_014962	GGT	2	6	922295	922300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3135	NC_014962	G	7	7	922326	922332	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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3262	NC_014962	GGTC	2	8	956203	956210	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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3408	NC_014962	CGGG	2	8	1000863	1000870	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3409	NC_014962	CGC	2	6	1001613	1001618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3444	NC_014962	GGGCT	2	10	1014216	1014225	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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