MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Isosphaera pallida ATCC 43644 chromosome

Total Repeats: 19715

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_014962	CGGT	2	8	397754	397761	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1502	NC_014962	AAC	2	6	397792	397797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_014962	TCAAG	2	10	397801	397810	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1504	NC_014962	ACG	2	6	397813	397818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_014962	TGG	2	6	399399	399404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_014962	CAA	2	6	399414	399419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_014962	CCCG	2	8	399469	399476	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1508	NC_014962	CCT	2	6	399477	399482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1509	NC_014962	CCGCT	2	10	399494	399503	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1510	NC_014962	CT	3	6	402054	402059	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1511	NC_014962	CCA	2	6	402060	402065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1512	NC_014962	AGA	2	6	402581	402586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_014962	AGG	2	6	404194	404199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_014962	GGC	2	6	404226	404231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_014962	G	6	6	404552	404557	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_014962	GA	3	6	404562	404567	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_014962	GGA	2	6	404568	404573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_014962	GAG	2	6	404581	404586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_014962	GCG	2	6	404593	404598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_014962	TAAC	2	8	404599	404606	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1521	NC_014962	GC	3	6	404622	404627	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1522	NC_014962	CCG	2	6	404634	404639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1523	NC_014962	CG	3	6	404669	404674	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1524	NC_014962	TC	3	6	405694	405699	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1525	NC_014962	TCT	2	6	405705	405710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_014962	CG	3	6	405719	405724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1527	NC_014962	CGTC	2	8	405742	405749	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1528	NC_014962	GCCG	2	8	405750	405757	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1529	NC_014962	AAACC	2	10	405812	405821	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
1530	NC_014962	TCG	2	6	405839	405844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_014962	GCC	2	6	405858	405863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1532	NC_014962	ACG	2	6	405864	405869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_014962	CGA	2	6	405870	405875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_014962	GGACC	2	10	405878	405887	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1535	NC_014962	TCG	2	6	405925	405930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_014962	TCCC	2	8	406609	406616	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1537	NC_014962	GC	3	6	406807	406812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1538	NC_014962	CGA	2	6	406839	406844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_014962	ACGG	2	8	406860	406867	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1540	NC_014962	GAC	2	6	406874	406879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_014962	ATG	2	6	406939	406944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_014962	ACA	2	6	406975	406980	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_014962	GAC	2	6	407601	407606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_014962	CCT	2	6	407613	407618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1545	NC_014962	CGATC	2	10	407700	407709	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1546	NC_014962	TCCT	2	8	409168	409175	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1547	NC_014962	CGGG	2	8	409234	409241	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1548	NC_014962	CCG	2	6	409276	409281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1549	NC_014962	TCCC	2	8	409294	409301	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1550	NC_014962	CG	3	6	409310	409315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1551	NC_014962	GGGC	2	8	409333	409340	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1552	NC_014962	TCC	2	6	409391	409396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1553	NC_014962	TGG	2	6	410771	410776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_014962	CGG	2	6	410867	410872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_014962	GCTT	2	8	410902	410909	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1556	NC_014962	CAG	2	6	411001	411006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1557	NC_014962	CGC	2	6	411011	411016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1558	NC_014962	AATC	2	8	411030	411037	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1559	NC_014962	GAA	2	6	413803	413808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_014962	CAAA	2	8	413823	413830	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1561	NC_014962	GGGGT	2	10	413880	413889	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_014962	CAGG	2	8	413935	413942	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1563	NC_014962	TCC	2	6	414025	414030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1564	NC_014962	TCG	2	6	414032	414037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_014962	CGG	2	6	414043	414048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_014962	TGGT	2	8	414113	414120	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_014962	TCG	2	6	414202	414207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_014962	TCA	2	6	416847	416852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_014962	CGGG	2	8	416857	416864	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1570	NC_014962	AGGAG	2	10	416865	416874	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_014962	GGCG	2	8	416877	416884	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1572	NC_014962	G	6	6	416884	416889	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_014962	CGGG	2	8	416989	416996	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1574	NC_014962	GCG	2	6	417017	417022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_014962	GAG	2	6	417043	417048	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_014962	TCG	2	6	417093	417098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_014962	ACCG	2	8	417131	417138	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1578	NC_014962	ATCCC	2	10	417144	417153	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1579	NC_014962	TCG	2	6	417193	417198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_014962	CG	3	6	417222	417227	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1581	NC_014962	GTC	3	9	417228	417236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_014962	ACG	2	6	417282	417287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_014962	CG	3	6	417299	417304	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1584	NC_014962	CCA	2	6	417485	417490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1585	NC_014962	GC	3	6	417501	417506	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1586	NC_014962	CGA	2	6	417517	417522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_014962	GAT	2	6	417529	417534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_014962	TCG	2	6	417564	417569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_014962	GCC	2	6	417631	417636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1590	NC_014962	GAT	2	6	417666	417671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_014962	GC	3	6	417705	417710	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1592	NC_014962	CGA	2	6	417729	417734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_014962	CGAG	2	8	417740	417747	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1594	NC_014962	GCC	2	6	417827	417832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1595	NC_014962	ATTG	2	8	417968	417975	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_014962	TCGC	2	8	417994	418001	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1597	NC_014962	GGACG	2	10	418026	418035	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1598	NC_014962	AGGG	2	8	418075	418082	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_014962	AGG	2	6	420146	420151	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_014962	C	6	6	420166	420171	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1601	NC_014962	C	7	7	425953	425959	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1602	NC_014962	GGT	2	6	426001	426006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_014962	TGG	2	6	426030	426035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_014962	GCG	2	6	426056	426061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_014962	CCT	2	6	426203	426208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1606	NC_014962	CAA	2	6	426238	426243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_014962	GCC	2	6	426258	426263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1608	NC_014962	CCTC	2	8	426303	426310	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1609	NC_014962	TTC	2	6	426314	426319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1610	NC_014962	ATTG	2	8	426358	426365	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_014962	ATC	2	6	426373	426378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_014962	AAACC	2	10	426398	426407	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
1613	NC_014962	CCAA	2	8	426450	426457	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1614	NC_014962	GT	3	6	426462	426467	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_014962	AACC	2	8	426471	426478	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1616	NC_014962	TTG	2	6	426498	426503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_014962	ATGA	2	8	426521	426528	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_014962	CCAA	2	8	426637	426644	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1619	NC_014962	CCAA	2	8	426661	426668	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1620	NC_014962	GTT	2	6	426728	426733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_014962	CAA	2	6	426763	426768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_014962	G	6	6	426795	426800	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_014962	CTG	2	6	426817	426822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_014962	ACGA	2	8	427691	427698	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1625	NC_014962	ACA	2	6	427836	427841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_014962	TGG	2	6	427869	427874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_014962	G	6	6	428320	428325	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_014962	TCA	2	6	428399	428404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NC_014962	AGGC	2	8	428409	428416	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1630	NC_014962	CCT	2	6	429635	429640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1631	NC_014962	CG	3	6	429695	429700	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1632	NC_014962	ACC	2	6	429719	429724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1633	NC_014962	GGAT	2	8	429818	429825	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_014962	CCG	2	6	429893	429898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1635	NC_014962	TGGG	2	8	429941	429948	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_014962	CGGA	2	8	429978	429985	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1637	NC_014962	GTTC	2	8	430665	430672	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1638	NC_014962	CA	3	6	432719	432724	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1772	NC_014962	GTGGG	2	10	484773	484782	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
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1775	NC_014962	CAT	2	6	484811	484816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1895	NC_014962	TCCGT	2	10	534244	534253	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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1898	NC_014962	TGGT	2	8	534464	534471	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1899	NC_014962	TACAA	2	10	534519	534528	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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1903	NC_014962	GAAAC	2	10	540022	540031	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1904	NC_014962	CCG	2	6	540105	540110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1905	NC_014962	ATC	2	6	540113	540118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1906	NC_014962	GCGA	2	8	540126	540133	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1909	NC_014962	AGC	2	6	541564	541569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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