MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Isosphaera pallida ATCC 43644 chromosome

Total Repeats: 19715

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014962	GTC	3	9	269603	269611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_014962	CCT	2	6	269701	269706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1003	NC_014962	GCA	2	6	269717	269722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_014962	CCGG	2	8	269738	269745	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1005	NC_014962	ACC	3	9	269771	269779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1006	NC_014962	GTC	2	6	269837	269842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_014962	CG	4	8	269949	269956	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1008	NC_014962	GTCG	3	12	269962	269973	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1009	NC_014962	GGCTG	2	10	269979	269988	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1010	NC_014962	GGT	2	6	269989	269994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_014962	GGT	2	6	269996	270001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_014962	AAC	2	6	270006	270011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_014962	T	6	6	270070	270075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_014962	GGT	2	6	270089	270094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_014962	AAG	2	6	272294	272299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_014962	GCGAC	2	10	272323	272332	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1017	NC_014962	ATC	2	6	272361	272366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_014962	TCG	2	6	273096	273101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_014962	TTC	2	6	273107	273112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_014962	TGAGA	2	10	275281	275290	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_014962	CGGGGT	2	12	275302	275313	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
1022	NC_014962	GT	3	6	275403	275408	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_014962	GTCGA	2	10	278729	278738	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1024	NC_014962	CGG	2	6	279832	279837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_014962	GAC	2	6	279872	279877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_014962	CGA	2	6	279938	279943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_014962	GACC	2	8	279953	279960	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1028	NC_014962	AAT	2	6	279966	279971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_014962	T	6	6	280125	280130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_014962	AAG	2	6	280170	280175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_014962	TCG	2	6	280246	280251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_014962	TGAA	2	8	280257	280264	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_014962	AGG	2	6	280270	280275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_014962	CCG	2	6	280959	280964	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1035	NC_014962	TGGTC	2	10	280971	280980	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1036	NC_014962	GGGA	2	8	281180	281187	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_014962	TGAGT	2	10	281231	281240	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_014962	ACCG	2	8	281264	281271	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1039	NC_014962	CGA	2	6	281307	281312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_014962	TGGG	2	8	283210	283217	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_014962	CGGATT	2	12	283252	283263	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1042	NC_014962	CG	3	6	283267	283272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1043	NC_014962	TCGG	2	8	283291	283298	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1044	NC_014962	TCG	2	6	283335	283340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_014962	CCG	2	6	283378	283383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_014962	GGCGT	2	10	283389	283398	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1047	NC_014962	CGA	2	6	283450	283455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_014962	GGA	2	6	283460	283465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_014962	TGG	2	6	286367	286372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_014962	GCC	2	6	286408	286413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1051	NC_014962	GGT	2	6	286420	286425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_014962	CGTTC	2	10	286444	286453	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1053	NC_014962	ATC	2	6	286516	286521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_014962	TCG	2	6	286701	286706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_014962	CGT	2	6	287916	287921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_014962	TTGGC	2	10	287922	287931	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1057	NC_014962	TCGAA	2	10	287937	287946	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1058	NC_014962	GGAT	2	8	287961	287968	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_014962	GTTC	2	8	288017	288024	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1060	NC_014962	GTC	2	6	288026	288031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_014962	TCC	2	6	289771	289776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1062	NC_014962	CCT	2	6	289801	289806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1063	NC_014962	CCAAG	2	10	289873	289882	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1064	NC_014962	CTC	2	6	290957	290962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1065	NC_014962	CTT	2	6	290976	290981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_014962	GGA	2	6	291010	291015	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_014962	TCCG	2	8	292229	292236	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1068	NC_014962	GAG	3	9	292273	292281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_014962	AG	3	6	292280	292285	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_014962	CG	3	6	292321	292326	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1071	NC_014962	GTTC	2	8	292372	292379	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1072	NC_014962	CG	3	6	292483	292488	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1073	NC_014962	ACGGA	2	10	292509	292518	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1074	NC_014962	CCTAA	2	10	294794	294803	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1075	NC_014962	CTCAT	2	10	294887	294896	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1076	NC_014962	C	7	7	294907	294913	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1077	NC_014962	CTC	2	6	294957	294962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1078	NC_014962	TGA	2	6	294983	294988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_014962	CAT	2	6	294991	294996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_014962	AAG	2	6	295003	295008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_014962	GAG	2	6	295046	295051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_014962	AGC	2	6	295065	295070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_014962	TGAT	2	8	295097	295104	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_014962	CGT	2	6	295107	295112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1085	NC_014962	CGG	2	6	295113	295118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_014962	ACC	2	6	295177	295182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1087	NC_014962	GGGTTG	2	12	295199	295210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_014962	GTG	2	6	295214	295219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_014962	CCG	2	6	295670	295675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1090	NC_014962	AAC	2	6	295711	295716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_014962	GCCC	2	8	295725	295732	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1092	NC_014962	AGG	2	6	295748	295753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_014962	CCACG	2	10	295792	295801	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1094	NC_014962	AAC	2	6	295823	295828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_014962	AG	4	8	295864	295871	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_014962	CG	3	6	295922	295927	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1097	NC_014962	ACC	2	6	295971	295976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1098	NC_014962	CCGCG	2	10	295981	295990	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1099	NC_014962	TG	3	6	296029	296034	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_014962	TGG	2	6	296091	296096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_014962	G	8	8	296120	296127	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_014962	CCT	2	6	297187	297192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1103	NC_014962	GAATC	2	10	297213	297222	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1104	NC_014962	GAGC	2	8	297263	297270	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1105	NC_014962	GCTC	2	8	297328	297335	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1106	NC_014962	CG	3	6	297339	297344	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1107	NC_014962	AACAA	2	10	299152	299161	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1108	NC_014962	CAA	2	6	299179	299184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_014962	G	6	6	299191	299196	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_014962	CCAGA	2	10	299212	299221	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1111	NC_014962	GGC	2	6	299235	299240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_014962	CGA	2	6	299255	299260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_014962	GTG	2	6	299267	299272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_014962	GGT	2	6	299312	299317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_014962	CGTCG	2	10	299363	299372	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1116	NC_014962	GC	3	6	299416	299421	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1117	NC_014962	GACC	2	8	299434	299441	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1118	NC_014962	TGG	2	6	299442	299447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_014962	GCC	2	6	299448	299453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1120	NC_014962	CG	4	8	301729	301736	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1121	NC_014962	CG	3	6	301740	301745	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1122	NC_014962	GTC	2	6	301815	301820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_014962	TGG	2	6	301839	301844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_014962	GGGA	2	8	302349	302356	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_014962	C	7	7	302382	302388	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1126	NC_014962	CACC	2	8	302411	302418	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1127	NC_014962	ATT	2	6	302604	302609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_014962	ATG	2	6	302625	302630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_014962	ACC	2	6	302633	302638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1130	NC_014962	GAG	2	6	302708	302713	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_014962	TCGG	2	8	304217	304224	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1132	NC_014962	TTGA	2	8	304248	304255	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_014962	TC	3	6	304272	304277	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1134	NC_014962	T	6	6	304592	304597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_014962	G	6	6	305689	305694	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_014962	CGG	2	6	305719	305724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1137	NC_014962	TGG	2	6	305799	305804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_014962	CGGGA	2	10	305827	305836	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1139	NC_014962	GAG	2	6	305838	305843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1147	NC_014962	CGC	2	6	309184	309189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1149	NC_014962	G	9	9	309227	309235	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1150	NC_014962	AACG	2	8	309236	309243	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1152	NC_014962	AGGCG	2	10	309324	309333	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1153	NC_014962	GAC	2	6	309389	309394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1247	NC_014962	TCCT	2	8	331304	331311	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1250	NC_014962	TGG	2	6	333547	333552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1253	NC_014962	CGGTT	2	10	333611	333620	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1254	NC_014962	CG	3	6	333634	333639	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1255	NC_014962	CG	3	6	333646	333651	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1256	NC_014962	GCC	2	6	333659	333664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1259	NC_014962	GGA	2	6	333730	333735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1261	NC_014962	ACC	2	6	335021	335026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1262	NC_014962	CGA	2	6	335050	335055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1265	NC_014962	CTTCAT	2	12	337916	337927	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1267	NC_014962	A	6	6	337981	337986	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1268	NC_014962	AAG	2	6	337991	337996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1269	NC_014962	CGG	2	6	339957	339962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1270	NC_014962	ACCG	2	8	340084	340091	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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1272	NC_014962	GGTTGG	2	12	340117	340128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1274	NC_014962	GAG	2	6	340174	340179	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1276	NC_014962	GGC	2	6	340289	340294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1277	NC_014962	CTC	2	6	341772	341777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1278	NC_014962	TTG	2	6	341867	341872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1279	NC_014962	CCT	2	6	341971	341976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1282	NC_014962	CGA	2	6	342079	342084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1383	NC_014962	TGG	2	6	367672	367677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1399	NC_014962	GAG	2	6	371203	371208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1400	NC_014962	AAC	2	6	371223	371228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1401	NC_014962	GTCG	2	8	371964	371971	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1402	NC_014962	CG	3	6	371973	371978	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1403	NC_014962	ACGTG	2	10	372042	372051	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1404	NC_014962	ATGG	2	8	372052	372059	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1405	NC_014962	ATC	2	6	372100	372105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1407	NC_014962	CGC	2	6	372124	372129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1408	NC_014962	GAGTT	2	10	372144	372153	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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1410	NC_014962	GAC	2	6	372233	372238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1412	NC_014962	CG	3	6	372288	372293	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1415	NC_014962	TGG	2	6	372449	372454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1432	NC_014962	TTC	2	6	379425	379430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1443	NC_014962	TTGA	2	8	382868	382875	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1471	NC_014962	CCAC	2	8	386951	386958	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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