MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Isosphaera pallida ATCC 43644 chromosome

Total Repeats: 19715

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014962	AGAACG	2	12	138698	138709	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
502	NC_014962	CGG	2	6	138715	138720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_014962	GCC	2	6	138759	138764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
504	NC_014962	TGAG	2	8	138799	138806	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
505	NC_014962	CGAA	2	8	138850	138857	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
506	NC_014962	TAA	2	6	141699	141704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_014962	ATC	2	6	141721	141726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_014962	GAC	2	6	141739	141744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_014962	AGG	2	6	146809	146814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
510	NC_014962	GAG	2	6	146841	146846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
511	NC_014962	TCC	2	6	146847	146852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
512	NC_014962	CGT	2	6	146918	146923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_014962	CG	3	6	146938	146943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
514	NC_014962	TCT	2	6	146944	146949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_014962	TTC	2	6	149448	149453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_014962	TCG	2	6	149459	149464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_014962	G	7	7	149485	149491	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
518	NC_014962	AAG	2	6	150681	150686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
519	NC_014962	TGGG	2	8	150783	150790	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
520	NC_014962	CG	3	6	150794	150799	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
521	NC_014962	TG	3	6	151938	151943	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
522	NC_014962	GAG	2	6	152011	152016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
523	NC_014962	AG	3	6	154220	154225	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
524	NC_014962	TCGA	2	8	154383	154390	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
525	NC_014962	CCTT	2	8	154509	154516	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
526	NC_014962	AGG	2	6	154526	154531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
527	NC_014962	G	8	8	158289	158296	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
528	NC_014962	AC	3	6	158354	158359	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
529	NC_014962	CG	3	6	158400	158405	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
530	NC_014962	GTG	2	6	158430	158435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
531	NC_014962	CCGAT	2	10	158453	158462	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
532	NC_014962	TTCA	2	8	158465	158472	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
533	NC_014962	CA	3	6	158471	158476	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
534	NC_014962	ACCCC	3	15	158497	158511	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
535	NC_014962	AGGA	2	8	158562	158569	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
536	NC_014962	AGGA	2	8	158576	158583	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
537	NC_014962	CGC	2	6	158594	158599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
538	NC_014962	GGA	2	6	158658	158663	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
539	NC_014962	CTTG	2	8	159102	159109	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
540	NC_014962	G	6	6	159116	159121	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
541	NC_014962	CGAAT	2	10	159129	159138	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
542	NC_014962	GATG	2	8	159165	159172	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
543	NC_014962	GGA	2	6	159176	159181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
544	NC_014962	GGC	2	6	159212	159217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_014962	AGGG	2	8	159259	159266	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
546	NC_014962	CGT	3	9	160614	160622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_014962	G	6	6	160626	160631	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
548	NC_014962	GTTC	2	8	160648	160655	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
549	NC_014962	ATCC	2	8	160694	160701	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
550	NC_014962	CGACT	2	10	160737	160746	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
551	NC_014962	CTGA	2	8	160760	160767	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
552	NC_014962	GAC	2	6	160768	160773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_014962	GGTTC	2	10	160818	160827	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
554	NC_014962	AGA	2	6	161298	161303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_014962	A	6	6	161316	161321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_014962	GAA	2	6	161330	161335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_014962	ACG	2	6	161371	161376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_014962	AGCC	2	8	161394	161401	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
559	NC_014962	GA	3	6	161405	161410	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
560	NC_014962	GTTTG	2	10	161427	161436	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
561	NC_014962	CAAC	2	8	161489	161496	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
562	NC_014962	CGAC	2	8	161502	161509	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
563	NC_014962	AGCG	2	8	162412	162419	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
564	NC_014962	CGG	3	9	162462	162470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_014962	G	6	6	162469	162474	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
566	NC_014962	CCG	2	6	163018	163023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
567	NC_014962	ATG	2	6	163030	163035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
568	NC_014962	CGATC	2	10	163055	163064	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
569	NC_014962	TCG	2	6	163072	163077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_014962	CGC	2	6	163084	163089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
571	NC_014962	CGG	2	6	163127	163132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_014962	GAAC	2	8	163183	163190	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
573	NC_014962	CGC	2	6	163199	163204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
574	NC_014962	CAA	2	6	163287	163292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_014962	GAT	2	6	163300	163305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_014962	GCCGA	2	10	163317	163326	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
577	NC_014962	CTCGC	2	10	163377	163386	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
578	NC_014962	CCG	2	6	163446	163451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
579	NC_014962	CGCTG	2	10	163458	163467	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
580	NC_014962	AG	3	6	163474	163479	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
581	NC_014962	GGA	2	6	163739	163744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
582	NC_014962	GAC	2	6	163920	163925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_014962	GAC	2	6	163940	163945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_014962	GAG	2	6	165324	165329	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
585	NC_014962	ATCA	2	8	165349	165356	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
586	NC_014962	CA	3	6	165355	165360	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
587	NC_014962	CGCGCC	2	12	165445	165456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
588	NC_014962	CGG	2	6	165475	165480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_014962	GACCGG	2	12	165481	165492	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_014962	GAC	2	6	165524	165529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_014962	GAG	2	6	165556	165561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
592	NC_014962	GCT	2	6	165591	165596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_014962	CAG	2	6	165656	165661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_014962	A	6	6	165688	165693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_014962	TCC	2	6	165697	165702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
596	NC_014962	CCA	2	6	165742	165747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
597	NC_014962	CAAA	2	8	165791	165798	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
598	NC_014962	GAC	2	6	166022	166027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_014962	CCA	2	6	166065	166070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
600	NC_014962	GAAT	2	8	166123	166130	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
601	NC_014962	TCA	2	6	166280	166285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_014962	TATCA	2	10	166306	166315	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
603	NC_014962	T	6	6	166340	166345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_014962	GC	3	6	166349	166354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
605	NC_014962	CGG	3	9	166355	166363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_014962	G	6	6	166373	166378	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
607	NC_014962	CGAGA	2	10	166487	166496	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
608	NC_014962	GAA	2	6	166497	166502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_014962	CGAT	2	8	167434	167441	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
610	NC_014962	CGG	2	6	167442	167447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_014962	CAC	2	6	167577	167582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
612	NC_014962	TAT	2	6	167637	167642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_014962	CG	3	6	167756	167761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
614	NC_014962	TCCCA	2	10	167773	167782	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
615	NC_014962	CGGAT	2	10	167803	167812	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
616	NC_014962	GAC	3	9	167815	167823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_014962	CGG	2	6	167843	167848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_014962	TCG	2	6	169040	169045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_014962	GAT	2	6	169114	169119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_014962	TTC	2	6	169177	169182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_014962	TGG	2	6	169200	169205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
622	NC_014962	AAGT	2	8	169214	169221	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
623	NC_014962	A	6	6	169241	169246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_014962	AGAGA	2	10	169299	169308	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
625	NC_014962	GGA	2	6	169334	169339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
626	NC_014962	CGC	2	6	169386	169391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
627	NC_014962	TGG	2	6	169431	169436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
628	NC_014962	CCGA	2	8	169500	169507	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
629	NC_014962	ATC	2	6	169528	169533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_014962	GACCG	2	10	170168	170177	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
631	NC_014962	CGG	2	6	170193	170198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_014962	TCG	2	6	170777	170782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_014962	CGA	2	6	170792	170797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_014962	CG	3	6	170798	170803	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
635	NC_014962	AACC	2	8	170844	170851	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
636	NC_014962	TGGT	2	8	170861	170868	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
637	NC_014962	CGA	2	6	170942	170947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_014962	GTT	2	6	170962	170967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
639	NC_014962	GAA	3	9	171024	171032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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772	NC_014962	CG	3	6	208069	208074	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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774	NC_014962	TGGAG	2	10	208159	208168	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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778	NC_014962	CAA	2	6	209566	209571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
779	NC_014962	CGC	2	6	209577	209582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
780	NC_014962	GAG	2	6	209590	209595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
781	NC_014962	CGA	2	6	209620	209625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
782	NC_014962	CGT	2	6	209669	209674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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784	NC_014962	CGA	2	6	209733	209738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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790	NC_014962	TTCGT	2	10	211553	211562	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
791	NC_014962	TCCG	2	8	211600	211607	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
792	NC_014962	CGA	2	6	212672	212677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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913	NC_014962	TGG	2	6	239966	239971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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916	NC_014962	GAG	2	6	240847	240852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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951	NC_014962	CGG	2	6	246475	246480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
952	NC_014962	AGG	3	9	246503	246511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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955	NC_014962	AAG	2	6	247247	247252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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984	NC_014962	CGCCC	2	10	255553	255562	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
985	NC_014962	AGGA	2	8	255565	255572	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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