MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Isosphaera pallida ATCC 43644 chromosome

Total Repeats: 19715

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_014962	CCAC	2	8	1853683	1853690	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6002	NC_014962	GAGCG	2	10	1853853	1853862	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6003	NC_014962	CGG	2	6	1853865	1853870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6004	NC_014962	CGG	2	6	1853882	1853887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6005	NC_014962	CGA	2	6	1853910	1853915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6006	NC_014962	AGGG	2	8	1853928	1853935	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_014962	GAC	2	6	1856239	1856244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_014962	GTC	2	6	1856263	1856268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6009	NC_014962	GGC	2	6	1856270	1856275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6010	NC_014962	GAT	2	6	1856292	1856297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_014962	CCG	2	6	1856324	1856329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6012	NC_014962	ACG	2	6	1857519	1857524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6013	NC_014962	ATCCA	2	10	1857620	1857629	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
6014	NC_014962	GGAAC	2	10	1858951	1858960	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6015	NC_014962	CAA	2	6	1858981	1858986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_014962	CGG	2	6	1858989	1858994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6017	NC_014962	AGG	2	6	1859001	1859006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_014962	CGG	2	6	1859014	1859019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6019	NC_014962	ACC	2	6	1859056	1859061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6020	NC_014962	TTGG	2	8	1859064	1859071	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_014962	CCGG	2	8	1861086	1861093	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6022	NC_014962	CGA	2	6	1861107	1861112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_014962	GTTG	2	8	1861185	1861192	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_014962	GGAA	2	8	1861791	1861798	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_014962	AG	3	6	1861817	1861822	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_014962	GAGG	2	8	1861828	1861835	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_014962	GATC	2	8	1861862	1861869	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6028	NC_014962	AG	3	6	1861916	1861921	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_014962	CTTGAA	2	12	1861927	1861938	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6030	NC_014962	CAAGT	2	10	1861953	1861962	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6031	NC_014962	CGG	2	6	1861963	1861968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6032	NC_014962	CGA	2	6	1863670	1863675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6033	NC_014962	CCG	2	6	1863744	1863749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6034	NC_014962	CCA	2	6	1863784	1863789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6035	NC_014962	CCT	2	6	1864268	1864273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6036	NC_014962	GTC	2	6	1864429	1864434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6037	NC_014962	GAG	2	6	1864436	1864441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_014962	CTTC	3	12	1865194	1865205	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6039	NC_014962	CTC	2	6	1865237	1865242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6040	NC_014962	CTT	2	6	1865275	1865280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6041	NC_014962	GC	3	6	1865423	1865428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6042	NC_014962	TCCA	2	8	1865556	1865563	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6043	NC_014962	CG	3	6	1865674	1865679	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6044	NC_014962	TGGA	2	8	1865743	1865750	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_014962	TAC	2	6	1865757	1865762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6046	NC_014962	CAA	2	6	1865832	1865837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_014962	TCC	2	6	1866435	1866440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6048	NC_014962	TGA	3	9	1866441	1866449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_014962	CTTT	2	8	1866467	1866474	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6050	NC_014962	AGA	2	6	1866482	1866487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_014962	CGT	2	6	1866522	1866527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_014962	GAC	2	6	1867588	1867593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_014962	CGG	2	6	1867597	1867602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_014962	GCG	2	6	1867765	1867770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6055	NC_014962	CGT	2	6	1867804	1867809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6056	NC_014962	CCG	2	6	1867902	1867907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6057	NC_014962	TTG	2	6	1867928	1867933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_014962	CTT	2	6	1867945	1867950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6059	NC_014962	CTC	2	6	1871355	1871360	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6060	NC_014962	GAA	2	6	1871390	1871395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_014962	CTTCCG	2	12	1871419	1871430	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6062	NC_014962	C	6	6	1871444	1871449	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6063	NC_014962	CAA	2	6	1872823	1872828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6064	NC_014962	AGAA	2	8	1872845	1872852	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_014962	A	6	6	1872851	1872856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_014962	GAC	2	6	1874119	1874124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6067	NC_014962	GGT	2	6	1874133	1874138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_014962	GGTTG	2	10	1874148	1874157	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_014962	TC	4	8	1874373	1874380	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6070	NC_014962	GTC	2	6	1874410	1874415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6071	NC_014962	ACGA	2	8	1874424	1874431	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6072	NC_014962	CCA	2	6	1874440	1874445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6073	NC_014962	ACC	2	6	1874471	1874476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6074	NC_014962	TGA	2	6	1874504	1874509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6075	NC_014962	TGA	2	6	1874515	1874520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6076	NC_014962	GTT	2	6	1876015	1876020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6077	NC_014962	TTC	2	6	1876029	1876034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6078	NC_014962	CGG	3	9	1876520	1876528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6079	NC_014962	CGT	2	6	1876561	1876566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6080	NC_014962	CGG	2	6	1877454	1877459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6081	NC_014962	GGA	2	6	1879600	1879605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_014962	GAA	2	6	1879632	1879637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_014962	ATG	2	6	1880333	1880338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6084	NC_014962	TTGA	2	8	1880406	1880413	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6085	NC_014962	TCA	2	6	1880540	1880545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6086	NC_014962	GGT	2	6	1894964	1894969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6087	NC_014962	TTG	2	6	1894970	1894975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6088	NC_014962	GTC	2	6	1894998	1895003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6089	NC_014962	CAC	2	6	1895027	1895032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6090	NC_014962	AGG	2	6	1895080	1895085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6091	NC_014962	GAG	2	6	1895141	1895146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_014962	GTT	2	6	1895192	1895197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_014962	GTT	2	6	1895222	1895227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_014962	AGGA	2	8	1895231	1895238	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_014962	ACC	2	6	1896488	1896493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6096	NC_014962	CGG	2	6	1896551	1896556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6097	NC_014962	TCG	2	6	1896563	1896568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6098	NC_014962	CAAC	2	8	1896578	1896585	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6099	NC_014962	CCA	2	6	1896587	1896592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6100	NC_014962	AGG	2	6	1896599	1896604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6101	NC_014962	ACCA	2	8	1898025	1898032	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6102	NC_014962	CGC	2	6	1898033	1898038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6103	NC_014962	ACC	2	6	1898120	1898125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6104	NC_014962	CCCT	2	8	1898209	1898216	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6105	NC_014962	AAT	2	6	1898280	1898285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6106	NC_014962	CG	3	6	1898318	1898323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6107	NC_014962	GTT	2	6	1898337	1898342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6108	NC_014962	ACA	2	6	1898357	1898362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6109	NC_014962	TGA	2	6	1898670	1898675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_014962	TCG	2	6	1898706	1898711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6111	NC_014962	TCG	2	6	1898721	1898726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6112	NC_014962	CG	3	6	1898725	1898730	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6113	NC_014962	CCT	2	6	1900372	1900377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6114	NC_014962	ACGA	2	8	1900404	1900411	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6115	NC_014962	TCC	2	6	1900414	1900419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6116	NC_014962	CGCT	2	8	1901745	1901752	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6117	NC_014962	GGACA	2	10	1901775	1901784	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6118	NC_014962	AGCG	2	8	1901796	1901803	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6119	NC_014962	CAC	2	6	1901846	1901851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6120	NC_014962	A	6	6	1901887	1901892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6121	NC_014962	TCC	2	6	1901945	1901950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6122	NC_014962	TCC	2	6	1901960	1901965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6123	NC_014962	CAT	2	6	1901972	1901977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6124	NC_014962	CCCG	2	8	1902021	1902028	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6125	NC_014962	CGCGG	2	10	1905744	1905753	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6126	NC_014962	CGC	2	6	1905780	1905785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6127	NC_014962	CGA	2	6	1909607	1909612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6128	NC_014962	GTC	2	6	1909616	1909621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6129	NC_014962	TTGGT	2	10	1909676	1909685	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_014962	GCA	2	6	1909739	1909744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6427	NC_014962	ACC	2	6	1995320	1995325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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