MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Isosphaera pallida ATCC 43644 chromosome

Total Repeats: 19715

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014962	ACCC	2	8	1518474	1518481	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5002	NC_014962	CTTGAT	2	12	1518534	1518545	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5003	NC_014962	ATTC	2	8	1518552	1518559	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5004	NC_014962	TTC	2	6	1518576	1518581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_014962	CGC	2	6	1518585	1518590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5006	NC_014962	GGT	2	6	1518591	1518596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_014962	ACC	2	6	1518640	1518645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5008	NC_014962	TTCA	2	8	1518666	1518673	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5009	NC_014962	CT	3	6	1518678	1518683	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5010	NC_014962	GA	3	6	1520401	1520406	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_014962	CGC	2	6	1520463	1520468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5012	NC_014962	TCA	2	6	1520485	1520490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_014962	CGATT	2	10	1520494	1520503	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5014	NC_014962	CCGA	2	8	1520525	1520532	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5015	NC_014962	TTC	2	6	1520538	1520543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_014962	TGG	2	6	1522259	1522264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_014962	GCC	2	6	1523588	1523593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5018	NC_014962	CAACC	2	10	1523614	1523623	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
5019	NC_014962	G	7	7	1526290	1526296	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_014962	TGA	2	6	1526300	1526305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_014962	GGAA	2	8	1528296	1528303	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_014962	GGCAA	2	10	1528323	1528332	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5023	NC_014962	TGGGG	2	10	1528373	1528382	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_014962	G	8	8	1528379	1528386	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_014962	CGC	2	6	1528403	1528408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5026	NC_014962	AGG	2	6	1528424	1528429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_014962	TCT	2	6	1528434	1528439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_014962	CCCG	2	8	1528475	1528482	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5029	NC_014962	TCC	2	6	1528486	1528491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5030	NC_014962	CCT	2	6	1528508	1528513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5031	NC_014962	GTG	2	6	1528529	1528534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_014962	AAACG	2	10	1528535	1528544	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5033	NC_014962	CGT	2	6	1528568	1528573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5034	NC_014962	GCTCG	2	10	1528583	1528592	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5035	NC_014962	CCGC	2	8	1528630	1528637	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5036	NC_014962	TC	3	6	1535345	1535350	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5037	NC_014962	CTCC	2	8	1535377	1535384	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5038	NC_014962	CAAC	2	8	1535464	1535471	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5039	NC_014962	GCTTG	2	10	1537266	1537275	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5040	NC_014962	CGCC	2	8	1537284	1537291	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5041	NC_014962	CGA	2	6	1537294	1537299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_014962	AGG	2	6	1537325	1537330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_014962	GAT	2	6	1537364	1537369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_014962	CG	3	6	1537371	1537376	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5045	NC_014962	ACG	2	6	1537386	1537391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_014962	TC	3	6	1537401	1537406	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5047	NC_014962	TGG	2	6	1538577	1538582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5048	NC_014962	ATTG	2	8	1538585	1538592	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_014962	GGA	2	6	1538605	1538610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_014962	CGA	2	6	1538643	1538648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_014962	CCT	2	6	1538665	1538670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5052	NC_014962	TGG	2	6	1538712	1538717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_014962	GGC	2	6	1538747	1538752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_014962	CCGC	2	8	1538883	1538890	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5055	NC_014962	TGG	2	6	1538895	1538900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_014962	CCT	2	6	1540100	1540105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5057	NC_014962	AACGA	2	10	1540137	1540146	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
5058	NC_014962	TCCA	2	8	1540269	1540276	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5059	NC_014962	TGA	2	6	1540322	1540327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_014962	CGC	2	6	1540352	1540357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5061	NC_014962	TGG	2	6	1540370	1540375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_014962	GA	3	6	1540456	1540461	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_014962	ATCCG	2	10	1545385	1545394	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5064	NC_014962	ATTCG	2	10	1545449	1545458	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5065	NC_014962	GCC	2	6	1546424	1546429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5066	NC_014962	CTC	2	6	1547805	1547810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5067	NC_014962	GGA	2	6	1547906	1547911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_014962	CCTTG	2	10	1548861	1548870	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5069	NC_014962	TGC	2	6	1548938	1548943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_014962	CG	3	6	1548947	1548952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5071	NC_014962	CGC	2	6	1548963	1548968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5072	NC_014962	TCGC	2	8	1548971	1548978	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5073	NC_014962	CGC	2	6	1549013	1549018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5074	NC_014962	GTC	2	6	1549019	1549024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_014962	GCC	2	6	1549025	1549030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5076	NC_014962	CG	3	6	1549048	1549053	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5077	NC_014962	TCC	2	6	1549061	1549066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5078	NC_014962	GAGT	2	8	1549092	1549099	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_014962	C	7	7	1549100	1549106	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5080	NC_014962	TTGC	2	8	1550489	1550496	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5081	NC_014962	CAC	2	6	1550602	1550607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5082	NC_014962	CGG	2	6	1550608	1550613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_014962	CGC	2	6	1550639	1550644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5084	NC_014962	CCG	2	6	1550645	1550650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5085	NC_014962	CGT	2	6	1550668	1550673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_014962	GTCG	2	8	1550677	1550684	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5087	NC_014962	AG	3	6	1551084	1551089	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_014962	GGTG	2	8	1552961	1552968	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_014962	CGG	2	6	1552980	1552985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5090	NC_014962	CAAG	2	8	1552989	1552996	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5091	NC_014962	CGG	2	6	1553001	1553006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5092	NC_014962	CGA	2	6	1553018	1553023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_014962	CATC	2	8	1553036	1553043	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5094	NC_014962	GTC	2	6	1553275	1553280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5095	NC_014962	CG	3	6	1553285	1553290	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5096	NC_014962	CG	3	6	1553336	1553341	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5097	NC_014962	GCTG	2	8	1555058	1555065	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5098	NC_014962	GTC	2	6	1555103	1555108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5099	NC_014962	CCAC	2	8	1555160	1555167	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5100	NC_014962	TGA	2	6	1555216	1555221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5101	NC_014962	CCG	2	6	1555264	1555269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5102	NC_014962	GGA	2	6	1555350	1555355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_014962	CG	3	6	1555426	1555431	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5104	NC_014962	CCA	2	6	1555441	1555446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5105	NC_014962	AACC	2	8	1555456	1555463	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5106	NC_014962	TCG	2	6	1555512	1555517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5107	NC_014962	C	7	7	1557359	1557365	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5108	NC_014962	CAC	2	6	1557369	1557374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5109	NC_014962	GCC	2	6	1557550	1557555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5110	NC_014962	TC	3	6	1557618	1557623	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5111	NC_014962	CGG	2	6	1557639	1557644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_014962	AAC	2	6	1557664	1557669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_014962	ACCG	2	8	1557678	1557685	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5114	NC_014962	GAG	2	6	1557726	1557731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_014962	AAC	2	6	1557759	1557764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_014962	ACG	2	6	1557769	1557774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5117	NC_014962	CAT	2	6	1559079	1559084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_014962	TCG	2	6	1559091	1559096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5119	NC_014962	AC	3	6	1559144	1559149	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5120	NC_014962	GGC	2	6	1559153	1559158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5121	NC_014962	CAA	2	6	1559179	1559184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_014962	ATG	2	6	1559251	1559256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5123	NC_014962	GAA	2	6	1559267	1559272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_014962	CTTA	2	8	1559343	1559350	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5125	NC_014962	CTT	2	6	1559598	1559603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5126	NC_014962	GAT	2	6	1559618	1559623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_014962	GTG	2	6	1559624	1559629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_014962	ATG	2	6	1560976	1560981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_014962	GTC	2	6	1561024	1561029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5130	NC_014962	TGG	2	6	1561160	1561165	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_014962	CGT	2	6	1561223	1561228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5132	NC_014962	GA	3	6	1561343	1561348	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5133	NC_014962	CGAT	2	8	1561370	1561377	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5134	NC_014962	GAC	2	6	1561382	1561387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5135	NC_014962	TCG	2	6	1561483	1561488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5136	NC_014962	CTG	2	6	1561504	1561509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5137	NC_014962	CCG	2	6	1561561	1561566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5138	NC_014962	AGGA	2	8	1561683	1561690	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5139	NC_014962	CCG	2	6	1561708	1561713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5140	NC_014962	CCCG	2	8	1561726	1561733	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5141	NC_014962	CCGTT	2	10	1561748	1561757	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5142	NC_014962	CCA	2	6	1562394	1562399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5143	NC_014962	GT	3	6	1562427	1562432	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5144	NC_014962	CCG	2	6	1562529	1562534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5145	NC_014962	AAG	2	6	1562565	1562570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5146	NC_014962	ACCC	2	8	1562587	1562594	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
5147	NC_014962	CGCGG	2	10	1563696	1563705	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5148	NC_014962	TTC	2	6	1563760	1563765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5149	NC_014962	CAA	2	6	1563766	1563771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5150	NC_014962	ACC	2	6	1564123	1564128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5151	NC_014962	GGA	2	6	1564135	1564140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5153	NC_014962	C	8	8	1566426	1566433	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5154	NC_014962	GCTA	2	8	1566452	1566459	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5155	NC_014962	CCG	2	6	1566486	1566491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5156	NC_014962	GCG	2	6	1566518	1566523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5158	NC_014962	GTCGC	2	10	1566592	1566601	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5159	NC_014962	GTC	2	6	1566602	1566607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5160	NC_014962	TCGAT	2	10	1566669	1566678	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5161	NC_014962	GACTT	3	15	1566681	1566695	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5162	NC_014962	GATCC	2	10	1566696	1566705	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5163	NC_014962	ACG	2	6	1566713	1566718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5166	NC_014962	GCC	2	6	1569662	1569667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5167	NC_014962	GTT	2	6	1569674	1569679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5177	NC_014962	GAAA	2	8	1570680	1570687	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5178	NC_014962	C	7	7	1570710	1570716	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5179	NC_014962	TC	3	6	1570717	1570722	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5180	NC_014962	G	6	6	1570755	1570760	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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5191	NC_014962	C	7	7	1572522	1572528	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5192	NC_014962	CGG	3	9	1572559	1572567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5204	NC_014962	TCGAA	2	10	1574169	1574178	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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5210	NC_014962	TGA	2	6	1574375	1574380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5254	NC_014962	TCGA	2	8	1598972	1598979	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5255	NC_014962	AAC	3	9	1598997	1599005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5256	NC_014962	CAT	2	6	1599006	1599011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5258	NC_014962	GCA	2	6	1599041	1599046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5259	NC_014962	CCA	2	6	1599091	1599096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5260	NC_014962	ACC	2	6	1599181	1599186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5261	NC_014962	ACC	2	6	1599244	1599249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5262	NC_014962	CGC	2	6	1599808	1599813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5263	NC_014962	GGTCG	2	10	1599872	1599881	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
5264	NC_014962	G	6	6	1599905	1599910	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5265	NC_014962	TTCA	2	8	1599921	1599928	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5266	NC_014962	GA	3	6	1599966	1599971	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5279	NC_014962	CGAT	2	8	1601756	1601763	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5285	NC_014962	GGATC	2	10	1602737	1602746	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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5382	NC_014962	CCT	2	6	1637311	1637316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5383	NC_014962	CGA	2	6	1637318	1637323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5386	NC_014962	CCAAT	3	15	1638953	1638967	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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5388	NC_014962	CTC	2	6	1640418	1640423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5389	NC_014962	ATGCG	2	10	1640656	1640665	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5390	NC_014962	CCCG	2	8	1640693	1640700	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5391	NC_014962	GCG	2	6	1640722	1640727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5392	NC_014962	TTCCC	2	10	1640777	1640786	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
5393	NC_014962	GCG	2	6	1640835	1640840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5394	NC_014962	GAGG	2	8	1646725	1646732	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5395	NC_014962	ACG	2	6	1646746	1646751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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