MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Isosphaera pallida ATCC 43644 chromosome

Total Repeats: 19715

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_014962	GCT	2	6	1340792	1340797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4502	NC_014962	CG	3	6	1340817	1340822	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4503	NC_014962	GCG	2	6	1342324	1342329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4504	NC_014962	GTG	2	6	1343094	1343099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_014962	ACG	2	6	1343102	1343107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4506	NC_014962	CAA	2	6	1343149	1343154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4507	NC_014962	ATC	2	6	1343167	1343172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4508	NC_014962	ATG	2	6	1343189	1343194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4509	NC_014962	AAT	2	6	1343212	1343217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_014962	ATTAT	2	10	1343221	1343230	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_014962	GAG	2	6	1343235	1343240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_014962	G	6	6	1351518	1351523	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4513	NC_014962	AGCA	2	8	1353385	1353392	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4514	NC_014962	GTC	2	6	1353408	1353413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4515	NC_014962	AGG	2	6	1353454	1353459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_014962	GGA	2	6	1353472	1353477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_014962	GTCG	2	8	1353503	1353510	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4518	NC_014962	GA	5	10	1353533	1353542	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_014962	ACC	2	6	1353549	1353554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4520	NC_014962	GC	3	6	1353558	1353563	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4521	NC_014962	TCGAC	2	10	1353565	1353574	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4522	NC_014962	GCC	2	6	1353597	1353602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4523	NC_014962	ACG	2	6	1354887	1354892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4524	NC_014962	ATG	2	6	1354929	1354934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_014962	CAA	2	6	1354944	1354949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4526	NC_014962	TTGG	2	8	1355162	1355169	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_014962	GA	3	6	1355179	1355184	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4528	NC_014962	TTC	2	6	1355228	1355233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4529	NC_014962	TCAC	2	8	1355258	1355265	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4530	NC_014962	CGC	2	6	1355277	1355282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4531	NC_014962	GA	3	6	1355295	1355300	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_014962	GAG	2	6	1355349	1355354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_014962	CGT	2	6	1356549	1356554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4534	NC_014962	CGT	2	6	1356579	1356584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4535	NC_014962	TCG	2	6	1356615	1356620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4536	NC_014962	TCCG	2	8	1356674	1356681	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4537	NC_014962	TTCGAG	2	12	1356689	1356700	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4538	NC_014962	TTCGGA	2	12	1356701	1356712	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4539	NC_014962	CG	3	6	1356779	1356784	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4540	NC_014962	CTT	2	6	1356791	1356796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4541	NC_014962	AAC	2	6	1356802	1356807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4542	NC_014962	TCC	2	6	1356821	1356826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4543	NC_014962	CCG	2	6	1357371	1357376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4544	NC_014962	CGC	2	6	1357394	1357399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4545	NC_014962	TCG	2	6	1357441	1357446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4546	NC_014962	CGT	2	6	1357591	1357596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4547	NC_014962	CGA	2	6	1357616	1357621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4548	NC_014962	TCG	2	6	1358824	1358829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4549	NC_014962	GAAT	2	8	1358842	1358849	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4550	NC_014962	TGA	2	6	1358853	1358858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4551	NC_014962	TTGAAA	2	12	1360220	1360231	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4552	NC_014962	TCG	2	6	1361253	1361258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4553	NC_014962	CGG	2	6	1361280	1361285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4554	NC_014962	GTTG	2	8	1361317	1361324	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_014962	CGTG	2	8	1361332	1361339	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4556	NC_014962	CGG	2	6	1361425	1361430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4557	NC_014962	TC	3	6	1361437	1361442	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4558	NC_014962	ACC	2	6	1361458	1361463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4559	NC_014962	CGG	2	6	1361472	1361477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4560	NC_014962	GTT	2	6	1361594	1361599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_014962	GT	3	6	1361717	1361722	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_014962	GTTG	2	8	1361734	1361741	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_014962	GATG	2	8	1361891	1361898	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_014962	CCG	2	6	1361923	1361928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4565	NC_014962	CGA	2	6	1361983	1361988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4566	NC_014962	GACC	2	8	1362006	1362013	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4567	NC_014962	TCA	2	6	1362019	1362024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4568	NC_014962	AAAC	2	8	1362039	1362046	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4569	NC_014962	GATG	2	8	1362078	1362085	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_014962	CGG	2	6	1362522	1362527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4571	NC_014962	CCA	2	6	1362537	1362542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4572	NC_014962	GCC	2	6	1362619	1362624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4573	NC_014962	GCG	2	6	1362626	1362631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4574	NC_014962	GTTGCC	2	12	1362658	1362669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4575	NC_014962	GAA	2	6	1362715	1362720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_014962	ATCGT	2	10	1362737	1362746	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4577	NC_014962	CAAC	2	8	1362793	1362800	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4578	NC_014962	TCG	2	6	1362803	1362808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4579	NC_014962	CGT	2	6	1362831	1362836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4580	NC_014962	GAC	2	6	1362877	1362882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4581	NC_014962	AG	3	6	1362968	1362973	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_014962	CGG	2	6	1362978	1362983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4583	NC_014962	CCA	2	6	1363009	1363014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4584	NC_014962	TCA	2	6	1363053	1363058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4585	NC_014962	CTC	2	6	1363066	1363071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4586	NC_014962	CG	3	6	1363162	1363167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4587	NC_014962	ATC	2	6	1363226	1363231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4588	NC_014962	AAG	2	6	1363242	1363247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4589	NC_014962	ATC	2	6	1363854	1363859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4590	NC_014962	AAG	2	6	1363965	1363970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4591	NC_014962	CGG	3	9	1366538	1366546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4592	NC_014962	CCACG	2	10	1366588	1366597	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4593	NC_014962	GAC	2	6	1366626	1366631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4594	NC_014962	GCGTTC	2	12	1366734	1366745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4595	NC_014962	GAG	2	6	1366775	1366780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_014962	CCG	2	6	1366866	1366871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4597	NC_014962	TGG	2	6	1366954	1366959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_014962	GGAG	2	8	1369745	1369752	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_014962	AACTC	2	10	1369851	1369860	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4600	NC_014962	GGT	2	6	1369865	1369870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_014962	ATC	2	6	1369889	1369894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4602	NC_014962	GGA	2	6	1369903	1369908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4603	NC_014962	G	6	6	1369956	1369961	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_014962	AGG	2	6	1370000	1370005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_014962	GAG	2	6	1370030	1370035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_014962	GTCG	2	8	1370122	1370129	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4607	NC_014962	GTG	2	6	1370143	1370148	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_014962	TGGGT	2	10	1370155	1370164	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_014962	TGGGA	2	10	1370167	1370176	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_014962	CTG	2	6	1370188	1370193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4611	NC_014962	CGGG	2	8	1370210	1370217	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4612	NC_014962	TCC	2	6	1371235	1371240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4613	NC_014962	ATCCA	2	10	1371837	1371846	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4614	NC_014962	GGT	2	6	1371917	1371922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_014962	GAT	3	9	1371942	1371950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_014962	GTCA	2	8	1371991	1371998	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4617	NC_014962	GCG	2	6	1372025	1372030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4618	NC_014962	CGG	2	6	1372141	1372146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4619	NC_014962	ACGG	2	8	1372180	1372187	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4620	NC_014962	CG	3	6	1372226	1372231	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4621	NC_014962	CCT	2	6	1372318	1372323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4622	NC_014962	TTCGA	2	10	1372349	1372358	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4623	NC_014962	TTCGC	2	10	1372359	1372368	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4624	NC_014962	TTGGTT	2	12	1372389	1372400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_014962	TCT	2	6	1372493	1372498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4626	NC_014962	AGT	2	6	1375655	1375660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4627	NC_014962	CGTT	2	8	1375670	1375677	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4628	NC_014962	TGGA	2	8	1375679	1375686	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4629	NC_014962	TGGT	2	8	1375705	1375712	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4630	NC_014962	GGC	2	6	1375771	1375776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4883	NC_014962	GTC	2	6	1479267	1479272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4885	NC_014962	GATGA	2	10	1479311	1479320	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4886	NC_014962	CT	3	6	1479331	1479336	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4887	NC_014962	ATCCA	2	10	1483334	1483343	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4888	NC_014962	ACCC	2	8	1483351	1483358	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4889	NC_014962	CGAG	2	8	1483377	1483384	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4890	NC_014962	GAT	2	6	1485630	1485635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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