MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Ilyobacter polytropus DSM 2926 plasmid pILYOP01

Total Repeats: 237

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014633	TAAAA	2	10	1855	1864	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014633	AAATA	2	10	4921	4930	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014633	ATTTT	2	10	8600	8609	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014633	TATAA	2	10	10527	10536	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014633	TATAC	2	10	36330	36339	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_014633	TATTT	2	10	40107	40116	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014633	ATTTT	2	10	40645	40654	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014633	ATTAT	2	10	41171	41180	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014633	TAAAA	2	10	51490	51499	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014633	AAGAT	2	10	54242	54251	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014633	AAATT	2	10	54847	54856	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014633	TCGTG	2	10	70408	70417	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_014633	TGGGC	2	10	70551	70560	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
14	NC_014633	GGGAG	2	10	71630	71639	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014633	ATGGA	2	10	78837	78846	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014633	CAGGG	2	10	90648	90657	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
17	NC_014633	TTAAT	2	10	96562	96571	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014633	TGTTT	2	10	96646	96655	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014633	TTTGA	2	10	116783	116792	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014633	ATTTT	2	10	118245	118254	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014633	TATCT	2	10	123937	123946	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_014633	TTTCT	2	10	129122	129131	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_014633	TTCTT	2	10	137376	137385	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_014633	ATCTA	2	10	142728	142737	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_014633	TTTTA	2	10	144527	144536	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014633	AAATC	2	10	147921	147930	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_014633	ATATT	2	10	147936	147945	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014633	ATATT	2	10	150382	150391	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014633	TAAAT	2	10	150427	150436	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014633	AAATA	2	10	153739	153748	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014633	AATAA	2	10	153863	153872	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014633	TTCAG	2	10	154570	154579	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_014633	GATCT	2	10	154688	154697	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_014633	ACCTT	2	10	154885	154894	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_014633	CTGGC	2	10	155034	155043	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
36	NC_014633	ATTTT	2	10	156216	156225	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014633	TCCAT	2	10	159128	159137	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
38	NC_014633	GAAAA	2	10	168353	168362	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014633	ATTTA	2	10	169602	169611	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014633	CAAGG	2	10	169869	169878	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_014633	GTCTT	2	10	169935	169944	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_014633	ATCAT	2	10	170055	170064	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_014633	ATTTT	2	10	172803	172812	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014633	TTTGA	2	10	175891	175900	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014633	ATTTA	2	10	176754	176763	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014633	ATATT	2	10	176800	176809	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014633	TTTCA	2	10	176938	176947	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_014633	GTTTA	2	10	178557	178566	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014633	ATTTT	2	10	180811	180820	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014633	GTTAT	2	10	184408	184417	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014633	TCAAA	2	10	184723	184732	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_014633	ATAAA	2	10	184791	184800	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014633	GATTT	2	10	192245	192254	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014633	TCCTA	2	10	215002	215011	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
55	NC_014633	ATTAT	2	10	215023	215032	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014633	TAAAA	2	10	217081	217090	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014633	TAAAA	2	10	222001	222010	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014633	AATAT	2	10	227259	227268	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014633	TAAAA	2	10	229984	229993	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014633	AGCGA	2	10	230655	230664	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_014633	TGGTT	2	10	244978	244987	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014633	ATTAA	2	10	257803	257812	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014633	TAAGA	2	10	260770	260779	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014633	TCCAA	2	10	264932	264941	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
65	NC_014633	ATTAA	2	10	266751	266760	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014633	TAAAA	2	10	271477	271486	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014633	TTTTA	2	10	271554	271563	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014633	TTTCT	2	10	286581	286590	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_014633	AAAAG	2	10	288198	288207	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014633	TTAAA	2	10	292285	292294	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014633	AATAA	2	10	292843	292852	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014633	TTATT	2	10	295793	295802	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014633	TATTT	2	10	306907	306916	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014633	ATTTT	2	10	307521	307530	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014633	CAAAT	2	10	311547	311556	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_014633	AGACA	2	10	312288	312297	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_014633	TTTTC	2	10	316343	316352	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_014633	TATTT	2	10	318127	318136	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014633	CAAAA	2	10	318343	318352	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_014633	CAATA	2	10	318358	318367	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_014633	ACTTT	2	10	325718	325727	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_014633	ACTTT	2	10	328361	328370	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_014633	GCAAT	2	10	355507	355516	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_014633	ATTAA	2	10	355890	355899	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014633	ATTAA	2	10	355901	355910	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014633	AAATA	2	10	356114	356123	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014633	CAAAA	2	10	356628	356637	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_014633	TATAA	2	10	357883	357892	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014633	ATTTA	2	10	360374	360383	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014633	AGAAA	2	10	363142	363151	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014633	GGGGA	2	10	364226	364235	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014633	AGCGA	2	10	364887	364896	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
93	NC_014633	TAAAA	2	10	365114	365123	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014633	TTTTA	2	10	372735	372744	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014633	TAAAA	2	10	381570	381579	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014633	AATAA	2	10	383080	383089	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014633	ATTTT	2	10	383791	383800	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014633	TTTAA	2	10	390757	390766	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014633	CTTTT	2	10	390887	390896	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_014633	CAATA	2	10	396055	396064	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_014633	GTTTT	2	10	396516	396525	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014633	AATTT	2	10	410021	410030	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014633	TAAAA	2	10	410178	410187	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014633	ATTAT	2	10	410230	410239	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014633	AAAAT	2	10	419147	419156	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014633	CTAAT	2	10	419541	419550	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_014633	TTAAG	2	10	425343	425352	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014633	AAAGA	2	10	428522	428531	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014633	AAATG	2	10	431765	431774	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014633	CATTT	2	10	431803	431812	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_014633	AATTA	2	10	446407	446416	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014633	GTATT	2	10	450085	450094	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014633	TAAAA	2	10	452165	452174	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014633	ATATC	2	10	489264	489273	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_014633	TTTAT	2	10	498370	498379	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014633	TATAC	2	10	502808	502817	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_014633	GATAA	2	10	507362	507371	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014633	TTTAA	2	10	513636	513645	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014633	ATAAA	2	10	513786	513795	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014633	AAAGT	2	10	549177	549186	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014633	ATTTT	2	10	550036	550045	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014633	TTAGT	2	10	550063	550072	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014633	TTTTA	2	10	555830	555839	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014633	TTTTA	2	10	560149	560158	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014633	GTTTT	2	10	565378	565387	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014633	ATTTT	2	10	568991	569000	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014633	AGCGA	2	10	573682	573691	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
128	NC_014633	ATTAA	2	10	580394	580403	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014633	GCTGA	2	10	580503	580512	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
130	NC_014633	AAAAT	2	10	580679	580688	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014633	TAAAT	2	10	586474	586483	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014633	ATTTA	2	10	592515	592524	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014633	AAATT	2	10	609337	609346	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014633	TAATT	2	10	609826	609835	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014633	CAAAC	2	10	611073	611082	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
136	NC_014633	AAAAT	2	10	614744	614753	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014633	TGAAT	2	10	617020	617029	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014633	TAATT	2	10	619251	619260	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014633	TGATT	2	10	623729	623738	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014633	TAAAA	2	10	623780	623789	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014633	ATTTT	2	10	629972	629981	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014633	TCAAA	2	10	636968	636977	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_014633	TTAAA	2	10	638497	638506	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014633	TTTTA	2	10	645503	645512	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014633	AATTT	2	10	645578	645587	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014633	CTTAG	2	10	650829	650838	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_014633	AAAAT	2	10	650881	650890	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014633	TATTT	2	10	653362	653371	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.