MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Ilyobacter polytropus DSM 2926 chromosome

Total Repeats: 127

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014632	ATAAAA	2	12	17791	17802	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014632	TTAAAA	2	12	17814	17825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014632	TATTTT	2	12	20693	20704	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014632	TATTTT	2	12	32003	32014	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014632	TTTATA	2	12	52979	52990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014632	AAATAT	2	12	60816	60827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014632	TTTATA	2	12	63021	63032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014632	TATTAA	2	12	67894	67905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014632	TTTAAA	2	12	84945	84956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014632	AATAAA	2	12	113323	113334	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014632	TTAGAT	2	12	122277	122288	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014632	AAATTT	2	12	139453	139464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014632	TATTTT	2	12	139556	139567	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014632	AATTTT	2	12	149969	149980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014632	TCTATT	2	12	153571	153582	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_014632	AAAATA	2	12	159775	159786	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014632	TTAATT	2	12	170361	170372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014632	TTATAT	2	12	184709	184720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014632	TTAATT	2	12	241595	241606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014632	AAATTT	2	12	273187	273198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014632	ATTTTT	2	12	275111	275122	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014632	AAATAA	2	12	275259	275270	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014632	TAAGCT	2	12	306085	306096	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_014632	ATAAAA	2	12	306200	306211	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014632	TAATTA	2	12	316564	316575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014632	TAAGAA	2	12	324519	324530	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014632	AAAATA	2	12	331692	331703	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014632	AAAAAT	2	12	352012	352023	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014632	GGATGA	2	12	397934	397945	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014632	AAAGAG	2	12	421886	421897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014632	TAATTA	2	12	426405	426416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014632	AAAGAT	2	12	434429	434440	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014632	CAAAGA	2	12	434790	434801	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_014632	TTTTAA	2	12	435004	435015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014632	TAAAAA	2	12	435123	435134	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014632	GTAAAA	2	12	447219	447230	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014632	TTATTC	2	12	452118	452129	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_014632	GAATAA	2	12	459699	459710	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014632	TGATTT	2	12	466903	466914	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014632	ATTTCT	2	12	489806	489817	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_014632	TATAAA	2	12	517516	517527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014632	TATAAA	2	12	565749	565760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014632	GTCTAT	2	12	604198	604209	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_014632	ATAAAA	2	12	618253	618264	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014632	TTTAAA	2	12	619262	619273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014632	AAAAGT	2	12	623324	623335	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014632	AAAAAG	2	12	637120	637131	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014632	GAAATA	2	12	645348	645359	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014632	ATAAAA	2	12	693401	693412	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014632	TAAAAT	2	12	730151	730162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014632	TAAAAA	2	12	737765	737776	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014632	TTTTAA	2	12	738896	738907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014632	AACTAA	2	12	746428	746439	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_014632	TTAATT	2	12	788523	788534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014632	AAATAA	2	12	807653	807664	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014632	AAATAA	2	12	834530	834541	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014632	GATTTT	2	12	861581	861592	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014632	ATTTAA	2	12	890242	890253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014632	TTTATA	2	12	931577	931588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014632	AAATAA	2	12	933697	933708	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014632	AAACCT	2	12	956830	956841	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_014632	AAAAAT	2	12	962275	962286	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014632	TATTAA	2	12	980631	980642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014632	TAAAAG	2	12	991502	991513	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014632	TTTAAT	2	12	998444	998455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014632	ATGTTA	2	12	1013292	1013303	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014632	AGAAAA	2	12	1027909	1027920	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014632	TAATTT	2	12	1029414	1029425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014632	CTTAAT	2	12	1041317	1041328	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_014632	AAATTA	2	12	1043217	1043228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014632	TTTGGA	2	12	1046088	1046099	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014632	TTTATA	2	12	1047552	1047563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014632	ATTTTT	3	18	1061295	1061312	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014632	ACTTTT	2	12	1064259	1064270	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_014632	ATAAAA	2	12	1077293	1077304	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014632	GCTTAA	2	12	1114042	1114053	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_014632	TTTTAA	2	12	1157238	1157249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014632	AAAATA	2	12	1180393	1180404	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014632	ACTTTT	2	12	1186126	1186137	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_014632	TGAAAA	2	12	1229721	1229732	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014632	CAATGG	2	12	1235389	1235400	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_014632	AGGCCT	2	12	1238207	1238218	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014632	TTTAAA	2	12	1247204	1247215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014632	TTTTTA	2	12	1254729	1254740	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014632	TTAATT	2	12	1267629	1267640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014632	AATTAA	2	12	1269024	1269035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014632	TATTTT	2	12	1278392	1278403	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014632	ATTTTT	2	12	1280998	1281009	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014632	AAAAGA	2	12	1282804	1282815	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014632	AATATT	2	12	1334950	1334961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014632	GCTCAA	2	12	1339411	1339422	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014632	AAAATA	2	12	1339699	1339710	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014632	TAAATA	2	12	1348963	1348974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014632	ATTAAA	2	12	1361137	1361148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014632	ATTTTT	2	12	1375105	1375116	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014632	TTTCAT	2	12	1401093	1401104	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_014632	TAAAAA	2	12	1408482	1408493	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014632	TAGATG	2	12	1449813	1449824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014632	ATTTTT	2	12	1492587	1492598	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014632	TATAAA	2	12	1508076	1508087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014632	TTTTTG	2	12	1526845	1526856	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014632	TTATAA	2	12	1546320	1546331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014632	CTTACC	2	12	1551389	1551400	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_014632	CTCTTT	2	12	1553394	1553405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_014632	AAAAAT	2	12	1571136	1571147	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014632	ATAATT	2	12	1630515	1630526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014632	TAAATA	2	12	1666492	1666503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014632	AAAATT	2	12	1743935	1743946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014632	ATTTAA	2	12	1745398	1745409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014632	ATTTAA	2	12	1749632	1749643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014632	ATAAAA	2	12	1825888	1825899	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014632	ATAAAA	2	12	1855414	1855425	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014632	TAAAAA	2	12	1856411	1856422	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014632	ATTCCA	2	12	1875425	1875436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_014632	TATTTT	2	12	1878785	1878796	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014632	TCAAAC	2	12	1895407	1895418	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_014632	ATAAAA	2	12	1901393	1901404	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014632	AAAAAG	2	12	1909106	1909117	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014632	TTTATT	2	12	1919429	1919440	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014632	AATTAA	2	12	1940780	1940791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014632	AAAAGA	2	12	1949235	1949246	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014632	GTTTCC	2	12	1949803	1949814	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_014632	TATAAA	2	12	1968443	1968454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014632	CTTTTT	2	12	1999189	1999200	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_014632	TTTAAT	2	12	2006168	2006179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014632	CTTTAA	2	12	2039149	2039160	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_014632	TGTACA	2	12	2041287	2041298	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.