MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Ignicoccus hospitalis KIN4/I chromosome

Total Repeats: 291

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009776	CT	3	6	2043	2048	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_009776	GC	3	6	5674	5679	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009776	TC	3	6	27169	27174	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_009776	GC	3	6	27294	27299	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_009776	CG	3	6	30155	30160	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_009776	CG	3	6	40199	40204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_009776	CT	3	6	40379	40384	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_009776	TC	3	6	56509	56514	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_009776	TC	3	6	58640	58645	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_009776	GC	3	6	65073	65078	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_009776	CG	3	6	69688	69693	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_009776	CG	3	6	69767	69772	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_009776	GT	3	6	74258	74263	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_009776	CG	3	6	84248	84253	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_009776	AT	4	8	84273	84280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009776	GC	3	6	85046	85051	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_009776	CT	3	6	89087	89092	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_009776	TG	4	8	89127	89134	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009776	CT	3	6	89155	89160	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_009776	CT	3	6	89217	89222	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_009776	CT	3	6	89281	89286	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_009776	GA	3	6	89310	89315	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009776	CT	3	6	89353	89358	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_009776	GA	3	6	89530	89535	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009776	TA	3	6	89671	89676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009776	TG	3	6	96756	96761	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009776	AT	3	6	112146	112151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009776	CG	3	6	117747	117752	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_009776	AG	3	6	120451	120456	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009776	AT	3	6	127964	127969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_009776	CG	3	6	131719	131724	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_009776	TC	3	6	134979	134984	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_009776	CT	3	6	135061	135066	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_009776	TA	3	6	142241	142246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009776	CG	3	6	152607	152612	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_009776	TA	3	6	153541	153546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009776	CG	3	6	153648	153653	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_009776	TA	3	6	165048	165053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009776	GA	3	6	169501	169506	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009776	AT	3	6	169524	169529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009776	GC	3	6	178697	178702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_009776	AT	3	6	180976	180981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009776	GA	3	6	181747	181752	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009776	CG	3	6	181763	181768	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_009776	AG	3	6	184135	184140	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009776	CT	3	6	189393	189398	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_009776	CT	3	6	195374	195379	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_009776	GA	3	6	205095	205100	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_009776	CG	3	6	209955	209960	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_009776	GT	3	6	221166	221171	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009776	AG	3	6	223615	223620	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009776	TA	3	6	225202	225207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_009776	CT	3	6	236255	236260	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_009776	CT	3	6	260388	260393	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_009776	CT	3	6	260519	260524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_009776	CT	3	6	260587	260592	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_009776	CT	3	6	260654	260659	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_009776	CT	3	6	260721	260726	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_009776	AT	3	6	260943	260948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009776	GA	3	6	261168	261173	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_009776	CG	3	6	263153	263158	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_009776	CT	3	6	279429	279434	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_009776	TA	3	6	282655	282660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009776	CG	3	6	285435	285440	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_009776	AG	3	6	290629	290634	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009776	AG	3	6	290827	290832	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009776	AG	3	6	290890	290895	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009776	TA	3	6	300183	300188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009776	GC	3	6	305379	305384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_009776	CG	3	6	305386	305391	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_009776	GC	4	8	306560	306567	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_009776	TG	3	6	307998	308003	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009776	GT	3	6	311959	311964	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009776	AT	3	6	320653	320658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009776	GC	3	6	342821	342826	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_009776	TG	3	6	345199	345204	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009776	TC	3	6	349013	349018	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_009776	CG	3	6	349096	349101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_009776	GT	3	6	362981	362986	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009776	CG	3	6	363238	363243	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_009776	CA	3	6	380767	380772	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_009776	GC	3	6	383098	383103	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_009776	AG	3	6	384397	384402	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009776	AG	3	6	384894	384899	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009776	GC	3	6	387968	387973	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_009776	GA	3	6	389053	389058	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009776	GA	3	6	394787	394792	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009776	TC	3	6	402576	402581	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_009776	CT	3	6	403095	403100	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_009776	AG	3	6	404833	404838	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009776	GC	3	6	405596	405601	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_009776	GC	3	6	413495	413500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_009776	TC	3	6	413542	413547	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_009776	TC	3	6	413956	413961	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_009776	CG	3	6	414003	414008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_009776	TC	3	6	414019	414024	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_009776	TC	3	6	414087	414092	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_009776	TC	3	6	414149	414154	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_009776	TC	3	6	414217	414222	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_009776	TC	3	6	414286	414291	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_009776	GA	3	6	414464	414469	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009776	CG	3	6	414635	414640	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_009776	AG	3	6	433207	433212	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009776	GC	3	6	449559	449564	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_009776	GA	3	6	449574	449579	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009776	AG	3	6	453761	453766	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009776	GC	3	6	454605	454610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_009776	CT	3	6	465485	465490	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_009776	CT	3	6	477029	477034	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_009776	GC	3	6	500109	500114	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_009776	AT	3	6	507149	507154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009776	AG	3	6	507298	507303	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009776	CG	3	6	509199	509204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_009776	AT	3	6	512586	512591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009776	CG	3	6	515923	515928	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_009776	GA	3	6	528923	528928	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009776	TC	3	6	544769	544774	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_009776	GC	3	6	544840	544845	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_009776	CT	3	6	556919	556924	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_009776	GA	3	6	556967	556972	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009776	AG	3	6	557166	557171	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009776	AG	3	6	557236	557241	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009776	CT	3	6	557342	557347	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_009776	AG	3	6	557439	557444	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009776	AG	3	6	557567	557572	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009776	AG	3	6	557635	557640	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009776	TC	3	6	557655	557660	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_009776	TA	3	6	571256	571261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009776	GC	3	6	571287	571292	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_009776	GC	3	6	573266	573271	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_009776	AC	3	6	574496	574501	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_009776	GC	3	6	574575	574580	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_009776	TC	3	6	574585	574590	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_009776	CG	4	8	576807	576814	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_009776	AT	3	6	582559	582564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009776	CT	3	6	585551	585556	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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138	NC_009776	AG	3	6	602384	602389	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009776	CT	3	6	603394	603399	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_009776	GC	3	6	604826	604831	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_009776	TC	3	6	610960	610965	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_009776	AG	3	6	634088	634093	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009776	AG	4	8	643763	643770	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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145	NC_009776	CT	3	6	673075	673080	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_009776	CG	3	6	674463	674468	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_009776	TC	3	6	682298	682303	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_009776	CG	3	6	686614	686619	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_009776	TA	3	6	694221	694226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_009776	AT	4	8	713751	713758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_009776	AG	3	6	715954	715959	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_009776	AT	3	6	718316	718321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_009776	GA	3	6	719660	719665	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_009776	TA	3	6	720243	720248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.