MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Idiomarina loihiensis L2TR chromosome

Total Repeats: 2406

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006512	ATA	2	6	107	112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006512	TAA	2	6	142	147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006512	ATA	2	6	3946	3951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006512	CAA	2	6	6401	6406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_006512	CTT	2	6	10926	10931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_006512	AGT	2	6	10957	10962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006512	TAA	2	6	12359	12364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006512	CCT	2	6	12365	12370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_006512	TTG	2	6	14561	14566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006512	TTC	2	6	22780	22785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_006512	ATA	3	9	27367	27375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006512	GTT	2	6	27485	27490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006512	TTA	2	6	27498	27503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006512	CAA	2	6	30393	30398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_006512	TCC	2	6	30412	30417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_006512	TAA	3	9	31347	31355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006512	GTG	2	6	31367	31372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006512	TAA	2	6	32920	32925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006512	AGT	2	6	32975	32980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006512	AAC	2	6	32984	32989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_006512	ATA	2	6	33049	33054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006512	TAA	3	9	33188	33196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006512	AAT	2	6	33198	33203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006512	ATC	2	6	33339	33344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_006512	GTT	2	6	33412	33417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006512	CGC	2	6	36806	36811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_006512	CAA	2	6	37251	37256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_006512	TAA	2	6	37896	37901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006512	TAA	2	6	39589	39594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006512	GTT	2	6	43190	43195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006512	TTA	2	6	44386	44391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006512	CAA	2	6	44435	44440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_006512	ATA	2	6	48393	48398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006512	CAG	2	6	49977	49982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_006512	GCT	2	6	49996	50001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_006512	GCA	2	6	51742	51747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_006512	GCC	2	6	51833	51838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_006512	TCC	2	6	51907	51912	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_006512	CTC	2	6	52094	52099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_006512	GTA	2	6	52152	52157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006512	TCA	2	6	53087	53092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_006512	TGA	2	6	53115	53120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006512	GAA	2	6	54081	54086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006512	CTT	2	6	54095	54100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_006512	TTC	2	6	54155	54160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_006512	CGC	2	6	54215	54220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_006512	TTA	2	6	55165	55170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006512	GCT	2	6	56242	56247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_006512	AAG	2	6	56248	56253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_006512	ATA	2	6	56321	56326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006512	TAG	2	6	56790	56795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006512	CAA	2	6	56828	56833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_006512	TGC	2	6	56849	56854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_006512	TTC	2	6	58531	58536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_006512	CTA	2	6	58617	58622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_006512	CAC	2	6	58668	58673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_006512	TAT	2	6	58699	58704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006512	ATG	2	6	59152	59157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006512	ACG	2	6	59163	59168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_006512	GAC	2	6	59202	59207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_006512	GCT	2	6	59371	59376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_006512	CGG	2	6	59770	59775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_006512	TAA	2	6	61614	61619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006512	TAC	2	6	61743	61748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_006512	ACT	2	6	62319	62324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_006512	TTG	2	6	68010	68015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006512	CTA	2	6	68110	68115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_006512	CAG	2	6	68873	68878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_006512	TCA	2	6	69828	69833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_006512	CAA	2	6	69875	69880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_006512	TCA	2	6	69888	69893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_006512	CAA	2	6	70278	70283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_006512	TCA	2	6	70313	70318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_006512	ACG	2	6	70354	70359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_006512	TTA	2	6	72443	72448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_006512	GCT	2	6	72544	72549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_006512	ATG	2	6	72668	72673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006512	TAA	2	6	72876	72881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_006512	ACC	2	6	73770	73775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_006512	TAA	2	6	73782	73787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_006512	TAA	2	6	73929	73934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_006512	TCA	2	6	74667	74672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_006512	GTC	2	6	74728	74733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_006512	CTC	2	6	76244	76249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_006512	ATT	3	9	79603	79611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_006512	AGT	2	6	79694	79699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_006512	CCT	2	6	80294	80299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_006512	TCA	2	6	80309	80314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_006512	ACG	2	6	80365	80370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_006512	TGG	2	6	80382	80387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_006512	CGT	2	6	80389	80394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_006512	CGC	2	6	81639	81644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_006512	GCG	2	6	83712	83717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_006512	TGA	2	6	83738	83743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_006512	ACT	2	6	83779	83784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_006512	ACG	2	6	84686	84691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_006512	ATA	2	6	89413	89418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_006512	AGC	2	6	89495	89500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_006512	CTC	2	6	91141	91146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_006512	CCG	2	6	91159	91164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_006512	TAT	2	6	91223	91228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_006512	CGA	2	6	91453	91458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_006512	CCT	2	6	92070	92075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_006512	TAG	2	6	92085	92090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_006512	TGC	2	6	94422	94427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_006512	TAA	2	6	94429	94434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_006512	AGC	2	6	94445	94450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_006512	TAA	2	6	94480	94485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_006512	AGC	2	6	94975	94980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_006512	CAG	2	6	99859	99864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_006512	GTT	2	6	101193	101198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_006512	CTT	2	6	108225	108230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_006512	GGC	2	6	108272	108277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_006512	TCC	2	6	110823	110828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_006512	GTA	2	6	110848	110853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_006512	AGA	2	6	111865	111870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_006512	GCT	2	6	111873	111878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_006512	ATT	2	6	111926	111931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_006512	TCT	2	6	116561	116566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_006512	AGC	2	6	116590	116595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_006512	CAA	2	6	116598	116603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_006512	TTA	2	6	116625	116630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_006512	TGT	2	6	116655	116660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_006512	TAA	2	6	116690	116695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_006512	TTA	2	6	116776	116781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_006512	GTT	2	6	116785	116790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_006512	AGA	2	6	116807	116812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_006512	AGG	2	6	116841	116846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_006512	GAG	2	6	117629	117634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_006512	CAC	2	6	119569	119574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_006512	CGT	2	6	121799	121804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_006512	TAA	2	6	125349	125354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_006512	TTA	2	6	128296	128301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_006512	GCA	2	6	130347	130352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_006512	CCA	2	6	134117	134122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_006512	TTA	3	9	134131	134139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_006512	CAC	2	6	135653	135658	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_006512	CTT	2	6	137245	137250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_006512	ATA	2	6	153782	153787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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