MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Ignavibacterium album JCM 16511 chromosome

Total Repeats: 1707

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017464	ATTAAA	2	12	2249	2260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385808588
2	NC_017464	GTGATG	2	12	2584	2595	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385808588
3	NC_017464	TTGATG	2	12	3781	3792	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385808589
4	NC_017464	AGAGGA	2	12	4729	4740	50 %	0 %	50 %	0 %	385808591
5	NC_017464	GCAACC	2	12	11223	11234	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	385808594
6	NC_017464	GCACCA	2	12	12111	12122	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	385808594
7	NC_017464	TTTTAT	2	12	12788	12799	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385808594
8	NC_017464	TGATTT	2	12	14540	14551	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385808595
9	NC_017464	ATTTTT	2	12	15391	15402	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385808596
10	NC_017464	CTGCAA	2	12	25085	25096	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385808602
11	NC_017464	TGAATT	2	12	35089	35100	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385808614
12	NC_017464	TCGCTT	2	12	39307	39318	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385808620
13	NC_017464	TATGTT	2	12	39608	39619	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385808620
14	NC_017464	GCAAGT	2	12	40780	40791	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385808620
15	NC_017464	GAAATT	2	12	42852	42863	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385808621
16	NC_017464	GGCGGA	2	12	43800	43811	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	385808621
17	NC_017464	GAAGCT	2	12	45635	45646	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385808623
18	NC_017464	TTGCAT	2	12	46758	46769	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385808625
19	NC_017464	AAAAAG	2	12	47002	47013	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385808626
20	NC_017464	GACGAA	2	12	48732	48743	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385808628
21	NC_017464	AAGATT	2	12	55992	56003	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385808633
22	NC_017464	AATTGA	2	12	56553	56564	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385808634
23	NC_017464	ACATCA	2	12	58256	58267	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385808637
24	NC_017464	CATTCA	2	12	59515	59526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385808639
25	NC_017464	TTTCTT	2	12	59543	59554	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385808639
26	NC_017464	ATCCTG	2	12	60955	60966	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385808640
27	NC_017464	GCTTCT	2	12	61671	61682	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385808640
28	NC_017464	ATCTTG	2	12	63051	63062	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385808642
29	NC_017464	AATTTC	2	12	70557	70568	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385808651
30	NC_017464	ACATCA	2	12	71137	71148	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385808651
31	NC_017464	TGTACA	2	12	77886	77897	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385808658
32	NC_017464	TATTTT	2	12	78514	78525	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385808658
33	NC_017464	CATAAC	2	12	79254	79265	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385808658
34	NC_017464	TTGAAA	2	12	80280	80291	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385808658
35	NC_017464	ATCATA	2	12	81124	81135	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385808658
36	NC_017464	TTGCAA	2	12	83011	83022	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385808659
37	NC_017464	AAGTTC	2	12	83315	83326	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385808659
38	NC_017464	TTGAAC	2	12	94303	94314	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385808675
39	NC_017464	TAAAGA	2	12	97344	97355	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385808677
40	NC_017464	GAACAA	2	12	108450	108461	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385808697
41	NC_017464	ATTTTT	2	12	114695	114706	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385808706
42	NC_017464	GTTGAT	2	12	116844	116855	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385808709
43	NC_017464	AACTTT	2	12	119016	119027	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385808710
44	NC_017464	CGAATC	2	12	121493	121504	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385808713
45	NC_017464	GAGTTG	2	12	123051	123062	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385808715
46	NC_017464	AAAATA	2	12	123241	123252	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385808715
47	NC_017464	GTTTAT	2	12	124747	124758	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385808717
48	NC_017464	TGTTAT	2	12	124791	124802	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385808717
49	NC_017464	AGTTTG	2	12	125289	125300	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385808717
50	NC_017464	AATTTT	2	12	128992	129003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385808720
51	NC_017464	ATTCAA	2	12	129160	129171	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385808720
52	NC_017464	GGATTA	2	12	129329	129340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385808720
53	NC_017464	TAAAGT	2	12	131160	131171	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385808722
54	NC_017464	ATTATC	2	12	135397	135408	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385808725
55	NC_017464	AAATAT	2	12	136747	136758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385808726
56	NC_017464	CTCAAG	2	12	137251	137262	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385808726
57	NC_017464	TATAAA	2	12	138105	138116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385808728
58	NC_017464	GAAAAA	2	12	145252	145263	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385808731
59	NC_017464	GCAGTT	2	12	147307	147318	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385808735
60	NC_017464	ACTCAG	2	12	147427	147438	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385808735
61	NC_017464	TTATGT	2	12	148462	148473	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385808737
62	NC_017464	CCTTCT	2	12	151050	151061	0 %	50 %	0 %	50 %	385808739
63	NC_017464	AAGAAA	2	12	153235	153246	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385808741
64	NC_017464	TCTTAC	2	12	153922	153933	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385808742
65	NC_017464	ATAATT	2	12	157035	157046	50 %	50 %	0 %	0 %	385808744
66	NC_017464	GAAGTG	2	12	158799	158810	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385808746
67	NC_017464	ACTAAA	2	12	159067	159078	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385808746
68	NC_017464	AAGATG	2	12	160925	160936	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385808747
69	NC_017464	CAATTT	2	12	161600	161611	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385808747
70	NC_017464	AAAGAC	2	12	162026	162037	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385808747
71	NC_017464	AATAAA	2	12	163039	163050	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385808748
72	NC_017464	TCTTTT	2	12	165763	165774	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385808754
73	NC_017464	ACCTTT	2	12	166044	166055	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385808754
74	NC_017464	CTTGTT	2	12	166415	166426	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385808755
75	NC_017464	TTAAAT	2	12	172837	172848	50 %	50 %	0 %	0 %	385808757
76	NC_017464	ATTTAT	2	12	173273	173284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385808758
77	NC_017464	TGTTTG	2	12	173915	173926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385808759
78	NC_017464	TTGCAT	2	12	175808	175819	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385808760
79	NC_017464	TTCAAC	2	12	176198	176209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385808761
80	NC_017464	TGGTTC	2	12	178053	178064	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385808762
81	NC_017464	CAAAAT	2	12	178435	178446	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385808763
82	NC_017464	AGCAAG	2	12	182443	182454	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385808765
83	NC_017464	TGAAAT	2	12	183332	183343	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385808766
84	NC_017464	TTTAAT	2	12	184575	184586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385808766
85	NC_017464	CAATTG	2	12	186168	186179	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385808768
86	NC_017464	CTCAAA	2	12	187390	187401	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385808768
87	NC_017464	TGATTA	2	12	189068	189079	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385808769
88	NC_017464	TATGTA	2	12	189189	189200	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385808769
89	NC_017464	GCTATT	2	12	189669	189680	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385808769
90	NC_017464	ATGTTT	2	12	189850	189861	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385808769
91	NC_017464	TCGGAT	2	12	190063	190074	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385808769
92	NC_017464	TTTGGA	2	12	195503	195514	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385808772
93	NC_017464	TACAGA	2	12	198871	198882	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385808775
94	NC_017464	AAATGT	2	12	202473	202484	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385808777
95	NC_017464	TTTACT	2	12	203258	203269	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385808777
96	NC_017464	TTCAGC	2	12	205373	205384	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385808779
97	NC_017464	TTCTTT	2	12	209607	209618	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385808783
98	NC_017464	GCCTGT	2	12	211610	211621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385808787
99	NC_017464	CTTTTT	2	12	213789	213800	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385808789
100	NC_017464	GAAAAA	2	12	219147	219158	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385808796
101	NC_017464	AAATAA	2	12	222726	222737	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385808799
102	NC_017464	GTAATG	2	12	223781	223792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385808800
103	NC_017464	CAACTG	2	12	224096	224107	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385808800
104	NC_017464	ATCAAT	2	12	231011	231022	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385808804
105	NC_017464	ATCTTT	2	12	231182	231193	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385808804
106	NC_017464	AAAGAA	2	12	231600	231611	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385808804
107	NC_017464	GAAATG	2	12	233159	233170	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385808806
108	NC_017464	TGAATT	2	12	234794	234805	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385808807
109	NC_017464	TTTATC	2	12	238181	238192	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385808811
110	NC_017464	AAAGTA	2	12	240680	240691	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385808814
111	NC_017464	ATTTTT	2	12	244074	244085	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385808817
112	NC_017464	CACCAA	2	12	245189	245200	50 %	0 %	0 %	50 %	385808818
113	NC_017464	AAAGAT	2	12	247298	247309	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385808820
114	NC_017464	TTTACT	2	12	248054	248065	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385808821
115	NC_017464	TTTTGC	2	12	253231	253242	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385808821
116	NC_017464	AATCTG	2	12	255880	255891	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385808826
117	NC_017464	AATTAA	2	12	263043	263054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385808833
118	NC_017464	CAAACA	2	12	264788	264799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385808836
119	NC_017464	TTGCTG	2	12	265145	265156	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385808836
120	NC_017464	ATTCCT	2	12	265684	265695	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385808837
121	NC_017464	AATTGC	2	12	266073	266084	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385808837
122	NC_017464	GAATCA	2	12	271804	271815	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385808842
123	NC_017464	TACTTA	2	12	271868	271879	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385808842
124	NC_017464	TTTGCT	2	12	271978	271989	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385808842
125	NC_017464	GAAAAA	2	12	272227	272238	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385808842
126	NC_017464	CTGAAC	2	12	273167	273178	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385808843
127	NC_017464	TTCAAC	2	12	273568	273579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385808844
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129	NC_017464	ATTTCA	2	12	275291	275302	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385808846
130	NC_017464	ATCAAT	2	12	275491	275502	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385808846
131	NC_017464	TTCATT	2	12	276858	276869	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385808847
132	NC_017464	TTTATT	2	12	277564	277575	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385808847
133	NC_017464	TTGCCG	2	12	277655	277666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385808847
134	NC_017464	AAAATC	2	12	278654	278665	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385808848
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137	NC_017464	AATGGA	2	12	282247	282258	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385808852
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140	NC_017464	AGAATA	2	12	289796	289807	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385808861
141	NC_017464	TAAAAA	2	12	290086	290097	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385808861
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145	NC_017464	AATATC	2	12	296780	296791	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385808867
146	NC_017464	ATCAAC	2	12	297950	297961	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385808867
147	NC_017464	CGATTT	2	12	302053	302064	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385808870
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149	NC_017464	GCAATT	2	12	309658	309669	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385808876
150	NC_017464	AATCAG	2	12	310481	310492	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385808877
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221	NC_017464	AAAACT	2	12	466979	466990	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385809011
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224	NC_017464	TTTTCC	2	12	477148	477159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385809020
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228	NC_017464	TGATAA	2	12	486969	486980	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385809030
229	NC_017464	CGTATT	2	12	490581	490592	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385809032
230	NC_017464	TTGATG	2	12	500756	500767	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385809044
231	NC_017464	ACAGAA	2	12	502217	502228	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385809045
232	NC_017464	TTAGTT	2	12	502905	502916	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385809045
233	NC_017464	AGCTAA	2	12	504619	504630	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385809046
234	NC_017464	ATATTC	2	12	505289	505300	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385809046
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