MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Isoptericola variabilis 225 chromosome

Total Repeats: 100195

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015588	CGG	2	6	34622	34627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335591
1002	NC_015588	GCT	2	6	34652	34657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335591
1003	NC_015588	AGC	2	6	34660	34665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335591
1004	NC_015588	CGA	2	6	34673	34678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335591
1005	NC_015588	CG	3	6	34697	34702	0 %	0 %	50 %	50 %	334335591
1006	NC_015588	TCG	2	6	34717	34722	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335591
1007	NC_015588	CCGCGG	2	12	34745	34756	0 %	0 %	50 %	50 %	334335591
1008	NC_015588	GCT	2	6	34757	34762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335591
1009	NC_015588	TCG	2	6	34771	34776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335591
1010	NC_015588	GC	3	6	34794	34799	0 %	0 %	50 %	50 %	334335591
1011	NC_015588	GCG	2	6	34804	34809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335591
1012	NC_015588	GAG	2	6	34812	34817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334335591
1013	NC_015588	CG	4	8	34844	34851	0 %	0 %	50 %	50 %	334335591
1014	NC_015588	GCC	2	6	34857	34862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334335591
1015	NC_015588	CGGCT	2	10	34869	34878	0 %	20 %	40 %	40 %	334335591
1016	NC_015588	GTCG	2	8	34891	34898	0 %	25 %	50 %	25 %	334335591
1017	NC_015588	AGCC	2	8	34946	34953	25 %	0 %	25 %	50 %	334335591
1018	NC_015588	CG	3	6	34961	34966	0 %	0 %	50 %	50 %	334335592
1019	NC_015588	GCTCCG	3	18	34977	34994	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	334335592
1020	NC_015588	GCTCGG	2	12	34995	35006	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	334335592
1021	NC_015588	GCCG	2	8	35009	35016	0 %	0 %	50 %	50 %	334335592
1022	NC_015588	ACC	2	6	35037	35042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334335592
1023	NC_015588	GAC	2	6	35059	35064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335592
1024	NC_015588	CGT	2	6	35094	35099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335592
1025	NC_015588	GC	3	6	35103	35108	0 %	0 %	50 %	50 %	334335592
1026	NC_015588	ACG	2	6	35129	35134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335592
1027	NC_015588	CGA	2	6	35166	35171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335592
1028	NC_015588	GCG	2	6	35191	35196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335592
1029	NC_015588	CACCG	2	10	35210	35219	20 %	0 %	20 %	60 %	334335592
1030	NC_015588	GCG	2	6	35220	35225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335592
1031	NC_015588	GCC	2	6	35231	35236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334335592
1032	NC_015588	AGC	2	6	35240	35245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335592
1033	NC_015588	CGC	2	6	35305	35310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334335592
1034	NC_015588	GC	3	6	35327	35332	0 %	0 %	50 %	50 %	334335592
1035	NC_015588	TCG	2	6	35339	35344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335592
1036	NC_015588	GTA	2	6	35404	35409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334335592
1037	NC_015588	GCGCG	2	10	35437	35446	0 %	0 %	60 %	40 %	334335592
1038	NC_015588	GCC	2	6	35450	35455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334335592
1039	NC_015588	CGACC	2	10	35541	35550	20 %	0 %	20 %	60 %	334335592
1040	NC_015588	GGT	2	6	35553	35558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334335592
1041	NC_015588	GCC	2	6	35584	35589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334335592
1042	NC_015588	CGGT	2	8	35618	35625	0 %	25 %	50 %	25 %	334335592
1043	NC_015588	GCC	2	6	35660	35665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334335592
1044	NC_015588	TCG	2	6	35675	35680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335592
1045	NC_015588	GAA	2	6	35806	35811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334335592
1046	NC_015588	CG	3	6	35866	35871	0 %	0 %	50 %	50 %	334335592
1047	NC_015588	CG	5	10	35880	35889	0 %	0 %	50 %	50 %	334335592
1048	NC_015588	CGA	2	6	35904	35909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335592
1049	NC_015588	GTC	2	6	35993	35998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335592
1050	NC_015588	GAC	2	6	36086	36091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335593
1051	NC_015588	GCC	2	6	36137	36142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334335593
1052	NC_015588	GCCG	2	8	36194	36201	0 %	0 %	50 %	50 %	334335593
1053	NC_015588	TGC	2	6	36205	36210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335593
1054	NC_015588	CGC	3	9	36213	36221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334335593
1055	NC_015588	AGC	2	6	36222	36227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335593
1056	NC_015588	ACG	2	6	36229	36234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335593
1057	NC_015588	CGC	2	6	36288	36293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334335593
1058	NC_015588	TGC	2	6	36301	36306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335593
1059	NC_015588	CCCA	2	8	36312	36319	25 %	0 %	0 %	75 %	334335593
1060	NC_015588	GAC	2	6	36347	36352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335593
1061	NC_015588	GC	3	6	36380	36385	0 %	0 %	50 %	50 %	334335593
1062	NC_015588	CGG	2	6	36430	36435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335593
1063	NC_015588	CGAG	2	8	36484	36491	25 %	0 %	50 %	25 %	334335593
1064	NC_015588	GGC	2	6	36514	36519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335593
1065	NC_015588	CAC	2	6	36527	36532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334335593
1066	NC_015588	CGC	2	6	36536	36541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334335593
1067	NC_015588	CGT	3	9	36577	36585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335593
1068	NC_015588	GCT	2	6	36592	36597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335593
1069	NC_015588	CGGCG	2	10	36598	36607	0 %	0 %	60 %	40 %	334335593
1070	NC_015588	CGT	2	6	36704	36709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335594
1071	NC_015588	CG	3	6	36722	36727	0 %	0 %	50 %	50 %	334335594
1072	NC_015588	CAGC	2	8	36732	36739	25 %	0 %	25 %	50 %	334335594
1073	NC_015588	CG	3	6	36764	36769	0 %	0 %	50 %	50 %	334335594
1074	NC_015588	CCGCC	2	10	36776	36785	0 %	0 %	20 %	80 %	334335594
1075	NC_015588	CG	3	6	36804	36809	0 %	0 %	50 %	50 %	334335594
1076	NC_015588	CGA	2	6	36836	36841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335594
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1078	NC_015588	CGG	2	6	36855	36860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335594
1079	NC_015588	CGTCGG	2	12	36884	36895	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	334335594
1080	NC_015588	ACG	2	6	36913	36918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335594
1081	NC_015588	GCC	2	6	36965	36970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334335594
1082	NC_015588	GC	3	6	37046	37051	0 %	0 %	50 %	50 %	334335594
1083	NC_015588	GCC	2	6	37071	37076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334335594
1084	NC_015588	CGA	2	6	37142	37147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335594
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1086	NC_015588	GC	3	6	37230	37235	0 %	0 %	50 %	50 %	334335594
1087	NC_015588	GTC	2	6	37239	37244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335594
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1089	NC_015588	GCGCGA	2	12	37310	37321	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	334335594
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1091	NC_015588	CG	3	6	37327	37332	0 %	0 %	50 %	50 %	334335594
1092	NC_015588	CGG	2	6	37360	37365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335594
1093	NC_015588	GCG	2	6	37397	37402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335594
1094	NC_015588	GC	3	6	37423	37428	0 %	0 %	50 %	50 %	334335594
1095	NC_015588	TCG	2	6	37459	37464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335594
1096	NC_015588	TTG	2	6	37465	37470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334335594
1097	NC_015588	GCT	2	6	37511	37516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335594
1098	NC_015588	CAG	2	6	37530	37535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335594
1099	NC_015588	CAG	2	6	37557	37562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335594
1100	NC_015588	ACG	2	6	37588	37593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335594
1101	NC_015588	GC	5	10	37644	37653	0 %	0 %	50 %	50 %	334335594
1102	NC_015588	ACGGC	2	10	37664	37673	20 %	0 %	40 %	40 %	334335594
1103	NC_015588	TCG	2	6	37732	37737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335594
1104	NC_015588	CG	3	6	37742	37747	0 %	0 %	50 %	50 %	334335594
1105	NC_015588	CTG	2	6	37800	37805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335594
1106	NC_015588	CGT	2	6	37829	37834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335594
1107	NC_015588	GTA	2	6	37893	37898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334335594
1108	NC_015588	CG	3	6	37927	37932	0 %	0 %	50 %	50 %	334335594
1109	NC_015588	CGA	2	6	37979	37984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335594
1110	NC_015588	GTC	2	6	38001	38006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335594
1111	NC_015588	GGT	2	6	38066	38071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334335594
1112	NC_015588	CGA	2	6	38072	38077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335594
1113	NC_015588	CGT	2	6	38078	38083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335594
1114	NC_015588	GCC	2	6	38085	38090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334335594
1115	NC_015588	AGC	2	6	38119	38124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335594
1116	NC_015588	CCG	2	6	38129	38134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334335594
1117	NC_015588	CGT	2	6	38207	38212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335594
1118	NC_015588	CGACGT	2	12	38399	38410	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	334335595
1119	NC_015588	GC	4	8	38414	38421	0 %	0 %	50 %	50 %	334335595
1120	NC_015588	ACG	2	6	38428	38433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335595
1121	NC_015588	GAA	2	6	38451	38456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	334335595
1122	NC_015588	CGA	3	9	38489	38497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335595
1123	NC_015588	CG	4	8	38516	38523	0 %	0 %	50 %	50 %	334335595
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1125	NC_015588	CGT	2	6	38585	38590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335595
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1499	NC_015588	CGC	2	6	49591	49596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334335607
1500	NC_015588	GCG	2	6	49608	49613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335607

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