MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Isoptericola variabilis 225 chromosome

Total Repeats: 100195

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015588	AGG	2	6	18707	18712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334335578
502	NC_015588	CCA	2	6	18783	18788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334335578
503	NC_015588	TCG	2	6	18857	18862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335578
504	NC_015588	ACG	2	6	18866	18871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335578
505	NC_015588	CTCG	2	8	18924	18931	0 %	25 %	25 %	50 %	334335578
506	NC_015588	TGC	2	6	18935	18940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335578
507	NC_015588	CGA	2	6	18954	18959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335578
508	NC_015588	TCG	2	6	18962	18967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335578
509	NC_015588	CAC	2	6	18975	18980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334335578
510	NC_015588	GCG	2	6	18986	18991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335578
511	NC_015588	GGGC	2	8	19065	19072	0 %	0 %	75 %	25 %	334335578
512	NC_015588	GCT	2	6	19077	19082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335578
513	NC_015588	GCG	2	6	19103	19108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335578
514	NC_015588	ACG	2	6	19109	19114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335578
515	NC_015588	CGG	2	6	19130	19135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335578
516	NC_015588	CCA	2	6	19152	19157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334335578
517	NC_015588	ACC	2	6	19164	19169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334335578
518	NC_015588	GCC	2	6	19633	19638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334335579
519	NC_015588	GAG	2	6	19639	19644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334335579
520	NC_015588	TCGCCG	2	12	19670	19681	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	334335579
521	NC_015588	GCC	2	6	19708	19713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334335579
522	NC_015588	GCC	2	6	19726	19731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334335579
523	NC_015588	GCC	2	6	19735	19740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334335579
524	NC_015588	CGC	2	6	19752	19757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334335579
525	NC_015588	GTG	2	6	19787	19792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334335579
526	NC_015588	CGACCT	2	12	19794	19805	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	334335579
527	NC_015588	CGGG	2	8	19815	19822	0 %	0 %	75 %	25 %	334335579
528	NC_015588	CCG	2	6	19863	19868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334335579
529	NC_015588	GCGG	2	8	19870	19877	0 %	0 %	75 %	25 %	334335579
530	NC_015588	CGA	2	6	19932	19937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335579
531	NC_015588	CTCGCG	2	12	19963	19974	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	334335579
532	NC_015588	CCGGC	2	10	20010	20019	0 %	0 %	40 %	60 %	334335579
533	NC_015588	TGA	2	6	20034	20039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334335579
534	NC_015588	CTC	2	6	20050	20055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334335579
535	NC_015588	CTC	2	6	20062	20067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334335579
536	NC_015588	CCT	3	9	20115	20123	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334335579
537	NC_015588	TGA	2	6	20226	20231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334335579
538	NC_015588	TCC	2	6	20237	20242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334335579
539	NC_015588	CTC	2	6	20263	20268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334335579
540	NC_015588	CGA	2	6	20277	20282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335579
541	NC_015588	GCC	2	6	20291	20296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334335579
542	NC_015588	TCG	2	6	20315	20320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335579
543	NC_015588	GTCCG	2	10	20356	20365	0 %	20 %	40 %	40 %	334335579
544	NC_015588	GCC	2	6	20410	20415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334335579
545	NC_015588	CTC	2	6	20449	20454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334335579
546	NC_015588	TCC	3	9	20465	20473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334335579
547	NC_015588	GAT	2	6	20500	20505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334335579
548	NC_015588	CTG	2	6	20506	20511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335579
549	NC_015588	GCCGT	2	10	20561	20570	0 %	20 %	40 %	40 %	334335579
550	NC_015588	GCA	2	6	20577	20582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335579
551	NC_015588	GGA	2	6	20583	20588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334335579
552	NC_015588	GAT	2	6	20593	20598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334335579
553	NC_015588	GC	3	6	20613	20618	0 %	0 %	50 %	50 %	334335579
554	NC_015588	GCTGC	2	10	20653	20662	0 %	20 %	40 %	40 %	334335579
555	NC_015588	TCC	3	9	20663	20671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334335579
556	NC_015588	CTC	2	6	20674	20679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334335579
557	NC_015588	GCG	2	6	20696	20701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335579
558	NC_015588	CTG	2	6	20704	20709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335579
559	NC_015588	CGC	2	6	20794	20799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334335579
560	NC_015588	GCG	2	6	20819	20824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335579
561	NC_015588	CGC	2	6	20856	20861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334335579
562	NC_015588	GC	3	6	20860	20865	0 %	0 %	50 %	50 %	334335579
563	NC_015588	CGG	2	6	20892	20897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335579
564	NC_015588	GCTC	2	8	20979	20986	0 %	25 %	25 %	50 %	334335579
565	NC_015588	GCG	2	6	20994	20999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335579
566	NC_015588	CGACGG	2	12	21021	21032	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	334335579
567	NC_015588	CGA	2	6	21042	21047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335579
568	NC_015588	CGG	2	6	21049	21054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335579
569	NC_015588	AGC	2	6	21065	21070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335579
570	NC_015588	CAG	2	6	21076	21081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335579
571	NC_015588	GC	3	6	21106	21111	0 %	0 %	50 %	50 %	334335579
572	NC_015588	CGC	2	6	21123	21128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334335579
573	NC_015588	GC	3	6	21127	21132	0 %	0 %	50 %	50 %	334335579
574	NC_015588	GCGT	2	8	21170	21177	0 %	25 %	50 %	25 %	334335579
575	NC_015588	GTG	2	6	21301	21306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334335579
576	NC_015588	GC	3	6	21318	21323	0 %	0 %	50 %	50 %	334335579
577	NC_015588	CCT	2	6	21351	21356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	334335579
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579	NC_015588	CGA	2	6	21492	21497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335579
580	NC_015588	GGT	2	6	21504	21509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334335579
581	NC_015588	GCC	2	6	21521	21526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334335579
582	NC_015588	CGG	2	6	21536	21541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335579
583	NC_015588	GC	3	6	21544	21549	0 %	0 %	50 %	50 %	334335579
584	NC_015588	ACG	2	6	21555	21560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335579
585	NC_015588	CGGAG	2	10	21576	21585	20 %	0 %	60 %	20 %	334335579
586	NC_015588	GCC	2	6	21646	21651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334335579
587	NC_015588	GTGCTG	2	12	21701	21712	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	334335579
588	NC_015588	CCA	2	6	21714	21719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334335579
589	NC_015588	GTC	2	6	21724	21729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335580
590	NC_015588	CG	4	8	21745	21752	0 %	0 %	50 %	50 %	334335580
591	NC_015588	CAT	2	6	21775	21780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334335580
592	NC_015588	ACG	2	6	21809	21814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335580
593	NC_015588	CGGC	2	8	21825	21832	0 %	0 %	50 %	50 %	334335580
594	NC_015588	CGC	2	6	21841	21846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334335580
595	NC_015588	CGT	2	6	21849	21854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335580
596	NC_015588	CCG	3	9	21857	21865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334335580
597	NC_015588	CG	4	8	21864	21871	0 %	0 %	50 %	50 %	334335580
598	NC_015588	GAG	2	6	21886	21891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334335580
599	NC_015588	ACG	2	6	21893	21898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335580
600	NC_015588	AGC	2	6	21908	21913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335580
601	NC_015588	CGA	2	6	21915	21920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335580
602	NC_015588	CGT	3	9	21961	21969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335580
603	NC_015588	CG	3	6	21977	21982	0 %	0 %	50 %	50 %	334335580
604	NC_015588	GCCG	2	8	22001	22008	0 %	0 %	50 %	50 %	334335580
605	NC_015588	CG	3	6	22043	22048	0 %	0 %	50 %	50 %	334335580
606	NC_015588	CGC	2	6	22073	22078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334335580
607	NC_015588	GCGG	2	8	22090	22097	0 %	0 %	75 %	25 %	334335580
608	NC_015588	CGG	2	6	22108	22113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335580
609	NC_015588	GCG	2	6	22149	22154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335580
610	NC_015588	CCGG	2	8	22223	22230	0 %	0 %	50 %	50 %	334335580
611	NC_015588	GCGAC	2	10	22244	22253	20 %	0 %	40 %	40 %	334335580
612	NC_015588	GTC	2	6	22260	22265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335580
613	NC_015588	GCC	2	6	22268	22273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334335580
614	NC_015588	GC	3	6	22277	22282	0 %	0 %	50 %	50 %	334335580
615	NC_015588	CGG	2	6	22362	22367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335580
616	NC_015588	CGT	2	6	22376	22381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335580
617	NC_015588	CGA	2	6	22407	22412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335580
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619	NC_015588	GCG	2	6	22446	22451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335580
620	NC_015588	GTT	2	6	22459	22464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	334335580
621	NC_015588	GCC	2	6	22512	22517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334335580
622	NC_015588	CGG	2	6	22518	22523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335580
623	NC_015588	CGA	2	6	22536	22541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335580
624	NC_015588	GCGA	2	8	22661	22668	25 %	0 %	50 %	25 %	334335580
625	NC_015588	CGC	2	6	22692	22697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334335580
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627	NC_015588	CGC	2	6	22707	22712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334335580
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753	NC_015588	GCG	2	6	26627	26632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335583
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871	NC_015588	CCGG	2	8	30665	30672	0 %	0 %	50 %	50 %	334335586
872	NC_015588	CGT	2	6	30724	30729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335586
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874	NC_015588	CGT	2	6	30775	30780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335586
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