MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Isosphaera pallida ATCC 43644 chromosome

Total Repeats: 105358

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_014962	TTG	2	6	175817	175822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320101675
3502	NC_014962	TCG	2	6	175841	175846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101675
3503	NC_014962	GCC	2	6	175858	175863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101675
3504	NC_014962	GTTGGT	2	12	175914	175925	0 %	50 %	50 %	0 %	320101675
3505	NC_014962	CGG	2	6	175988	175993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101675
3506	NC_014962	GGT	2	6	176004	176009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101675
3507	NC_014962	T	6	6	176009	176014	0 %	100 %	0 %	0 %	320101675
3508	NC_014962	CCA	2	6	176030	176035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101675
3509	NC_014962	GAA	2	6	176128	176133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320101675
3510	NC_014962	GAA	2	6	176194	176199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320101675
3511	NC_014962	CCG	2	6	176255	176260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101675
3512	NC_014962	GAACG	2	10	176314	176323	40 %	0 %	40 %	20 %	320101675
3513	NC_014962	CAA	2	6	176353	176358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320101675
3514	NC_014962	GCCG	2	8	176409	176416	0 %	0 %	50 %	50 %	320101675
3515	NC_014962	TCG	2	6	176444	176449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101675
3516	NC_014962	TGACC	2	10	176451	176460	20 %	20 %	20 %	40 %	320101675
3517	NC_014962	TCGCC	2	10	176465	176474	0 %	20 %	20 %	60 %	320101675
3518	NC_014962	GGT	2	6	176519	176524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101675
3519	NC_014962	GCT	2	6	176538	176543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101675
3520	NC_014962	GGA	2	6	176669	176674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320101676
3521	NC_014962	CAC	2	6	176708	176713	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101676
3522	NC_014962	GGCT	2	8	176755	176762	0 %	25 %	50 %	25 %	320101676
3523	NC_014962	GCC	2	6	176775	176780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101676
3524	NC_014962	TCG	2	6	176820	176825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101676
3525	NC_014962	GTT	2	6	176851	176856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320101676
3526	NC_014962	CAT	2	6	176954	176959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320101676
3527	NC_014962	AC	3	6	176980	176985	50 %	0 %	0 %	50 %	320101676
3528	NC_014962	CGG	2	6	177061	177066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101676
3529	NC_014962	GTG	2	6	177104	177109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101676
3530	NC_014962	CCA	2	6	177122	177127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101676
3531	NC_014962	TGAA	2	8	177144	177151	50 %	25 %	25 %	0 %	320101676
3532	NC_014962	CCAG	2	8	177175	177182	25 %	0 %	25 %	50 %	320101676
3533	NC_014962	GGC	2	6	177210	177215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101676
3534	NC_014962	CGG	2	6	177220	177225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101676
3535	NC_014962	TCC	2	6	177423	177428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320101676
3536	NC_014962	TGA	2	6	177444	177449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320101676
3537	NC_014962	GTT	2	6	177458	177463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320101676
3538	NC_014962	GCC	2	6	177478	177483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101676
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3540	NC_014962	CGA	2	6	177724	177729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101676
3541	NC_014962	AGGGG	2	10	177844	177853	20 %	0 %	80 %	0 %	320101677
3542	NC_014962	GTC	2	6	177873	177878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101677
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3544	NC_014962	TCG	2	6	177911	177916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101677
3545	NC_014962	GGGC	2	8	177926	177933	0 %	0 %	75 %	25 %	320101677
3546	NC_014962	TGCG	2	8	177960	177967	0 %	25 %	50 %	25 %	320101677
3547	NC_014962	GGA	2	6	178011	178016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320101677
3548	NC_014962	GGC	2	6	178084	178089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101677
3549	NC_014962	TGA	2	6	178136	178141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320101677
3550	NC_014962	ACG	2	6	178145	178150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101677
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3552	NC_014962	CGT	2	6	178188	178193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101677
3553	NC_014962	GGGT	2	8	178214	178221	0 %	25 %	75 %	0 %	320101677
3554	NC_014962	GGT	2	6	178243	178248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101677
3555	NC_014962	ACC	3	9	178394	178402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101677
3556	NC_014962	CG	3	6	178407	178412	0 %	0 %	50 %	50 %	320101677
3557	NC_014962	TCGA	2	8	178415	178422	25 %	25 %	25 %	25 %	320101677
3558	NC_014962	TGA	2	6	178449	178454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320101677
3559	NC_014962	CGG	2	6	178464	178469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101677
3560	NC_014962	CCA	2	6	178521	178526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101677
3561	NC_014962	ATC	2	6	178652	178657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320101677
3562	NC_014962	CGG	2	6	178683	178688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101677
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3564	NC_014962	CGT	2	6	178788	178793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101677
3565	NC_014962	GTG	2	6	178919	178924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101677
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3570	NC_014962	CCG	2	6	179584	179589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101678
3571	NC_014962	CGG	2	6	179659	179664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101678
3572	NC_014962	CCG	2	6	179701	179706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101678
3573	NC_014962	TGA	2	6	179765	179770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320101678
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3575	NC_014962	CGA	2	6	179831	179836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101678
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3577	NC_014962	CGA	2	6	179894	179899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101678
3578	NC_014962	GCG	2	6	179914	179919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101678
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3584	NC_014962	CG	3	6	180235	180240	0 %	0 %	50 %	50 %	320101678
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3594	NC_014962	GC	3	6	180751	180756	0 %	0 %	50 %	50 %	320101678
3595	NC_014962	GCC	2	6	180772	180777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101678
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3601	NC_014962	GCCGTT	2	12	181086	181097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101678
3602	NC_014962	CCT	2	6	181136	181141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320101678
3603	NC_014962	CGA	2	6	181178	181183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101678
3604	NC_014962	ACG	2	6	181227	181232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101678
3605	NC_014962	GCA	2	6	181253	181258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101678
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3607	NC_014962	AGGCC	2	10	181388	181397	20 %	0 %	40 %	40 %	320101678
3608	NC_014962	TGA	2	6	181450	181455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320101678
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3610	NC_014962	CG	3	6	181468	181473	0 %	0 %	50 %	50 %	320101678
3611	NC_014962	GAC	2	6	181548	181553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101678
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3613	NC_014962	GATC	2	8	181628	181635	25 %	25 %	25 %	25 %	320101678
3614	NC_014962	AGTA	2	8	181733	181740	50 %	25 %	25 %	0 %	320101678
3615	NC_014962	GGA	2	6	181775	181780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320101678
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3839	NC_014962	G	7	7	190079	190085	0 %	0 %	100 %	0 %	320101680
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3846	NC_014962	GTC	2	6	190328	190333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101680
3847	NC_014962	GCG	3	9	190340	190348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101680
3848	NC_014962	GCG	2	6	190374	190379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101680
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3860	NC_014962	ACCG	2	8	190974	190981	25 %	0 %	25 %	50 %	320101680
3861	NC_014962	CCG	2	6	191001	191006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101680
3862	NC_014962	TCC	2	6	191010	191015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320101680
3863	NC_014962	CGT	2	6	191068	191073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101680
3864	NC_014962	GCC	2	6	191110	191115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101680
3865	NC_014962	CGC	2	6	191173	191178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101680
3866	NC_014962	C	7	7	191203	191209	0 %	0 %	0 %	100 %	320101680
3867	NC_014962	ACG	2	6	191229	191234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101680
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3870	NC_014962	TGG	2	6	191364	191369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101680
3871	NC_014962	CCG	2	6	191680	191685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101681
3872	NC_014962	GAT	2	6	191687	191692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320101681
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3880	NC_014962	GATGGT	2	12	192194	192205	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	320101681
3881	NC_014962	CGC	2	6	192208	192213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101681
3882	NC_014962	GTT	2	6	192215	192220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320101681
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3885	NC_014962	AGT	2	6	192307	192312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320101681
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3888	NC_014962	CGA	2	6	192359	192364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101681
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3893	NC_014962	GCG	2	6	192650	192655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101681
3894	NC_014962	GCC	2	6	192657	192662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101681
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3898	NC_014962	ACG	2	6	192764	192769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101681
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3911	NC_014962	CCCT	2	8	194526	194533	0 %	25 %	0 %	75 %	320101682
3912	NC_014962	ATC	2	6	194576	194581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320101682
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3954	NC_014962	CT	3	6	197171	197176	0 %	50 %	0 %	50 %	320101685
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3968	NC_014962	AATG	2	8	197720	197727	50 %	25 %	25 %	0 %	320101685
3969	NC_014962	TG	3	6	197726	197731	0 %	50 %	50 %	0 %	320101685
3970	NC_014962	TCG	2	6	198160	198165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101686
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3978	NC_014962	AGCGC	2	10	198604	198613	20 %	0 %	40 %	40 %	320101686
3979	NC_014962	CGA	2	6	198629	198634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101686
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3981	NC_014962	GAG	2	6	198657	198662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320101686
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3983	NC_014962	CG	3	6	198761	198766	0 %	0 %	50 %	50 %	320101686
3984	NC_014962	GGC	2	6	198789	198794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101686
3985	NC_014962	GAG	2	6	198822	198827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320101686
3986	NC_014962	CGG	2	6	198912	198917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101686
3987	NC_014962	TCG	2	6	198934	198939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101686
3988	NC_014962	CTG	2	6	199014	199019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101686
3989	NC_014962	CGA	2	6	199136	199141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101686
3990	NC_014962	GGC	2	6	199147	199152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101686
3991	NC_014962	GACC	2	8	199172	199179	25 %	0 %	25 %	50 %	320101686
3992	NC_014962	GCC	2	6	199193	199198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101686
3993	NC_014962	CTG	2	6	199203	199208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101686
3994	NC_014962	AGCC	2	8	199225	199232	25 %	0 %	25 %	50 %	320101686
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4000	NC_014962	GC	3	6	199549	199554	0 %	0 %	50 %	50 %	320101687

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