MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Isosphaera pallida ATCC 43644 chromosome

Total Repeats: 105358

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
105001	NC_014962	GC	3	6	5456147	5456152	0 %	0 %	50 %	50 %	320105233
105002	NC_014962	GGA	2	6	5456240	5456245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320105233
105003	NC_014962	CAGACG	2	12	5456250	5456261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320105233
105004	NC_014962	TGA	2	6	5456300	5456305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320105233
105005	NC_014962	CCGC	2	8	5456315	5456322	0 %	0 %	25 %	75 %	320105233
105006	NC_014962	GC	3	6	5456370	5456375	0 %	0 %	50 %	50 %	320105233
105007	NC_014962	ACCA	2	8	5456424	5456431	50 %	0 %	0 %	50 %	320105233
105008	NC_014962	CAT	2	6	5456436	5456441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320105233
105009	NC_014962	CGA	2	6	5456488	5456493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320105233
105010	NC_014962	GTG	2	6	5456530	5456535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320105233
105011	NC_014962	GCT	2	6	5456560	5456565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320105233
105012	NC_014962	GC	3	6	5456595	5456600	0 %	0 %	50 %	50 %	320105233
105013	NC_014962	GAT	3	9	5457201	5457209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320105234
105014	NC_014962	CG	3	6	5457240	5457245	0 %	0 %	50 %	50 %	320105234
105015	NC_014962	CG	3	6	5457275	5457280	0 %	0 %	50 %	50 %	320105234
105016	NC_014962	CGCGC	2	10	5457299	5457308	0 %	0 %	40 %	60 %	320105234
105017	NC_014962	CCG	2	6	5457329	5457334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320105234
105018	NC_014962	GCT	2	6	5457372	5457377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320105234
105019	NC_014962	TTTGTT	2	12	5457411	5457422	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	320105234
105020	NC_014962	CGA	2	6	5457446	5457451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320105234
105021	NC_014962	CGA	2	6	5457453	5457458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320105234
105022	NC_014962	GCG	2	6	5457459	5457464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320105234
105023	NC_014962	ACGA	2	8	5457478	5457485	50 %	0 %	25 %	25 %	320105234
105024	NC_014962	CGG	2	6	5457486	5457491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320105234
105025	NC_014962	GGT	4	12	5457492	5457503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320105234
105026	NC_014962	ACG	2	6	5457572	5457577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320105234
105027	NC_014962	CCT	2	6	5457587	5457592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320105234
105028	NC_014962	GGC	2	6	5457688	5457693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320105234
105029	NC_014962	GTG	2	6	5457706	5457711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320105234
105030	NC_014962	GCG	2	6	5457717	5457722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320105234
105031	NC_014962	CGG	2	6	5457759	5457764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320105234
105032	NC_014962	TGG	3	9	5457770	5457778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320105234
105033	NC_014962	TCG	2	6	5457802	5457807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320105234
105034	NC_014962	CCGA	2	8	5457826	5457833	25 %	0 %	25 %	50 %	320105234
105035	NC_014962	GCG	2	6	5457849	5457854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320105234
105036	NC_014962	CAACG	2	10	5457892	5457901	40 %	0 %	20 %	40 %	320105234
105037	NC_014962	TGC	2	6	5457929	5457934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320105234
105038	NC_014962	CGC	2	6	5457935	5457940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320105234
105039	NC_014962	CGGCTC	2	12	5457947	5457958	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	320105234
105040	NC_014962	CCCGGT	2	12	5458000	5458011	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	320105234
105041	NC_014962	GCC	2	6	5458035	5458040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320105234
105042	NC_014962	CAC	2	6	5458050	5458055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320105234
105043	NC_014962	CCA	2	6	5458133	5458138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320105234
105044	NC_014962	CCT	2	6	5458200	5458205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320105234
105045	NC_014962	GGC	2	6	5458216	5458221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320105234
105046	NC_014962	CT	3	6	5458225	5458230	0 %	50 %	0 %	50 %	320105234
105047	NC_014962	ATTT	2	8	5458352	5458359	25 %	75 %	0 %	0 %	320105234
105048	NC_014962	GAA	2	6	5458453	5458458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320105234
105049	NC_014962	CG	3	6	5458672	5458677	0 %	0 %	50 %	50 %	320105235
105050	NC_014962	CGG	2	6	5458690	5458695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320105235
105051	NC_014962	ACA	2	6	5458735	5458740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320105235
105052	NC_014962	GTCG	2	8	5458752	5458759	0 %	25 %	50 %	25 %	320105235
105053	NC_014962	GGT	2	6	5458766	5458771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320105235
105054	NC_014962	GGC	2	6	5458791	5458796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320105235
105055	NC_014962	ATG	3	9	5458828	5458836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320105235
105056	NC_014962	CCG	2	6	5458842	5458847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320105235
105057	NC_014962	CAG	2	6	5458884	5458889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320105235
105058	NC_014962	TCA	2	6	5458919	5458924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320105235
105059	NC_014962	CAA	2	6	5458944	5458949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320105235
105060	NC_014962	CGC	2	6	5458955	5458960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320105235
105061	NC_014962	G	6	6	5459060	5459065	0 %	0 %	100 %	0 %	320105235
105062	NC_014962	TCCC	2	8	5459136	5459143	0 %	25 %	0 %	75 %	320105235
105063	NC_014962	TGC	2	6	5459150	5459155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320105235
105064	NC_014962	ACCTG	2	10	5459176	5459185	20 %	20 %	20 %	40 %	320105235
105065	NC_014962	CCAACC	2	12	5459282	5459293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320105235
105066	NC_014962	CGT	2	6	5459306	5459311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320105235
105067	NC_014962	CTC	2	6	5459318	5459323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320105235
105068	NC_014962	TCC	2	6	5459335	5459340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320105235
105069	NC_014962	CCG	2	6	5459364	5459369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320105235
105070	NC_014962	TCG	2	6	5459374	5459379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320105235
105071	NC_014962	AGC	2	6	5459380	5459385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320105235
105072	NC_014962	GAG	2	6	5459520	5459525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320105236
105073	NC_014962	CGCAG	2	10	5459537	5459546	20 %	0 %	40 %	40 %	320105236
105074	NC_014962	TGA	2	6	5459551	5459556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320105236
105075	NC_014962	GATG	2	8	5459582	5459589	25 %	25 %	50 %	0 %	320105236
105076	NC_014962	CTG	2	6	5459655	5459660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320105236
105077	NC_014962	TGG	2	6	5459668	5459673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320105236
105078	NC_014962	GGC	2	6	5459728	5459733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320105236
105079	NC_014962	CTG	2	6	5459769	5459774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320105236
105080	NC_014962	CACC	2	8	5459777	5459784	25 %	0 %	0 %	75 %	320105236
105081	NC_014962	ACTC	2	8	5459823	5459830	25 %	25 %	0 %	50 %	320105236
105082	NC_014962	GGA	2	6	5459849	5459854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320105236
105083	NC_014962	CAC	2	6	5459894	5459899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320105236
105084	NC_014962	TAT	2	6	5459909	5459914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320105236
105085	NC_014962	CGACCT	2	12	5459936	5459947	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	320105236
105086	NC_014962	CCG	2	6	5459968	5459973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320105236
105087	NC_014962	GTT	2	6	5460017	5460022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320105236
105088	NC_014962	CCG	2	6	5460155	5460160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320105236
105089	NC_014962	CGA	2	6	5460167	5460172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320105236
105090	NC_014962	TGG	2	6	5460197	5460202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320105236
105091	NC_014962	GTC	2	6	5460384	5460389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320105237
105092	NC_014962	GTG	3	9	5460417	5460425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320105237
105093	NC_014962	ATCGA	2	10	5460489	5460498	40 %	20 %	20 %	20 %	320105237
105094	NC_014962	GGT	3	9	5460527	5460535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320105237
105095	NC_014962	TCGT	2	8	5460576	5460583	0 %	50 %	25 %	25 %	320105237
105096	NC_014962	GCC	2	6	5460634	5460639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320105237
105097	NC_014962	CGA	2	6	5460716	5460721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320105237
105098	NC_014962	ACG	2	6	5460864	5460869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320105237
105099	NC_014962	GCC	2	6	5460933	5460938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320105237
105100	NC_014962	CGG	2	6	5460964	5460969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320105237
105101	NC_014962	TCC	2	6	5461093	5461098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320105237
105102	NC_014962	CGC	2	6	5461121	5461126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320105237
105103	NC_014962	CGA	2	6	5461136	5461141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320105237
105104	NC_014962	CTC	2	6	5461156	5461161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320105237
105105	NC_014962	GGT	2	6	5461169	5461174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320105237
105106	NC_014962	GAC	2	6	5461187	5461192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320105237
105107	NC_014962	CGA	2	6	5461232	5461237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320105237
105108	NC_014962	GTG	2	6	5461263	5461268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320105237
105109	NC_014962	CGT	2	6	5461280	5461285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320105237
105110	NC_014962	CG	3	6	5461289	5461294	0 %	0 %	50 %	50 %	320105237
105111	NC_014962	CCG	2	6	5461369	5461374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320105237
105112	NC_014962	ACCCA	2	10	5461534	5461543	40 %	0 %	0 %	60 %	320105237
105113	NC_014962	GCG	2	6	5461559	5461564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320105237
105114	NC_014962	CG	3	6	5461604	5461609	0 %	0 %	50 %	50 %	320105237
105115	NC_014962	GTG	2	6	5461659	5461664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320105237
105116	NC_014962	CG	3	6	5461710	5461715	0 %	0 %	50 %	50 %	320105237
105117	NC_014962	CGA	2	6	5461727	5461732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320105237
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105217	NC_014962	CGC	2	6	5465881	5465886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320105239
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105225	NC_014962	TCC	2	6	5466214	5466219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320105239
105226	NC_014962	CTC	2	6	5466282	5466287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320105240
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105228	NC_014962	GCG	2	6	5466350	5466355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320105240
105229	NC_014962	TCG	2	6	5466393	5466398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320105240
105230	NC_014962	GGCA	2	8	5466484	5466491	25 %	0 %	50 %	25 %	320105240
105231	NC_014962	TCG	2	6	5466513	5466518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320105240
105232	NC_014962	CGG	2	6	5466559	5466564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320105240
105233	NC_014962	GCG	2	6	5466591	5466596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320105240
105234	NC_014962	CGAC	2	8	5466613	5466620	25 %	0 %	25 %	50 %	320105240
105235	NC_014962	GAG	2	6	5466644	5466649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320105240
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105237	NC_014962	GAG	2	6	5466734	5466739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320105240
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105240	NC_014962	GGCT	2	8	5466882	5466889	0 %	25 %	50 %	25 %	320105240
105241	NC_014962	GAG	2	6	5466914	5466919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320105240
105242	NC_014962	CGT	3	9	5466929	5466937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320105240
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105246	NC_014962	GTC	2	6	5467061	5467066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320105240
105247	NC_014962	GAG	2	6	5467067	5467072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320105240
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105256	NC_014962	TGC	2	6	5467347	5467352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320105240
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105331	NC_014962	TCT	2	6	5471355	5471360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320105245
105332	NC_014962	GAT	2	6	5471391	5471396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320105245
105333	NC_014962	GCG	2	6	5471439	5471444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320105245
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105335	NC_014962	AGCG	2	8	5471486	5471493	25 %	0 %	50 %	25 %	320105245
105336	NC_014962	CGG	2	6	5471499	5471504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320105245
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105338	NC_014962	CG	3	6	5471558	5471563	0 %	0 %	50 %	50 %	320105245
105339	NC_014962	CCA	2	6	5471583	5471588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320105245
105340	NC_014962	GGT	2	6	5471644	5471649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320105245
105341	NC_014962	GGCCTC	2	12	5471725	5471736	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	320105245
105342	NC_014962	TGG	2	6	5471754	5471759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320105245
105343	NC_014962	GGA	2	6	5471875	5471880	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320105245
105344	NC_014962	GAT	2	6	5471944	5471949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320105245
105345	NC_014962	GAT	2	6	5472034	5472039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320105245
105346	NC_014962	CCG	2	6	5472103	5472108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320105245
105347	NC_014962	GTCG	2	8	5472126	5472133	0 %	25 %	50 %	25 %	320105245
105348	NC_014962	CGA	2	6	5472165	5472170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320105245
105349	NC_014962	CG	3	6	5472191	5472196	0 %	0 %	50 %	50 %	320105245
105350	NC_014962	GTC	2	6	5472391	5472396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320105245
105351	NC_014962	TCG	2	6	5472497	5472502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320105245
105352	NC_014962	GGC	2	6	5472561	5472566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320105245
105353	NC_014962	GCCG	2	8	5472658	5472665	0 %	0 %	50 %	50 %	320105245
105354	NC_014962	GTCCCG	2	12	5472685	5472696	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	320105245
105355	NC_014962	GGCC	2	8	5472700	5472707	0 %	0 %	50 %	50 %	320105245
105356	NC_014962	CGA	2	6	5472745	5472750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320105245
105357	NC_014962	CGA	2	6	5472760	5472765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320105245
105358	NC_014962	GGA	2	6	5472772	5472777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320105245

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