MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Isosphaera pallida ATCC 43644 chromosome

Total Repeats: 105358

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_014962	TGA	2	6	275710	275715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320101741
5502	NC_014962	CCG	2	6	275743	275748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101741
5503	NC_014962	AC	3	6	275750	275755	50 %	0 %	0 %	50 %	320101741
5504	NC_014962	ATT	2	6	275874	275879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320101741
5505	NC_014962	GGTC	2	8	275891	275898	0 %	25 %	50 %	25 %	320101741
5506	NC_014962	GAG	2	6	276057	276062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320101741
5507	NC_014962	GC	3	6	276127	276132	0 %	0 %	50 %	50 %	320101741
5508	NC_014962	GGC	2	6	276135	276140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101741
5509	NC_014962	CGA	2	6	276146	276151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101741
5510	NC_014962	CGAACC	2	12	276212	276223	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	320101741
5511	NC_014962	GCC	2	6	276224	276229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101741
5512	NC_014962	CGA	2	6	276233	276238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101741
5513	NC_014962	GAG	2	6	276294	276299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320101741
5514	NC_014962	GGC	2	6	276323	276328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101741
5515	NC_014962	GCC	2	6	276436	276441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101741
5516	NC_014962	CCG	2	6	276553	276558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101741
5517	NC_014962	TGGA	2	8	276561	276568	25 %	25 %	50 %	0 %	320101741
5518	NC_014962	CG	3	6	276652	276657	0 %	0 %	50 %	50 %	320101741
5519	NC_014962	CCG	2	6	276685	276690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101741
5520	NC_014962	GTC	2	6	276693	276698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101741
5521	NC_014962	ACCG	2	8	276699	276706	25 %	0 %	25 %	50 %	320101741
5522	NC_014962	GTT	2	6	276731	276736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320101741
5523	NC_014962	CG	3	6	276903	276908	0 %	0 %	50 %	50 %	320101741
5524	NC_014962	G	6	6	276914	276919	0 %	0 %	100 %	0 %	320101741
5525	NC_014962	GGT	2	6	276932	276937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101741
5526	NC_014962	CTCGA	2	10	276942	276951	20 %	20 %	20 %	40 %	320101741
5527	NC_014962	GAG	2	6	276960	276965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320101741
5528	NC_014962	ATG	2	6	277134	277139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320101742
5529	NC_014962	GTTCG	2	10	277156	277165	0 %	40 %	40 %	20 %	320101742
5530	NC_014962	GTCGC	2	10	277250	277259	0 %	20 %	40 %	40 %	320101742
5531	NC_014962	GGC	2	6	277280	277285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101742
5532	NC_014962	GTC	2	6	277300	277305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101742
5533	NC_014962	GTC	2	6	277365	277370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101742
5534	NC_014962	CG	3	6	277390	277395	0 %	0 %	50 %	50 %	320101742
5535	NC_014962	CGAGC	2	10	277515	277524	20 %	0 %	40 %	40 %	320101742
5536	NC_014962	CGGGTT	2	12	277565	277576	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	320101742
5537	NC_014962	CCA	2	6	277578	277583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101742
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5539	NC_014962	CCA	2	6	277659	277664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101742
5540	NC_014962	CGG	2	6	277698	277703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101742
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5542	NC_014962	CAG	2	6	277834	277839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101742
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5544	NC_014962	CGT	2	6	277916	277921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101742
5545	NC_014962	CCG	2	6	277947	277952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101742
5546	NC_014962	CAC	3	9	277969	277977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101742
5547	NC_014962	GC	3	6	278076	278081	0 %	0 %	50 %	50 %	320101742
5548	NC_014962	GCCC	2	8	278148	278155	0 %	0 %	25 %	75 %	320101742
5549	NC_014962	GC	3	6	278197	278202	0 %	0 %	50 %	50 %	320101742
5550	NC_014962	TGC	2	6	278208	278213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101742
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5552	NC_014962	CACCGC	2	12	278308	278319	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	320101742
5553	NC_014962	CGG	2	6	278388	278393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101742
5554	NC_014962	GGCGT	2	10	278444	278453	0 %	20 %	60 %	20 %	320101742
5555	NC_014962	G	9	9	278461	278469	0 %	0 %	100 %	0 %	320101742
5556	NC_014962	TTG	2	6	278521	278526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320101742
5557	NC_014962	GTC	2	6	278537	278542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101742
5558	NC_014962	GAGC	2	8	278558	278565	25 %	0 %	50 %	25 %	320101742
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5560	NC_014962	CCA	2	6	278615	278620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101742
5561	NC_014962	GTC	2	6	278626	278631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101742
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5563	NC_014962	TCG	2	6	278645	278650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101742
5564	NC_014962	CCAGG	2	10	278780	278789	20 %	0 %	40 %	40 %	320101743
5565	NC_014962	GAG	2	6	278799	278804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320101743
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5567	NC_014962	CGG	3	9	278923	278931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101743
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5569	NC_014962	TGCC	2	8	279024	279031	0 %	25 %	25 %	50 %	320101743
5570	NC_014962	GCA	2	6	279057	279062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101743
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5573	NC_014962	GAA	2	6	279311	279316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320101743
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5577	NC_014962	CG	3	6	279419	279424	0 %	0 %	50 %	50 %	320101743
5578	NC_014962	GTCCC	2	10	279445	279454	0 %	20 %	20 %	60 %	320101743
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5590	NC_014962	CGT	2	6	280304	280309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101744
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5593	NC_014962	G	6	6	280351	280356	0 %	0 %	100 %	0 %	320101744
5594	NC_014962	CGC	2	6	280398	280403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101744
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5600	NC_014962	GC	3	6	280600	280605	0 %	0 %	50 %	50 %	320101744
5601	NC_014962	TC	3	6	280617	280622	0 %	50 %	0 %	50 %	320101744
5602	NC_014962	GAG	2	6	280654	280659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320101744
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5604	NC_014962	AGCC	2	8	280743	280750	25 %	0 %	25 %	50 %	320101744
5605	NC_014962	CG	3	6	280767	280772	0 %	0 %	50 %	50 %	320101744
5606	NC_014962	CG	3	6	281353	281358	0 %	0 %	50 %	50 %	320101745
5607	NC_014962	AGGC	2	8	281393	281400	25 %	0 %	50 %	25 %	320101745
5608	NC_014962	GAA	2	6	281442	281447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320101745
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5610	NC_014962	GGTG	2	8	281490	281497	0 %	25 %	75 %	0 %	320101745
5611	NC_014962	CAG	2	6	281521	281526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101745
5612	NC_014962	CAG	2	6	281545	281550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101745
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5614	NC_014962	CAGA	2	8	281650	281657	50 %	0 %	25 %	25 %	320101745
5615	NC_014962	CATG	2	8	281676	281683	25 %	25 %	25 %	25 %	320101745
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5618	NC_014962	TAC	2	6	281925	281930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320101745
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5621	NC_014962	CAG	2	6	282007	282012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101745
5622	NC_014962	CGC	2	6	282035	282040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101745
5623	NC_014962	TCAACA	2	12	282057	282068	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	320101745
5624	NC_014962	GTCG	2	8	282078	282085	0 %	25 %	50 %	25 %	320101745
5625	NC_014962	GAG	2	6	282152	282157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320101745
5626	NC_014962	GCC	2	6	282203	282208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101745
5627	NC_014962	GCG	2	6	282212	282217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101745
5628	NC_014962	AGGT	2	8	282257	282264	25 %	25 %	50 %	0 %	320101745
5629	NC_014962	CGG	3	9	282288	282296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101745
5630	NC_014962	CCAG	2	8	282372	282379	25 %	0 %	25 %	50 %	320101745
5631	NC_014962	GCC	2	6	282391	282396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101745
5632	NC_014962	TTC	2	6	282397	282402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320101745
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5634	NC_014962	CGA	2	6	282423	282428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101745
5635	NC_014962	AGCACC	2	12	282461	282472	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	320101745
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5643	NC_014962	CG	3	6	282735	282740	0 %	0 %	50 %	50 %	320101745
5644	NC_014962	TGT	2	6	282753	282758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320101745
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5647	NC_014962	AAG	2	6	282884	282889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320101745
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5651	NC_014962	CG	3	6	283021	283026	0 %	0 %	50 %	50 %	320101745
5652	NC_014962	GTC	2	6	283033	283038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101745
5653	NC_014962	GGCT	2	8	283041	283048	0 %	25 %	50 %	25 %	320101745
5654	NC_014962	G	7	7	283125	283131	0 %	0 %	100 %	0 %	320101745
5655	NC_014962	TCG	2	6	283191	283196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101745
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5664	NC_014962	GTC	2	6	283917	283922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101746
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5689	NC_014962	CGC	2	6	284577	284582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101747
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5727	NC_014962	GC	4	8	286204	286211	0 %	0 %	50 %	50 %	320101748
5728	NC_014962	GAC	2	6	286212	286217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101748
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5730	NC_014962	CAACC	2	10	286272	286281	40 %	0 %	0 %	60 %	320101748
5731	NC_014962	CGGGG	2	10	286760	286769	0 %	0 %	80 %	20 %	320101749
5732	NC_014962	GCCG	2	8	286793	286800	0 %	0 %	50 %	50 %	320101749
5733	NC_014962	CG	3	6	286799	286804	0 %	0 %	50 %	50 %	320101749
5734	NC_014962	CTGG	2	8	286838	286845	0 %	25 %	50 %	25 %	320101749
5735	NC_014962	TGA	2	6	286924	286929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320101749
5736	NC_014962	CCG	2	6	286939	286944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101749
5737	NC_014962	TCC	2	6	286965	286970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320101749
5738	NC_014962	GCT	3	9	287030	287038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101749
5739	NC_014962	GAG	2	6	287082	287087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320101749
5740	NC_014962	TCT	2	6	287140	287145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320101749
5741	NC_014962	ATGGGG	2	12	287262	287273	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	320101749
5742	NC_014962	CGC	2	6	287303	287308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101749
5743	NC_014962	CGC	2	6	287415	287420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101749
5744	NC_014962	ACC	2	6	287422	287427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101749
5745	NC_014962	GAG	2	6	287454	287459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320101749
5746	NC_014962	GGC	2	6	287516	287521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101749
5747	NC_014962	ACT	2	6	287527	287532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320101749
5748	NC_014962	CTT	2	6	287571	287576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320101749
5749	NC_014962	GACCGC	2	12	287589	287600	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	320101749
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5751	NC_014962	GCC	2	6	287731	287736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101749
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5755	NC_014962	CGGG	2	8	287878	287885	0 %	0 %	75 %	25 %	320101749
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5758	NC_014962	GTC	2	6	288149	288154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101750
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5760	NC_014962	GCC	2	6	288243	288248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101750
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5762	NC_014962	TCG	2	6	288346	288351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101750
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5764	NC_014962	AGCT	2	8	288631	288638	25 %	25 %	25 %	25 %	320101750
5765	NC_014962	AAG	2	6	288649	288654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320101750
5766	NC_014962	TGC	2	6	288691	288696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101750
5767	NC_014962	GGC	2	6	288755	288760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101750
5768	NC_014962	GCT	2	6	288770	288775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101750
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5773	NC_014962	GTT	2	6	288935	288940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320101751
5774	NC_014962	GCTG	2	8	288985	288992	0 %	25 %	50 %	25 %	320101751
5775	NC_014962	GGTG	2	8	288998	289005	0 %	25 %	75 %	0 %	320101751
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5779	NC_014962	GTG	2	6	289085	289090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101751
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5784	NC_014962	CCGA	2	8	289554	289561	25 %	0 %	25 %	50 %	320101751
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5848	NC_014962	TGAT	2	8	292040	292047	25 %	50 %	25 %	0 %	320101753
5849	NC_014962	GGC	2	6	292069	292074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101753
5850	NC_014962	G	6	6	292089	292094	0 %	0 %	100 %	0 %	320101753
5851	NC_014962	TGG	2	6	292133	292138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101753
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5853	NC_014962	TCGA	2	8	292148	292155	25 %	25 %	25 %	25 %	320101753
5854	NC_014962	CAG	2	6	292201	292206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101753
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5856	NC_014962	CCCG	2	8	292651	292658	0 %	0 %	25 %	75 %	320101754
5857	NC_014962	CCAC	2	8	292665	292672	25 %	0 %	0 %	75 %	320101754
5858	NC_014962	CGAA	2	8	292699	292706	50 %	0 %	25 %	25 %	320101754
5859	NC_014962	TTG	2	6	292794	292799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320101754
5860	NC_014962	CCCA	2	8	292818	292825	25 %	0 %	0 %	75 %	320101754
5861	NC_014962	GC	3	6	292850	292855	0 %	0 %	50 %	50 %	320101754
5862	NC_014962	GGCGG	2	10	292889	292898	0 %	0 %	80 %	20 %	320101754
5863	NC_014962	CGC	2	6	292955	292960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101754
5864	NC_014962	CGC	2	6	292975	292980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101754
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5866	NC_014962	G	7	7	293155	293161	0 %	0 %	100 %	0 %	320101754
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5987	NC_014962	GCCA	2	8	299003	299010	25 %	0 %	25 %	50 %	320101757
5988	NC_014962	CG	3	6	299113	299118	0 %	0 %	50 %	50 %	320101757
5989	NC_014962	AAC	2	6	299134	299139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320101757
5990	NC_014962	GCT	2	6	299478	299483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101758
5991	NC_014962	G	6	6	299516	299521	0 %	0 %	100 %	0 %	320101758
5992	NC_014962	CGC	2	6	299555	299560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101758
5993	NC_014962	CGT	2	6	299580	299585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101758
5994	NC_014962	CG	3	6	299589	299594	0 %	0 %	50 %	50 %	320101758
5995	NC_014962	CGA	2	6	299598	299603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101758
5996	NC_014962	CTCA	2	8	299614	299621	25 %	25 %	0 %	50 %	320101758
5997	NC_014962	CGG	2	6	299652	299657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101758
5998	NC_014962	CG	3	6	299711	299716	0 %	0 %	50 %	50 %	320101758
5999	NC_014962	CGG	2	6	299730	299735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101758
6000	NC_014962	CGA	2	6	299742	299747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101758

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