MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Isosphaera pallida ATCC 43644 plasmid pISOP01

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014957	TCGGT	2	10	367	376	0 %	40 %	40 %	20 %	320041923
2	NC_014957	CGCCC	2	10	1031	1040	0 %	0 %	20 %	80 %	320041923
3	NC_014957	ACGCC	2	10	3041	3050	20 %	0 %	20 %	60 %	320041923
4	NC_014957	CCCGG	2	10	3098	3107	0 %	0 %	40 %	60 %	320041923
5	NC_014957	CGCCC	2	10	3324	3333	0 %	0 %	20 %	80 %	320041923
6	NC_014957	ATGCG	2	10	3730	3739	20 %	20 %	40 %	20 %	320041924
7	NC_014957	ACATG	2	10	3801	3810	40 %	20 %	20 %	20 %	320041924
8	NC_014957	CTGAT	2	10	4116	4125	20 %	40 %	20 %	20 %	320041925
9	NC_014957	CACCT	2	10	8818	8827	20 %	20 %	0 %	60 %	320041927
10	NC_014957	CGCGG	2	10	9149	9158	0 %	0 %	60 %	40 %	320041927
11	NC_014957	GCGCC	2	10	9857	9866	0 %	0 %	40 %	60 %	320041927
12	NC_014957	CGGCC	2	10	10920	10929	0 %	0 %	40 %	60 %	320041927
13	NC_014957	CGCGC	2	10	11109	11118	0 %	0 %	40 %	60 %	320041927
14	NC_014957	CCGCG	2	10	11162	11171	0 %	0 %	40 %	60 %	320041927
15	NC_014957	CCCCT	2	10	13977	13986	0 %	20 %	0 %	80 %	320041928
16	NC_014957	TGGCG	2	10	14022	14031	0 %	20 %	60 %	20 %	320041928
17	NC_014957	GGTCG	2	10	14038	14047	0 %	20 %	60 %	20 %	320041928
18	NC_014957	TTGGG	2	10	14221	14230	0 %	40 %	60 %	0 %	320041928
19	NC_014957	TCACC	2	10	15284	15293	20 %	20 %	0 %	60 %	320041929
20	NC_014957	GCCCC	2	10	15682	15691	0 %	0 %	20 %	80 %	320041929
21	NC_014957	CGCTC	2	10	16243	16252	0 %	20 %	20 %	60 %	320041930
22	NC_014957	TCCCC	2	10	16333	16342	0 %	20 %	0 %	80 %	320041930
23	NC_014957	GGGGA	2	10	18170	18179	20 %	0 %	80 %	0 %	320041932
24	NC_014957	AAACC	2	10	19144	19153	60 %	0 %	0 %	40 %	320041933
25	NC_014957	GGTTG	2	10	20123	20132	0 %	40 %	60 %	0 %	320041934
26	NC_014957	ACCGT	2	10	20294	20303	20 %	20 %	20 %	40 %	320041934
27	NC_014957	CGCGC	2	10	20825	20834	0 %	0 %	40 %	60 %	320041934
28	NC_014957	CGCAG	2	10	22722	22731	20 %	0 %	40 %	40 %	320041936
29	NC_014957	GCCCC	2	10	25253	25262	0 %	0 %	20 %	80 %	320041937
30	NC_014957	CCATC	2	10	27967	27976	20 %	20 %	0 %	60 %	320041939
31	NC_014957	CGGGC	2	10	28287	28296	0 %	0 %	60 %	40 %	320041940
32	NC_014957	GGCGG	2	10	28877	28886	0 %	0 %	80 %	20 %	320041940
33	NC_014957	CCGGC	2	10	31054	31063	0 %	0 %	40 %	60 %	320041941
34	NC_014957	TCGAG	2	10	31270	31279	20 %	20 %	40 %	20 %	320041941
35	NC_014957	GGCCT	2	10	31444	31453	0 %	20 %	40 %	40 %	320041941
36	NC_014957	CGGCC	2	10	32600	32609	0 %	0 %	40 %	60 %	320041942
37	NC_014957	ACCGC	2	10	32872	32881	20 %	0 %	20 %	60 %	320041942
38	NC_014957	CCGCT	2	10	33118	33127	0 %	20 %	20 %	60 %	320041942
39	NC_014957	GCTGC	2	10	34289	34298	0 %	20 %	40 %	40 %	320041942
40	NC_014957	AAGCC	2	10	35278	35287	40 %	0 %	20 %	40 %	320041942
41	NC_014957	GCCAC	2	10	35619	35628	20 %	0 %	20 %	60 %	320041942
42	NC_014957	CGCGC	2	10	36009	36018	0 %	0 %	40 %	60 %	320041942
43	NC_014957	TCGCG	2	10	39941	39950	0 %	20 %	40 %	40 %	320041945
44	NC_014957	TTGAG	2	10	40033	40042	20 %	40 %	40 %	0 %	320041945
45	NC_014957	GGGAG	2	10	40785	40794	20 %	0 %	80 %	0 %	320041946
46	NC_014957	CGGTG	2	10	41052	41061	0 %	20 %	60 %	20 %	320041946
47	NC_014957	GGCCC	2	10	41343	41352	0 %	0 %	40 %	60 %	320041946
48	NC_014957	ACAGC	2	10	42284	42293	40 %	0 %	20 %	40 %	320041946
49	NC_014957	CGGCG	2	10	42841	42850	0 %	0 %	60 %	40 %	320041948
50	NC_014957	TCATC	2	10	44160	44169	20 %	40 %	0 %	40 %	320041948
51	NC_014957	GCTGG	2	10	45245	45254	0 %	20 %	60 %	20 %	320041949
52	NC_014957	CCTGA	2	10	46550	46559	20 %	20 %	20 %	40 %	320041949
53	NC_014957	CCAGG	2	10	50762	50771	20 %	0 %	40 %	40 %	320041951
54	NC_014957	GGTCC	2	10	51886	51895	0 %	20 %	40 %	40 %	320041951
55	NC_014957	TCATC	2	10	53218	53227	20 %	40 %	0 %	40 %	320041953
56	NC_014957	CCCCG	2	10	53232	53241	0 %	0 %	20 %	80 %	320041953
57	NC_014957	GCGCC	2	10	53811	53820	0 %	0 %	40 %	60 %	320041953
58	NC_014957	CGGTT	2	10	55408	55417	0 %	40 %	40 %	20 %	320041954

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.