MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Isosphaera pallida ATCC 43644 plasmid pISOP01

Total Repeats: 1134

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014957	G	6	6	25775	25780	0 %	0 %	100 %	0 %	320041938
502	NC_014957	CGT	2	6	25789	25794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320041938
503	NC_014957	CTC	2	6	25814	25819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320041938
504	NC_014957	CTCGAA	2	12	25862	25873	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	320041938
505	NC_014957	GTG	2	6	25889	25894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320041938
506	NC_014957	TCC	2	6	25908	25913	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320041938
507	NC_014957	CGA	2	6	25954	25959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320041938
508	NC_014957	GGA	2	6	25984	25989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320041938
509	NC_014957	GCG	2	6	25992	25997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320041938
510	NC_014957	CGG	2	6	26067	26072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320041938
511	NC_014957	GGCT	2	8	26108	26115	0 %	25 %	50 %	25 %	320041938
512	NC_014957	GTC	2	6	26162	26167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320041938
513	NC_014957	GTC	2	6	26289	26294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320041938
514	NC_014957	G	9	9	26295	26303	0 %	0 %	100 %	0 %	320041938
515	NC_014957	TCGG	2	8	26304	26311	0 %	25 %	50 %	25 %	320041938
516	NC_014957	CGG	2	6	26327	26332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320041938
517	NC_014957	CCT	2	6	26392	26397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320041938
518	NC_014957	GATC	2	8	26398	26405	25 %	25 %	25 %	25 %	320041938
519	NC_014957	CCCCCA	3	18	26465	26482	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	320041938
520	NC_014957	GGT	2	6	26492	26497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320041938
521	NC_014957	GAA	2	6	26564	26569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320041938
522	NC_014957	CGG	2	6	26587	26592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320041938
523	NC_014957	GAT	2	6	26593	26598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320041938
524	NC_014957	GCGT	2	8	27288	27295	0 %	25 %	50 %	25 %	320041939
525	NC_014957	TGG	3	9	27303	27311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320041939
526	NC_014957	TGC	2	6	27315	27320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320041939
527	NC_014957	CGGG	2	8	27436	27443	0 %	0 %	75 %	25 %	320041939
528	NC_014957	CAT	2	6	27460	27465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320041939
529	NC_014957	CGC	2	6	27500	27505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041939
530	NC_014957	CTG	2	6	27654	27659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320041939
531	NC_014957	CGC	2	6	27729	27734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041939
532	NC_014957	AGG	2	6	27801	27806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320041939
533	NC_014957	GGC	2	6	27819	27824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320041939
534	NC_014957	CGC	2	6	27838	27843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041939
535	NC_014957	CAAC	2	8	27934	27941	50 %	0 %	0 %	50 %	320041939
536	NC_014957	GCC	2	6	27953	27958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041939
537	NC_014957	CCATC	2	10	27967	27976	20 %	20 %	0 %	60 %	320041939
538	NC_014957	CGG	2	6	28098	28103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320041939
539	NC_014957	GCT	2	6	28198	28203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320041940
540	NC_014957	CGCC	2	8	28212	28219	0 %	0 %	25 %	75 %	320041940
541	NC_014957	GGC	2	6	28234	28239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320041940
542	NC_014957	GCC	2	6	28246	28251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041940
543	NC_014957	G	6	6	28260	28265	0 %	0 %	100 %	0 %	320041940
544	NC_014957	CTT	2	6	28267	28272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320041940
545	NC_014957	CGGGC	2	10	28287	28296	0 %	0 %	60 %	40 %	320041940
546	NC_014957	CGC	2	6	28334	28339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041940
547	NC_014957	CCT	2	6	28342	28347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320041940
548	NC_014957	TGC	3	9	28353	28361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320041940
549	NC_014957	GCC	2	6	28430	28435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041940
550	NC_014957	CGC	2	6	28449	28454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041940
551	NC_014957	CCG	2	6	28551	28556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041940
552	NC_014957	GAC	2	6	28607	28612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320041940
553	NC_014957	TCA	2	6	28635	28640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320041940
554	NC_014957	GCC	2	6	28706	28711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041940
555	NC_014957	GTG	2	6	28727	28732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320041940
556	NC_014957	GC	3	6	28780	28785	0 %	0 %	50 %	50 %	320041940
557	NC_014957	GAT	2	6	28804	28809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320041940
558	NC_014957	GC	3	6	28814	28819	0 %	0 %	50 %	50 %	320041940
559	NC_014957	CGC	2	6	28838	28843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041940
560	NC_014957	CGC	2	6	28861	28866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041940
561	NC_014957	GGCGG	2	10	28877	28886	0 %	0 %	80 %	20 %	320041940
562	NC_014957	CCG	2	6	28933	28938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041940
563	NC_014957	GCG	3	9	29008	29016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320041940
564	NC_014957	CGA	2	6	29017	29022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320041940
565	NC_014957	CAGGCC	2	12	29024	29035	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	320041940
566	NC_014957	TGGG	2	8	29076	29083	0 %	25 %	75 %	0 %	320041940
567	NC_014957	CG	3	6	29164	29169	0 %	0 %	50 %	50 %	320041940
568	NC_014957	GCGG	2	8	29209	29216	0 %	0 %	75 %	25 %	320041940
569	NC_014957	CGC	2	6	29219	29224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041940
570	NC_014957	GAT	2	6	29269	29274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320041940
571	NC_014957	GGA	2	6	29275	29280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320041940
572	NC_014957	CCG	2	6	29296	29301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041940
573	NC_014957	CGG	2	6	29338	29343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320041940
574	NC_014957	CGA	2	6	29362	29367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320041940
575	NC_014957	CAAC	2	8	29404	29411	50 %	0 %	0 %	50 %	320041940
576	NC_014957	ACA	2	6	29481	29486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320041940
577	NC_014957	CAAC	2	8	29551	29558	50 %	0 %	0 %	50 %	320041940
578	NC_014957	TCAA	2	8	29559	29566	50 %	25 %	0 %	25 %	320041940
579	NC_014957	ACCA	2	8	29639	29646	50 %	0 %	0 %	50 %	320041940
580	NC_014957	GGC	2	6	29662	29667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320041940
581	NC_014957	G	6	6	29682	29687	0 %	0 %	100 %	0 %	320041940
582	NC_014957	TGG	4	12	29688	29699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320041940
583	NC_014957	CG	3	6	29719	29724	0 %	0 %	50 %	50 %	320041940
584	NC_014957	GAG	2	6	29747	29752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320041940
585	NC_014957	GTG	2	6	29786	29791	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320041940
586	NC_014957	C	6	6	29856	29861	0 %	0 %	0 %	100 %	320041940
587	NC_014957	GCG	2	6	29866	29871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320041940
588	NC_014957	CGA	2	6	29878	29883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320041940
589	NC_014957	GTG	2	6	29912	29917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320041940
590	NC_014957	TGG	2	6	29960	29965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320041940
591	NC_014957	G	9	9	29968	29976	0 %	0 %	100 %	0 %	320041940
592	NC_014957	CGG	2	6	29998	30003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320041940
593	NC_014957	CGG	2	6	30039	30044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320041940
594	NC_014957	ACC	2	6	30062	30067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320041940
595	NC_014957	GCG	2	6	30136	30141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320041940
596	NC_014957	GCT	2	6	30157	30162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320041940
597	NC_014957	CTG	2	6	30194	30199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320041940
598	NC_014957	GCC	2	6	30227	30232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041940
599	NC_014957	CGG	2	6	30250	30255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320041940
600	NC_014957	CCG	3	9	30260	30268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041940
601	NC_014957	GGT	2	6	30301	30306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320041940
602	NC_014957	G	6	6	30328	30333	0 %	0 %	100 %	0 %	320041940
603	NC_014957	CGT	2	6	30337	30342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320041940
604	NC_014957	GCC	2	6	30454	30459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041940
605	NC_014957	TGC	2	6	30510	30515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320041940
606	NC_014957	CGT	2	6	30604	30609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320041940
607	NC_014957	CGG	2	6	30661	30666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320041940
608	NC_014957	TATGGC	2	12	30674	30685	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	320041940
609	NC_014957	TATGGC	3	18	30692	30709	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	320041940
610	NC_014957	GGA	2	6	30727	30732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320041940
611	NC_014957	GTCAAG	2	12	30734	30745	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	320041940
612	NC_014957	CGG	2	6	30762	30767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320041940
613	NC_014957	CAG	2	6	30775	30780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320041940
614	NC_014957	CAACGC	2	12	30790	30801	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	320041940
615	NC_014957	CAGACT	2	12	30828	30839	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	320041940
616	NC_014957	GAC	2	6	30993	30998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320041941
617	NC_014957	CTC	2	6	30999	31004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320041941
618	NC_014957	CCGGC	2	10	31054	31063	0 %	0 %	40 %	60 %	320041941
619	NC_014957	ATGG	2	8	31178	31185	25 %	25 %	50 %	0 %	320041941
620	NC_014957	GCC	2	6	31191	31196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041941
621	NC_014957	GCC	2	6	31225	31230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041941
622	NC_014957	CGC	2	6	31244	31249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041941
623	NC_014957	TCGAG	2	10	31270	31279	20 %	20 %	40 %	20 %	320041941
624	NC_014957	GGC	2	6	31280	31285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320041941
625	NC_014957	GCC	2	6	31289	31294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041941
626	NC_014957	GGGCGT	2	12	31295	31306	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	320041941
627	NC_014957	CTG	2	6	31336	31341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320041941
628	NC_014957	GCC	2	6	31342	31347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041941
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739	NC_014957	CCA	2	6	35395	35400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320041942
740	NC_014957	CGA	2	6	35402	35407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320041942
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742	NC_014957	GCT	2	6	35465	35470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320041942
743	NC_014957	C	6	6	35490	35495	0 %	0 %	0 %	100 %	320041942
744	NC_014957	CGC	2	6	35522	35527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041942
745	NC_014957	CTGCGT	2	12	35542	35553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320041942
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747	NC_014957	CGC	2	6	35603	35608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041942
748	NC_014957	GCCAC	2	10	35619	35628	20 %	0 %	20 %	60 %	320041942
749	NC_014957	CTG	2	6	35658	35663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320041942
750	NC_014957	CCCG	2	8	35668	35675	0 %	0 %	25 %	75 %	320041942
751	NC_014957	GGCT	2	8	35683	35690	0 %	25 %	50 %	25 %	320041942
752	NC_014957	CAGT	2	8	35726	35733	25 %	25 %	25 %	25 %	320041942
753	NC_014957	ACGCCC	2	12	35857	35868	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	320041942
754	NC_014957	AAC	2	6	35887	35892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320041942
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756	NC_014957	CG	3	6	35937	35942	0 %	0 %	50 %	50 %	320041942
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759	NC_014957	CG	3	6	35985	35990	0 %	0 %	50 %	50 %	320041942
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876	NC_014957	CTT	2	6	41238	41243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320041946
877	NC_014957	CG	3	6	41268	41273	0 %	0 %	50 %	50 %	320041946
878	NC_014957	GGCCC	2	10	41343	41352	0 %	0 %	40 %	60 %	320041946
879	NC_014957	C	6	6	41365	41370	0 %	0 %	0 %	100 %	320041946
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1000	NC_014957	CCCT	2	8	46642	46649	0 %	25 %	0 %	75 %	320041949

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