MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Ilyobacter polytropus DSM 2926 plasmid pILYOP02

Total Repeats: 77

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014634	GAATA	2	10	1968	1977	60 %	20 %	20 %	0 %	310780580
2	NC_014634	ATAAA	2	10	6274	6283	80 %	20 %	0 %	0 %	310780585
3	NC_014634	GAAAA	2	10	6685	6694	80 %	0 %	20 %	0 %	310780586
4	NC_014634	ATTTT	2	10	8271	8280	20 %	80 %	0 %	0 %	310780587
5	NC_014634	ATTGA	2	10	9167	9176	40 %	40 %	20 %	0 %	310780587
6	NC_014634	CTACA	2	10	12498	12507	40 %	20 %	0 %	40 %	310780591
7	NC_014634	GATGC	2	10	12731	12740	20 %	20 %	40 %	20 %	310780591
8	NC_014634	ATACT	2	10	12759	12768	40 %	40 %	0 %	20 %	310780591
9	NC_014634	CTTGT	2	10	13007	13016	0 %	60 %	20 %	20 %	310780591
10	NC_014634	GAATA	2	10	13166	13175	60 %	20 %	20 %	0 %	310780591
11	NC_014634	AAAGT	2	10	14726	14735	60 %	20 %	20 %	0 %	310780593
12	NC_014634	GAAAA	2	10	15558	15567	80 %	0 %	20 %	0 %	310780594
13	NC_014634	TTTAA	2	10	18126	18135	40 %	60 %	0 %	0 %	310780597
14	NC_014634	TCCAT	2	10	19187	19196	20 %	40 %	0 %	40 %	310780597
15	NC_014634	ACCTT	2	10	26328	26337	20 %	40 %	0 %	40 %	310780606
16	NC_014634	TATTC	2	10	26631	26640	20 %	60 %	0 %	20 %	310780607
17	NC_014634	TCTAA	2	10	28201	28210	40 %	40 %	0 %	20 %	310780608
18	NC_014634	TCATT	2	10	28794	28803	20 %	60 %	0 %	20 %	310780609
19	NC_014634	TATCT	2	10	29011	29020	20 %	60 %	0 %	20 %	310780609
20	NC_014634	TTTGG	2	10	30682	30691	0 %	60 %	40 %	0 %	310780610
21	NC_014634	CCAAT	2	10	31402	31411	40 %	20 %	0 %	40 %	310780610
22	NC_014634	AAATC	2	10	31816	31825	60 %	20 %	0 %	20 %	310780611
23	NC_014634	CTTCT	2	10	32645	32654	0 %	60 %	0 %	40 %	310780612
24	NC_014634	AAATG	2	10	33063	33072	60 %	20 %	20 %	0 %	310780612
25	NC_014634	TGGTT	2	10	34770	34779	0 %	60 %	40 %	0 %	310780614
26	NC_014634	ACAAA	2	10	35819	35828	80 %	0 %	0 %	20 %	310780614
27	NC_014634	GTAAG	2	10	38659	38668	40 %	20 %	40 %	0 %	310780617
28	NC_014634	ATAAC	2	10	42423	42432	60 %	20 %	0 %	20 %	310780620
29	NC_014634	ACTAT	2	10	42783	42792	40 %	40 %	0 %	20 %	310780620
30	NC_014634	ATTTT	2	10	46165	46174	20 %	80 %	0 %	0 %	310780622
31	NC_014634	AATCC	2	10	57469	57478	40 %	20 %	0 %	40 %	310780629
32	NC_014634	ATTTA	2	10	60533	60542	40 %	60 %	0 %	0 %	310780630
33	NC_014634	CAATA	2	10	61305	61314	60 %	20 %	0 %	20 %	310780631
34	NC_014634	TCATC	2	10	61445	61454	20 %	40 %	0 %	40 %	310780631
35	NC_014634	TTTCT	2	10	64148	64157	0 %	80 %	0 %	20 %	310780633
36	NC_014634	TTATA	2	10	69017	69026	40 %	60 %	0 %	0 %	310780639
37	NC_014634	TCTTT	2	10	69416	69425	0 %	80 %	0 %	20 %	310780639
38	NC_014634	TGCTT	2	10	71091	71100	0 %	60 %	20 %	20 %	310780642
39	NC_014634	GTTTT	2	10	71161	71170	0 %	80 %	20 %	0 %	310780642
40	NC_014634	CATAT	2	10	71516	71525	40 %	40 %	0 %	20 %	310780642
41	NC_014634	CTTTT	2	10	71673	71682	0 %	80 %	0 %	20 %	310780642
42	NC_014634	TAGTT	2	10	72316	72325	20 %	60 %	20 %	0 %	310780642
43	NC_014634	TTTTA	2	10	72469	72478	20 %	80 %	0 %	0 %	310780642
44	NC_014634	CTTTT	2	10	72575	72584	0 %	80 %	0 %	20 %	310780642
45	NC_014634	TTTTC	2	10	74808	74817	0 %	80 %	0 %	20 %	310780644
46	NC_014634	TCTCT	2	10	75168	75177	0 %	60 %	0 %	40 %	310780644
47	NC_014634	AGTAT	2	10	79700	79709	40 %	40 %	20 %	0 %	310780649
48	NC_014634	ATGGA	2	10	79926	79935	40 %	20 %	40 %	0 %	310780649
49	NC_014634	GAAAG	2	10	80769	80778	60 %	0 %	40 %	0 %	310780650
50	NC_014634	CAACG	2	10	81831	81840	40 %	0 %	20 %	40 %	310780652
51	NC_014634	TTCAT	2	10	82807	82816	20 %	60 %	0 %	20 %	310780653
52	NC_014634	TAAAT	2	10	87091	87100	60 %	40 %	0 %	0 %	310780654
53	NC_014634	GCTTT	2	10	89541	89550	0 %	60 %	20 %	20 %	310780657
54	NC_014634	GATAA	2	10	91163	91172	60 %	20 %	20 %	0 %	310780657
55	NC_014634	CAAAA	2	10	91348	91357	80 %	0 %	0 %	20 %	310780657
56	NC_014634	AAAAT	2	10	92179	92188	80 %	20 %	0 %	0 %	310780659
57	NC_014634	GAACA	2	10	92828	92837	60 %	0 %	20 %	20 %	310780660
58	NC_014634	TTTTC	2	10	95300	95309	0 %	80 %	0 %	20 %	310780661
59	NC_014634	GATAA	2	10	99318	99327	60 %	20 %	20 %	0 %	310780665
60	NC_014634	TGAAA	2	10	99365	99374	60 %	20 %	20 %	0 %	310780665
61	NC_014634	ATCCT	2	10	101449	101458	20 %	40 %	0 %	40 %	310780668
62	NC_014634	CATCT	2	10	103030	103039	20 %	40 %	0 %	40 %	310780670
63	NC_014634	ATTCT	2	10	104517	104526	20 %	60 %	0 %	20 %	310780671
64	NC_014634	ATAAG	2	10	104586	104595	60 %	20 %	20 %	0 %	310780671
65	NC_014634	AAAAT	2	10	106598	106607	80 %	20 %	0 %	0 %	310780672
66	NC_014634	ATATT	2	10	106742	106751	40 %	60 %	0 %	0 %	310780672
67	NC_014634	AATAT	2	10	108031	108040	60 %	40 %	0 %	0 %	310780673
68	NC_014634	GAAAA	2	10	112065	112074	80 %	0 %	20 %	0 %	310780676
69	NC_014634	TGATA	2	10	112547	112556	40 %	40 %	20 %	0 %	310780676
70	NC_014634	TTATT	2	10	112616	112625	20 %	80 %	0 %	0 %	310780676
71	NC_014634	AGTAT	2	10	113992	114001	40 %	40 %	20 %	0 %	310780678
72	NC_014634	ATATA	2	10	115396	115405	60 %	40 %	0 %	0 %	310780679
73	NC_014634	AATTT	2	10	115582	115591	40 %	60 %	0 %	0 %	310780679
74	NC_014634	TTCTC	2	10	116451	116460	0 %	60 %	0 %	40 %	310780680
75	NC_014634	GAACT	2	10	117579	117588	40 %	20 %	20 %	20 %	310780681
76	NC_014634	ATTTT	2	10	118491	118500	20 %	80 %	0 %	0 %	310780682
77	NC_014634	AAATT	2	10	123254	123263	60 %	40 %	0 %	0 %	310780687

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.