MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Idiomarina loihiensis L2TR chromosome

Total Repeats: 1497

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006512	CACAA	2	10	4682	4691	60 %	0 %	0 %	40 %	56459116
2	NC_006512	GAAGT	2	10	4986	4995	40 %	20 %	40 %	0 %	56459116
3	NC_006512	GGCGA	2	10	5052	5061	20 %	0 %	60 %	20 %	56459116
4	NC_006512	GAACA	2	10	7473	7482	60 %	0 %	20 %	20 %	56459117
5	NC_006512	CCCAG	2	10	9065	9074	20 %	0 %	20 %	60 %	56459118
6	NC_006512	TCTTT	2	10	10334	10343	0 %	80 %	0 %	20 %	56459120
7	NC_006512	GTTCA	2	10	11433	11442	20 %	40 %	20 %	20 %	56459122
8	NC_006512	TACCG	2	10	11658	11667	20 %	20 %	20 %	40 %	56459122
9	NC_006512	CTTGC	2	10	12680	12689	0 %	40 %	20 %	40 %	56459123
10	NC_006512	CGCTT	2	10	13893	13902	0 %	40 %	20 %	40 %	56459123
11	NC_006512	GGCAG	2	10	15013	15022	20 %	0 %	60 %	20 %	56459124
12	NC_006512	AAGAA	2	10	18659	18668	80 %	0 %	20 %	0 %	56459127
13	NC_006512	ATCGC	2	10	20635	20644	20 %	20 %	20 %	40 %	56459128
14	NC_006512	CGCGG	2	10	24669	24678	0 %	0 %	60 %	40 %	56459133
15	NC_006512	TCTGG	2	10	26174	26183	0 %	40 %	40 %	20 %	56459135
16	NC_006512	CCAAA	2	10	28106	28115	60 %	0 %	0 %	40 %	56459137
17	NC_006512	CAGAA	2	10	30723	30732	60 %	0 %	20 %	20 %	56459138
18	NC_006512	AATGA	2	10	32737	32746	60 %	20 %	20 %	0 %	56459140
19	NC_006512	CAAAA	2	10	33590	33599	80 %	0 %	0 %	20 %	56459141
20	NC_006512	GCCAC	2	10	35288	35297	20 %	0 %	20 %	60 %	56459144
21	NC_006512	TTTCC	2	10	36675	36684	0 %	60 %	0 %	40 %	56459144
22	NC_006512	GTTAA	2	10	40433	40442	40 %	40 %	20 %	0 %	56459150
23	NC_006512	ATGGC	2	10	43424	43433	20 %	20 %	40 %	20 %	56459152
24	NC_006512	ACTGA	2	10	43519	43528	40 %	20 %	20 %	20 %	56459152
25	NC_006512	ATTGC	2	10	43996	44005	20 %	40 %	20 %	20 %	56459152
26	NC_006512	CGTGA	2	10	45994	46003	20 %	20 %	40 %	20 %	56459154
27	NC_006512	TGTGG	2	10	46351	46360	0 %	40 %	60 %	0 %	56459154
28	NC_006512	AAACT	2	10	48714	48723	60 %	20 %	0 %	20 %	56459157
29	NC_006512	GAAAA	2	10	49598	49607	80 %	0 %	20 %	0 %	56459157
30	NC_006512	ACCGG	2	10	50317	50326	20 %	0 %	40 %	40 %	56459158
31	NC_006512	GTGAA	2	10	58061	58070	40 %	20 %	40 %	0 %	56459167
32	NC_006512	AAATG	2	10	60869	60878	60 %	20 %	20 %	0 %	56459170
33	NC_006512	TCTTT	2	10	61891	61900	0 %	80 %	0 %	20 %	56459171
34	NC_006512	AGCCT	2	10	65559	65568	20 %	20 %	20 %	40 %	56459174
35	NC_006512	TAGCG	2	10	69405	69414	20 %	20 %	40 %	20 %	56459178
36	NC_006512	AAGCT	2	10	71194	71203	40 %	20 %	20 %	20 %	56459180
37	NC_006512	TCGCC	2	10	72023	72032	0 %	20 %	20 %	60 %	56459180
38	NC_006512	GATTA	2	10	76372	76381	40 %	40 %	20 %	0 %	56459184
39	NC_006512	TTTGA	2	10	78965	78974	20 %	60 %	20 %	0 %	56459185
40	NC_006512	AGTCC	2	10	80726	80735	20 %	20 %	20 %	40 %	56459187
41	NC_006512	TTTCG	2	10	81698	81707	0 %	60 %	20 %	20 %	56459188
42	NC_006512	GTATG	2	10	84140	84149	20 %	40 %	40 %	0 %	56459189
43	NC_006512	GGGGC	2	10	84582	84591	0 %	0 %	80 %	20 %	56459189
44	NC_006512	AACCG	2	10	85029	85038	40 %	0 %	20 %	40 %	56459190
45	NC_006512	ACGGT	2	10	85634	85643	20 %	20 %	40 %	20 %	56459190
46	NC_006512	GAACC	2	10	85758	85767	40 %	0 %	20 %	40 %	56459190
47	NC_006512	CTTGT	2	10	87403	87412	0 %	60 %	20 %	20 %	56459192
48	NC_006512	AATAA	2	10	87701	87710	80 %	20 %	0 %	0 %	56459192
49	NC_006512	GCAAA	2	10	87791	87800	60 %	0 %	20 %	20 %	56459192
50	NC_006512	GTTTC	2	10	89141	89150	0 %	60 %	20 %	20 %	56459193
51	NC_006512	AAAGC	2	10	91600	91609	60 %	0 %	20 %	20 %	56459196
52	NC_006512	AAAGA	2	10	94343	94352	80 %	0 %	20 %	0 %	56459199
53	NC_006512	TGGCA	2	10	97368	97377	20 %	20 %	40 %	20 %	56459203
54	NC_006512	TGCAA	2	10	99758	99767	40 %	20 %	20 %	20 %	56459206
55	NC_006512	AGCTG	2	10	100649	100658	20 %	20 %	40 %	20 %	56459207
56	NC_006512	GGTCA	2	10	102469	102478	20 %	20 %	40 %	20 %	56459210
57	NC_006512	GTGCA	2	10	103996	104005	20 %	20 %	40 %	20 %	56459212
58	NC_006512	GTTAA	2	10	105138	105147	40 %	40 %	20 %	0 %	56459212
59	NC_006512	ACAGA	2	10	107642	107651	60 %	0 %	20 %	20 %	56459213
60	NC_006512	GTTGT	2	10	107760	107769	0 %	60 %	40 %	0 %	56459213
61	NC_006512	GTGCG	2	10	111624	111633	0 %	20 %	60 %	20 %	56459218
62	NC_006512	TAACG	2	10	113745	113754	40 %	20 %	20 %	20 %	56459219
63	NC_006512	GTCCA	2	10	116138	116147	20 %	20 %	20 %	40 %	56459220
64	NC_006512	TGCGG	2	10	116395	116404	0 %	20 %	60 %	20 %	56459220
65	NC_006512	GTATT	2	10	117457	117466	20 %	60 %	20 %	0 %	56459221
66	NC_006512	ACGGC	2	10	118220	118229	20 %	0 %	40 %	40 %	56459222
67	NC_006512	GCCTT	2	10	119120	119129	0 %	40 %	20 %	40 %	56459222
68	NC_006512	ACTGT	2	10	119701	119710	20 %	40 %	20 %	20 %	56459223
69	NC_006512	GTTTC	2	10	121109	121118	0 %	60 %	20 %	20 %	56459223
70	NC_006512	TGCAA	2	10	123017	123026	40 %	20 %	20 %	20 %	56459225
71	NC_006512	GAACT	2	10	123979	123988	40 %	20 %	20 %	20 %	56459226
72	NC_006512	AGGTC	2	10	124720	124729	20 %	20 %	40 %	20 %	56459227
73	NC_006512	AACCG	2	10	126169	126178	40 %	0 %	20 %	40 %	56459228
74	NC_006512	GAATT	2	10	127835	127844	40 %	40 %	20 %	0 %	56459228
75	NC_006512	CAGAG	2	10	129881	129890	40 %	0 %	40 %	20 %	56459229
76	NC_006512	GTTAA	2	10	130265	130274	40 %	40 %	20 %	0 %	56459229
77	NC_006512	AGGAC	2	10	131568	131577	40 %	0 %	40 %	20 %	56459231
78	NC_006512	CGCAG	2	10	134302	134311	20 %	0 %	40 %	40 %	56459233
79	NC_006512	CGGTG	2	10	135532	135541	0 %	20 %	60 %	20 %	56459233
80	NC_006512	ACTGC	2	10	138035	138044	20 %	20 %	20 %	40 %	56459237
81	NC_006512	GGCGC	2	10	138470	138479	0 %	0 %	60 %	40 %	56459237
82	NC_006512	GAGTG	2	10	139756	139765	20 %	20 %	60 %	0 %	56459240
83	NC_006512	GTTTG	2	10	142490	142499	0 %	60 %	40 %	0 %	56459244
84	NC_006512	CTTGC	2	10	143801	143810	0 %	40 %	20 %	40 %	56459245
85	NC_006512	ATTCC	2	10	146377	146386	20 %	40 %	0 %	40 %	56459248
86	NC_006512	GTTAC	2	10	146813	146822	20 %	40 %	20 %	20 %	56459248
87	NC_006512	GGAAG	2	10	147232	147241	40 %	0 %	60 %	0 %	56459248
88	NC_006512	CATTG	2	10	147647	147656	20 %	40 %	20 %	20 %	56459248
89	NC_006512	CCGGC	2	10	147941	147950	0 %	0 %	40 %	60 %	56459249
90	NC_006512	GCTTT	2	10	148778	148787	0 %	60 %	20 %	20 %	56459249
91	NC_006512	CCGGT	2	10	150149	150158	0 %	20 %	40 %	40 %	56459251
92	NC_006512	ACGCA	2	10	151559	151568	40 %	0 %	20 %	40 %	161761293
93	NC_006512	TAACC	2	10	153172	153181	40 %	20 %	0 %	40 %	56459254
94	NC_006512	ACGCG	2	10	159102	159111	20 %	0 %	40 %	40 %	56459260
95	NC_006512	CATCG	2	10	159352	159361	20 %	20 %	20 %	40 %	56459261
96	NC_006512	CCGGA	2	10	161935	161944	20 %	0 %	40 %	40 %	56459263
97	NC_006512	GACAT	2	10	167142	167151	40 %	20 %	20 %	20 %	56459270
98	NC_006512	TTGCA	2	10	172291	172300	20 %	40 %	20 %	20 %	56459273
99	NC_006512	GAACC	2	10	172575	172584	40 %	0 %	20 %	40 %	56459273
100	NC_006512	ATTTT	2	10	173063	173072	20 %	80 %	0 %	0 %	56459273
101	NC_006512	TTTCT	2	10	174608	174617	0 %	80 %	0 %	20 %	56459274
102	NC_006512	GGCTG	2	10	176097	176106	0 %	20 %	60 %	20 %	56459276
103	NC_006512	CTTCA	2	10	176371	176380	20 %	40 %	0 %	40 %	56459276
104	NC_006512	CTGAC	2	10	177116	177125	20 %	20 %	20 %	40 %	56459278
105	NC_006512	TCGGG	2	10	177443	177452	0 %	20 %	60 %	20 %	56459278
106	NC_006512	CAACA	2	10	177949	177958	60 %	0 %	0 %	40 %	56459278
107	NC_006512	TGGGC	2	10	179274	179283	0 %	20 %	60 %	20 %	56459279
108	NC_006512	GTTCC	2	10	181925	181934	0 %	40 %	20 %	40 %	56459282
109	NC_006512	CGCTG	2	10	182693	182702	0 %	20 %	40 %	40 %	56459283
110	NC_006512	TCATG	2	10	185154	185163	20 %	40 %	20 %	20 %	56459284
111	NC_006512	ACCAC	2	10	185453	185462	40 %	0 %	0 %	60 %	56459285
112	NC_006512	AGTGG	2	10	186267	186276	20 %	20 %	60 %	0 %	56459286
113	NC_006512	ATTTA	2	10	186320	186329	40 %	60 %	0 %	0 %	56459286
114	NC_006512	GGAAA	2	10	186888	186897	60 %	0 %	40 %	0 %	56459286
115	NC_006512	AAGTG	2	10	187586	187595	40 %	20 %	40 %	0 %	56459286
116	NC_006512	AGCTC	2	10	188211	188220	20 %	20 %	20 %	40 %	56459286
117	NC_006512	GAATG	2	10	189090	189099	40 %	20 %	40 %	0 %	56459287
118	NC_006512	GCTTT	2	10	189626	189635	0 %	60 %	20 %	20 %	56459287
119	NC_006512	ACCCA	2	10	192689	192698	40 %	0 %	0 %	60 %	56459289
120	NC_006512	TCATC	2	10	193804	193813	20 %	40 %	0 %	40 %	56459290
121	NC_006512	GTCAT	2	10	196082	196091	20 %	40 %	20 %	20 %	56459293
122	NC_006512	CTTAA	2	10	196554	196563	40 %	40 %	0 %	20 %	56459294
123	NC_006512	CTGCT	2	10	199200	199209	0 %	40 %	20 %	40 %	56459295
124	NC_006512	ACGAA	2	10	202859	202868	60 %	0 %	20 %	20 %	56459298
125	NC_006512	GCATT	2	10	204557	204566	20 %	40 %	20 %	20 %	56459299
126	NC_006512	GGGCT	2	10	205948	205957	0 %	20 %	60 %	20 %	56459300
127	NC_006512	TGTGC	2	10	206142	206151	0 %	40 %	40 %	20 %	56459300
128	NC_006512	GCAGC	2	10	209726	209735	20 %	0 %	40 %	40 %	56459303
129	NC_006512	CTGGT	2	10	210430	210439	0 %	40 %	40 %	20 %	56459304
130	NC_006512	CGCTG	2	10	213311	213320	0 %	20 %	40 %	40 %	56459307
131	NC_006512	GTGCT	2	10	213813	213822	0 %	40 %	40 %	20 %	56459307
132	NC_006512	ACGTC	2	10	215048	215057	20 %	20 %	20 %	40 %	56459309
133	NC_006512	CTAAA	2	10	219319	219328	60 %	20 %	0 %	20 %	56459311
134	NC_006512	TATTT	2	10	219967	219976	20 %	80 %	0 %	0 %	56459312
135	NC_006512	ATAAA	2	10	221498	221507	80 %	20 %	0 %	0 %	56459313
136	NC_006512	ATGCC	2	10	224607	224616	20 %	20 %	20 %	40 %	56459316
137	NC_006512	CTTTG	2	10	225293	225302	0 %	60 %	20 %	20 %	56459317
138	NC_006512	GCTTT	2	10	226952	226961	0 %	60 %	20 %	20 %	56459317
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141	NC_006512	GCCGC	2	10	228299	228308	0 %	0 %	40 %	60 %	56459318
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150	NC_006512	AAAAG	2	10	248057	248066	80 %	0 %	20 %	0 %	56459340
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153	NC_006512	GGCCC	2	10	257312	257321	0 %	0 %	40 %	60 %	56459351
154	NC_006512	GTTAC	2	10	257497	257506	20 %	40 %	20 %	20 %	56459351
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167	NC_006512	TAACT	2	10	286854	286863	40 %	40 %	0 %	20 %	56459384
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201	NC_006512	CCGTA	2	10	366466	366475	20 %	20 %	20 %	40 %	56459461
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252	NC_006512	AAACA	2	10	447100	447109	80 %	0 %	0 %	20 %	56459543
253	NC_006512	ACAGA	2	10	447564	447573	60 %	0 %	20 %	20 %	56459543
254	NC_006512	TTAAC	2	10	448263	448272	40 %	40 %	0 %	20 %	56459544
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262	NC_006512	CGGTC	2	10	468084	468093	0 %	20 %	40 %	40 %	56459563
263	NC_006512	ATGAA	2	10	473863	473872	60 %	20 %	20 %	0 %	56459569
264	NC_006512	GTCCC	2	10	476195	476204	0 %	20 %	20 %	60 %	56459570
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394	NC_006512	TGCTC	2	10	713134	713143	0 %	40 %	20 %	40 %	56459764
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