MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Idiomarina loihiensis L2TR chromosome

Total Repeats: 48605

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48501	NC_006512	ACGC	2	8	2832555	2832562	25 %	0 %	25 %	50 %	56461732
48502	NC_006512	TTA	2	6	2832578	2832583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56461732
48503	NC_006512	TAA	2	6	2832915	2832920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56461733
48504	NC_006512	CGT	2	6	2832942	2832947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56461733
48505	NC_006512	T	6	6	2832975	2832980	0 %	100 %	0 %	0 %	56461733
48506	NC_006512	GTC	2	6	2833075	2833080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56461733
48507	NC_006512	GTT	2	6	2833176	2833181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56461733
48508	NC_006512	GT	3	6	2833333	2833338	0 %	50 %	50 %	0 %	56461733
48509	NC_006512	TGT	2	6	2833349	2833354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56461733
48510	NC_006512	CAGA	2	8	2833356	2833363	50 %	0 %	25 %	25 %	56461733
48511	NC_006512	TCA	2	6	2833373	2833378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56461733
48512	NC_006512	GCG	2	6	2833540	2833545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56461734
48513	NC_006512	ATA	2	6	2833557	2833562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56461734
48514	NC_006512	A	6	6	2833571	2833576	100 %	0 %	0 %	0 %	56461734
48515	NC_006512	CGT	2	6	2833598	2833603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56461734
48516	NC_006512	GAG	2	6	2833625	2833630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56461734
48517	NC_006512	CGAAC	2	10	2833635	2833644	40 %	0 %	20 %	40 %	56461734
48518	NC_006512	CG	3	6	2833683	2833688	0 %	0 %	50 %	50 %	56461734
48519	NC_006512	GTTTT	2	10	2833855	2833864	0 %	80 %	20 %	0 %	56461735
48520	NC_006512	TTC	2	6	2833880	2833885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56461735
48521	NC_006512	TTGG	2	8	2833926	2833933	0 %	50 %	50 %	0 %	56461735
48522	NC_006512	ATAA	2	8	2833934	2833941	75 %	25 %	0 %	0 %	56461735
48523	NC_006512	G	6	6	2833966	2833971	0 %	0 %	100 %	0 %	56461735
48524	NC_006512	T	6	6	2834086	2834091	0 %	100 %	0 %	0 %	56461735
48525	NC_006512	CTG	2	6	2834194	2834199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56461735
48526	NC_006512	GC	3	6	2834203	2834208	0 %	0 %	50 %	50 %	56461735
48527	NC_006512	A	6	6	2834222	2834227	100 %	0 %	0 %	0 %	56461735
48528	NC_006512	AAT	2	6	2834316	2834321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56461735
48529	NC_006512	ACC	2	6	2834329	2834334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56461735
48530	NC_006512	ATA	2	6	2834355	2834360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56461735
48531	NC_006512	GGC	2	6	2834375	2834380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56461735
48532	NC_006512	GCG	2	6	2834514	2834519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56461735
48533	NC_006512	ATTTA	2	10	2834582	2834591	40 %	60 %	0 %	0 %	56461735
48534	NC_006512	AGTA	2	8	2834604	2834611	50 %	25 %	25 %	0 %	56461735
48535	NC_006512	T	7	7	2834628	2834634	0 %	100 %	0 %	0 %	56461735
48536	NC_006512	TTCAG	2	10	2834649	2834658	20 %	40 %	20 %	20 %	56461735
48537	NC_006512	TAA	2	6	2834680	2834685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56461735
48538	NC_006512	TGC	2	6	2834759	2834764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56461735
48539	NC_006512	TTA	2	6	2834799	2834804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56461735
48540	NC_006512	TTAA	2	8	2834868	2834875	50 %	50 %	0 %	0 %	56461735
48541	NC_006512	ACC	2	6	2835003	2835008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56461735
48542	NC_006512	CCA	2	6	2835109	2835114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56461735
48543	NC_006512	AAC	2	6	2835140	2835145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56461735
48544	NC_006512	AAG	2	6	2835209	2835214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56461735
48545	NC_006512	AAT	2	6	2835290	2835295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56461735
48546	NC_006512	GCAG	2	8	2835305	2835312	25 %	0 %	50 %	25 %	56461735
48547	NC_006512	TTTA	2	8	2835416	2835423	25 %	75 %	0 %	0 %	56461736
48548	NC_006512	ATC	2	6	2835459	2835464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56461736
48549	NC_006512	TTC	2	6	2835516	2835521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56461736
48550	NC_006512	GGC	2	6	2835608	2835613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56461736
48551	NC_006512	TGT	3	9	2835728	2835736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56461736
48552	NC_006512	TCT	2	6	2835802	2835807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56461736
48553	NC_006512	TCG	2	6	2835838	2835843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56461736
48554	NC_006512	ATA	2	6	2835976	2835981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56461736
48555	NC_006512	AAGC	2	8	2836083	2836090	50 %	0 %	25 %	25 %	56461736
48556	NC_006512	CTTG	2	8	2836154	2836161	0 %	50 %	25 %	25 %	56461736
48557	NC_006512	CTT	2	6	2836163	2836168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56461736
48558	NC_006512	GAAA	2	8	2836228	2836235	75 %	0 %	25 %	0 %	56461736
48559	NC_006512	TCA	2	6	2836246	2836251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56461736
48560	NC_006512	GGC	2	6	2836350	2836355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56461736
48561	NC_006512	ATA	2	6	2836513	2836518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56461736
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48564	NC_006512	GTT	2	6	2836610	2836615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56461736
48565	NC_006512	CCG	2	6	2836729	2836734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56461736
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48569	NC_006512	CTTT	2	8	2836875	2836882	0 %	75 %	0 %	25 %	56461737
48570	NC_006512	CCAG	2	8	2836935	2836942	25 %	0 %	25 %	50 %	56461737
48571	NC_006512	GAA	2	6	2836972	2836977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56461737
48572	NC_006512	TGTCGG	2	12	2837032	2837043	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	56461737
48573	NC_006512	GTA	2	6	2837095	2837100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56461737
48574	NC_006512	GCC	2	6	2837224	2837229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56461737
48575	NC_006512	TCA	2	6	2837262	2837267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56461737
48576	NC_006512	GTCG	2	8	2837286	2837293	0 %	25 %	50 %	25 %	56461737
48577	NC_006512	GCA	2	6	2837331	2837336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56461737
48578	NC_006512	TTAG	2	8	2837369	2837376	25 %	50 %	25 %	0 %	56461737
48579	NC_006512	ATA	2	6	2837414	2837419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56461737
48580	NC_006512	TAA	2	6	2837433	2837438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56461737
48581	NC_006512	GCA	2	6	2837457	2837462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56461737
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48584	NC_006512	TAGG	2	8	2837834	2837841	25 %	25 %	50 %	0 %	56461737
48585	NC_006512	AAG	2	6	2838075	2838080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56461737
48586	NC_006512	GGC	2	6	2838081	2838086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56461737
48587	NC_006512	TCCG	2	8	2838103	2838110	0 %	25 %	25 %	50 %	56461737
48588	NC_006512	CTGA	2	8	2838123	2838130	25 %	25 %	25 %	25 %	56461737
48589	NC_006512	GTT	2	6	2838142	2838147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56461737
48590	NC_006512	TTC	2	6	2838175	2838180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56461737
48591	NC_006512	ACA	2	6	2838221	2838226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56461737
48592	NC_006512	CAC	2	6	2838228	2838233	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56461737
48593	NC_006512	TATC	2	8	2838240	2838247	25 %	50 %	0 %	25 %	56461737
48594	NC_006512	CCA	2	6	2838435	2838440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56461737
48595	NC_006512	GATTCG	2	12	2838544	2838555	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	56461738
48596	NC_006512	GCC	2	6	2838606	2838611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56461738
48597	NC_006512	GCA	2	6	2838646	2838651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56461738
48598	NC_006512	CAG	2	6	2838738	2838743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56461738
48599	NC_006512	ATAA	2	8	2838817	2838824	75 %	25 %	0 %	0 %	56461738
48600	NC_006512	GCG	2	6	2838843	2838848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56461739
48601	NC_006512	AAT	2	6	2838878	2838883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56461739
48602	NC_006512	GC	3	6	2838966	2838971	0 %	0 %	50 %	50 %	56461739
48603	NC_006512	AGG	2	6	2839067	2839072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56461739
48604	NC_006512	CGA	2	6	2839174	2839179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56461740
48605	NC_006512	T	6	6	2839198	2839203	0 %	100 %	0 %	0 %	56461740

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.