MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Isoptericola variabilis 225 chromosome

Total Repeats: 109926

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_015588	CCGA	2	8	182231	182238	25 %	0 %	25 %	50 %	334335717
6002	NC_015588	CAC	2	6	182251	182256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334335717
6003	NC_015588	CGG	2	6	182307	182312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335717
6004	NC_015588	CGT	2	6	182346	182351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335717
6005	NC_015588	GCG	2	6	182383	182388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335717
6006	NC_015588	CGA	2	6	182458	182463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335717
6007	NC_015588	CGG	2	6	182473	182478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335717
6008	NC_015588	TCGA	2	8	182486	182493	25 %	25 %	25 %	25 %	334335717
6009	NC_015588	GGA	2	6	182494	182499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334335717
6010	NC_015588	CGA	2	6	182500	182505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335717
6011	NC_015588	GAC	2	6	182507	182512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335717
6012	NC_015588	GGA	2	6	182521	182526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334335717
6013	NC_015588	AGT	2	6	182532	182537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	334335717
6014	NC_015588	AAT	2	6	182586	182591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_015588	TGC	3	9	182705	182713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6016	NC_015588	CCG	2	6	182718	182723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6017	NC_015588	GCC	2	6	182804	182809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6018	NC_015588	CGA	2	6	182854	182859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6019	NC_015588	GGA	2	6	182868	182873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_015588	ACG	2	6	182932	182937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335718
6021	NC_015588	CGAGAC	2	12	182942	182953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335718
6022	NC_015588	GGC	2	6	182996	183001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335718
6023	NC_015588	ACCG	2	8	183033	183040	25 %	0 %	25 %	50 %	334335718
6024	NC_015588	CG	3	6	183061	183066	0 %	0 %	50 %	50 %	334335718
6025	NC_015588	GCA	2	6	183076	183081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335718
6026	NC_015588	ACGC	2	8	183114	183121	25 %	0 %	25 %	50 %	334335718
6027	NC_015588	CGA	2	6	183122	183127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335718
6028	NC_015588	ACC	2	6	183130	183135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334335718
6029	NC_015588	CGT	2	6	183137	183142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335718
6030	NC_015588	GCG	2	6	183184	183189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335718
6031	NC_015588	ACC	2	6	183220	183225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334335718
6032	NC_015588	CGA	2	6	183227	183232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335718
6033	NC_015588	GCC	2	6	183257	183262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334335718
6034	NC_015588	GCT	2	6	183272	183277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335718
6035	NC_015588	TCG	2	6	183316	183321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335718
6036	NC_015588	ACC	2	6	183328	183333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334335718
6037	NC_015588	GAC	2	6	183456	183461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335718
6038	NC_015588	CGA	2	6	183470	183475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335718
6039	NC_015588	CTG	2	6	183477	183482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335718
6040	NC_015588	GCG	2	6	183536	183541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335718
6041	NC_015588	CGG	2	6	183562	183567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335718
6042	NC_015588	GCG	2	6	183596	183601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335718
6043	NC_015588	GCTGGC	2	12	183608	183619	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	334335718
6044	NC_015588	GTG	2	6	183642	183647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334335718
6045	NC_015588	GAG	2	6	183808	183813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_015588	CGA	2	6	183820	183825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6047	NC_015588	TCG	4	12	183870	183881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335719
6048	NC_015588	GTG	2	6	183902	183907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334335719
6049	NC_015588	GCTCG	2	10	183943	183952	0 %	20 %	40 %	40 %	334335719
6050	NC_015588	TGC	2	6	183963	183968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335719
6051	NC_015588	CGG	2	6	183970	183975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335719
6052	NC_015588	CGC	3	9	183997	184005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334335719
6053	NC_015588	CGC	2	6	184021	184026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334335719
6054	NC_015588	CGA	2	6	184048	184053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335719
6055	NC_015588	CGG	2	6	184071	184076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335719
6056	NC_015588	GCCCG	2	10	184120	184129	0 %	0 %	40 %	60 %	334335719
6057	NC_015588	ATC	2	6	184142	184147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	334335719
6058	NC_015588	CGA	2	6	184156	184161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335719
6059	NC_015588	TCG	3	9	184176	184184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335719
6060	NC_015588	CGACGC	2	12	184207	184218	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	334335719
6061	NC_015588	TCG	2	6	184239	184244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335719
6062	NC_015588	CGT	3	9	184255	184263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335719
6063	NC_015588	GAG	2	6	184295	184300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	334335719
6064	NC_015588	CG	3	6	184303	184308	0 %	0 %	50 %	50 %	334335719
6065	NC_015588	CGA	2	6	184360	184365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335719
6066	NC_015588	CTCGC	2	10	184371	184380	0 %	20 %	20 %	60 %	334335719
6067	NC_015588	GTC	2	6	184391	184396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335719
6068	NC_015588	ACG	2	6	184446	184451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335719
6069	NC_015588	TCG	2	6	184464	184469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335719
6070	NC_015588	GTG	2	6	184509	184514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334335719
6071	NC_015588	GGC	2	6	184561	184566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335719
6072	NC_015588	CGT	2	6	184579	184584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335719
6073	NC_015588	ACC	2	6	184589	184594	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334335719
6074	NC_015588	TCG	2	6	184611	184616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335719
6075	NC_015588	CTGGC	2	10	184622	184631	0 %	20 %	40 %	40 %	334335719
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6079	NC_015588	CGG	2	6	184728	184733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335719
6080	NC_015588	CGG	2	6	184765	184770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6081	NC_015588	AATG	2	8	184816	184823	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_015588	GT	3	6	184840	184845	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_015588	CTC	2	6	184920	184925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6084	NC_015588	CCT	2	6	184971	184976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6085	NC_015588	CGC	2	6	184977	184982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6086	NC_015588	CGT	2	6	184984	184989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6087	NC_015588	CG	3	6	185027	185032	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6088	NC_015588	CTG	2	6	185034	185039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6089	NC_015588	CG	4	8	185064	185071	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6090	NC_015588	GGCC	2	8	185105	185112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6091	NC_015588	CGG	2	6	185121	185126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6092	NC_015588	GC	3	6	185134	185139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6093	NC_015588	AC	3	6	185224	185229	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6094	NC_015588	CGA	2	6	185251	185256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6095	NC_015588	GTCG	2	8	185273	185280	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6096	NC_015588	GCG	2	6	185299	185304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6097	NC_015588	TCG	2	6	185330	185335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6098	NC_015588	GAC	2	6	185419	185424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6099	NC_015588	CGGG	2	8	185437	185444	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6100	NC_015588	CGG	2	6	185460	185465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6101	NC_015588	CAAG	2	8	185472	185479	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6102	NC_015588	TGG	2	6	185504	185509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6103	NC_015588	GGT	3	9	185536	185544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6104	NC_015588	AGC	2	6	185545	185550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6105	NC_015588	GCT	2	6	185572	185577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6106	NC_015588	GAA	2	6	185580	185585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6107	NC_015588	CAG	2	6	185670	185675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6108	NC_015588	TGG	3	9	185688	185696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_015588	GCT	2	6	185748	185753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6110	NC_015588	GC	4	8	185971	185978	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6111	NC_015588	GCCGA	2	10	185984	185993	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6112	NC_015588	ATG	2	6	186046	186051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6113	NC_015588	CTG	2	6	186054	186059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6114	NC_015588	GTGACC	2	12	186060	186071	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	334335720
6115	NC_015588	GCA	2	6	186084	186089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335720
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6120	NC_015588	CGG	2	6	186261	186266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335720
6121	NC_015588	GCT	2	6	186319	186324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335720
6122	NC_015588	TGG	2	6	186375	186380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	334335720
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6124	NC_015588	GCC	2	6	186476	186481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334335720
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6249	NC_015588	CGC	2	6	191819	191824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6250	NC_015588	TCCG	2	8	191854	191861	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6251	NC_015588	ACC	2	6	191872	191877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6254	NC_015588	CGG	2	6	191964	191969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6371	NC_015588	CGT	2	6	194930	194935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335727
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6488	NC_015588	ACG	2	6	198907	198912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335733
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6490	NC_015588	CGGG	2	8	199016	199023	0 %	0 %	75 %	25 %	334335733
6491	NC_015588	GTC	2	6	199024	199029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335733
6492	NC_015588	CAC	2	6	199057	199062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	334335733
6493	NC_015588	TCG	2	6	199112	199117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335733
6494	NC_015588	TGCG	2	8	199143	199150	0 %	25 %	50 %	25 %	334335733
6495	NC_015588	GCC	2	6	199238	199243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334335733
6496	NC_015588	CCG	2	6	199270	199275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	334335733
6497	NC_015588	TCG	2	6	199298	199303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	334335733
6498	NC_015588	GCCGG	2	10	199310	199319	0 %	0 %	60 %	40 %	334335733
6499	NC_015588	CGA	2	6	199508	199513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	334335734
6500	NC_015588	CGG	2	6	199544	199549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	334335734

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