MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Isosphaera pallida ATCC 43644 chromosome

Total Repeats: 125073

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014962	TTG	2	6	42697	42702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320101591
1002	NC_014962	CAA	2	6	42708	42713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320101591
1003	NC_014962	GCA	2	6	42743	42748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101591
1004	NC_014962	CCA	2	6	42797	42802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101591
1005	NC_014962	AGC	2	6	42808	42813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101591
1006	NC_014962	CCT	2	6	42830	42835	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320101591
1007	NC_014962	CCA	2	6	42857	42862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101591
1008	NC_014962	AGC	2	6	42904	42909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101591
1009	NC_014962	GCC	2	6	42915	42920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101591
1010	NC_014962	CGG	2	6	42974	42979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101591
1011	NC_014962	GCGG	2	8	43068	43075	0 %	0 %	75 %	25 %	320101591
1012	NC_014962	ACC	2	6	43102	43107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101591
1013	NC_014962	GCT	2	6	43166	43171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101591
1014	NC_014962	GCCCG	2	10	43176	43185	0 %	0 %	40 %	60 %	320101591
1015	NC_014962	C	6	6	43198	43203	0 %	0 %	0 %	100 %	320101591
1016	NC_014962	ACCTTG	2	12	43345	43356	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	320101591
1017	NC_014962	TGC	2	6	43360	43365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101591
1018	NC_014962	GGGC	2	8	43382	43389	0 %	0 %	75 %	25 %	320101591
1019	NC_014962	CGA	2	6	43433	43438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101591
1020	NC_014962	CGG	2	6	43495	43500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101591
1021	NC_014962	GCA	2	6	43505	43510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101591
1022	NC_014962	GGCC	2	8	43529	43536	0 %	0 %	50 %	50 %	320101591
1023	NC_014962	TCG	2	6	43558	43563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101591
1024	NC_014962	GCA	2	6	43595	43600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101591
1025	NC_014962	CCA	2	6	43607	43612	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101591
1026	NC_014962	GCTC	2	8	43618	43625	0 %	25 %	25 %	50 %	320101591
1027	NC_014962	CCGA	2	8	43682	43689	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1028	NC_014962	ATCGG	2	10	43707	43716	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1029	NC_014962	C	6	6	43796	43801	0 %	0 %	0 %	100 %	320101592
1030	NC_014962	TGG	2	6	43823	43828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101592
1031	NC_014962	CGG	2	6	43953	43958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101592
1032	NC_014962	ACC	2	6	43972	43977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101592
1033	NC_014962	TTC	2	6	44019	44024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320101592
1034	NC_014962	ATC	2	6	44050	44055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320101592
1035	NC_014962	CCT	2	6	44078	44083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320101592
1036	NC_014962	TCC	2	6	44122	44127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320101592
1037	NC_014962	ACCG	2	8	44135	44142	25 %	0 %	25 %	50 %	320101592
1038	NC_014962	CGGGTC	2	12	44146	44157	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	320101592
1039	NC_014962	GAT	2	6	44166	44171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320101592
1040	NC_014962	CGC	2	6	44231	44236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101592
1041	NC_014962	ATCTCG	2	12	44242	44253	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	320101592
1042	NC_014962	GGC	2	6	44307	44312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101592
1043	NC_014962	CG	3	6	44331	44336	0 %	0 %	50 %	50 %	320101592
1044	NC_014962	GC	3	6	44350	44355	0 %	0 %	50 %	50 %	320101592
1045	NC_014962	CGCC	2	8	44356	44363	0 %	0 %	25 %	75 %	320101592
1046	NC_014962	GCGG	2	8	44383	44390	0 %	0 %	75 %	25 %	320101592
1047	NC_014962	CTG	2	6	44462	44467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101592
1048	NC_014962	ACC	2	6	44479	44484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101592
1049	NC_014962	GCG	2	6	44491	44496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101592
1050	NC_014962	TGG	2	6	44576	44581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101592
1051	NC_014962	CGA	2	6	44594	44599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101592
1052	NC_014962	ACC	2	6	44689	44694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101592
1053	NC_014962	CGG	2	6	44712	44717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101592
1054	NC_014962	CGA	2	6	44745	44750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101592
1055	NC_014962	GAGCA	2	10	44804	44813	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1056	NC_014962	GAC	2	6	44859	44864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_014962	CTC	2	6	44941	44946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320101593
1058	NC_014962	CGG	2	6	44977	44982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101593
1059	NC_014962	CG	3	6	45008	45013	0 %	0 %	50 %	50 %	320101593
1060	NC_014962	GCG	2	6	45038	45043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101593
1061	NC_014962	CCA	2	6	45088	45093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101593
1062	NC_014962	TCGC	2	8	45139	45146	0 %	25 %	25 %	50 %	320101593
1063	NC_014962	CGT	2	6	45147	45152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101593
1064	NC_014962	CTT	2	6	45160	45165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320101593
1065	NC_014962	TGG	2	6	45186	45191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101593
1066	NC_014962	G	7	7	45190	45196	0 %	0 %	100 %	0 %	320101593
1067	NC_014962	GTC	2	6	45206	45211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101593
1068	NC_014962	CCG	2	6	45225	45230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101593
1069	NC_014962	TGG	2	6	45336	45341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101593
1070	NC_014962	TGG	2	6	45372	45377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101593
1071	NC_014962	CCA	2	6	45384	45389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101593
1072	NC_014962	GCTG	2	8	45439	45446	0 %	25 %	50 %	25 %	320101593
1073	NC_014962	GGC	2	6	45459	45464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101593
1074	NC_014962	TGG	2	6	45534	45539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101593
1075	NC_014962	GGT	2	6	45547	45552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101593
1076	NC_014962	CGG	2	6	45603	45608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101593
1077	NC_014962	TGG	2	6	45609	45614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101593
1078	NC_014962	GAC	3	9	45630	45638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101593
1079	NC_014962	GGC	2	6	45691	45696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101593
1080	NC_014962	GCC	2	6	45725	45730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101593
1081	NC_014962	GTC	2	6	45745	45750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101593
1082	NC_014962	CGC	2	6	45967	45972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101593
1083	NC_014962	TGA	2	6	45990	45995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320101593
1084	NC_014962	TTC	2	6	46112	46117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320101593
1085	NC_014962	CGC	2	6	46153	46158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101593
1086	NC_014962	CCGCT	2	10	46180	46189	0 %	20 %	20 %	60 %	320101593
1087	NC_014962	CCG	2	6	46190	46195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101593
1088	NC_014962	TCG	2	6	46254	46259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101593
1089	NC_014962	GTC	2	6	46283	46288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101593
1090	NC_014962	TGG	2	6	46314	46319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101593
1091	NC_014962	GCC	2	6	46405	46410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101593
1092	NC_014962	CGC	2	6	46420	46425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101593
1093	NC_014962	CGA	2	6	46430	46435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101593
1094	NC_014962	GGTC	2	8	46447	46454	0 %	25 %	50 %	25 %	320101593
1095	NC_014962	GTC	3	9	46498	46506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101593
1096	NC_014962	TCC	2	6	46535	46540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1097	NC_014962	AT	4	8	46609	46616	50 %	50 %	0 %	0 %	320101594
1098	NC_014962	GAT	2	6	46642	46647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320101594
1099	NC_014962	CCT	2	6	46720	46725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320101594
1100	NC_014962	G	6	6	46783	46788	0 %	0 %	100 %	0 %	320101594
1101	NC_014962	TG	3	6	46790	46795	0 %	50 %	50 %	0 %	320101594
1102	NC_014962	GATC	2	8	46905	46912	25 %	25 %	25 %	25 %	320101594
1103	NC_014962	GCG	2	6	46929	46934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101594
1104	NC_014962	GC	3	6	46952	46957	0 %	0 %	50 %	50 %	320101594
1105	NC_014962	CCG	2	6	47002	47007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101594
1106	NC_014962	ATG	2	6	47033	47038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320101594
1107	NC_014962	CGG	2	6	47063	47068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101594
1108	NC_014962	GGA	2	6	47103	47108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320101594
1109	NC_014962	GCT	2	6	47142	47147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101594
1110	NC_014962	TGG	2	6	47285	47290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101594
1111	NC_014962	CGCGC	2	10	47317	47326	0 %	0 %	40 %	60 %	320101594
1112	NC_014962	CGG	2	6	47340	47345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101594
1113	NC_014962	TCA	2	6	47384	47389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320101594
1114	NC_014962	CG	3	6	47435	47440	0 %	0 %	50 %	50 %	320101594
1115	NC_014962	GATCG	2	10	47444	47453	20 %	20 %	40 %	20 %	320101594
1116	NC_014962	GCT	3	9	47455	47463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101595
1117	NC_014962	GAC	2	6	47491	47496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101595
1118	NC_014962	TGCT	2	8	47498	47505	0 %	50 %	25 %	25 %	320101595
1119	NC_014962	TCA	2	6	47529	47534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320101595
1120	NC_014962	CAC	2	6	47543	47548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101595
1121	NC_014962	CG	3	6	47624	47629	0 %	0 %	50 %	50 %	320101595
1122	NC_014962	CGC	2	6	47794	47799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101595
1123	NC_014962	TCC	2	6	47831	47836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320101595
1124	NC_014962	CTC	2	6	47847	47852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320101595
1125	NC_014962	CG	3	6	47883	47888	0 %	0 %	50 %	50 %	320101596
1126	NC_014962	TTC	2	6	47908	47913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320101596
1127	NC_014962	CAA	2	6	48048	48053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320101596
1128	NC_014962	GCC	2	6	48101	48106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1129	NC_014962	TTC	2	6	48125	48130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_014962	ATCCG	2	10	48134	48143	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1131	NC_014962	TCGC	2	8	48170	48177	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1132	NC_014962	AGC	2	6	48190	48195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_014962	CCG	2	6	48253	48258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1134	NC_014962	CGT	2	6	48312	48317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_014962	AATCAT	2	12	48333	48344	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1136	NC_014962	TCCC	2	8	48349	48356	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1137	NC_014962	TCCC	2	8	48361	48368	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1138	NC_014962	CCCCG	2	10	48384	48393	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
1139	NC_014962	GAG	2	6	48395	48400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1141	NC_014962	CCG	2	6	48485	48490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101597
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1143	NC_014962	CGT	2	6	48511	48516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101597
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1149	NC_014962	GGC	2	6	48950	48955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101597
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1154	NC_014962	TTCG	2	8	49204	49211	0 %	50 %	25 %	25 %	320101597
1155	NC_014962	CGAT	2	8	49236	49243	25 %	25 %	25 %	25 %	320101597
1156	NC_014962	GTG	2	6	49262	49267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101597
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1159	NC_014962	GGGC	2	8	49426	49433	0 %	0 %	75 %	25 %	320101597
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1233	NC_014962	GGT	2	6	52477	52482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101597
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1248	NC_014962	CAA	2	6	53110	53115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320101597
1249	NC_014962	ATCC	2	8	53126	53133	25 %	25 %	0 %	50 %	320101597
1250	NC_014962	GCG	2	6	53274	53279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101597
1251	NC_014962	GGCG	2	8	53302	53309	0 %	0 %	75 %	25 %	320101597
1252	NC_014962	ACG	2	6	53313	53318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101597
1253	NC_014962	CGC	2	6	53383	53388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101597
1254	NC_014962	GAG	2	6	53396	53401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320101597
1255	NC_014962	GCC	2	6	53446	53451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101597
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1257	NC_014962	GCTCC	2	10	53498	53507	0 %	20 %	20 %	60 %	320101597
1258	NC_014962	GGTT	2	8	53520	53527	0 %	50 %	50 %	0 %	320101597
1259	NC_014962	CCG	2	6	53583	53588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101597
1260	NC_014962	CTCAG	2	10	53653	53662	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1261	NC_014962	CGG	2	6	53721	53726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1262	NC_014962	CGGC	2	8	53745	53752	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1263	NC_014962	ACTCG	2	10	53765	53774	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1264	NC_014962	TCC	2	6	53786	53791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1265	NC_014962	TTCCA	2	10	53814	53823	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1266	NC_014962	CGC	2	6	53839	53844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1267	NC_014962	CCCT	2	8	53854	53861	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1268	NC_014962	TCCC	2	8	53875	53882	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1269	NC_014962	C	7	7	53880	53886	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1270	NC_014962	TCCC	2	8	53887	53894	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1271	NC_014962	CGC	2	6	53986	53991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101598
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1275	NC_014962	TCGA	2	8	54289	54296	25 %	25 %	25 %	25 %	320101598
1276	NC_014962	CGCT	2	8	54313	54320	0 %	25 %	25 %	50 %	320101598
1277	NC_014962	CCG	2	6	54353	54358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101598
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1310	NC_014962	TGG	2	6	55571	55576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1312	NC_014962	TCGAG	2	10	55656	55665	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1313	NC_014962	TCA	2	6	55846	55851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1364	NC_014962	CCG	2	6	58219	58224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101599
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1375	NC_014962	C	6	6	58660	58665	0 %	0 %	0 %	100 %	320101599
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1498	NC_014962	CTT	2	6	62943	62948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320101602
1499	NC_014962	CTCC	2	8	62984	62991	0 %	25 %	0 %	75 %	320101602
1500	NC_014962	CG	3	6	62994	62999	0 %	0 %	50 %	50 %	320101602

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