MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Isosphaera pallida ATCC 43644 chromosome

Total Repeats: 125073

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014962	ATT	2	6	20614	20619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320101570
502	NC_014962	CGC	2	6	20676	20681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101570
503	NC_014962	AACC	2	8	20799	20806	50 %	0 %	0 %	50 %	320101571
504	NC_014962	GAC	2	6	20848	20853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101571
505	NC_014962	GTC	2	6	20947	20952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101571
506	NC_014962	CTA	2	6	21021	21026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320101571
507	NC_014962	TGG	3	9	21041	21049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101571
508	NC_014962	GGT	2	6	21093	21098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101571
509	NC_014962	CGC	2	6	21104	21109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101571
510	NC_014962	GAG	2	6	21214	21219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320101571
511	NC_014962	TGG	2	6	21238	21243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101571
512	NC_014962	ACG	2	6	21269	21274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101571
513	NC_014962	TTC	2	6	21328	21333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320101571
514	NC_014962	TGC	2	6	21347	21352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101571
515	NC_014962	GAC	2	6	21437	21442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101571
516	NC_014962	TCT	2	6	21449	21454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320101571
517	NC_014962	AAC	2	6	21641	21646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320101571
518	NC_014962	CAA	2	6	21676	21681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320101571
519	NC_014962	CGC	2	6	21738	21743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101571
520	NC_014962	ATC	2	6	21746	21751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320101571
521	NC_014962	GAT	2	6	21756	21761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320101571
522	NC_014962	GCC	2	6	21822	21827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101571
523	NC_014962	AAG	2	6	21841	21846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320101571
524	NC_014962	CGC	2	6	21869	21874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101571
525	NC_014962	CCA	2	6	21878	21883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101571
526	NC_014962	AAT	2	6	21914	21919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_014962	CAA	2	6	21954	21959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_014962	CAT	2	6	21962	21967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_014962	CGATC	2	10	21968	21977	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
530	NC_014962	AAG	2	6	21991	21996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_014962	GGATC	2	10	22002	22011	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
532	NC_014962	CAA	2	6	22050	22055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_014962	CCG	2	6	22083	22088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
534	NC_014962	ACCA	2	8	22097	22104	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
535	NC_014962	GGT	2	6	22112	22117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101572
536	NC_014962	GGC	2	6	22172	22177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101572
537	NC_014962	GAA	2	6	22269	22274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320101572
538	NC_014962	CCGCG	2	10	22285	22294	0 %	0 %	40 %	60 %	320101572
539	NC_014962	CCT	2	6	22340	22345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320101573
540	NC_014962	ACC	2	6	22378	22383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101573
541	NC_014962	GCC	2	6	22384	22389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101573
542	NC_014962	TCGG	2	8	22392	22399	0 %	25 %	50 %	25 %	320101573
543	NC_014962	CGA	2	6	22409	22414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101573
544	NC_014962	GAG	2	6	22439	22444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320101573
545	NC_014962	AAAC	2	8	22454	22461	75 %	0 %	0 %	25 %	320101573
546	NC_014962	CGC	2	6	22571	22576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101573
547	NC_014962	TGG	2	6	22580	22585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101573
548	NC_014962	GTC	2	6	22590	22595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101573
549	NC_014962	CGT	2	6	22742	22747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101573
550	NC_014962	CTT	2	6	22755	22760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320101573
551	NC_014962	TC	3	6	22784	22789	0 %	50 %	0 %	50 %	320101573
552	NC_014962	GGC	2	6	22815	22820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101573
553	NC_014962	GC	3	6	22826	22831	0 %	0 %	50 %	50 %	320101573
554	NC_014962	CAC	2	6	22836	22841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101573
555	NC_014962	GCT	2	6	22910	22915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101573
556	NC_014962	GCG	2	6	23008	23013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101573
557	NC_014962	GCT	2	6	23036	23041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101573
558	NC_014962	GAC	2	6	23079	23084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101573
559	NC_014962	TCA	2	6	23175	23180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_014962	ATC	2	6	23199	23204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_014962	ACA	2	6	23219	23224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_014962	GAGT	2	8	23298	23305	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
563	NC_014962	TCAT	2	8	23306	23313	25 %	50 %	0 %	25 %	320101574
564	NC_014962	CGG	2	6	23317	23322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101574
565	NC_014962	AG	3	6	23345	23350	50 %	0 %	50 %	0 %	320101574
566	NC_014962	TTC	2	6	23370	23375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320101574
567	NC_014962	CGATC	2	10	23407	23416	20 %	20 %	20 %	40 %	320101574
568	NC_014962	AGT	2	6	23421	23426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320101574
569	NC_014962	CAT	2	6	23485	23490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320101574
570	NC_014962	CAG	2	6	23522	23527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101574
571	NC_014962	GCGG	2	8	23564	23571	0 %	0 %	75 %	25 %	320101574
572	NC_014962	TGG	2	6	23593	23598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101574
573	NC_014962	GTT	2	6	23611	23616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320101574
574	NC_014962	CTT	2	6	23654	23659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320101574
575	NC_014962	TTC	2	6	23699	23704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320101574
576	NC_014962	TTG	2	6	23742	23747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320101574
577	NC_014962	GAG	2	6	23807	23812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320101574
578	NC_014962	GTG	2	6	23826	23831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101574
579	NC_014962	GTC	2	6	23862	23867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101574
580	NC_014962	ATCC	2	8	23902	23909	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
581	NC_014962	ATCGA	2	10	23941	23950	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
582	NC_014962	GAAC	2	8	23956	23963	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
583	NC_014962	CGT	2	6	23968	23973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_014962	ACG	2	6	23977	23982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_014962	GAG	3	9	24051	24059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
586	NC_014962	G	9	9	24095	24103	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
587	NC_014962	G	6	6	24206	24211	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
588	NC_014962	GTG	3	9	24241	24249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
589	NC_014962	CGG	2	6	24266	24271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_014962	CGG	2	6	24273	24278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_014962	TGGGAT	2	12	24286	24297	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
592	NC_014962	GGGTC	2	10	24304	24313	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
593	NC_014962	GGC	2	6	24385	24390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101575
594	NC_014962	CGG	3	9	24405	24413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101575
595	NC_014962	CCA	2	6	24438	24443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101575
596	NC_014962	CGG	2	6	24450	24455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101575
597	NC_014962	TGG	2	6	24474	24479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101575
598	NC_014962	TCGAG	2	10	24498	24507	20 %	20 %	40 %	20 %	320101575
599	NC_014962	CGG	2	6	24513	24518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101575
600	NC_014962	GGT	2	6	24670	24675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101575
601	NC_014962	AGCC	2	8	24679	24686	25 %	0 %	25 %	50 %	320101575
602	NC_014962	GTT	2	6	24783	24788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320101575
603	NC_014962	CGG	2	6	24818	24823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101575
604	NC_014962	TCC	2	6	24869	24874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320101575
605	NC_014962	CGC	3	9	24885	24893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101575
606	NC_014962	CGA	2	6	24903	24908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101575
607	NC_014962	GGCG	2	8	24996	25003	0 %	0 %	75 %	25 %	320101575
608	NC_014962	GAT	2	6	25018	25023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320101575
609	NC_014962	CGAC	2	8	25044	25051	25 %	0 %	25 %	50 %	320101575
610	NC_014962	GAC	2	6	25092	25097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101575
611	NC_014962	GTG	2	6	25126	25131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101575
612	NC_014962	GGT	2	6	25228	25233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101575
613	NC_014962	CCG	2	6	25247	25252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320101575
614	NC_014962	GCGG	2	8	25306	25313	0 %	0 %	75 %	25 %	320101575
615	NC_014962	GAT	3	9	25351	25359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320101575
616	NC_014962	GACG	2	8	25360	25367	25 %	0 %	50 %	25 %	320101575
617	NC_014962	TCG	2	6	25377	25382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101575
618	NC_014962	CAACGC	2	12	25481	25492	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	320101576
619	NC_014962	TGG	2	6	25532	25537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320101576
620	NC_014962	CGT	2	6	25547	25552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320101576
621	NC_014962	CAAC	2	8	25608	25615	50 %	0 %	0 %	50 %	320101576
622	NC_014962	GAT	2	6	25672	25677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320101576
623	NC_014962	GCG	2	6	25692	25697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320101576
624	NC_014962	CG	3	6	25708	25713	0 %	0 %	50 %	50 %	320101576
625	NC_014962	TCCGA	2	10	25732	25741	20 %	20 %	20 %	40 %	320101576
626	NC_014962	CCGCT	3	15	25743	25757	0 %	20 %	20 %	60 %	320101576
627	NC_014962	ACC	2	6	25775	25780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320101576
628	NC_014962	CCGGC	2	10	25792	25801	0 %	0 %	40 %	60 %	320101576
629	NC_014962	GGAAC	2	10	25836	25845	40 %	0 %	40 %	20 %	320101576
630	NC_014962	G	6	6	25848	25853	0 %	0 %	100 %	0 %	320101576
631	NC_014962	CGA	2	6	25906	25911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320101576
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633	NC_014962	C	6	6	25968	25973	0 %	0 %	0 %	100 %	320101576
634	NC_014962	CG	3	6	26038	26043	0 %	0 %	50 %	50 %	320101576
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637	NC_014962	G	6	6	26149	26154	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
638	NC_014962	GGTC	2	8	26158	26165	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
639	NC_014962	GCA	2	6	26281	26286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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641	NC_014962	GC	4	8	26337	26344	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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885	NC_014962	CGG	2	6	36600	36605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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