MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Isosphaera pallida ATCC 43644 plasmid pISOP01

Total Repeats: 103

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014957	ACGAG	2	10	157	166	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_014957	TCGGT	2	10	367	376	0 %	40 %	40 %	20 %	320041923
3	NC_014957	CGCCC	2	10	1031	1040	0 %	0 %	20 %	80 %	320041923
4	NC_014957	ACGCC	2	10	3041	3050	20 %	0 %	20 %	60 %	320041923
5	NC_014957	CCCGG	2	10	3098	3107	0 %	0 %	40 %	60 %	320041923
6	NC_014957	CGCCC	2	10	3324	3333	0 %	0 %	20 %	80 %	320041923
7	NC_014957	ATGCG	2	10	3730	3739	20 %	20 %	40 %	20 %	320041924
8	NC_014957	ACATG	2	10	3801	3810	40 %	20 %	20 %	20 %	320041924
9	NC_014957	CTGAT	2	10	4116	4125	20 %	40 %	20 %	20 %	320041925
10	NC_014957	ATGGG	2	10	4278	4287	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014957	GGAAG	2	10	4348	4357	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014957	CGAAT	2	10	4511	4520	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_014957	GGCCG	2	10	4669	4678	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
14	NC_014957	ATCGA	2	10	4737	4746	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_014957	GCGGA	2	10	4788	4797	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
16	NC_014957	GATGA	2	10	4859	4868	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014957	GTCGC	2	10	4933	4942	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_014957	GGAAA	2	10	4966	4975	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014957	GTTCC	2	10	4989	4998	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_014957	CATTC	2	10	5003	5012	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NC_014957	GTGAT	2	10	5132	5141	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014957	AACCG	2	10	5174	5183	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_014957	GTCAT	2	10	5458	5467	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_014957	CTCGT	2	10	5496	5505	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_014957	CTGGT	3	15	5506	5520	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_014957	GTTGT	2	10	7725	7734	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014957	CGCGG	2	10	7752	7761	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
28	NC_014957	CACCT	2	10	8818	8827	20 %	20 %	0 %	60 %	320041927
29	NC_014957	CGCGG	2	10	9149	9158	0 %	0 %	60 %	40 %	320041927
30	NC_014957	GCGCC	2	10	9857	9866	0 %	0 %	40 %	60 %	320041927
31	NC_014957	CGGCC	2	10	10920	10929	0 %	0 %	40 %	60 %	320041927
32	NC_014957	CGCGC	2	10	11109	11118	0 %	0 %	40 %	60 %	320041927
33	NC_014957	CCGCG	2	10	11162	11171	0 %	0 %	40 %	60 %	320041927
34	NC_014957	CCCCT	2	10	13977	13986	0 %	20 %	0 %	80 %	320041928
35	NC_014957	TGGCG	2	10	14022	14031	0 %	20 %	60 %	20 %	320041928
36	NC_014957	GGTCG	2	10	14038	14047	0 %	20 %	60 %	20 %	320041928
37	NC_014957	TTGGG	2	10	14221	14230	0 %	40 %	60 %	0 %	320041928
38	NC_014957	TCACC	2	10	15284	15293	20 %	20 %	0 %	60 %	320041929
39	NC_014957	GCCCC	2	10	15682	15691	0 %	0 %	20 %	80 %	320041929
40	NC_014957	CGCTC	2	10	16243	16252	0 %	20 %	20 %	60 %	320041930
41	NC_014957	TCCCC	2	10	16333	16342	0 %	20 %	0 %	80 %	320041930
42	NC_014957	GCAGG	2	10	17471	17480	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
43	NC_014957	GGGGA	2	10	18170	18179	20 %	0 %	80 %	0 %	320041932
44	NC_014957	AAACC	2	10	19144	19153	60 %	0 %	0 %	40 %	320041933
45	NC_014957	CTGGT	2	10	19805	19814	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_014957	GGTTG	2	10	20123	20132	0 %	40 %	60 %	0 %	320041934
47	NC_014957	ACCGT	2	10	20294	20303	20 %	20 %	20 %	40 %	320041934
48	NC_014957	CGCGC	2	10	20825	20834	0 %	0 %	40 %	60 %	320041934
49	NC_014957	CGCAG	2	10	22722	22731	20 %	0 %	40 %	40 %	320041936
50	NC_014957	ATCCC	3	15	23786	23800	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
51	NC_014957	CGGAC	3	15	23818	23832	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
52	NC_014957	CGGAC	4	20	23838	23857	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
53	NC_014957	GTAAC	2	10	24057	24066	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_014957	ATGTT	2	10	24080	24089	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014957	GCCCC	2	10	25253	25262	0 %	0 %	20 %	80 %	320041937
56	NC_014957	CAGGG	2	10	25371	25380	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
57	NC_014957	GAGGG	2	10	26697	26706	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014957	AGGGG	2	10	26714	26723	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014957	TCGGG	3	15	26750	26764	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
60	NC_014957	CCATC	2	10	27967	27976	20 %	20 %	0 %	60 %	320041939
61	NC_014957	CGGGC	2	10	28287	28296	0 %	0 %	60 %	40 %	320041940
62	NC_014957	GGCGG	2	10	28877	28886	0 %	0 %	80 %	20 %	320041940
63	NC_014957	CCGGC	2	10	31054	31063	0 %	0 %	40 %	60 %	320041941
64	NC_014957	TCGAG	2	10	31270	31279	20 %	20 %	40 %	20 %	320041941
65	NC_014957	GGCCT	2	10	31444	31453	0 %	20 %	40 %	40 %	320041941
66	NC_014957	GGCAT	2	10	32030	32039	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_014957	CGGCC	2	10	32600	32609	0 %	0 %	40 %	60 %	320041942
68	NC_014957	ACCGC	2	10	32872	32881	20 %	0 %	20 %	60 %	320041942
69	NC_014957	CCGCT	2	10	33118	33127	0 %	20 %	20 %	60 %	320041942
70	NC_014957	GCTGC	2	10	34289	34298	0 %	20 %	40 %	40 %	320041942
71	NC_014957	AAGCC	2	10	35278	35287	40 %	0 %	20 %	40 %	320041942
72	NC_014957	GCCAC	2	10	35619	35628	20 %	0 %	20 %	60 %	320041942
73	NC_014957	CGCGC	2	10	36009	36018	0 %	0 %	40 %	60 %	320041942
74	NC_014957	CCCAA	2	10	38474	38483	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
75	NC_014957	TCGCG	2	10	39941	39950	0 %	20 %	40 %	40 %	320041945
76	NC_014957	TTGAG	2	10	40033	40042	20 %	40 %	40 %	0 %	320041945
77	NC_014957	ACGAC	2	10	40408	40417	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_014957	GGGAG	2	10	40785	40794	20 %	0 %	80 %	0 %	320041946
79	NC_014957	CGGTG	2	10	41052	41061	0 %	20 %	60 %	20 %	320041946
80	NC_014957	GGCCC	2	10	41343	41352	0 %	0 %	40 %	60 %	320041946
81	NC_014957	ACAGC	2	10	42284	42293	40 %	0 %	20 %	40 %	320041946
82	NC_014957	CGGCG	2	10	42841	42850	0 %	0 %	60 %	40 %	320041948
83	NC_014957	TCATC	2	10	44160	44169	20 %	40 %	0 %	40 %	320041948
84	NC_014957	TTGTT	3	15	44361	44375	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014957	GGACG	2	10	45023	45032	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
86	NC_014957	TGGGG	2	10	45083	45092	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014957	GCTGG	2	10	45245	45254	0 %	20 %	60 %	20 %	320041949
88	NC_014957	CCTGA	2	10	46550	46559	20 %	20 %	20 %	40 %	320041949
89	NC_014957	TTAAG	2	10	46709	46718	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014957	GTTCC	2	10	47792	47801	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
91	NC_014957	TTGAG	2	10	50646	50655	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014957	CCAGG	2	10	50762	50771	20 %	0 %	40 %	40 %	320041951
93	NC_014957	GGTCC	2	10	51886	51895	0 %	20 %	40 %	40 %	320041951
94	NC_014957	ACGGA	5	25	52290	52314	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
95	NC_014957	CACCT	3	15	53179	53193	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
96	NC_014957	TCACC	2	10	53208	53217	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
97	NC_014957	TCATC	2	10	53218	53227	20 %	40 %	0 %	40 %	320041953
98	NC_014957	CCCCG	2	10	53232	53241	0 %	0 %	20 %	80 %	320041953
99	NC_014957	GCGCC	2	10	53811	53820	0 %	0 %	40 %	60 %	320041953
100	NC_014957	TGGTG	5	25	54313	54337	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014957	CTGAA	2	10	54727	54736	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_014957	CTTGA	2	10	54826	54835	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_014957	CGGTT	2	10	55408	55417	0 %	40 %	40 %	20 %	320041954

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.