MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Isosphaera pallida ATCC 43644 plasmid pISOP01

Total Repeats: 175

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014957	TGTT	2	8	127	134	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014957	GCCG	2	8	837	844	0 %	0 %	50 %	50 %	320041923
3	NC_014957	CGCC	2	8	920	927	0 %	0 %	25 %	75 %	320041923
4	NC_014957	GACG	2	8	1089	1096	25 %	0 %	50 %	25 %	320041923
5	NC_014957	CCGC	2	8	1417	1424	0 %	0 %	25 %	75 %	320041923
6	NC_014957	GCCA	2	8	1611	1618	25 %	0 %	25 %	50 %	320041923
7	NC_014957	CTGC	2	8	1919	1926	0 %	25 %	25 %	50 %	320041923
8	NC_014957	CGCT	2	8	2601	2608	0 %	25 %	25 %	50 %	320041923
9	NC_014957	CGCC	2	8	2762	2769	0 %	0 %	25 %	75 %	320041923
10	NC_014957	ACGG	2	8	3007	3014	25 %	0 %	50 %	25 %	320041923
11	NC_014957	CGCC	2	8	3020	3027	0 %	0 %	25 %	75 %	320041923
12	NC_014957	CCGC	2	8	3112	3119	0 %	0 %	25 %	75 %	320041923
13	NC_014957	GGTC	2	8	3146	3153	0 %	25 %	50 %	25 %	320041923
14	NC_014957	CCGC	2	8	3343	3350	0 %	0 %	25 %	75 %	320041923
15	NC_014957	AAGC	2	8	3540	3547	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_014957	GGTC	2	8	3752	3759	0 %	25 %	50 %	25 %	320041924
17	NC_014957	CATC	2	8	3905	3912	25 %	25 %	0 %	50 %	320041924
18	NC_014957	TCGC	2	8	4031	4038	0 %	25 %	25 %	50 %	320041925
19	NC_014957	AGTG	2	8	4248	4255	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014957	GAAG	2	8	4295	4302	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014957	ATCG	2	8	4426	4433	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_014957	GTTC	2	8	4719	4726	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_014957	GACG	2	8	4749	4756	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_014957	CTTG	2	8	5409	5416	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_014957	GACG	2	8	5551	5558	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_014957	CCGG	2	8	5575	5582	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_014957	ACGG	2	8	5758	5765	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_014957	CCCG	2	8	6029	6036	0 %	0 %	25 %	75 %	320041926
29	NC_014957	CCTT	2	8	6213	6220	0 %	50 %	0 %	50 %	320041926
30	NC_014957	CCCA	2	8	7337	7344	25 %	0 %	0 %	75 %	320041926
31	NC_014957	CCCA	2	8	7829	7836	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
32	NC_014957	GCAG	2	8	8005	8012	25 %	0 %	50 %	25 %	320041927
33	NC_014957	GACC	2	8	8081	8088	25 %	0 %	25 %	50 %	320041927
34	NC_014957	CGCC	2	8	8948	8955	0 %	0 %	25 %	75 %	320041927
35	NC_014957	TGCA	2	8	9108	9115	25 %	25 %	25 %	25 %	320041927
36	NC_014957	CGAT	2	8	9982	9989	25 %	25 %	25 %	25 %	320041927
37	NC_014957	GCCC	2	8	10304	10311	0 %	0 %	25 %	75 %	320041927
38	NC_014957	CGGC	2	8	10492	10499	0 %	0 %	50 %	50 %	320041927
39	NC_014957	CCCG	2	8	10529	10536	0 %	0 %	25 %	75 %	320041927
40	NC_014957	ACCC	2	8	10722	10729	25 %	0 %	0 %	75 %	320041927
41	NC_014957	GCCG	2	8	10796	10803	0 %	0 %	50 %	50 %	320041927
42	NC_014957	AGCG	2	8	11667	11674	25 %	0 %	50 %	25 %	320041927
43	NC_014957	GGGA	2	8	11935	11942	25 %	0 %	75 %	0 %	320041927
44	NC_014957	GACC	2	8	12281	12288	25 %	0 %	25 %	50 %	320041927
45	NC_014957	GATC	2	8	12408	12415	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_014957	GGCA	2	8	12797	12804	25 %	0 %	50 %	25 %	320041928
47	NC_014957	TGGT	2	8	13756	13763	0 %	50 %	50 %	0 %	320041928
48	NC_014957	CCGG	2	8	14095	14102	0 %	0 %	50 %	50 %	320041928
49	NC_014957	TGGG	2	8	14204	14211	0 %	25 %	75 %	0 %	320041928
50	NC_014957	GCCG	2	8	14299	14306	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_014957	CGGG	2	8	14329	14336	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
52	NC_014957	GCCG	2	8	14503	14510	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_014957	CGGC	2	8	15298	15305	0 %	0 %	50 %	50 %	320041929
54	NC_014957	CCCG	2	8	15529	15536	0 %	0 %	25 %	75 %	320041929
55	NC_014957	CCGT	2	8	15734	15741	0 %	25 %	25 %	50 %	320041929
56	NC_014957	CCCG	2	8	15783	15790	0 %	0 %	25 %	75 %	320041929
57	NC_014957	TGGC	2	8	15875	15882	0 %	25 %	50 %	25 %	320041929
58	NC_014957	CAAG	2	8	17224	17231	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_014957	GCGG	2	8	17976	17983	0 %	0 %	75 %	25 %	320041932
60	NC_014957	GCGG	2	8	18148	18155	0 %	0 %	75 %	25 %	320041932
61	NC_014957	TGGG	2	8	18349	18356	0 %	25 %	75 %	0 %	320041933
62	NC_014957	CAGG	2	8	18366	18373	25 %	0 %	50 %	25 %	320041933
63	NC_014957	CCGC	2	8	18952	18959	0 %	0 %	25 %	75 %	320041933
64	NC_014957	TGAA	2	8	19078	19085	50 %	25 %	25 %	0 %	320041933
65	NC_014957	TTCG	2	8	19424	19431	0 %	50 %	25 %	25 %	320041933
66	NC_014957	GGCG	2	8	19757	19764	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
67	NC_014957	GGGA	2	8	19789	19796	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014957	CGGA	2	8	20592	20599	25 %	0 %	50 %	25 %	320041934
69	NC_014957	GCCA	2	8	21569	21576	25 %	0 %	25 %	50 %	320041935
70	NC_014957	GGGC	2	8	21911	21918	0 %	0 %	75 %	25 %	320041935
71	NC_014957	CGGG	2	8	22383	22390	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
72	NC_014957	TGGT	2	8	22776	22783	0 %	50 %	50 %	0 %	320041936
73	NC_014957	CCAA	2	8	23010	23017	50 %	0 %	0 %	50 %	320041936
74	NC_014957	GGGC	2	8	23029	23036	0 %	0 %	75 %	25 %	320041936
75	NC_014957	GATC	2	8	23161	23168	25 %	25 %	25 %	25 %	320041936
76	NC_014957	GGCC	2	8	23467	23474	0 %	0 %	50 %	50 %	320041936
77	NC_014957	CCCG	2	8	23493	23500	0 %	0 %	25 %	75 %	320041936
78	NC_014957	CCCA	2	8	23591	23598	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
79	NC_014957	GCCA	2	8	23712	23719	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_014957	GGAT	2	8	23859	23866	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014957	TGCG	2	8	24214	24221	0 %	25 %	50 %	25 %	320041937
82	NC_014957	CTGG	2	8	24708	24715	0 %	25 %	50 %	25 %	320041937
83	NC_014957	CGAC	2	8	24810	24817	25 %	0 %	25 %	50 %	320041937
84	NC_014957	GCTG	2	8	24981	24988	0 %	25 %	50 %	25 %	320041937
85	NC_014957	GGCT	2	8	26108	26115	0 %	25 %	50 %	25 %	320041938
86	NC_014957	TCGG	2	8	26304	26311	0 %	25 %	50 %	25 %	320041938
87	NC_014957	GATC	2	8	26398	26405	25 %	25 %	25 %	25 %	320041938
88	NC_014957	CACC	2	8	26845	26852	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
89	NC_014957	AGGG	2	8	27030	27037	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014957	TCGG	2	8	27135	27142	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_014957	GCGT	2	8	27288	27295	0 %	25 %	50 %	25 %	320041939
92	NC_014957	CGGG	2	8	27436	27443	0 %	0 %	75 %	25 %	320041939
93	NC_014957	CAAC	2	8	27934	27941	50 %	0 %	0 %	50 %	320041939
94	NC_014957	CGCC	2	8	28212	28219	0 %	0 %	25 %	75 %	320041940
95	NC_014957	TGGG	2	8	29076	29083	0 %	25 %	75 %	0 %	320041940
96	NC_014957	GCGG	2	8	29209	29216	0 %	0 %	75 %	25 %	320041940
97	NC_014957	CAAC	2	8	29404	29411	50 %	0 %	0 %	50 %	320041940
98	NC_014957	CAAC	2	8	29551	29558	50 %	0 %	0 %	50 %	320041940
99	NC_014957	TCAA	2	8	29559	29566	50 %	25 %	0 %	25 %	320041940
100	NC_014957	ACCA	2	8	29639	29646	50 %	0 %	0 %	50 %	320041940
101	NC_014957	ATGG	2	8	31178	31185	25 %	25 %	50 %	0 %	320041941
102	NC_014957	GGCC	2	8	31469	31476	0 %	0 %	50 %	50 %	320041941
103	NC_014957	GCCC	2	8	31593	31600	0 %	0 %	25 %	75 %	320041941
104	NC_014957	CCGC	2	8	31979	31986	0 %	0 %	25 %	75 %	320041941
105	NC_014957	GCCC	2	8	32015	32022	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
106	NC_014957	CGAC	2	8	32188	32195	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_014957	TGGC	2	8	32460	32467	0 %	25 %	50 %	25 %	320041942
108	NC_014957	CCGC	2	8	33682	33689	0 %	0 %	25 %	75 %	320041942
109	NC_014957	CGCC	2	8	33782	33789	0 %	0 %	25 %	75 %	320041942
110	NC_014957	CGGG	2	8	33836	33843	0 %	0 %	75 %	25 %	320041942
111	NC_014957	GGTT	2	8	34180	34187	0 %	50 %	50 %	0 %	320041942
112	NC_014957	CAGG	2	8	34211	34218	25 %	0 %	50 %	25 %	320041942
113	NC_014957	CCGC	2	8	34450	34457	0 %	0 %	25 %	75 %	320041942
114	NC_014957	ACCC	2	8	34694	34701	25 %	0 %	0 %	75 %	320041942
115	NC_014957	GGAG	2	8	34805	34812	25 %	0 %	75 %	0 %	320041942
116	NC_014957	CGCC	2	8	35135	35142	0 %	0 %	25 %	75 %	320041942
117	NC_014957	AACC	2	8	35213	35220	50 %	0 %	0 %	50 %	320041942
118	NC_014957	CGCC	2	8	35375	35382	0 %	0 %	25 %	75 %	320041942
119	NC_014957	CCCG	2	8	35668	35675	0 %	0 %	25 %	75 %	320041942
120	NC_014957	GGCT	2	8	35683	35690	0 %	25 %	50 %	25 %	320041942
121	NC_014957	CAGT	2	8	35726	35733	25 %	25 %	25 %	25 %	320041942
122	NC_014957	GCCC	2	8	36307	36314	0 %	0 %	25 %	75 %	320041942
123	NC_014957	TCGG	2	8	36403	36410	0 %	25 %	50 %	25 %	320041942
124	NC_014957	ATCG	2	8	36828	36835	25 %	25 %	25 %	25 %	320041942
125	NC_014957	ACGC	2	8	37161	37168	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_014957	GCGG	2	8	37338	37345	0 %	0 %	75 %	25 %	320041943
127	NC_014957	ACCC	2	8	38011	38018	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
128	NC_014957	CTTC	2	8	38202	38209	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_014957	CCAC	2	8	38902	38909	25 %	0 %	0 %	75 %	320041944
130	NC_014957	GGAC	2	8	39533	39540	25 %	0 %	50 %	25 %	320041944
131	NC_014957	TGGT	2	8	39587	39594	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014957	GATT	2	8	39662	39669	25 %	50 %	25 %	0 %	320041945
133	NC_014957	GTCC	2	8	40600	40607	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_014957	GCCC	2	8	40677	40684	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
135	NC_014957	TTGA	2	8	40745	40752	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014957	TGGT	2	8	41564	41571	0 %	50 %	50 %	0 %	320041946
137	NC_014957	CCCG	2	8	41764	41771	0 %	0 %	25 %	75 %	320041946
138	NC_014957	GGCG	2	8	42068	42075	0 %	0 %	75 %	25 %	320041946
139	NC_014957	CACC	2	8	42257	42264	25 %	0 %	0 %	75 %	320041946
140	NC_014957	GAGG	2	8	42374	42381	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014957	ATCA	2	8	43276	43283	50 %	25 %	0 %	25 %	320041948
142	NC_014957	CGGT	2	8	44123	44130	0 %	25 %	50 %	25 %	320041948
143	NC_014957	GCCA	2	8	45290	45297	25 %	0 %	25 %	50 %	320041949
144	NC_014957	GCCG	2	8	45496	45503	0 %	0 %	50 %	50 %	320041949
145	NC_014957	GCCC	2	8	45604	45611	0 %	0 %	25 %	75 %	320041949
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.