MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Intrasporangium calvum DSM 43043 chromosome

Total Repeats: 110151

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014830	CCTT	2	8	19990	19997	0 %	50 %	0 %	50 %	317123192
502	NC_014830	CGC	2	6	20045	20050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317123192
503	NC_014830	GCA	2	6	20077	20082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317123193
504	NC_014830	GCG	2	6	20126	20131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317123193
505	NC_014830	GCC	2	6	20147	20152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317123193
506	NC_014830	CTC	2	6	20165	20170	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317123193
507	NC_014830	GGC	2	6	20228	20233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317123193
508	NC_014830	TCG	2	6	20283	20288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317123193
509	NC_014830	TCG	2	6	20331	20336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317123193
510	NC_014830	GTC	2	6	20366	20371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317123193
511	NC_014830	TGACC	2	10	20407	20416	20 %	20 %	20 %	40 %	317123193
512	NC_014830	TCC	2	6	20429	20434	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317123194
513	NC_014830	TCG	2	6	20447	20452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317123194
514	NC_014830	GCC	2	6	20468	20473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317123194
515	NC_014830	CGCA	2	8	20506	20513	25 %	0 %	25 %	50 %	317123194
516	NC_014830	CGA	2	6	20688	20693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317123194
517	NC_014830	GCG	2	6	20717	20722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317123194
518	NC_014830	AGC	3	9	20756	20764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317123194
519	NC_014830	TCG	2	6	20828	20833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317123194
520	NC_014830	AGC	2	6	20834	20839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317123194
521	NC_014830	GAT	2	6	20842	20847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317123194
522	NC_014830	GCT	2	6	20898	20903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317123194
523	NC_014830	GC	3	6	20906	20911	0 %	0 %	50 %	50 %	317123194
524	NC_014830	GAC	2	6	20923	20928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317123194
525	NC_014830	CAC	2	6	20941	20946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317123194
526	NC_014830	CG	3	6	20978	20983	0 %	0 %	50 %	50 %	317123194
527	NC_014830	AG	3	6	20985	20990	50 %	0 %	50 %	0 %	317123194
528	NC_014830	CGA	2	6	21042	21047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317123194
529	NC_014830	TCT	2	6	21173	21178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317123194
530	NC_014830	TGC	2	6	21196	21201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317123194
531	NC_014830	GGGGCA	2	12	21222	21233	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	317123194
532	NC_014830	CCTG	2	8	21280	21287	0 %	25 %	25 %	50 %	317123194
533	NC_014830	TGCCT	2	10	21343	21352	0 %	40 %	20 %	40 %	317123194
534	NC_014830	CGT	2	6	21357	21362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317123194
535	NC_014830	ACGC	2	8	21421	21428	25 %	0 %	25 %	50 %	317123194
536	NC_014830	CGTC	2	8	21470	21477	0 %	25 %	25 %	50 %	317123194
537	NC_014830	CGG	2	6	21497	21502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317123194
538	NC_014830	AAG	2	6	21610	21615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317123194
539	NC_014830	GACGAG	2	12	21628	21639	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	317123194
540	NC_014830	AGG	2	6	21659	21664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317123194
541	NC_014830	GAG	2	6	21682	21687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317123194
542	NC_014830	CAC	2	6	21769	21774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317123194
543	NC_014830	GTC	2	6	21799	21804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317123194
544	NC_014830	TCG	2	6	22042	22047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317123195
545	NC_014830	AAG	2	6	22060	22065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317123195
546	NC_014830	CAC	2	6	22069	22074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317123195
547	NC_014830	CGT	2	6	22082	22087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317123195
548	NC_014830	CGCC	2	8	22103	22110	0 %	0 %	25 %	75 %	317123196
549	NC_014830	GA	3	6	22154	22159	50 %	0 %	50 %	0 %	317123196
550	NC_014830	TCG	2	6	22194	22199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317123196
551	NC_014830	CCT	2	6	22204	22209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317123196
552	NC_014830	CGG	2	6	22257	22262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317123196
553	NC_014830	TCAT	2	8	22269	22276	25 %	50 %	0 %	25 %	317123196
554	NC_014830	GAG	2	6	22286	22291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317123196
555	NC_014830	GGC	2	6	22378	22383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317123197
556	NC_014830	CGGCGC	2	12	22402	22413	0 %	0 %	50 %	50 %	317123197
557	NC_014830	CGC	2	6	22467	22472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317123197
558	NC_014830	CGG	2	6	22495	22500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317123197
559	NC_014830	GTCC	2	8	22516	22523	0 %	25 %	25 %	50 %	317123197
560	NC_014830	ACG	2	6	22550	22555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317123197
561	NC_014830	CGG	2	6	22585	22590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317123197
562	NC_014830	TTC	2	6	22634	22639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317123197
563	NC_014830	TGG	2	6	22641	22646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317123197
564	NC_014830	GCT	2	6	22707	22712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317123197
565	NC_014830	TTG	2	6	22718	22723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	317123197
566	NC_014830	CGA	2	6	22746	22751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317123197
567	NC_014830	TCG	2	6	22796	22801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317123197
568	NC_014830	TGCG	2	8	22818	22825	0 %	25 %	50 %	25 %	317123197
569	NC_014830	CCT	2	6	22839	22844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
570	NC_014830	GTA	2	6	22919	22924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
571	NC_014830	CCG	2	6	22946	22951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
572	NC_014830	CGA	2	6	23005	23010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_014830	CGC	2	6	23022	23027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
574	NC_014830	GAGGC	2	10	23096	23105	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
575	NC_014830	CCA	2	6	23128	23133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
576	NC_014830	GAC	2	6	23168	23173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_014830	GGCC	2	8	23179	23186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
578	NC_014830	GTCGC	2	10	23270	23279	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
579	NC_014830	GAG	2	6	23309	23314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
580	NC_014830	CGG	2	6	23360	23365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317123198
581	NC_014830	CGA	2	6	23496	23501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317123198
582	NC_014830	AAG	2	6	23617	23622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317123198
583	NC_014830	GTAG	2	8	23687	23694	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
584	NC_014830	GTC	2	6	23730	23735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317123199
585	NC_014830	ATC	2	6	23816	23821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317123199
586	NC_014830	AGG	2	6	23889	23894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	317123199
587	NC_014830	GCCA	2	8	23895	23902	25 %	0 %	25 %	50 %	317123199
588	NC_014830	GTC	2	6	23924	23929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317123199
589	NC_014830	GGC	2	6	24067	24072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317123199
590	NC_014830	GAA	2	6	24112	24117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317123199
591	NC_014830	TTC	2	6	24125	24130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317123199
592	NC_014830	GTG	2	6	24136	24141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317123199
593	NC_014830	TGA	2	6	24251	24256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317123200
594	NC_014830	GGC	2	6	24270	24275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317123200
595	NC_014830	CCT	2	6	24304	24309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317123200
596	NC_014830	TGCC	2	8	24338	24345	0 %	25 %	25 %	50 %	317123200
597	NC_014830	CG	3	6	24347	24352	0 %	0 %	50 %	50 %	317123200
598	NC_014830	TGG	2	6	24353	24358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317123200
599	NC_014830	CCA	2	6	24587	24592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317123200
600	NC_014830	GCT	2	6	24604	24609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317123200
601	NC_014830	AAG	3	9	24615	24623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317123200
602	NC_014830	ACG	2	6	24707	24712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317123200
603	NC_014830	CCTT	2	8	24766	24773	0 %	50 %	0 %	50 %	317123200
604	NC_014830	GA	3	6	24853	24858	50 %	0 %	50 %	0 %	317123200
605	NC_014830	CAA	2	6	24902	24907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317123200
606	NC_014830	GCGG	2	8	24922	24929	0 %	0 %	75 %	25 %	317123200
607	NC_014830	CAC	2	6	25008	25013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317123200
608	NC_014830	CGC	2	6	25023	25028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317123200
609	NC_014830	AGC	2	6	25032	25037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317123200
610	NC_014830	GAA	2	6	25044	25049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	317123200
611	NC_014830	TGAGGA	2	12	25079	25090	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	317123200
612	NC_014830	ACC	2	6	25114	25119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317123200
613	NC_014830	GCC	2	6	25131	25136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317123200
614	NC_014830	GAT	2	6	25137	25142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317123200
615	NC_014830	CAA	2	6	25163	25168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	317123200
616	NC_014830	CCG	2	6	25208	25213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317123200
617	NC_014830	ACG	2	6	25222	25227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317123200
618	NC_014830	GTC	2	6	25275	25280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317123200
619	NC_014830	GCCG	2	8	25361	25368	0 %	0 %	50 %	50 %	317123200
620	NC_014830	CTG	2	6	25379	25384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317123200
621	NC_014830	CCT	2	6	25397	25402	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	317123200
622	NC_014830	TCG	2	6	25440	25445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317123201
623	NC_014830	CCG	2	6	25470	25475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	317123201
624	NC_014830	CG	3	6	25481	25486	0 %	0 %	50 %	50 %	317123201
625	NC_014830	CCA	2	6	25549	25554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	317123201
626	NC_014830	ACGC	2	8	25578	25585	25 %	0 %	25 %	50 %	317123201
627	NC_014830	TGA	2	6	25597	25602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	317123201
628	NC_014830	TCA	2	6	25639	25644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	317123201
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631	NC_014830	TCG	2	6	25710	25715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317123202
632	NC_014830	GCT	2	6	25738	25743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317123202
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753	NC_014830	GCCG	2	8	31298	31305	0 %	0 %	50 %	50 %	317123207
754	NC_014830	GGC	2	6	31407	31412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317123207
755	NC_014830	GCCG	2	8	31427	31434	0 %	0 %	50 %	50 %	317123207
756	NC_014830	TCG	2	6	31462	31467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	317123207
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758	NC_014830	GCG	2	6	31528	31533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317123207
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825	NC_014830	GC	3	6	34368	34373	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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830	NC_014830	AG	3	6	34493	34498	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
831	NC_014830	TCCGA	2	10	34572	34581	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
832	NC_014830	GTG	2	6	34673	34678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	317123210
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862	NC_014830	CGG	2	6	35930	35935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
863	NC_014830	GCG	2	6	36048	36053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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865	NC_014830	ATC	2	6	36124	36129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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873	NC_014830	CTT	3	9	36474	36482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	317123211
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876	NC_014830	CG	3	6	36765	36770	0 %	0 %	50 %	50 %	317123211
877	NC_014830	CGCC	2	8	36807	36814	0 %	0 %	25 %	75 %	317123211
878	NC_014830	ACGC	2	8	36819	36826	25 %	0 %	25 %	50 %	317123211
879	NC_014830	CGG	2	6	36897	36902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	317123211
880	NC_014830	CGA	2	6	36969	36974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317123211
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882	NC_014830	ACG	2	6	37064	37069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	317123211
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