MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Ignisphaera aggregans DSM 17230 chromosome

Total Repeats: 1308

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014471	AATAC	2	10	489	498	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_014471	CTCTC	2	10	3477	3486	0 %	40 %	0 %	60 %	305662448
3	NC_014471	TAAAT	2	10	4679	4688	60 %	40 %	0 %	0 %	305662450
4	NC_014471	GAATG	2	10	5074	5083	40 %	20 %	40 %	0 %	305662451
5	NC_014471	TAGTA	2	10	6200	6209	40 %	40 %	20 %	0 %	305662452
6	NC_014471	TAAGA	2	10	7865	7874	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014471	CATAT	2	10	7960	7969	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_014471	TGAAT	2	10	10787	10796	40 %	40 %	20 %	0 %	305662456
9	NC_014471	AAAAC	2	10	10887	10896	80 %	0 %	0 %	20 %	305662456
10	NC_014471	TTCTA	2	10	11770	11779	20 %	60 %	0 %	20 %	305662457
11	NC_014471	AATAT	2	10	12155	12164	60 %	40 %	0 %	0 %	305662457
12	NC_014471	ACATA	2	10	13480	13489	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_014471	GGAAT	2	10	14888	14897	40 %	20 %	40 %	0 %	305662462
14	NC_014471	ACTAT	2	10	15707	15716	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_014471	ATTCT	2	10	17226	17235	20 %	60 %	0 %	20 %	305662464
16	NC_014471	ATCTC	2	10	18972	18981	20 %	40 %	0 %	40 %	305662466
17	NC_014471	CAATA	2	10	21521	21530	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_014471	GGTAA	2	10	23769	23778	40 %	20 %	40 %	0 %	305662470
19	NC_014471	AGTGG	2	10	24820	24829	20 %	20 %	60 %	0 %	305662472
20	NC_014471	AGGGA	2	10	25357	25366	40 %	0 %	60 %	0 %	305662472
21	NC_014471	AGGGT	2	10	25866	25875	20 %	20 %	60 %	0 %	305662473
22	NC_014471	AGAGG	2	10	27110	27119	40 %	0 %	60 %	0 %	305662474
23	NC_014471	CAATA	2	10	28159	28168	60 %	20 %	0 %	20 %	305662475
24	NC_014471	TGTCC	2	10	29723	29732	0 %	40 %	20 %	40 %	305662477
25	NC_014471	TCTAT	2	10	32781	32790	20 %	60 %	0 %	20 %	305662482
26	NC_014471	AAGCT	2	10	37321	37330	40 %	20 %	20 %	20 %	305662486
27	NC_014471	GTTTT	2	10	40292	40301	0 %	80 %	20 %	0 %	305662488
28	NC_014471	ACTAT	2	10	40307	40316	40 %	40 %	0 %	20 %	305662488
29	NC_014471	ACAGC	2	10	43131	43140	40 %	0 %	20 %	40 %	305662491
30	NC_014471	ATTCT	2	10	45027	45036	20 %	60 %	0 %	20 %	305662492
31	NC_014471	ATAGC	2	10	45559	45568	40 %	20 %	20 %	20 %	305662492
32	NC_014471	CATCT	2	10	45875	45884	20 %	40 %	0 %	40 %	305662493
33	NC_014471	TCTCC	2	10	46140	46149	0 %	40 %	0 %	60 %	305662493
34	NC_014471	TCCTT	2	10	46918	46927	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_014471	ACACC	2	10	49025	49034	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
36	NC_014471	ATTAG	2	10	52802	52811	40 %	40 %	20 %	0 %	305662500
37	NC_014471	GGAAA	2	10	52871	52880	60 %	0 %	40 %	0 %	305662500
38	NC_014471	ATGAC	2	10	53189	53198	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_014471	ATATC	2	10	54448	54457	40 %	40 %	0 %	20 %	305662502
40	NC_014471	ACTTC	2	10	54614	54623	20 %	40 %	0 %	40 %	305662503
41	NC_014471	AGAAA	2	10	56931	56940	80 %	0 %	20 %	0 %	305662505
42	NC_014471	TGTGA	2	10	58379	58388	20 %	40 %	40 %	0 %	305662507
43	NC_014471	ATGGC	2	10	59757	59766	20 %	20 %	40 %	20 %	305662508
44	NC_014471	GGCAA	2	10	60897	60906	40 %	0 %	40 %	20 %	305662509
45	NC_014471	CTATA	2	10	61171	61180	40 %	40 %	0 %	20 %	305662509
46	NC_014471	AGAGA	2	10	61303	61312	60 %	0 %	40 %	0 %	305662509
47	NC_014471	TAGGA	2	10	61674	61683	40 %	20 %	40 %	0 %	305662509
48	NC_014471	ATTAA	2	10	62187	62196	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014471	ATTGT	2	10	62736	62745	20 %	60 %	20 %	0 %	305662510
50	NC_014471	TTGAT	2	10	62819	62828	20 %	60 %	20 %	0 %	305662510
51	NC_014471	GCATA	2	10	63412	63421	40 %	20 %	20 %	20 %	305662511
52	NC_014471	ATGAG	2	10	64715	64724	40 %	20 %	40 %	0 %	305662513
53	NC_014471	GTATA	2	10	65655	65664	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014471	TATAA	2	10	67720	67729	60 %	40 %	0 %	0 %	305662516
55	NC_014471	GAAAG	2	10	68500	68509	60 %	0 %	40 %	0 %	305662518
56	NC_014471	TAATA	2	10	69676	69685	60 %	40 %	0 %	0 %	305662519
57	NC_014471	TATCA	2	10	70841	70850	40 %	40 %	0 %	20 %	305662520
58	NC_014471	ATGAA	2	10	70951	70960	60 %	20 %	20 %	0 %	305662520
59	NC_014471	CCAAA	2	10	71454	71463	60 %	0 %	0 %	40 %	305662521
60	NC_014471	AATGA	2	10	71518	71527	60 %	20 %	20 %	0 %	305662521
61	NC_014471	CTTTA	2	10	71652	71661	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_014471	AATAT	2	10	73628	73637	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014471	AAAGA	2	10	75204	75213	80 %	0 %	20 %	0 %	305662526
64	NC_014471	TAGGA	2	10	75891	75900	40 %	20 %	40 %	0 %	305662528
65	NC_014471	TATAG	2	10	75907	75916	40 %	40 %	20 %	0 %	305662528
66	NC_014471	TATTT	2	10	76440	76449	20 %	80 %	0 %	0 %	305662529
67	NC_014471	TACAA	2	10	76752	76761	60 %	20 %	0 %	20 %	305662529
68	NC_014471	AACAA	2	10	78266	78275	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_014471	TAGAA	2	10	80775	80784	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014471	AGGAA	2	10	82042	82051	60 %	0 %	40 %	0 %	305662536
71	NC_014471	ATATT	2	10	82432	82441	40 %	60 %	0 %	0 %	305662537
72	NC_014471	CTAAT	2	10	82676	82685	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_014471	GAATC	2	10	83610	83619	40 %	20 %	20 %	20 %	305662538
74	NC_014471	TCAAT	2	10	84787	84796	40 %	40 %	0 %	20 %	305662538
75	NC_014471	AAACA	2	10	85186	85195	80 %	0 %	0 %	20 %	305662538
76	NC_014471	TTTAT	2	10	85887	85896	20 %	80 %	0 %	0 %	305662540
77	NC_014471	AAACA	2	10	87688	87697	80 %	0 %	0 %	20 %	305662542
78	NC_014471	CTCTT	2	10	88701	88710	0 %	60 %	0 %	40 %	305662543
79	NC_014471	ATCTA	2	10	89940	89949	40 %	40 %	0 %	20 %	305662545
80	NC_014471	CAAAA	2	10	93811	93820	80 %	0 %	0 %	20 %	305662550
81	NC_014471	ATAGA	2	10	97914	97923	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014471	TCTTT	2	10	98191	98200	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_014471	CAATA	2	10	99558	99567	60 %	20 %	0 %	20 %	305662554
84	NC_014471	ATCTT	2	10	100479	100488	20 %	60 %	0 %	20 %	305662555
85	NC_014471	AGCTA	2	10	102523	102532	40 %	20 %	20 %	20 %	305662558
86	NC_014471	GGTTG	2	10	102980	102989	0 %	40 %	60 %	0 %	305662559
87	NC_014471	ATTTA	2	10	105358	105367	40 %	60 %	0 %	0 %	305662560
88	NC_014471	TAGCT	2	10	107104	107113	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_014471	GTAGA	2	10	111060	111069	40 %	20 %	40 %	0 %	305662564
90	NC_014471	GATTG	2	10	112338	112347	20 %	40 %	40 %	0 %	305662564
91	NC_014471	TATAA	2	10	113720	113729	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014471	ATTAC	2	10	113751	113760	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_014471	GATGG	2	10	117794	117803	20 %	20 %	60 %	0 %	305662567
94	NC_014471	TTGTT	2	10	117936	117945	0 %	80 %	20 %	0 %	305662568
95	NC_014471	ATTGT	2	10	118517	118526	20 %	60 %	20 %	0 %	305662570
96	NC_014471	TAATA	2	10	121231	121240	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014471	AGGCT	2	10	122528	122537	20 %	20 %	40 %	20 %	305662575
98	NC_014471	ATGTA	2	10	123575	123584	40 %	40 %	20 %	0 %	305662577
99	NC_014471	AATAG	2	10	124380	124389	60 %	20 %	20 %	0 %	305662577
100	NC_014471	TTGCT	2	10	125281	125290	0 %	60 %	20 %	20 %	305662577
101	NC_014471	TAATG	2	10	126333	126342	40 %	40 %	20 %	0 %	305662578
102	NC_014471	GATAT	2	10	127351	127360	40 %	40 %	20 %	0 %	305662579
103	NC_014471	AGATG	2	10	129499	129508	40 %	20 %	40 %	0 %	305662581
104	NC_014471	ACATG	2	10	129754	129763	40 %	20 %	20 %	20 %	305662581
105	NC_014471	GCTTA	2	10	130512	130521	20 %	40 %	20 %	20 %	305662583
106	NC_014471	TCTTT	2	10	131142	131151	0 %	80 %	0 %	20 %	305662583
107	NC_014471	CCTAA	2	10	131244	131253	40 %	20 %	0 %	40 %	305662584
108	NC_014471	ACATT	2	10	131381	131390	40 %	40 %	0 %	20 %	305662584
109	NC_014471	TTTTC	2	10	131431	131440	0 %	80 %	0 %	20 %	305662584
110	NC_014471	ATTTT	2	10	131571	131580	20 %	80 %	0 %	0 %	305662585
111	NC_014471	TTTAA	2	10	131859	131868	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014471	TATTT	2	10	131946	131955	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014471	AAAAT	2	10	132546	132555	80 %	20 %	0 %	0 %	305662587
114	NC_014471	CAATA	2	10	133258	133267	60 %	20 %	0 %	20 %	305662587
115	NC_014471	TAAAT	2	10	133328	133337	60 %	40 %	0 %	0 %	305662587
116	NC_014471	TGAAT	2	10	133366	133375	40 %	40 %	20 %	0 %	305662587
117	NC_014471	ATCAC	2	10	134000	134009	40 %	20 %	0 %	40 %	305662588
118	NC_014471	ATCCA	2	10	134622	134631	40 %	20 %	0 %	40 %	305662589
119	NC_014471	ATTCT	2	10	136913	136922	20 %	60 %	0 %	20 %	305662592
120	NC_014471	ATAAA	2	10	138172	138181	80 %	20 %	0 %	0 %	305662594
121	NC_014471	ACTAC	2	10	141370	141379	40 %	20 %	0 %	40 %	305662599
122	NC_014471	AAGAA	2	10	142419	142428	80 %	0 %	20 %	0 %	305662602
123	NC_014471	AAGAG	2	10	142680	142689	60 %	0 %	40 %	0 %	305662602
124	NC_014471	TATTT	2	10	144097	144106	20 %	80 %	0 %	0 %	305662604
125	NC_014471	TCACA	2	10	145029	145038	40 %	20 %	0 %	40 %	305662607
126	NC_014471	AAATG	2	10	145710	145719	60 %	20 %	20 %	0 %	305662608
127	NC_014471	AAAAG	2	10	145964	145973	80 %	0 %	20 %	0 %	305662609
128	NC_014471	CATAG	2	10	146380	146389	40 %	20 %	20 %	20 %	305662610
129	NC_014471	TTGGT	2	10	148140	148149	0 %	60 %	40 %	0 %	305662613
130	NC_014471	TGAGG	2	10	148188	148197	20 %	20 %	60 %	0 %	305662613
131	NC_014471	AGCTC	2	10	148780	148789	20 %	20 %	20 %	40 %	305662614
132	NC_014471	TCATT	2	10	149533	149542	20 %	60 %	0 %	20 %	305662614
133	NC_014471	CTATA	2	10	149566	149575	40 %	40 %	0 %	20 %	305662614
134	NC_014471	GCTAT	2	10	150400	150409	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_014471	TCTCC	2	10	153955	153964	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
136	NC_014471	AGTCT	2	10	154184	154193	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_014471	GTGAA	2	10	154570	154579	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014471	ACATA	2	10	156599	156608	60 %	20 %	0 %	20 %	305662624
139	NC_014471	GCGGA	2	10	156623	156632	20 %	0 %	60 %	20 %	305662624
140	NC_014471	AAATG	2	10	157732	157741	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014471	TATAC	2	10	158534	158543	40 %	40 %	0 %	20 %	305662628
142	NC_014471	AATAT	2	10	160526	160535	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014471	ATGTT	2	10	162499	162508	20 %	60 %	20 %	0 %	305662634
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152	NC_014471	TATTC	2	10	172547	172556	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
153	NC_014471	GTTCT	2	10	173488	173497	0 %	60 %	20 %	20 %	305662649
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164	NC_014471	ATATA	2	10	182720	182729	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_014471	TTCTA	2	10	192684	192693	20 %	60 %	0 %	20 %	305662670
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263	NC_014471	ATATG	2	10	329454	329463	40 %	40 %	20 %	0 %	305662806
264	NC_014471	ATCTC	2	10	330715	330724	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
265	NC_014471	CATAT	2	10	332861	332870	40 %	40 %	0 %	20 %	305662808
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287	NC_014471	ATCTT	2	10	361035	361044	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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399	NC_014471	TTTCT	2	10	528137	528146	0 %	80 %	0 %	20 %	305663008
400	NC_014471	TTCTT	2	10	536983	536992	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
401	NC_014471	GAAAG	2	10	537314	537323	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
402	NC_014471	GAATA	2	10	539228	539237	60 %	20 %	20 %	0 %	305663022
403	NC_014471	AGATG	2	10	542593	542602	40 %	20 %	40 %	0 %	305663027
404	NC_014471	TCAAA	2	10	545966	545975	60 %	20 %	0 %	20 %	305663031
405	NC_014471	AAGAA	2	10	546630	546639	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
406	NC_014471	CCTAT	2	10	547458	547467	20 %	40 %	0 %	40 %	305663033
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421	NC_014471	AGAAA	2	10	566334	566343	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
422	NC_014471	AAGAA	2	10	566662	566671	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
423	NC_014471	ACAGC	2	10	567549	567558	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
424	NC_014471	GAATA	2	10	568000	568009	60 %	20 %	20 %	0 %	305663050
425	NC_014471	AGTAC	2	10	568124	568133	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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435	NC_014471	GGTAC	2	10	582154	582163	20 %	20 %	40 %	20 %	305663063
436	NC_014471	ATGCT	2	10	586229	586238	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
437	NC_014471	ATTTA	2	10	587239	587248	40 %	60 %	0 %	0 %	305663069
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439	NC_014471	TACAA	2	10	587521	587530	60 %	20 %	0 %	20 %	305663069
440	NC_014471	TTATG	2	10	589880	589889	20 %	60 %	20 %	0 %	305663072
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442	NC_014471	GATAG	2	10	593023	593032	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
443	NC_014471	TCTAT	2	10	593334	593343	20 %	60 %	0 %	20 %	305663075
444	NC_014471	CCTCT	2	10	593718	593727	0 %	40 %	0 %	60 %	305663075
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446	NC_014471	CATTA	2	10	594962	594971	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
447	NC_014471	CAAAG	2	10	595110	595119	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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449	NC_014471	GAATA	2	10	599639	599648	60 %	20 %	20 %	0 %	305663081
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462	NC_014471	AAATA	2	10	614943	614952	80 %	20 %	0 %	0 %	305663095
463	NC_014471	GCAAT	2	10	629552	629561	40 %	20 %	20 %	20 %	305663109
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