MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Ignisphaera aggregans DSM 17230 chromosome

Total Repeats: 26845

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014471	AAT	2	6	7	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014471	ATC	2	6	72	77	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014471	AAT	2	6	137	142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014471	CCT	2	6	191	196	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_014471	AGT	2	6	204	209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014471	GAT	2	6	240	245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014471	GAT	2	6	247	252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014471	GAT	2	6	288	293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014471	GAG	2	6	294	299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014471	TAA	2	6	338	343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014471	AAT	2	6	373	378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014471	GAG	2	6	409	414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014471	TTA	2	6	534	539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014471	TGG	2	6	548	553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014471	ATG	2	6	753	758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305662446
16	NC_014471	CTG	2	6	762	767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	305662446
17	NC_014471	TGA	2	6	847	852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305662446
18	NC_014471	CTG	2	6	966	971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	305662446
19	NC_014471	TTA	2	6	984	989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	305662446
20	NC_014471	ATA	2	6	1028	1033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	305662446
21	NC_014471	GAT	2	6	1058	1063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305662446
22	NC_014471	ACC	2	6	1064	1069	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	305662446
23	NC_014471	TAC	2	6	1080	1085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305662446
24	NC_014471	AGA	2	6	1148	1153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	305662446
25	NC_014471	AGG	2	6	1177	1182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	305662446
26	NC_014471	TTG	2	6	1191	1196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	305662446
27	NC_014471	CTT	2	6	1213	1218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	305662446
28	NC_014471	GTG	2	6	1263	1268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	305662446
29	NC_014471	AAT	2	6	1294	1299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	305662446
30	NC_014471	TTG	2	6	1323	1328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	305662446
31	NC_014471	AGT	2	6	1352	1357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305662446
32	NC_014471	GGA	2	6	1405	1410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	305662446
33	NC_014471	AGA	2	6	1421	1426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	305662446
34	NC_014471	ATA	2	6	1458	1463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	305662446
35	NC_014471	GCA	2	6	1481	1486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	305662446
36	NC_014471	GCA	2	6	1490	1495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	305662446
37	NC_014471	GTT	2	6	1574	1579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	305662446
38	NC_014471	TAC	2	6	1671	1676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305662446
39	NC_014471	GGT	2	6	1703	1708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	305662446
40	NC_014471	GAC	2	6	1711	1716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	305662446
41	NC_014471	AGA	2	6	1784	1789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	305662446
42	NC_014471	TAA	2	6	1827	1832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	305662446
43	NC_014471	TAA	2	6	1842	1847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	305662446
44	NC_014471	AGG	2	6	1920	1925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	305662446
45	NC_014471	ACT	2	6	1942	1947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305662446
46	NC_014471	TGT	3	9	2012	2020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	305662447
47	NC_014471	ATA	2	6	2035	2040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	305662447
48	NC_014471	ATT	2	6	2112	2117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	305662447
49	NC_014471	TAA	2	6	2230	2235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	305662447
50	NC_014471	ATC	2	6	2352	2357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305662447
51	NC_014471	AAG	2	6	2410	2415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	305662447
52	NC_014471	ATG	2	6	2520	2525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305662447
53	NC_014471	CTT	2	6	2556	2561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	305662448
54	NC_014471	CAT	2	6	2645	2650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305662448
55	NC_014471	CAA	2	6	2681	2686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	305662448
56	NC_014471	TCT	2	6	2796	2801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	305662448
57	NC_014471	TAA	2	6	2981	2986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	305662448
58	NC_014471	CAA	2	6	3149	3154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	305662448
59	NC_014471	ATT	2	6	3255	3260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	305662448
60	NC_014471	TGT	2	6	3324	3329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	305662448
61	NC_014471	TCT	2	6	3334	3339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	305662448
62	NC_014471	TCC	2	6	3342	3347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	305662448
63	NC_014471	CCA	2	6	3403	3408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	305662448
64	NC_014471	TGT	2	6	3471	3476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	305662448
65	NC_014471	CTC	2	6	3507	3512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	305662448
66	NC_014471	CAT	2	6	3530	3535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305662448
67	NC_014471	GCA	2	6	3559	3564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	305662448
68	NC_014471	CAC	2	6	3578	3583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	305662448
69	NC_014471	CTG	2	6	3608	3613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	305662448
70	NC_014471	GAA	2	6	3629	3634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	305662448
71	NC_014471	CTA	2	6	3670	3675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305662448
72	NC_014471	ATT	2	6	3685	3690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	305662448
73	NC_014471	CTT	2	6	3691	3696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	305662448
74	NC_014471	TCC	2	6	3734	3739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	305662448
75	NC_014471	TAG	2	6	3836	3841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014471	ATA	2	6	3973	3978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	305662449
77	NC_014471	GAA	2	6	3982	3987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	305662449
78	NC_014471	ATG	2	6	4024	4029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305662449
79	NC_014471	TAG	2	6	4070	4075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305662449
80	NC_014471	TAA	2	6	4193	4198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	305662449
81	NC_014471	TGA	2	6	4260	4265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305662449
82	NC_014471	TCA	2	6	4383	4388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305662449
83	NC_014471	ATA	2	6	4500	4505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	305662450
84	NC_014471	AGA	2	6	4526	4531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	305662450
85	NC_014471	GAA	2	6	4563	4568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	305662450
86	NC_014471	AAG	2	6	4607	4612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	305662450
87	NC_014471	TTG	2	6	4720	4725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	305662450
88	NC_014471	TCA	2	6	4765	4770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305662450
89	NC_014471	TAA	2	6	4789	4794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	305662450
90	NC_014471	ATT	3	9	4868	4876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014471	TTG	2	6	4985	4990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	305662451
92	NC_014471	GCA	2	6	5056	5061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	305662451
93	NC_014471	TAC	2	6	5183	5188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305662451
94	NC_014471	TAT	2	6	5222	5227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	305662451
95	NC_014471	CTA	2	6	5252	5257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305662451
96	NC_014471	TAC	2	6	5367	5372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305662451
97	NC_014471	TAA	2	6	5427	5432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	305662451
98	NC_014471	GAT	2	6	5683	5688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305662451
99	NC_014471	TGC	2	6	5715	5720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	305662451
100	NC_014471	TTA	2	6	5799	5804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	305662452
101	NC_014471	TAT	2	6	5830	5835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	305662452
102	NC_014471	TAA	2	6	5926	5931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	305662452
103	NC_014471	TAA	2	6	5939	5944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	305662452
104	NC_014471	GGA	2	6	5988	5993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	305662452
105	NC_014471	TAA	2	6	6010	6015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	305662452
106	NC_014471	AAT	2	6	6053	6058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	305662452
107	NC_014471	TTC	3	9	6328	6336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	305662452
108	NC_014471	ATT	2	6	6342	6347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	305662452
109	NC_014471	TCA	2	6	6543	6548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305662452
110	NC_014471	TAG	2	6	6589	6594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305662452
111	NC_014471	ATA	2	6	6944	6949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	305662453
112	NC_014471	TAT	2	6	7021	7026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	305662453
113	NC_014471	ACC	2	6	7075	7080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	305662453
114	NC_014471	ATC	2	6	7093	7098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305662453
115	NC_014471	AAT	2	6	7185	7190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	305662453
116	NC_014471	ACA	2	6	7256	7261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	305662453
117	NC_014471	CTA	2	6	7334	7339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305662453
118	NC_014471	GAA	2	6	7476	7481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	305662453
119	NC_014471	CAA	2	6	7539	7544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	305662453
120	NC_014471	CTC	2	6	7690	7695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	305662453
121	NC_014471	ATT	2	6	7781	7786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014471	ATT	2	6	7794	7799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014471	AAG	2	6	7839	7844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014471	AAT	2	6	7850	7855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014471	ATG	2	6	7972	7977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014471	ATC	2	6	8129	8134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_014471	ATC	2	6	8192	8197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_014471	TTC	2	6	8273	8278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_014471	TGG	2	6	8415	8420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	305662454
130	NC_014471	TAG	2	6	8490	8495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305662454
131	NC_014471	AAG	2	6	8496	8501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	305662454
132	NC_014471	TTC	2	6	8572	8577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	305662454
133	NC_014471	TTA	2	6	8740	8745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	305662454
134	NC_014471	TAA	2	6	8808	8813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	305662454
135	NC_014471	TCT	2	6	8817	8822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	305662454
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163	NC_014471	ATT	2	6	10110	10115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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248	NC_014471	TTA	2	6	15689	15694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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255	NC_014471	GAA	2	6	16369	16374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	305662464
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259	NC_014471	TTA	2	6	16477	16482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	305662464
260	NC_014471	CAT	2	6	16846	16851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305662464
261	NC_014471	CCT	2	6	16923	16928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	305662464
262	NC_014471	TCA	2	6	17101	17106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305662464
263	NC_014471	CTT	2	6	17116	17121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	305662464
264	NC_014471	TGC	2	6	17201	17206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	305662464
265	NC_014471	ACT	2	6	17220	17225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305662464
266	NC_014471	TAC	2	6	17452	17457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305662465
267	NC_014471	TCA	2	6	17491	17496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305662465
268	NC_014471	AAT	2	6	17533	17538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	305662465
269	NC_014471	TCT	2	6	17544	17549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	305662465
270	NC_014471	TTA	2	6	17608	17613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	305662465
271	NC_014471	ATA	2	6	17620	17625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	305662465
272	NC_014471	TTC	2	6	17717	17722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	305662465
273	NC_014471	TCA	2	6	17752	17757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305662465
274	NC_014471	ACA	2	6	17761	17766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	305662465
275	NC_014471	TTA	2	6	18002	18007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	305662465
276	NC_014471	CTA	2	6	18008	18013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305662465
277	NC_014471	TTA	2	6	18052	18057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	305662466
278	NC_014471	TAA	2	6	18109	18114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	305662466
279	NC_014471	ATT	2	6	18257	18262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	305662466
280	NC_014471	TAC	2	6	18314	18319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305662466
281	NC_014471	TTC	2	6	18364	18369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	305662466
282	NC_014471	CTT	2	6	18442	18447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	305662466
283	NC_014471	ATC	2	6	18452	18457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305662466
284	NC_014471	TCT	2	6	18578	18583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	305662466
285	NC_014471	ATA	2	6	18626	18631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	305662466
286	NC_014471	ATT	2	6	18749	18754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	305662466
287	NC_014471	TAA	2	6	18788	18793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	305662466
288	NC_014471	ATG	2	6	18929	18934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305662466
289	NC_014471	TAC	2	6	19022	19027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305662466
290	NC_014471	ATT	2	6	19042	19047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_014471	TAA	2	6	19053	19058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_014471	ATT	2	6	19162	19167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	305662467
293	NC_014471	GCT	2	6	19383	19388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	305662467
294	NC_014471	AAT	2	6	19481	19486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	305662467
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296	NC_014471	CTA	2	6	19570	19575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305662467
297	NC_014471	TGT	2	6	19595	19600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	305662467
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299	NC_014471	CTT	2	6	19754	19759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	305662467
300	NC_014471	CTA	3	9	19788	19796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305662467
301	NC_014471	CAT	2	6	19798	19803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305662467
302	NC_014471	TGA	2	6	19865	19870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305662467
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304	NC_014471	TAA	2	6	19907	19912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
305	NC_014471	AGG	2	6	19988	19993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	305662468
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324	NC_014471	AAT	2	6	21249	21254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
325	NC_014471	ATA	2	6	21285	21290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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332	NC_014471	ATA	2	6	21568	21573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
333	NC_014471	AAT	2	6	21596	21601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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379	NC_014471	AGT	2	6	24137	24142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305662471
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381	NC_014471	ATT	2	6	24296	24301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	305662471
382	NC_014471	TAT	3	9	24319	24327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	305662471
383	NC_014471	GTG	2	6	24339	24344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	305662471
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