MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ignisphaera aggregans DSM 17230 chromosome

Total Repeats: 44408

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014471	TTC	2	6	41358	41363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	305662489
1002	NC_014471	TAT	2	6	41380	41385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	305662489
1003	NC_014471	CTT	2	6	41400	41405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	305662489
1004	NC_014471	ACA	2	6	41432	41437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	305662489
1005	NC_014471	TTG	2	6	41481	41486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	305662489
1006	NC_014471	GCT	2	6	41512	41517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	305662489
1007	NC_014471	TTC	2	6	41561	41566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	305662489
1008	NC_014471	CACT	2	8	41576	41583	25 %	25 %	0 %	50 %	305662489
1009	NC_014471	TGT	2	6	41597	41602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	305662489
1010	NC_014471	TAG	2	6	41608	41613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305662489
1011	NC_014471	TGC	2	6	41623	41628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	305662489
1012	NC_014471	ATTC	2	8	41643	41650	25 %	50 %	0 %	25 %	305662489
1013	NC_014471	TAG	2	6	41698	41703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305662489
1014	NC_014471	ATA	2	6	41720	41725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	305662489
1015	NC_014471	CCG	2	6	41930	41935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	305662489
1016	NC_014471	AAT	2	6	41941	41946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	305662489
1017	NC_014471	CT	3	6	41962	41967	0 %	50 %	0 %	50 %	305662489
1018	NC_014471	CT	3	6	41982	41987	0 %	50 %	0 %	50 %	305662489
1019	NC_014471	TAG	2	6	42000	42005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305662489
1020	NC_014471	TAACAA	2	12	42099	42110	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	305662489
1021	NC_014471	AT	3	6	42135	42140	50 %	50 %	0 %	0 %	305662489
1022	NC_014471	CAA	2	6	42171	42176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	305662489
1023	NC_014471	ATCT	2	8	42193	42200	25 %	50 %	0 %	25 %	305662489
1024	NC_014471	ATT	2	6	42208	42213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	305662489
1025	NC_014471	AT	3	6	42254	42259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_014471	AAC	2	6	42316	42321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_014471	TA	3	6	42354	42359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_014471	TATAGA	2	12	42373	42384	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	305662490
1029	NC_014471	AT	3	6	42400	42405	50 %	50 %	0 %	0 %	305662490
1030	NC_014471	GATA	2	8	42409	42416	50 %	25 %	25 %	0 %	305662490
1031	NC_014471	ACA	2	6	42460	42465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	305662490
1032	NC_014471	TGT	2	6	42489	42494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	305662490
1033	NC_014471	GCT	2	6	42499	42504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	305662490
1034	NC_014471	A	6	6	42508	42513	100 %	0 %	0 %	0 %	305662490
1035	NC_014471	TAG	2	6	42599	42604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305662490
1036	NC_014471	TA	3	6	42628	42633	50 %	50 %	0 %	0 %	305662490
1037	NC_014471	TAC	3	9	42649	42657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305662490
1038	NC_014471	AAT	2	6	42664	42669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	305662490
1039	NC_014471	AGG	2	6	42759	42764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	305662490
1040	NC_014471	ACT	2	6	42803	42808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305662490
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1042	NC_014471	CTGGCT	2	12	42842	42853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	305662490
1043	NC_014471	CTATAG	2	12	42857	42868	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	305662490
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1045	NC_014471	TTG	2	6	42923	42928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	305662490
1046	NC_014471	GA	3	6	42954	42959	50 %	0 %	50 %	0 %	305662490
1047	NC_014471	GTT	2	6	42991	42996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	305662490
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1050	NC_014471	TA	3	6	43095	43100	50 %	50 %	0 %	0 %	305662491
1051	NC_014471	ACAGC	2	10	43131	43140	40 %	0 %	20 %	40 %	305662491
1052	NC_014471	CTAT	2	8	43174	43181	25 %	50 %	0 %	25 %	305662491
1053	NC_014471	ACAG	2	8	43208	43215	50 %	0 %	25 %	25 %	305662491
1054	NC_014471	AAG	2	6	43245	43250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	305662491
1055	NC_014471	TA	3	6	43308	43313	50 %	50 %	0 %	0 %	305662491
1056	NC_014471	CCA	2	6	43326	43331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	305662491
1057	NC_014471	TGA	2	6	43358	43363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305662491
1058	NC_014471	GTT	2	6	43377	43382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	305662491
1059	NC_014471	GAG	2	6	43410	43415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	305662491
1060	NC_014471	TA	3	6	43435	43440	50 %	50 %	0 %	0 %	305662491
1061	NC_014471	CTC	2	6	43468	43473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	305662491
1062	NC_014471	GTA	2	6	43597	43602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305662491
1063	NC_014471	TTG	2	6	43660	43665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	305662491
1064	NC_014471	AG	3	6	43673	43678	50 %	0 %	50 %	0 %	305662491
1065	NC_014471	TGA	2	6	43766	43771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	305662491
1066	NC_014471	TA	3	6	43858	43863	50 %	50 %	0 %	0 %	305662491
1067	NC_014471	GA	4	8	43923	43930	50 %	0 %	50 %	0 %	305662491
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1072	NC_014471	TA	3	6	44113	44118	50 %	50 %	0 %	0 %	305662491
1073	NC_014471	TAGA	2	8	44152	44159	50 %	25 %	25 %	0 %	305662491
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1083	NC_014471	AG	3	6	44712	44717	50 %	0 %	50 %	0 %	305662491
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1089	NC_014471	AAT	2	6	45052	45057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	305662492
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1091	NC_014471	TA	4	8	45190	45197	50 %	50 %	0 %	0 %	305662492
1092	NC_014471	TA	3	6	45223	45228	50 %	50 %	0 %	0 %	305662492
1093	NC_014471	TC	3	6	45257	45262	0 %	50 %	0 %	50 %	305662492
1094	NC_014471	CT	3	6	45266	45271	0 %	50 %	0 %	50 %	305662492
1095	NC_014471	TC	3	6	45296	45301	0 %	50 %	0 %	50 %	305662492
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1099	NC_014471	GCA	2	6	45405	45410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	305662492
1100	NC_014471	TC	3	6	45419	45424	0 %	50 %	0 %	50 %	305662492
1101	NC_014471	ATA	2	6	45533	45538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	305662492
1102	NC_014471	ATAGC	2	10	45559	45568	40 %	20 %	20 %	20 %	305662492
1103	NC_014471	CAA	2	6	45574	45579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	305662492
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1106	NC_014471	TC	3	6	45653	45658	0 %	50 %	0 %	50 %	305662492
1107	NC_014471	AT	3	6	45661	45666	50 %	50 %	0 %	0 %	305662492
1108	NC_014471	ATC	2	6	45701	45706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_014471	TAA	2	6	45713	45718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_014471	TAA	2	6	45739	45744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_014471	GCG	2	6	45800	45805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_014471	CCA	2	6	45808	45813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1113	NC_014471	TA	3	6	45855	45860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_014471	CATCT	2	10	45875	45884	20 %	40 %	0 %	40 %	305662493
1115	NC_014471	AT	3	6	45891	45896	50 %	50 %	0 %	0 %	305662493
1116	NC_014471	AGCT	2	8	45897	45904	25 %	25 %	25 %	25 %	305662493
1117	NC_014471	TTCT	2	8	45916	45923	0 %	75 %	0 %	25 %	305662493
1118	NC_014471	TA	4	8	45937	45944	50 %	50 %	0 %	0 %	305662493
1119	NC_014471	CTAT	2	8	45950	45957	25 %	50 %	0 %	25 %	305662493
1120	NC_014471	TAT	2	6	46003	46008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	305662493
1121	NC_014471	CTC	2	6	46043	46048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	305662493
1122	NC_014471	CT	3	6	46058	46063	0 %	50 %	0 %	50 %	305662493
1123	NC_014471	TA	4	8	46072	46079	50 %	50 %	0 %	0 %	305662493
1124	NC_014471	ACT	2	6	46087	46092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	305662493
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1127	NC_014471	TAA	2	6	46168	46173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	305662493
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1129	NC_014471	ATA	2	6	46201	46206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	305662493
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1258	NC_014471	TATT	2	8	51549	51556	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1261	NC_014471	TATT	2	8	51681	51688	25 %	75 %	0 %	0 %	305662500
1262	NC_014471	TCT	2	6	51793	51798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	305662500
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1294	NC_014471	CAT	2	6	53455	53460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1295	NC_014471	AT	3	6	53459	53464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1296	NC_014471	GA	3	6	53484	53489	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1369	NC_014471	TGT	2	6	56416	56421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1385	NC_014471	AG	3	6	57494	57499	50 %	0 %	50 %	0 %	305662506
1386	NC_014471	AT	3	6	57544	57549	50 %	50 %	0 %	0 %	305662506
1387	NC_014471	TA	3	6	57595	57600	50 %	50 %	0 %	0 %	305662506
1388	NC_014471	GA	4	8	57601	57608	50 %	0 %	50 %	0 %	305662506
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