MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ignicoccus hospitalis KIN4/I chromosome

Total Repeats: 29075

< Previous12...47484950515253545556575859Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
29001	NC_009776	ATC	2	6	1293915	1293920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156938224
29002	NC_009776	CGT	2	6	1293963	1293968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29003	NC_009776	AAG	2	6	1293971	1293976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29004	NC_009776	CAA	2	6	1293983	1293988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29005	NC_009776	CTT	2	6	1294157	1294162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156938225
29006	NC_009776	AGG	2	6	1294186	1294191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156938225
29007	NC_009776	GGA	2	6	1294277	1294282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156938225
29008	NC_009776	GCT	2	6	1294498	1294503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156938226
29009	NC_009776	TAA	2	6	1294512	1294517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156938226
29010	NC_009776	GAG	2	6	1294577	1294582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156938226
29011	NC_009776	GC	3	6	1294603	1294608	0 %	0 %	50 %	50 %	156938226
29012	NC_009776	CGGAG	2	10	1294618	1294627	20 %	0 %	60 %	20 %	156938226
29013	NC_009776	AGA	2	6	1294665	1294670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156938226
29014	NC_009776	AGA	2	6	1294687	1294692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156938226
29015	NC_009776	G	6	6	1294729	1294734	0 %	0 %	100 %	0 %	156938226
29016	NC_009776	AGG	2	6	1294748	1294753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156938226
29017	NC_009776	GTA	2	6	1294766	1294771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156938226
29018	NC_009776	GGA	2	6	1294776	1294781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156938226
29019	NC_009776	TCG	2	6	1294854	1294859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156938226
29020	NC_009776	CTC	2	6	1294941	1294946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156938227
29021	NC_009776	CCG	2	6	1295007	1295012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156938227
29022	NC_009776	AG	3	6	1295067	1295072	50 %	0 %	50 %	0 %	156938227
29023	NC_009776	CGG	2	6	1295156	1295161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156938227
29024	NC_009776	AGG	2	6	1295177	1295182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156938227
29025	NC_009776	TCT	2	6	1295229	1295234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156938227
29026	NC_009776	CCA	2	6	1295262	1295267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156938227
29027	NC_009776	GAGAG	2	10	1295300	1295309	40 %	0 %	60 %	0 %	156938227
29028	NC_009776	GCCCC	2	10	1295316	1295325	0 %	0 %	20 %	80 %	156938227
29029	NC_009776	CCG	2	6	1295375	1295380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156938228
29030	NC_009776	TCC	2	6	1295422	1295427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156938228
29031	NC_009776	ATA	2	6	1295428	1295433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156938228
29032	NC_009776	TGC	2	6	1295480	1295485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156938228
29033	NC_009776	GCCG	2	8	1295490	1295497	0 %	0 %	50 %	50 %	156938228
29034	NC_009776	CT	3	6	1295508	1295513	0 %	50 %	0 %	50 %	156938228
29035	NC_009776	AC	3	6	1295523	1295528	50 %	0 %	0 %	50 %	156938228
29036	NC_009776	TCT	2	6	1295537	1295542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156938228
29037	NC_009776	TAT	2	6	1295640	1295645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156938228
29038	NC_009776	CAT	2	6	1295646	1295651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156938228
29039	NC_009776	ATT	2	6	1295656	1295661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156938228
29040	NC_009776	CT	3	6	1295677	1295682	0 %	50 %	0 %	50 %	156938228
29041	NC_009776	CGGG	2	8	1295684	1295691	0 %	0 %	75 %	25 %	156938228
29042	NC_009776	GT	3	6	1295698	1295703	0 %	50 %	50 %	0 %	156938228
29043	NC_009776	TCG	2	6	1295731	1295736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156938228
29044	NC_009776	TG	3	6	1295747	1295752	0 %	50 %	50 %	0 %	156938228
29045	NC_009776	AGG	2	6	1295802	1295807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156938228
29046	NC_009776	CCT	2	6	1295841	1295846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156938228
29047	NC_009776	CGT	2	6	1295858	1295863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156938228
29048	NC_009776	GCC	3	9	1295883	1295891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156938228
29049	NC_009776	GGC	2	6	1295898	1295903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156938228
29050	NC_009776	GCC	2	6	1295922	1295927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156938228
29051	NC_009776	CAA	3	9	1296003	1296011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156938228
29052	NC_009776	GAC	2	6	1296099	1296104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156938228
29053	NC_009776	TCG	2	6	1296136	1296141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156938228
29054	NC_009776	CCA	2	6	1296152	1296157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156938228
29055	NC_009776	GCC	2	6	1296192	1296197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156938228
29056	NC_009776	CGC	2	6	1296215	1296220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156938228
29057	NC_009776	CGA	2	6	1296279	1296284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29058	NC_009776	GAAG	2	8	1296301	1296308	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29059	NC_009776	G	6	6	1296308	1296313	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
29060	NC_009776	CGAA	2	8	1296398	1296405	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29061	NC_009776	T	6	6	1296472	1296477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29062	NC_009776	GGA	2	6	1296670	1296675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156938229
29063	NC_009776	CGG	2	6	1296792	1296797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156938229
29064	NC_009776	GTT	2	6	1296830	1296835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156938229
29065	NC_009776	CGGC	2	8	1296864	1296871	0 %	0 %	50 %	50 %	156938229
29066	NC_009776	TCC	2	6	1296913	1296918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156938229
29067	NC_009776	C	6	6	1296969	1296974	0 %	0 %	0 %	100 %	156938229
29068	NC_009776	ACC	2	6	1296978	1296983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156938229
29069	NC_009776	GAA	2	6	1296991	1296996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156938229
29070	NC_009776	GAGC	2	8	1297096	1297103	25 %	0 %	50 %	25 %	156938229
29071	NC_009776	GAA	2	6	1297135	1297140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156938229
29072	NC_009776	GGT	2	6	1297162	1297167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156938229
29073	NC_009776	AG	3	6	1297288	1297293	50 %	0 %	50 %	0 %	156938229
29074	NC_009776	GTC	2	6	1297451	1297456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156938229
29075	NC_009776	ATA	2	6	1297499	1297504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156938229

< Previous12...47484950515253545556575859Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.