MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ignicoccus hospitalis KIN4/I chromosome

Total Repeats: 29075

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009776	TAA	2	6	45959	45964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156936842
1002	NC_009776	ACA	2	6	45965	45970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156936842
1003	NC_009776	AGA	2	6	45977	45982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156936842
1004	NC_009776	CTT	2	6	46194	46199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936842
1005	NC_009776	AG	3	6	46222	46227	50 %	0 %	50 %	0 %	156936842
1006	NC_009776	TGA	2	6	46296	46301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_009776	GAA	2	6	46343	46348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156936843
1008	NC_009776	GCT	2	6	46361	46366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936843
1009	NC_009776	AAG	2	6	46386	46391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156936843
1010	NC_009776	GAG	2	6	46434	46439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156936843
1011	NC_009776	AG	3	6	46449	46454	50 %	0 %	50 %	0 %	156936843
1012	NC_009776	CGA	2	6	46505	46510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936843
1013	NC_009776	GAG	2	6	46533	46538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156936843
1014	NC_009776	AAG	2	6	46569	46574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156936843
1015	NC_009776	C	6	6	46584	46589	0 %	0 %	0 %	100 %	156936843
1016	NC_009776	GAG	2	6	46665	46670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156936843
1017	NC_009776	CGC	2	6	46680	46685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936843
1018	NC_009776	GGT	2	6	46723	46728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156936844
1019	NC_009776	GGA	2	6	46788	46793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156936844
1020	NC_009776	GAG	2	6	47001	47006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156936844
1021	NC_009776	ACG	2	6	47028	47033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936844
1022	NC_009776	GCT	2	6	47037	47042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936844
1023	NC_009776	ACG	2	6	47046	47051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936844
1024	NC_009776	AGGA	2	8	47144	47151	50 %	0 %	50 %	0 %	156936844
1025	NC_009776	AGG	2	6	47225	47230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156936844
1026	NC_009776	CGT	3	9	47263	47271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936844
1027	NC_009776	CCCA	2	8	47291	47298	25 %	0 %	0 %	75 %	156936844
1028	NC_009776	TGC	2	6	47304	47309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936844
1029	NC_009776	ACG	2	6	47310	47315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936844
1030	NC_009776	GGT	2	6	47320	47325	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156936844
1031	NC_009776	GGA	2	6	47432	47437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156936844
1032	NC_009776	CT	3	6	47587	47592	0 %	50 %	0 %	50 %	156936845
1033	NC_009776	GC	3	6	47721	47726	0 %	0 %	50 %	50 %	156936845
1034	NC_009776	ACG	2	6	47756	47761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936845
1035	NC_009776	CTT	2	6	47769	47774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936845
1036	NC_009776	AAG	2	6	47809	47814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156936845
1037	NC_009776	TCG	2	6	47825	47830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936845
1038	NC_009776	CGA	2	6	47835	47840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936845
1039	NC_009776	GTG	2	6	47841	47846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156936845
1040	NC_009776	GAC	2	6	47896	47901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936845
1041	NC_009776	AG	3	6	47908	47913	50 %	0 %	50 %	0 %	156936845
1042	NC_009776	TGG	2	6	48032	48037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156936845
1043	NC_009776	GCC	2	6	48079	48084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936845
1044	NC_009776	AGG	2	6	48086	48091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156936845
1045	NC_009776	CCG	2	6	48137	48142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936845
1046	NC_009776	ATA	2	6	48148	48153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156936845
1047	NC_009776	GCTG	2	8	48174	48181	0 %	25 %	50 %	25 %	156936845
1048	NC_009776	AAGG	2	8	48221	48228	50 %	0 %	50 %	0 %	156936846
1049	NC_009776	AT	3	6	48249	48254	50 %	50 %	0 %	0 %	156936846
1050	NC_009776	CGAAGG	2	12	48302	48313	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	156936846
1051	NC_009776	G	6	6	48312	48317	0 %	0 %	100 %	0 %	156936846
1052	NC_009776	GGA	2	6	48395	48400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156936846
1053	NC_009776	TCC	2	6	48541	48546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936846
1054	NC_009776	TCC	3	9	48549	48557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936846
1055	NC_009776	AGGG	2	8	48675	48682	25 %	0 %	75 %	0 %	156936846
1056	NC_009776	CAA	2	6	48695	48700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156936846
1057	NC_009776	GTG	2	6	48711	48716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156936846
1058	NC_009776	GAG	2	6	48720	48725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156936846
1059	NC_009776	AGA	2	6	48757	48762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156936846
1060	NC_009776	CGG	2	6	48851	48856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156936846
1061	NC_009776	AAC	2	6	48954	48959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156936846
1062	NC_009776	CGA	2	6	48962	48967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936846
1063	NC_009776	AGT	2	6	48980	48985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156936846
1064	NC_009776	GGA	2	6	48989	48994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156936846
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1067	NC_009776	GGA	2	6	49091	49096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156936846
1068	NC_009776	GA	3	6	49103	49108	50 %	0 %	50 %	0 %	156936846
1069	NC_009776	GTG	2	6	49158	49163	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156936846
1070	NC_009776	TGT	2	6	49165	49170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156936846
1071	NC_009776	TCC	2	6	49292	49297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936846
1072	NC_009776	CGC	2	6	49328	49333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936846
1073	NC_009776	AAC	2	6	49356	49361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156936847
1074	NC_009776	TCCCT	2	10	49393	49402	0 %	40 %	0 %	60 %	156936847
1075	NC_009776	CCG	2	6	49511	49516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936847
1076	NC_009776	CCA	2	6	49543	49548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156936847
1077	NC_009776	AGA	2	6	49554	49559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156936847
1078	NC_009776	CGG	2	6	49677	49682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156936847
1079	NC_009776	GTAC	2	8	49683	49690	25 %	25 %	25 %	25 %	156936847
1080	NC_009776	AAAGA	2	10	49742	49751	80 %	0 %	20 %	0 %	156936847
1081	NC_009776	CGG	3	9	49815	49823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	156936847
1082	NC_009776	ATT	2	6	49838	49843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156936847
1083	NC_009776	AGA	2	6	49905	49910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156936847
1084	NC_009776	AAC	2	6	50009	50014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156936847
1085	NC_009776	ACA	2	6	50019	50024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156936847
1086	NC_009776	AGGG	2	8	50032	50039	25 %	0 %	75 %	0 %	156936847
1087	NC_009776	TTA	2	6	50106	50111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156936847
1088	NC_009776	CTC	2	6	50197	50202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1089	NC_009776	TAA	2	6	50224	50229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156936848
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1092	NC_009776	TCC	2	6	50378	50383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936848
1093	NC_009776	TCT	2	6	50403	50408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936848
1094	NC_009776	TTA	2	6	50496	50501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156936848
1095	NC_009776	GC	3	6	50688	50693	0 %	0 %	50 %	50 %	156936848
1096	NC_009776	CAAG	2	8	50713	50720	50 %	0 %	25 %	25 %	156936848
1097	NC_009776	CTC	2	6	50729	50734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936848
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1099	NC_009776	TGC	2	6	50811	50816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936848
1100	NC_009776	TAA	2	6	50826	50831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156936848
1101	NC_009776	GTT	2	6	50845	50850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156936848
1102	NC_009776	GAG	2	6	50968	50973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156936848
1103	NC_009776	GCC	2	6	51056	51061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936848
1104	NC_009776	CT	3	6	51071	51076	0 %	50 %	0 %	50 %	156936848
1105	NC_009776	TGGG	2	8	51130	51137	0 %	25 %	75 %	0 %	156936848
1106	NC_009776	CT	3	6	51164	51169	0 %	50 %	0 %	50 %	156936848
1107	NC_009776	TAT	2	6	51181	51186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156936848
1108	NC_009776	GAA	2	6	51211	51216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156936848
1109	NC_009776	GTTA	2	8	51217	51224	25 %	50 %	25 %	0 %	156936848
1110	NC_009776	CCA	2	6	51240	51245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156936848
1111	NC_009776	CCT	2	6	51262	51267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936848
1112	NC_009776	CCT	2	6	51324	51329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936848
1113	NC_009776	AGG	2	6	51372	51377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156936848
1114	NC_009776	TCG	2	6	51446	51451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936848
1115	NC_009776	CCT	2	6	51465	51470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936848
1116	NC_009776	GCGG	2	8	51629	51636	0 %	0 %	75 %	25 %	156936848
1117	NC_009776	CT	3	6	51752	51757	0 %	50 %	0 %	50 %	156936848
1118	NC_009776	G	6	6	51770	51775	0 %	0 %	100 %	0 %	156936848
1119	NC_009776	CTT	2	6	51811	51816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936848
1120	NC_009776	CTT	2	6	51904	51909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936848
1121	NC_009776	TAA	2	6	52002	52007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156936849
1122	NC_009776	CCAG	2	8	52052	52059	25 %	0 %	25 %	50 %	156936849
1123	NC_009776	TTG	2	6	52066	52071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156936849
1124	NC_009776	GTA	2	6	52120	52125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156936849
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1126	NC_009776	TGT	2	6	52208	52213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156936849
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