MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ignicoccus hospitalis KIN4/I chromosome

Total Repeats: 29075

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009776	CTT	2	6	23578	23583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936817
502	NC_009776	T	6	6	23593	23598	0 %	100 %	0 %	0 %	156936817
503	NC_009776	CTT	2	6	23602	23607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936817
504	NC_009776	CCT	2	6	23617	23622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936817
505	NC_009776	AAC	2	6	23624	23629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156936817
506	NC_009776	TTC	2	6	23709	23714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936817
507	NC_009776	AAC	2	6	23747	23752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	156936817
508	NC_009776	CA	3	6	23826	23831	50 %	0 %	0 %	50 %	156936818
509	NC_009776	TTGGAG	2	12	23849	23860	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	156936818
510	NC_009776	ACT	2	6	24031	24036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	156936818
511	NC_009776	AAG	2	6	24039	24044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156936818
512	NC_009776	AGA	2	6	24148	24153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156936818
513	NC_009776	GTT	2	6	24166	24171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156936818
514	NC_009776	TTC	2	6	24275	24280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936818
515	NC_009776	TCG	2	6	24303	24308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936818
516	NC_009776	CGA	2	6	24397	24402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936818
517	NC_009776	AG	3	6	24455	24460	50 %	0 %	50 %	0 %	156936818
518	NC_009776	GTG	2	6	24461	24466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156936818
519	NC_009776	GTA	2	6	24503	24508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156936818
520	NC_009776	GTC	2	6	24597	24602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936819
521	NC_009776	TGA	2	6	24604	24609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156936819
522	NC_009776	ACG	2	6	24619	24624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936819
523	NC_009776	TGG	2	6	24630	24635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	156936819
524	NC_009776	GAC	2	6	24672	24677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936819
525	NC_009776	GC	3	6	24685	24690	0 %	0 %	50 %	50 %	156936819
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527	NC_009776	GCT	2	6	24740	24745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936819
528	NC_009776	GGA	2	6	24800	24805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156936819
529	NC_009776	GA	4	8	24848	24855	50 %	0 %	50 %	0 %	156936819
530	NC_009776	CGC	2	6	24890	24895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936819
531	NC_009776	GGAAA	2	10	24981	24990	60 %	0 %	40 %	0 %	156936820
532	NC_009776	AGG	2	6	25065	25070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156936820
533	NC_009776	TACT	2	8	25083	25090	25 %	50 %	0 %	25 %	156936820
534	NC_009776	TA	4	8	25092	25099	50 %	50 %	0 %	0 %	156936820
535	NC_009776	CGC	2	6	25152	25157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936820
536	NC_009776	GC	3	6	25160	25165	0 %	0 %	50 %	50 %	156936820
537	NC_009776	GAG	2	6	25342	25347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156936820
538	NC_009776	CGA	2	6	25368	25373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936820
539	NC_009776	CGA	2	6	25400	25405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936820
540	NC_009776	GA	3	6	25417	25422	50 %	0 %	50 %	0 %	156936820
541	NC_009776	AGA	2	6	25430	25435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156936820
542	NC_009776	CGT	2	6	25446	25451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936820
543	NC_009776	CGC	2	6	25458	25463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	156936820
544	NC_009776	ACC	2	6	25502	25507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156936820
545	NC_009776	CGGGG	2	10	25514	25523	0 %	0 %	80 %	20 %	156936820
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547	NC_009776	GGA	2	6	25607	25612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156936820
548	NC_009776	CCA	2	6	25631	25636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	156936820
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554	NC_009776	GAG	2	6	26038	26043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	156936820
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556	NC_009776	GCCA	2	8	26284	26291	25 %	0 %	25 %	50 %	156936820
557	NC_009776	GCCCC	2	10	26304	26313	0 %	0 %	20 %	80 %	156936820
558	NC_009776	GC	3	6	26333	26338	0 %	0 %	50 %	50 %	156936820
559	NC_009776	CGTG	2	8	26402	26409	0 %	25 %	50 %	25 %	156936820
560	NC_009776	GAGC	2	8	26436	26443	25 %	0 %	50 %	25 %	156936820
561	NC_009776	GTA	2	6	26452	26457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156936820
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563	NC_009776	CGA	3	9	26553	26561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	156936820
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569	NC_009776	AAG	2	6	26845	26850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_009776	CCTC	2	8	26862	26869	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
571	NC_009776	AGG	2	6	26889	26894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
572	NC_009776	TCT	2	6	26902	26907	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_009776	CCCCTC	2	12	26924	26935	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
574	NC_009776	TAGA	2	8	26991	26998	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
575	NC_009776	TTA	2	6	27012	27017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_009776	ATT	2	6	27101	27106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_009776	TGT	2	6	27116	27121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_009776	GTT	2	6	27122	27127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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581	NC_009776	GC	3	6	27294	27299	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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599	NC_009776	TCT	2	6	27894	27899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936822
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601	NC_009776	TCTT	2	8	27910	27917	0 %	75 %	0 %	25 %	156936822
602	NC_009776	TCG	2	6	27936	27941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	156936822
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605	NC_009776	TTC	2	6	27963	27968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	156936822
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608	NC_009776	CCT	2	6	28045	28050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936822
609	NC_009776	TAG	2	6	28067	28072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156936822
610	NC_009776	AAG	2	6	28107	28112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156936822
611	NC_009776	CTC	2	6	28210	28215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	156936823
612	NC_009776	TAT	2	6	28291	28296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	156936823
613	NC_009776	AT	3	6	28301	28306	50 %	50 %	0 %	0 %	156936823
614	NC_009776	GTAT	2	8	28338	28345	25 %	50 %	25 %	0 %	156936823
615	NC_009776	GTA	2	6	28363	28368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	156936823
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619	NC_009776	CCA	2	6	28528	28533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
620	NC_009776	TAA	2	6	28617	28622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	156936824
621	NC_009776	AGA	2	6	28633	28638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	156936824
622	NC_009776	AG	3	6	28674	28679	50 %	0 %	50 %	0 %	156936824
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627	NC_009776	GTT	2	6	28801	28806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	156936824
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