MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Idiomarina loihiensis L2TR chromosome

Total Repeats: 52873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_006512	TCG	2	6	82343	82348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56459188
1502	NC_006512	TCA	2	6	82359	82364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56459188
1503	NC_006512	TCA	2	6	82413	82418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56459188
1504	NC_006512	TTG	2	6	82427	82432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56459188
1505	NC_006512	GCA	2	6	82495	82500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56459188
1506	NC_006512	AAAGGC	2	12	82532	82543	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	56459188
1507	NC_006512	TTCG	2	8	82672	82679	0 %	50 %	25 %	25 %	56459188
1508	NC_006512	AAT	2	6	82751	82756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56459188
1509	NC_006512	GCT	2	6	82855	82860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56459188
1510	NC_006512	GCTT	2	8	82880	82887	0 %	50 %	25 %	25 %	56459188
1511	NC_006512	GTC	2	6	82958	82963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56459188
1512	NC_006512	GTT	2	6	83174	83179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56459188
1513	NC_006512	TCGG	2	8	83234	83241	0 %	25 %	50 %	25 %	56459188
1514	NC_006512	AAG	2	6	83272	83277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56459188
1515	NC_006512	CTC	2	6	83360	83365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56459188
1516	NC_006512	CAAA	2	8	83380	83387	75 %	0 %	0 %	25 %	56459188
1517	NC_006512	T	7	7	83410	83416	0 %	100 %	0 %	0 %	56459188
1518	NC_006512	CTT	2	6	83458	83463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56459188
1519	NC_006512	CT	3	6	83483	83488	0 %	50 %	0 %	50 %	56459188
1520	NC_006512	CAA	2	6	83555	83560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56459188
1521	NC_006512	T	6	6	83567	83572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_006512	TTAAG	2	10	83681	83690	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_006512	GCG	2	6	83712	83717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_006512	TGA	2	6	83738	83743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_006512	ACT	2	6	83779	83784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_006512	AGA	2	6	83900	83905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56459189
1527	NC_006512	CGC	2	6	83936	83941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56459189
1528	NC_006512	A	6	6	83943	83948	100 %	0 %	0 %	0 %	56459189
1529	NC_006512	TTAA	2	8	83952	83959	50 %	50 %	0 %	0 %	56459189
1530	NC_006512	GTT	2	6	84047	84052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56459189
1531	NC_006512	GCA	2	6	84056	84061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56459189
1532	NC_006512	GCA	2	6	84113	84118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56459189
1533	NC_006512	GTATG	2	10	84140	84149	20 %	40 %	40 %	0 %	56459189
1534	NC_006512	CCG	2	6	84232	84237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56459189
1535	NC_006512	GGC	2	6	84335	84340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56459189
1536	NC_006512	A	6	6	84394	84399	100 %	0 %	0 %	0 %	56459189
1537	NC_006512	GAA	2	6	84402	84407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56459189
1538	NC_006512	AGA	2	6	84424	84429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56459189
1539	NC_006512	ACT	2	6	84463	84468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56459189
1540	NC_006512	ACCT	2	8	84478	84485	25 %	25 %	0 %	50 %	56459189
1541	NC_006512	CAA	2	6	84518	84523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56459189
1542	NC_006512	GGGGC	2	10	84582	84591	0 %	0 %	80 %	20 %	56459189
1543	NC_006512	TGG	2	6	84596	84601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56459189
1544	NC_006512	A	6	6	84649	84654	100 %	0 %	0 %	0 %	56459189
1545	NC_006512	ACG	2	6	84686	84691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_006512	TAA	2	6	84842	84847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56459190
1547	NC_006512	TGA	2	6	84857	84862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56459190
1548	NC_006512	GCC	2	6	84892	84897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56459190
1549	NC_006512	GGT	2	6	84912	84917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56459190
1550	NC_006512	AACCG	2	10	85029	85038	40 %	0 %	20 %	40 %	56459190
1551	NC_006512	TGT	2	6	85040	85045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56459190
1552	NC_006512	GCAA	2	8	85131	85138	50 %	0 %	25 %	25 %	56459190
1553	NC_006512	ACG	2	6	85177	85182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56459190
1554	NC_006512	TTTC	2	8	85190	85197	0 %	75 %	0 %	25 %	56459190
1555	NC_006512	AAG	2	6	85210	85215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56459190
1556	NC_006512	GCT	2	6	85238	85243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56459190
1557	NC_006512	TGA	2	6	85246	85251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56459190
1558	NC_006512	CAC	2	6	85303	85308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56459190
1559	NC_006512	GCA	2	6	85313	85318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56459190
1560	NC_006512	GAT	2	6	85334	85339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56459190
1561	NC_006512	ATT	2	6	85365	85370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56459190
1562	NC_006512	TTG	2	6	85396	85401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56459190
1563	NC_006512	TAA	2	6	85526	85531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56459190
1564	NC_006512	GAA	2	6	85575	85580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56459190
1565	NC_006512	GGGC	2	8	85585	85592	0 %	0 %	75 %	25 %	56459190
1566	NC_006512	ACGGT	2	10	85634	85643	20 %	20 %	40 %	20 %	56459190
1567	NC_006512	TTA	2	6	85664	85669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56459190
1568	NC_006512	GAT	2	6	85743	85748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56459190
1569	NC_006512	GAACC	2	10	85758	85767	40 %	0 %	20 %	40 %	56459190
1570	NC_006512	TTG	2	6	85780	85785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56459190
1571	NC_006512	TGG	2	6	85891	85896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56459190
1572	NC_006512	GAT	2	6	85908	85913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56459190
1573	NC_006512	GTTT	2	8	85937	85944	0 %	75 %	25 %	0 %	56459190
1574	NC_006512	TTA	2	6	85955	85960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56459190
1575	NC_006512	TGAA	2	8	85987	85994	50 %	25 %	25 %	0 %	56459190
1576	NC_006512	ATG	2	6	86020	86025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56459190
1577	NC_006512	GCTG	2	8	86038	86045	0 %	25 %	50 %	25 %	56459190
1578	NC_006512	CGA	2	6	86161	86166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56459190
1579	NC_006512	AAG	2	6	86209	86214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56459190
1580	NC_006512	AAC	2	6	86427	86432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56459190
1581	NC_006512	GTG	2	6	86500	86505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56459190
1582	NC_006512	TAA	2	6	86531	86536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56459190
1583	NC_006512	TGG	2	6	86584	86589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56459190
1584	NC_006512	GGT	2	6	86615	86620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56459190
1585	NC_006512	TTA	3	9	86743	86751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56459190
1586	NC_006512	CGG	2	6	86762	86767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56459190
1587	NC_006512	AGCC	2	8	86787	86794	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1588	NC_006512	TTA	2	6	86879	86884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56459191
1589	NC_006512	AATG	2	8	86964	86971	50 %	25 %	25 %	0 %	56459191
1590	NC_006512	CGC	2	6	87112	87117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56459191
1591	NC_006512	AAT	2	6	87119	87124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56459191
1592	NC_006512	CGT	2	6	87198	87203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56459191
1593	NC_006512	CTGA	2	8	87210	87217	25 %	25 %	25 %	25 %	56459191
1594	NC_006512	CCG	2	6	87227	87232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56459191
1595	NC_006512	GT	3	6	87288	87293	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_006512	CGAA	2	8	87352	87359	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1597	NC_006512	CTTGT	2	10	87403	87412	0 %	60 %	20 %	20 %	56459192
1598	NC_006512	GT	3	6	87437	87442	0 %	50 %	50 %	0 %	56459192
1599	NC_006512	TCA	2	6	87458	87463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56459192
1600	NC_006512	GCAG	2	8	87505	87512	25 %	0 %	50 %	25 %	56459192
1601	NC_006512	TCG	2	6	87566	87571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56459192
1602	NC_006512	TTA	2	6	87588	87593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56459192
1603	NC_006512	GCT	2	6	87600	87605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56459192
1604	NC_006512	TAA	2	6	87615	87620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56459192
1605	NC_006512	AAC	2	6	87647	87652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56459192
1606	NC_006512	AATAA	2	10	87701	87710	80 %	20 %	0 %	0 %	56459192
1607	NC_006512	AGC	2	6	87743	87748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56459192
1608	NC_006512	GCAAA	2	10	87791	87800	60 %	0 %	20 %	20 %	56459192
1609	NC_006512	TTA	2	6	87824	87829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56459192
1610	NC_006512	ACAA	2	8	87893	87900	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1611	NC_006512	GGC	2	6	88066	88071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56459193
1612	NC_006512	CTG	2	6	88086	88091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56459193
1613	NC_006512	TAT	2	6	88105	88110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56459193
1614	NC_006512	CCG	2	6	88125	88130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56459193
1615	NC_006512	TGTA	2	8	88167	88174	25 %	50 %	25 %	0 %	56459193
1616	NC_006512	AGA	2	6	88192	88197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56459193
1617	NC_006512	T	6	6	88205	88210	0 %	100 %	0 %	0 %	56459193
1618	NC_006512	TCTA	2	8	88226	88233	25 %	50 %	0 %	25 %	56459193
1619	NC_006512	ACG	2	6	88374	88379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56459193
1620	NC_006512	TATT	2	8	88542	88549	25 %	75 %	0 %	0 %	56459193
1621	NC_006512	GAT	2	6	88550	88555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56459193
1622	NC_006512	CTA	2	6	88594	88599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56459193
1623	NC_006512	CCG	2	6	88887	88892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56459193
1624	NC_006512	TCG	2	6	88915	88920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56459193
1625	NC_006512	GCA	2	6	88959	88964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56459193
1626	NC_006512	TGC	2	6	89071	89076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56459193
1627	NC_006512	GAAA	2	8	89083	89090	75 %	0 %	25 %	0 %	56459193
1628	NC_006512	GAA	2	6	89131	89136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56459193
1629	NC_006512	GTTTC	2	10	89141	89150	0 %	60 %	20 %	20 %	56459193
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1760	NC_006512	ACC	2	6	95862	95867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56459202
1761	NC_006512	T	6	6	95869	95874	0 %	100 %	0 %	0 %	56459202
1762	NC_006512	CAG	2	6	95881	95886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56459202
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1764	NC_006512	GTC	2	6	95913	95918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56459202
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1768	NC_006512	TGGT	2	8	96149	96156	0 %	50 %	50 %	0 %	56459202
1769	NC_006512	ATC	3	9	96180	96188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56459202
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1771	NC_006512	GGC	2	6	96264	96269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56459202
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1775	NC_006512	TGT	2	6	96423	96428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56459202
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1781	NC_006512	CCAA	2	8	96890	96897	50 %	0 %	0 %	50 %	56459202
1782	NC_006512	ACCGGA	2	12	96904	96915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56459202
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1785	NC_006512	CAGA	2	8	97012	97019	50 %	0 %	25 %	25 %	56459203
1786	NC_006512	CAG	2	6	97021	97026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56459203
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1793	NC_006512	GGAA	2	8	97386	97393	50 %	0 %	50 %	0 %	56459203
1794	NC_006512	GCC	2	6	97414	97419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56459203
1795	NC_006512	GGATCA	2	12	97491	97502	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	56459203
1796	NC_006512	T	6	6	97510	97515	0 %	100 %	0 %	0 %	56459203
1797	NC_006512	TGA	2	6	97523	97528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56459203
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1799	NC_006512	ATT	2	6	97561	97566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56459203
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1805	NC_006512	GCA	2	6	97914	97919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56459204
1806	NC_006512	CA	3	6	97922	97927	50 %	0 %	0 %	50 %	56459204
1807	NC_006512	GGCA	2	8	98092	98099	25 %	0 %	50 %	25 %	56459204
1808	NC_006512	CAG	2	6	98244	98249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56459204
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1810	NC_006512	TCA	2	6	98297	98302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56459204
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1812	NC_006512	TTA	2	6	98415	98420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56459204
1813	NC_006512	TGC	2	6	98512	98517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56459205
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1819	NC_006512	TTTGGT	2	12	98849	98860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56459205
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1822	NC_006512	ACT	2	6	98928	98933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56459205
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1831	NC_006512	GAAC	2	8	99423	99430	50 %	0 %	25 %	25 %	56459206
1832	NC_006512	GC	4	8	99444	99451	0 %	0 %	50 %	50 %	56459206
1833	NC_006512	TCG	2	6	99456	99461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56459206
1834	NC_006512	GAC	2	6	99511	99516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56459206
1835	NC_006512	GTT	3	9	99529	99537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56459206
1836	NC_006512	GCTG	2	8	99543	99550	0 %	25 %	50 %	25 %	56459206
1837	NC_006512	AG	3	6	99663	99668	50 %	0 %	50 %	0 %	56459206
1838	NC_006512	TGCAA	2	10	99758	99767	40 %	20 %	20 %	20 %	56459206
1839	NC_006512	CAG	2	6	99859	99864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1840	NC_006512	TGA	2	6	99896	99901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56459207
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1842	NC_006512	AATC	2	8	99997	100004	50 %	25 %	0 %	25 %	56459207
1843	NC_006512	GCT	2	6	100058	100063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56459207
1844	NC_006512	AG	3	6	100129	100134	50 %	0 %	50 %	0 %	56459207
1845	NC_006512	GCAT	2	8	100151	100158	25 %	25 %	25 %	25 %	56459207
1846	NC_006512	TGG	2	6	100296	100301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56459207
1847	NC_006512	GAC	2	6	100365	100370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56459207
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1849	NC_006512	AG	3	6	100398	100403	50 %	0 %	50 %	0 %	56459207
1850	NC_006512	AGC	2	6	100567	100572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56459207
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1853	NC_006512	CAGG	2	8	100700	100707	25 %	0 %	50 %	25 %	56459207
1854	NC_006512	TGA	2	6	100790	100795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56459207
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1856	NC_006512	TTTG	2	8	100896	100903	0 %	75 %	25 %	0 %	56459207
1857	NC_006512	TATTGA	2	12	100928	100939	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	56459207
1858	NC_006512	GAT	2	6	101061	101066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56459207
1859	NC_006512	GTT	2	6	101193	101198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1860	NC_006512	ATG	2	6	101283	101288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56459208
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1862	NC_006512	GCC	2	6	101328	101333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56459208
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1864	NC_006512	A	6	6	101415	101420	100 %	0 %	0 %	0 %	56459208
1865	NC_006512	GTT	2	6	101448	101453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56459208
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1868	NC_006512	AAG	2	6	101599	101604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56459208
1869	NC_006512	TTG	2	6	101644	101649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56459208
1870	NC_006512	TGT	2	6	101666	101671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56459208
1871	NC_006512	AGC	2	6	101693	101698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56459208
1872	NC_006512	AAAT	2	8	101720	101727	75 %	25 %	0 %	0 %	56459209
1873	NC_006512	TGC	2	6	101737	101742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56459209
1874	NC_006512	CAGC	2	8	101769	101776	25 %	0 %	25 %	50 %	56459209
1875	NC_006512	GTT	2	6	101796	101801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56459209
1876	NC_006512	GCA	2	6	101858	101863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56459209
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1878	NC_006512	AT	3	6	101895	101900	50 %	50 %	0 %	0 %	56459209
1879	NC_006512	CAG	2	6	101928	101933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56459209
1880	NC_006512	GCC	2	6	101968	101973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56459209
1881	NC_006512	TGC	2	6	102067	102072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56459209
1882	NC_006512	TGA	2	6	102094	102099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56459209
1883	NC_006512	CCG	2	6	102143	102148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56459209
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1885	NC_006512	T	6	6	102184	102189	0 %	100 %	0 %	0 %	56459209
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