MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Idiomarina loihiensis L2TR chromosome

Total Repeats: 52873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_006512	CTA	2	6	26642	26647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56459136
502	NC_006512	ATA	2	6	26652	26657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56459136
503	NC_006512	ATT	2	6	26675	26680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56459136
504	NC_006512	ATA	2	6	26756	26761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56459136
505	NC_006512	AAAG	2	8	26815	26822	75 %	0 %	25 %	0 %	56459136
506	NC_006512	CGTCTG	2	12	26889	26900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56459136
507	NC_006512	CAG	3	9	26938	26946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56459136
508	NC_006512	CTCC	2	8	26969	26976	0 %	25 %	0 %	75 %	56459136
509	NC_006512	GCT	2	6	26977	26982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56459136
510	NC_006512	GGCT	2	8	27055	27062	0 %	25 %	50 %	25 %	56459136
511	NC_006512	TTGA	2	8	27092	27099	25 %	50 %	25 %	0 %	56459136
512	NC_006512	GCAG	2	8	27100	27107	25 %	0 %	50 %	25 %	56459136
513	NC_006512	TTGA	3	12	27184	27195	25 %	50 %	25 %	0 %	56459136
514	NC_006512	A	7	7	27251	27257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_006512	TCTG	2	8	27296	27303	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
516	NC_006512	TTCC	2	8	27321	27328	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
517	NC_006512	ATA	3	9	27367	27375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_006512	AAATTT	2	12	27455	27466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_006512	GTT	2	6	27485	27490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_006512	TTA	2	6	27498	27503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_006512	TTC	2	6	27631	27636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56459137
522	NC_006512	GCC	2	6	27661	27666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56459137
523	NC_006512	ACCG	2	8	27691	27698	25 %	0 %	25 %	50 %	56459137
524	NC_006512	GCT	2	6	27904	27909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56459137
525	NC_006512	GAT	2	6	27932	27937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56459137
526	NC_006512	GC	3	6	27953	27958	0 %	0 %	50 %	50 %	56459137
527	NC_006512	CCAAA	2	10	28106	28115	60 %	0 %	0 %	40 %	56459137
528	NC_006512	ATT	2	6	28122	28127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56459137
529	NC_006512	CTG	2	6	28199	28204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56459137
530	NC_006512	GCT	2	6	28315	28320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56459137
531	NC_006512	CCG	2	6	28441	28446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56459137
532	NC_006512	TGA	2	6	28453	28458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56459137
533	NC_006512	TGA	2	6	28554	28559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56459137
534	NC_006512	AAC	2	6	28627	28632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56459137
535	NC_006512	TGGT	2	8	28659	28666	0 %	50 %	50 %	0 %	56459137
536	NC_006512	GT	3	6	28665	28670	0 %	50 %	50 %	0 %	56459137
537	NC_006512	TA	3	6	28700	28705	50 %	50 %	0 %	0 %	56459137
538	NC_006512	CCT	2	6	28890	28895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56459137
539	NC_006512	TTAC	2	8	29067	29074	25 %	50 %	0 %	25 %	56459137
540	NC_006512	A	7	7	29259	29265	100 %	0 %	0 %	0 %	56459137
541	NC_006512	GAG	2	6	29285	29290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56459137
542	NC_006512	TTC	2	6	29327	29332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56459137
543	NC_006512	GAA	2	6	29356	29361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56459137
544	NC_006512	GC	3	6	29373	29378	0 %	0 %	50 %	50 %	56459137
545	NC_006512	GCA	2	6	29443	29448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56459137
546	NC_006512	GAT	2	6	29497	29502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56459137
547	NC_006512	AC	3	6	29524	29529	50 %	0 %	0 %	50 %	56459137
548	NC_006512	CCG	2	6	29607	29612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56459137
549	NC_006512	TGA	2	6	29797	29802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56459137
550	NC_006512	CGT	2	6	30020	30025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56459137
551	NC_006512	TAA	2	6	30166	30171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56459137
552	NC_006512	GAT	2	6	30179	30184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56459137
553	NC_006512	TAA	2	6	30328	30333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56459137
554	NC_006512	CAA	2	6	30393	30398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_006512	TCC	2	6	30412	30417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
556	NC_006512	A	6	6	30421	30426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_006512	T	6	6	30470	30475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_006512	GCCA	2	8	30495	30502	25 %	0 %	25 %	50 %	56459138
559	NC_006512	TAGG	2	8	30627	30634	25 %	25 %	50 %	0 %	56459138
560	NC_006512	TAC	2	6	30669	30674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56459138
561	NC_006512	CGG	2	6	30698	30703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56459138
562	NC_006512	CAGAA	2	10	30723	30732	60 %	0 %	20 %	20 %	56459138
563	NC_006512	GCT	2	6	30755	30760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56459138
564	NC_006512	TAA	2	6	30770	30775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56459138
565	NC_006512	TTG	2	6	30800	30805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56459138
566	NC_006512	TGA	2	6	30875	30880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56459138
567	NC_006512	GC	3	6	31023	31028	0 %	0 %	50 %	50 %	56459138
568	NC_006512	TGA	2	6	31033	31038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56459138
569	NC_006512	CGC	2	6	31100	31105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56459138
570	NC_006512	CGG	2	6	31213	31218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56459138
571	NC_006512	CTG	2	6	31244	31249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56459138
572	NC_006512	T	7	7	31299	31305	0 %	100 %	0 %	0 %	56459138
573	NC_006512	A	6	6	31312	31317	100 %	0 %	0 %	0 %	56459138
574	NC_006512	TAA	3	9	31347	31355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_006512	GTG	2	6	31367	31372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
576	NC_006512	TCG	2	6	31382	31387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56459139
577	NC_006512	GCTT	2	8	31499	31506	0 %	50 %	25 %	25 %	56459139
578	NC_006512	GC	4	8	31528	31535	0 %	0 %	50 %	50 %	56459139
579	NC_006512	TAA	2	6	31561	31566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56459139
580	NC_006512	AATT	2	8	31603	31610	50 %	50 %	0 %	0 %	56459139
581	NC_006512	TTAA	2	8	31796	31803	50 %	50 %	0 %	0 %	56459139
582	NC_006512	GTCC	2	8	31808	31815	0 %	25 %	25 %	50 %	56459139
583	NC_006512	CGGC	2	8	31892	31899	0 %	0 %	50 %	50 %	56459139
584	NC_006512	CGG	2	6	31924	31929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56459139
585	NC_006512	A	6	6	32019	32024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_006512	CA	3	6	32109	32114	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
587	NC_006512	CAGAA	2	10	32173	32182	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
588	NC_006512	A	6	6	32197	32202	100 %	0 %	0 %	0 %	56459140
589	NC_006512	TTC	2	6	32224	32229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56459140
590	NC_006512	CCG	2	6	32234	32239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56459140
591	NC_006512	GCG	2	6	32258	32263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56459140
592	NC_006512	CCGA	2	8	32329	32336	25 %	0 %	25 %	50 %	56459140
593	NC_006512	AGC	2	6	32381	32386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56459140
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595	NC_006512	GAA	2	6	32422	32427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56459140
596	NC_006512	TAA	2	6	32433	32438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56459140
597	NC_006512	ATG	2	6	32446	32451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56459140
598	NC_006512	CCT	2	6	32462	32467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56459140
599	NC_006512	AGA	2	6	32472	32477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56459140
600	NC_006512	TGC	2	6	32493	32498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56459140
601	NC_006512	CAT	2	6	32544	32549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56459140
602	NC_006512	CCG	2	6	32571	32576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56459140
603	NC_006512	GCT	2	6	32647	32652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56459140
604	NC_006512	CGC	2	6	32676	32681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56459140
605	NC_006512	GCG	2	6	32714	32719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56459140
606	NC_006512	AATGA	2	10	32737	32746	60 %	20 %	20 %	0 %	56459140
607	NC_006512	T	7	7	32857	32863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_006512	T	6	6	32895	32900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_006512	TAA	2	6	32920	32925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_006512	A	6	6	32924	32929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_006512	T	6	6	32934	32939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_006512	AGT	2	6	32975	32980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_006512	AAC	2	6	32984	32989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_006512	CAGA	2	8	33004	33011	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
615	NC_006512	A	7	7	33011	33017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_006512	A	8	8	33019	33026	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_006512	ATA	2	6	33049	33054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_006512	A	7	7	33087	33093	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_006512	TAA	3	9	33188	33196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_006512	AAT	2	6	33198	33203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_006512	GA	3	6	33292	33297	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
622	NC_006512	T	6	6	33322	33327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_006512	ATC	2	6	33339	33344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_006512	GTT	2	6	33412	33417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
625	NC_006512	GA	3	6	33488	33493	50 %	0 %	50 %	0 %	56459141
626	NC_006512	A	6	6	33528	33533	100 %	0 %	0 %	0 %	56459141
627	NC_006512	CAA	2	6	33582	33587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56459141
628	NC_006512	CAAAA	2	10	33590	33599	80 %	0 %	0 %	20 %	56459141
629	NC_006512	GTC	2	6	33628	33633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56459141
630	NC_006512	TGA	2	6	33649	33654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56459141
631	NC_006512	CAG	2	6	33739	33744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56459141
632	NC_006512	AGC	2	6	33784	33789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56459141
633	NC_006512	CGA	2	6	33815	33820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56459141
634	NC_006512	GAC	2	6	33828	33833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56459141
635	NC_006512	GAG	2	6	33834	33839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56459141
636	NC_006512	ATT	2	6	33890	33895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56459142
637	NC_006512	TGA	2	6	33991	33996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56459142
638	NC_006512	ATT	2	6	34001	34006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56459142
639	NC_006512	GCA	2	6	34024	34029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56459142
640	NC_006512	ATC	2	6	34080	34085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56459142
641	NC_006512	CGATTA	2	12	34099	34110	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	56459142
642	NC_006512	AAG	2	6	34181	34186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56459142
643	NC_006512	AAG	2	6	34193	34198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56459142
644	NC_006512	GAC	2	6	34214	34219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56459142
645	NC_006512	ATT	2	6	34253	34258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56459142
646	NC_006512	CGG	2	6	34293	34298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56459142
647	NC_006512	GAG	2	6	34302	34307	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56459142
648	NC_006512	T	6	6	34319	34324	0 %	100 %	0 %	0 %	56459143
649	NC_006512	AGA	2	6	34336	34341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56459143
650	NC_006512	GC	3	6	34373	34378	0 %	0 %	50 %	50 %	56459143
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653	NC_006512	TGT	3	9	34762	34770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56459143
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655	NC_006512	TAA	2	6	34999	35004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56459143
656	NC_006512	GAC	2	6	35048	35053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56459143
657	NC_006512	GAA	2	6	35066	35071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56459143
658	NC_006512	CGC	2	6	35080	35085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56459143
659	NC_006512	ACG	2	6	35089	35094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56459143
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661	NC_006512	CTG	2	6	35230	35235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56459144
662	NC_006512	GCCAC	2	10	35288	35297	20 %	0 %	20 %	60 %	56459144
663	NC_006512	TTC	2	6	35302	35307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56459144
664	NC_006512	GAAC	2	8	35525	35532	50 %	0 %	25 %	25 %	56459144
665	NC_006512	TCA	2	6	35534	35539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56459144
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668	NC_006512	TTC	2	6	35680	35685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56459144
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672	NC_006512	ATC	2	6	35932	35937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56459144
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674	NC_006512	TCAC	2	8	36005	36012	25 %	25 %	0 %	50 %	56459144
675	NC_006512	AACT	2	8	36067	36074	50 %	25 %	0 %	25 %	56459144
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683	NC_006512	TTTCC	2	10	36675	36684	0 %	60 %	0 %	40 %	56459144
684	NC_006512	A	7	7	36799	36805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
685	NC_006512	CGC	2	6	36806	36811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
686	NC_006512	GAAA	2	8	36930	36937	75 %	0 %	25 %	0 %	56459145
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689	NC_006512	A	6	6	37183	37188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
690	NC_006512	CAA	2	6	37251	37256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
691	NC_006512	TGC	2	6	37332	37337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56459146
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705	NC_006512	CAA	2	6	37772	37777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56459146
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709	NC_006512	TAAA	2	8	37980	37987	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
710	NC_006512	ACTT	2	8	38125	38132	25 %	50 %	0 %	25 %	56459147
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731	NC_006512	TGAT	2	8	39501	39508	25 %	50 %	25 %	0 %	56459148
732	NC_006512	CAG	2	6	39535	39540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56459148
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734	NC_006512	TAA	2	6	39589	39594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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749	NC_006512	GTTAA	2	10	40433	40442	40 %	40 %	20 %	0 %	56459150
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753	NC_006512	ACC	2	6	40661	40666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56459150
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755	NC_006512	ATTC	2	8	40746	40753	25 %	50 %	0 %	25 %	56459150
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758	NC_006512	GA	3	6	40899	40904	50 %	0 %	50 %	0 %	56459150
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760	NC_006512	TCT	2	6	41254	41259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56459151
761	NC_006512	AAC	2	6	41269	41274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56459151
762	NC_006512	CACC	2	8	41294	41301	25 %	0 %	0 %	75 %	56459151
763	NC_006512	TTC	2	6	41337	41342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56459151
764	NC_006512	GCA	2	6	41440	41445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56459151
765	NC_006512	GCC	2	6	41499	41504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56459151
766	NC_006512	AATA	2	8	41508	41515	75 %	25 %	0 %	0 %	56459151
767	NC_006512	GTT	2	6	41517	41522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56459151
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772	NC_006512	CAG	2	6	41751	41756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56459151
773	NC_006512	GGC	2	6	41785	41790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56459151
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776	NC_006512	GGC	2	6	42017	42022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56459151
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793	NC_006512	GTT	2	6	43190	43195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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