MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori SouthAfrica20

Total Repeats: 254

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022130	GA	9	18	7127	7144	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022130	AG	3	6	13495	13500	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022130	CA	3	6	16525	16530	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_022130	AG	3	6	23349	23354	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022130	AG	3	6	23416	23421	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022130	AG	3	6	25769	25774	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022130	AG	3	6	40477	40482	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022130	TC	3	6	62073	62078	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_022130	AG	3	6	62590	62595	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022130	AG	3	6	62729	62734	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022130	AT	3	6	73106	73111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022130	AT	3	6	83112	83117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_022130	TA	4	8	83139	83146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_022130	AT	3	6	83180	83185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022130	TC	3	6	85101	85106	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_022130	TG	3	6	85142	85147	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_022130	AG	3	6	89468	89473	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_022130	TA	3	6	95888	95893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_022130	TC	3	6	96800	96805	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_022130	AG	3	6	98083	98088	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_022130	AT	3	6	100584	100589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022130	TC	3	6	100718	100723	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_022130	GT	3	6	108536	108541	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022130	TA	3	6	119457	119462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022130	GA	3	6	134677	134682	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_022130	TC	3	6	134862	134867	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_022130	TG	3	6	157990	157995	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022130	AG	3	6	167528	167533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022130	AT	3	6	167539	167544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022130	GA	3	6	167792	167797	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022130	AG	3	6	172264	172269	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022130	TA	3	6	172290	172295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_022130	TC	3	6	172676	172681	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_022130	TC	3	6	173266	173271	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_022130	GA	3	6	185593	185598	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022130	TC	3	6	190585	190590	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_022130	CA	3	6	190952	190957	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_022130	AG	3	6	191220	191225	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022130	TA	3	6	191327	191332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022130	CA	3	6	191595	191600	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_022130	TA	4	8	205293	205300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_022130	TA	3	6	205330	205335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022130	TA	4	8	205649	205656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022130	AT	3	6	206140	206145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022130	GT	3	6	216697	216702	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022130	TG	3	6	228850	228855	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022130	CT	3	6	232027	232032	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_022130	GT	3	6	236947	236952	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022130	TC	3	6	243088	243093	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_022130	AG	3	6	307461	307466	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022130	TC	3	6	311244	311249	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_022130	AC	3	6	321134	321139	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_022130	AG	3	6	329920	329925	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022130	AG	3	6	336903	336908	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022130	AG	3	6	345788	345793	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022130	AG	3	6	350936	350941	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022130	CA	3	6	360089	360094	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_022130	AG	3	6	360432	360437	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022130	AG	3	6	363127	363132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022130	TC	3	6	375306	375311	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_022130	TA	3	6	379863	379868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022130	TA	4	8	382595	382602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_022130	AG	3	6	384365	384370	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_022130	GA	4	8	394346	394353	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022130	GT	3	6	416653	416658	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_022130	AG	3	6	431491	431496	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_022130	TG	3	6	432435	432440	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_022130	TA	3	6	445389	445394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_022130	GC	3	6	445479	445484	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_022130	AG	3	6	445517	445522	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_022130	CT	3	6	463245	463250	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_022130	AC	3	6	465660	465665	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_022130	GC	3	6	471658	471663	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_022130	AG	3	6	479473	479478	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022130	TG	3	6	479776	479781	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022130	CA	3	6	486295	486300	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_022130	AG	3	6	496853	496858	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022130	CT	3	6	505466	505471	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_022130	CT	3	6	505517	505522	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_022130	GA	3	6	506025	506030	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_022130	AC	3	6	506035	506040	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_022130	TA	3	6	506535	506540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022130	CT	3	6	507233	507238	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_022130	CA	3	6	509110	509115	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_022130	TA	3	6	529727	529732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_022130	AC	3	6	533461	533466	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_022130	TA	3	6	534268	534273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022130	GA	3	6	534336	534341	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022130	TA	3	6	542597	542602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_022130	TC	3	6	559536	559541	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_022130	GT	3	6	585462	585467	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_022130	AG	3	6	588469	588474	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022130	AT	3	6	588573	588578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022130	TG	3	6	588606	588611	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022130	TA	3	6	616559	616564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_022130	CT	3	6	617251	617256	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_022130	CT	7	14	617259	617272	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_022130	CT	3	6	630938	630943	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_022130	TC	3	6	645639	645644	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_022130	TA	3	6	661307	661312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022130	TG	3	6	661329	661334	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_022130	CG	3	6	665902	665907	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_022130	TG	3	6	681880	681885	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022130	AG	3	6	693964	693969	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022130	CA	3	6	694151	694156	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_022130	TA	3	6	697234	697239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_022130	CA	3	6	701055	701060	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_022130	GT	3	6	703181	703186	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_022130	CG	3	6	710530	710535	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_022130	CA	3	6	716595	716600	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_022130	TA	3	6	718910	718915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022130	TA	3	6	718944	718949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_022130	TA	3	6	718972	718977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_022130	CA	3	6	729207	729212	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_022130	CT	3	6	756059	756064	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_022130	TC	3	6	756122	756127	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_022130	CT	3	6	756647	756652	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_022130	CT	3	6	756675	756680	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_022130	AC	3	6	758182	758187	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_022130	CT	3	6	760006	760011	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_022130	TG	3	6	796019	796024	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022130	AT	3	6	825134	825139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_022130	TA	3	6	831911	831916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_022130	TG	3	6	831980	831985	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022130	AC	3	6	842995	843000	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_022130	CT	3	6	856531	856536	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_022130	CT	3	6	864859	864864	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_022130	TA	3	6	864892	864897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022130	CT	3	6	865361	865366	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_022130	TG	3	6	865421	865426	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_022130	TC	3	6	865429	865434	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_022130	CT	3	6	865640	865645	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_022130	TG	3	6	879363	879368	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022130	AG	3	6	900784	900789	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022130	AT	3	6	906701	906706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022130	AC	3	6	913304	913309	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_022130	CT	3	6	940857	940862	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_022130	CT	3	6	941071	941076	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_022130	CA	3	6	978903	978908	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_022130	CT	3	6	984221	984226	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_022130	GT	3	6	984446	984451	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_022130	CA	3	6	984767	984772	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_022130	AT	3	6	985876	985881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022130	CA	3	6	986116	986121	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_022130	AT	3	6	986328	986333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_022130	CT	3	6	987012	987017	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_022130	CT	3	6	987132	987137	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_022130	TA	4	8	987478	987485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_022130	AG	3	6	989237	989242	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_022130	CT	4	8	989514	989521	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_022130	TA	3	6	989563	989568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_022130	AG	3	6	989912	989917	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_022130	GT	3	6	1002609	1002614	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_022130	AG	3	6	1033607	1033612	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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253	NC_022130	CT	4	8	1618712	1618719	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
254	NC_022130	CG	3	6	1618815	1618820	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.