MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Halorhabdus tiamatea SARL4B plasmid pHTIA complete sequence

Total Repeats: 219

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021913	GT	3	6	3710	3715	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021913	CA	3	6	3791	3796	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_021913	AG	3	6	4137	4142	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021913	AG	3	6	4553	4558	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021913	CA	3	6	5194	5199	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_021913	GA	3	6	6023	6028	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021913	GA	3	6	6895	6900	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021913	TG	3	6	12128	12133	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021913	GA	3	6	12199	12204	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021913	TG	3	6	12278	12283	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021913	AC	3	6	12377	12382	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_021913	CT	3	6	12763	12768	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_021913	CT	3	6	16364	16369	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_021913	TC	3	6	18739	18744	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_021913	GA	3	6	28376	28381	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021913	AG	3	6	29034	29039	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021913	GT	3	6	30287	30292	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021913	TG	3	6	30498	30503	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021913	GA	3	6	31560	31565	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021913	TA	3	6	38983	38988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021913	CG	3	6	41474	41479	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_021913	AC	3	6	42325	42330	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_021913	AC	3	6	42597	42602	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_021913	TG	3	6	43392	43397	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021913	TA	3	6	43399	43404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021913	CT	3	6	43783	43788	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_021913	AG	3	6	44138	44143	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021913	CA	4	8	44261	44268	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_021913	AC	3	6	44752	44757	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_021913	AG	3	6	44773	44778	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021913	AG	3	6	46149	46154	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021913	TA	3	6	46334	46339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021913	CA	3	6	46672	46677	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_021913	TC	3	6	46811	46816	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_021913	CT	3	6	47396	47401	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_021913	AG	3	6	47418	47423	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021913	GA	3	6	47463	47468	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021913	AC	3	6	47496	47501	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_021913	GA	3	6	47586	47591	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021913	GT	4	8	47709	47716	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021913	CT	3	6	47803	47808	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_021913	GT	4	8	47914	47921	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021913	CA	3	6	48040	48045	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_021913	CT	3	6	52080	52085	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_021913	CT	3	6	53232	53237	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_021913	GA	4	8	53244	53251	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021913	AT	3	6	55178	55183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021913	AC	3	6	55987	55992	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_021913	CT	3	6	61332	61337	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_021913	GA	3	6	63445	63450	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021913	CA	3	6	63560	63565	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_021913	TC	3	6	65908	65913	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_021913	AG	3	6	66034	66039	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021913	TC	3	6	70417	70422	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_021913	CT	3	6	70872	70877	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_021913	CG	4	8	71034	71041	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_021913	TC	3	6	72846	72851	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_021913	TC	3	6	73092	73097	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_021913	CA	3	6	73488	73493	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_021913	AC	3	6	73533	73538	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_021913	CT	3	6	75093	75098	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_021913	CG	3	6	79215	79220	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_021913	CG	3	6	79377	79382	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_021913	CG	3	6	82411	82416	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_021913	AG	3	6	82577	82582	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021913	GA	4	8	82982	82989	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021913	GA	3	6	85604	85609	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021913	TC	3	6	91624	91629	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_021913	GT	3	6	92256	92261	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021913	AT	3	6	92380	92385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021913	GT	3	6	92444	92449	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021913	TG	3	6	94105	94110	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021913	GA	3	6	94225	94230	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021913	AG	3	6	94341	94346	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021913	CA	5	10	94432	94441	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_021913	TC	3	6	94559	94564	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_021913	GT	3	6	94649	94654	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021913	GA	3	6	95124	95129	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021913	TC	3	6	99639	99644	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_021913	GT	3	6	99676	99681	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021913	TC	3	6	99746	99751	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_021913	GC	3	6	99896	99901	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_021913	AT	3	6	100282	100287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021913	AG	3	6	100453	100458	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021913	TC	3	6	103392	103397	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_021913	CA	3	6	103599	103604	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_021913	AT	3	6	104184	104189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021913	AC	3	6	104243	104248	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_021913	AC	4	8	113800	113807	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_021913	AG	3	6	114305	114310	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021913	GC	3	6	114366	114371	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_021913	CG	3	6	114944	114949	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_021913	GC	3	6	116868	116873	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_021913	TG	3	6	116959	116964	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021913	CA	3	6	119949	119954	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_021913	CG	3	6	127311	127316	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_021913	CG	3	6	129119	129124	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_021913	TG	3	6	132945	132950	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021913	TA	3	6	136420	136425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021913	AC	3	6	136603	136608	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_021913	TG	3	6	136771	136776	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021913	AC	3	6	137186	137191	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_021913	TC	3	6	137407	137412	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_021913	AC	3	6	137609	137614	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_021913	CG	3	6	137750	137755	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_021913	TA	3	6	138328	138333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021913	AT	3	6	140757	140762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021913	AT	3	6	140842	140847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021913	GT	4	8	142587	142594	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021913	AG	3	6	148439	148444	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021913	TC	3	6	148807	148812	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_021913	CA	3	6	148921	148926	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_021913	CG	3	6	150147	150152	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_021913	GT	3	6	167608	167613	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021913	GC	3	6	171527	171532	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_021913	CG	3	6	172337	172342	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_021913	TC	3	6	175200	175205	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_021913	CA	3	6	175804	175809	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_021913	AG	3	6	179859	179864	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021913	GA	3	6	180434	180439	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021913	GC	3	6	181512	181517	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_021913	AG	3	6	181597	181602	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021913	AC	3	6	182979	182984	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_021913	CT	3	6	189794	189799	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_021913	AG	3	6	190038	190043	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021913	CT	3	6	190370	190375	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_021913	CT	3	6	192042	192047	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_021913	GA	3	6	192493	192498	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021913	AC	3	6	192554	192559	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_021913	GA	3	6	192699	192704	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021913	AC	3	6	192912	192917	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_021913	CA	3	6	193026	193031	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_021913	CA	3	6	193290	193295	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_021913	TC	3	6	193326	193331	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_021913	GC	3	6	194225	194230	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_021913	AG	3	6	195867	195872	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021913	AC	3	6	196309	196314	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_021913	CA	3	6	198553	198558	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_021913	GA	3	6	200861	200866	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021913	TA	3	6	201309	201314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021913	CT	3	6	203979	203984	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_021913	CT	4	8	208438	208445	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_021913	TC	3	6	209009	209014	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_021913	CT	3	6	211120	211125	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_021913	GT	3	6	212154	212159	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021913	TC	3	6	212904	212909	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_021913	GA	3	6	212928	212933	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021913	CT	4	8	214463	214470	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_021913	TC	3	6	214485	214490	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_021913	GA	4	8	216039	216046	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_021913	GA	3	6	219209	219214	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021913	GT	3	6	219841	219846	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_021913	TC	3	6	224639	224644	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_021913	AG	3	6	224798	224803	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
155	NC_021913	AG	3	6	224928	224933	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
156	NC_021913	TC	3	6	225058	225063	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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158	NC_021913	CG	3	6	228210	228215	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.