MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori UM037

Total Repeats: 245

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021217	AAGCC	2	10	1111	1120	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_021217	CAATC	2	10	3282	3291	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3	NC_021217	TTTTC	2	10	11824	11833	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_021217	CAAAT	2	10	35349	35358	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_021217	AAGCC	2	10	39310	39319	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_021217	AAAAT	2	10	42930	42939	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021217	GAATG	2	10	54050	54059	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021217	TTTAA	2	10	60137	60146	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021217	ATTCA	2	10	71523	71532	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_021217	TCATT	2	10	82907	82916	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_021217	ATTTA	2	10	85033	85042	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021217	AAACA	2	10	85055	85064	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_021217	TCATT	2	10	87761	87770	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_021217	AACCA	2	10	106309	106318	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_021217	CTAAC	2	10	120310	120319	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_021217	CAAAA	2	10	121648	121657	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_021217	AAATT	2	10	130991	131000	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021217	CAATC	2	10	140362	140371	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_021217	TAAAA	2	10	145056	145065	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021217	GAGAA	2	10	146157	146166	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021217	TGAGC	2	10	148473	148482	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_021217	GTTTT	2	10	152186	152195	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021217	TGATT	2	10	157031	157040	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021217	TAAAA	2	10	169533	169542	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021217	AAGTT	2	10	169583	169592	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021217	TAATC	2	10	179224	179233	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_021217	TATCT	2	10	181652	181661	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_021217	AACAA	2	10	184815	184824	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_021217	CAAGG	2	10	185048	185057	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_021217	TTTTA	2	10	187872	187881	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021217	AAAAG	2	10	203518	203527	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021217	TGTGG	2	10	247468	247477	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021217	AGTAA	2	10	248208	248217	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021217	AGTGA	2	10	248504	248513	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021217	AGATG	2	10	249980	249989	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021217	TTGAA	2	10	250212	250221	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021217	GATAA	2	10	251227	251236	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021217	TAAAC	2	10	262996	263005	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_021217	AATGA	2	10	275057	275066	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021217	TTTAA	2	10	291026	291035	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021217	TAGAT	2	10	301018	301027	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021217	ACAAA	2	10	301893	301902	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_021217	ATAAA	2	10	307768	307777	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021217	AAACC	2	10	312338	312347	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
45	NC_021217	TCATT	2	10	330854	330863	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_021217	AAAGA	2	10	338624	338633	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021217	TGATT	2	10	365343	365352	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021217	GCTAA	2	10	366495	366504	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_021217	AAATT	2	10	371349	371358	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021217	TATAG	2	10	374602	374611	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021217	TAAAT	2	10	379031	379040	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021217	TGAGC	2	10	398268	398277	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_021217	AGAAA	2	10	401585	401594	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021217	TAACC	2	10	401683	401692	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
55	NC_021217	ATTCC	2	10	420841	420850	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
56	NC_021217	AATAA	2	10	424146	424155	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021217	TTTTG	2	10	441843	441852	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021217	GTTTT	2	10	441854	441863	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021217	TTAAT	2	10	445182	445191	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021217	CTTTT	2	10	450909	450918	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_021217	TTAAA	2	10	510695	510704	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021217	TTAAA	2	10	521335	521344	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021217	AAATC	2	10	525830	525839	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_021217	TTGTT	2	10	526232	526241	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021217	ATACT	2	10	526446	526455	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_021217	ATCTT	2	10	536284	536293	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_021217	CCTTA	2	10	553481	553490	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
68	NC_021217	ATAAG	2	10	557304	557313	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021217	TCGTT	2	10	575141	575150	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_021217	CTTTT	2	10	580469	580478	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_021217	TACAA	2	10	589468	589477	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_021217	ATTAA	2	10	595205	595214	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021217	AATTT	2	10	596630	596639	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021217	TAAAG	2	10	601384	601393	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021217	TTCTT	2	10	610946	610955	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_021217	AAATC	2	10	612416	612425	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_021217	TTTAT	2	10	622699	622708	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021217	TATTT	2	10	645207	645216	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021217	ATAAA	2	10	645410	645419	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021217	TCTTT	2	10	659892	659901	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_021217	TGGTG	2	10	660511	660520	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021217	TTTAA	2	10	675733	675742	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021217	ATTTT	2	10	680431	680440	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021217	TGATT	2	10	684605	684614	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021217	TTCTC	2	10	685892	685901	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
86	NC_021217	TATAA	2	10	688692	688701	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021217	GGCAC	2	10	694032	694041	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
88	NC_021217	GATTT	2	10	700535	700544	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021217	TTTTA	2	10	700569	700578	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021217	TAAAT	2	10	703418	703427	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021217	TAAAA	2	10	710173	710182	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021217	TTTGT	2	10	723164	723173	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021217	TTCTT	2	10	727718	727727	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_021217	AAGTT	2	10	742824	742833	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021217	GTTTT	2	10	769047	769056	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021217	TCAAA	2	10	802655	802664	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_021217	ACAAA	2	10	803275	803284	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_021217	AGCCT	2	10	808870	808879	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_021217	AGTTA	2	10	818203	818212	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021217	TCATT	2	10	827030	827039	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_021217	TTCTC	2	10	829501	829510	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
102	NC_021217	GGATA	2	10	833544	833553	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021217	TATTT	2	10	843835	843844	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021217	ATCAA	2	10	848407	848416	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_021217	TTTTA	2	10	848508	848517	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021217	TTATT	2	10	848604	848613	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021217	TCATT	2	10	863300	863309	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_021217	ATTTT	2	10	870778	870787	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021217	ATTTT	3	15	870810	870824	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021217	AACAA	2	10	876189	876198	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_021217	TAAAA	2	10	894321	894330	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021217	CACTA	2	10	895827	895836	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
113	NC_021217	TTATT	2	10	917499	917508	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021217	TTTTA	2	10	935676	935685	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021217	AAAAC	2	10	951249	951258	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_021217	CCCCA	2	10	951827	951836	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
117	NC_021217	TCATT	2	10	952183	952192	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_021217	TCATC	2	10	962395	962404	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
119	NC_021217	ACACG	2	10	962675	962684	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
120	NC_021217	AAATC	2	10	966408	966417	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_021217	AACTT	2	10	971230	971239	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_021217	AAAAT	2	10	980495	980504	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021217	AAATC	2	10	980533	980542	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_021217	AAAAC	2	10	1023272	1023281	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_021217	ATGAA	2	10	1063576	1063585	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021217	CCAAA	2	10	1064197	1064206	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
127	NC_021217	CACTT	2	10	1064790	1064799	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
128	NC_021217	TTTTC	2	10	1065551	1065560	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_021217	GATTT	2	10	1067317	1067326	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021217	CAACA	2	10	1068225	1068234	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
131	NC_021217	CACGA	2	10	1068991	1069000	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
132	NC_021217	TTACC	2	10	1069789	1069798	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
133	NC_021217	AAAAT	2	10	1071639	1071648	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021217	GTTCT	2	10	1071653	1071662	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_021217	CCAAT	2	10	1072060	1072069	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
136	NC_021217	TTAAA	2	10	1078573	1078582	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021217	TTTTA	2	10	1086083	1086092	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021217	TAAAA	2	10	1087488	1087497	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021217	TAAAA	2	10	1089545	1089554	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021217	TTTAA	2	10	1095320	1095329	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021217	AAAGA	2	10	1101850	1101859	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021217	GTCAA	2	10	1102732	1102741	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_021217	TTAAT	2	10	1104320	1104329	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021217	TATTT	2	10	1104356	1104365	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021217	AAATC	2	10	1110794	1110803	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_021217	TTAAT	2	10	1117162	1117171	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021217	CAATC	2	10	1119645	1119654	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
148	NC_021217	ACTTT	2	10	1123505	1123514	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_021217	TTGGT	2	10	1123995	1124004	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021217	TACAA	2	10	1124027	1124036	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
151	NC_021217	AATCC	2	10	1138272	1138281	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
152	NC_021217	CTAGA	2	10	1138824	1138833	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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157	NC_021217	ACAAA	2	10	1168457	1168466	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
158	NC_021217	CTACC	2	10	1173648	1173657	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
159	NC_021217	TAAAA	2	10	1174732	1174741	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_021217	ATTGA	2	10	1216799	1216808	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
163	NC_021217	TCACT	2	10	1218100	1218109	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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169	NC_021217	CATTT	2	10	1292761	1292770	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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171	NC_021217	CTAAA	2	10	1298829	1298838	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
172	NC_021217	TTATG	2	10	1311797	1311806	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_021217	CTCAT	2	10	1314317	1314326	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
179	NC_021217	TCACT	2	10	1315795	1315804	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
180	NC_021217	TACTT	2	10	1316092	1316101	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
181	NC_021217	TGCTA	2	10	1318682	1318691	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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183	NC_021217	TCAAA	2	10	1321204	1321213	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
184	NC_021217	CATGA	2	10	1321604	1321613	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
185	NC_021217	TCTTT	2	10	1337437	1337446	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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192	NC_021217	ATCTC	2	10	1364778	1364787	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
193	NC_021217	TAAAA	2	10	1369858	1369867	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_021217	CAAGC	2	10	1371393	1371402	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
195	NC_021217	TAAAC	2	10	1389139	1389148	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
196	NC_021217	TAAAA	2	10	1409169	1409178	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NC_021217	ATAGA	2	10	1412506	1412515	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
198	NC_021217	ATTTT	2	10	1431901	1431910	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_021217	TAATA	2	10	1437962	1437971	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
200	NC_021217	TTAGA	2	10	1451115	1451124	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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240	NC_021217	ATTTA	2	10	1679854	1679863	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
241	NC_021217	CAATC	2	10	1689230	1689239	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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244	NC_021217	TTTGA	2	10	1691631	1691640	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.