MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori UM032

Total Repeats: 171

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021215	AGATGA	2	12	2999	3010	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021215	TTTTCT	2	12	5973	5984	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_021215	AAAGAG	2	12	6521	6532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021215	AGTGGA	2	12	12334	12345	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021215	AGGGAA	2	12	13222	13233	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021215	TGAGCG	2	12	14578	14589	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_021215	ACGATA	2	12	14869	14880	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_021215	GGGCTT	2	12	24013	24024	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_021215	GCGTGG	2	12	24200	24211	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_021215	TAATGA	2	12	38554	38565	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021215	AAAAAG	2	12	50929	50940	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021215	GAAACC	2	12	53561	53572	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021215	AAACAC	2	12	64357	64368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021215	ACCTTA	2	12	83380	83391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_021215	GGCACA	2	12	102063	102074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_021215	TGAGCA	2	12	104184	104195	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_021215	GAAAAT	2	12	104852	104863	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021215	AGAAAA	2	12	119718	119729	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021215	TATTTT	2	12	137657	137668	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021215	AATATT	2	12	141660	141671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021215	CTAAAA	2	12	158650	158661	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_021215	ATTTTT	2	12	182077	182088	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021215	AATTAA	2	12	189617	189628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021215	CACCGC	2	12	190152	190163	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_021215	ATTTTT	2	12	195726	195737	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021215	TAAAAA	2	12	235481	235492	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021215	AATTTC	2	12	239610	239621	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_021215	GCATTT	2	12	252278	252289	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_021215	ATTCTT	2	12	253336	253347	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_021215	ACTCAA	2	12	272266	272277	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_021215	TATAAT	2	12	279096	279107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021215	CAAAAC	2	12	291608	291619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_021215	ATTAAA	2	12	293113	293124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021215	ATTTTA	2	12	316225	316236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021215	TCCCGC	2	12	320111	320122	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_021215	TCCCGC	2	12	320925	320936	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_021215	AGCGAG	2	12	357478	357489	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_021215	ATTTCA	2	12	371187	371198	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_021215	TGGCTA	2	12	407527	407538	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_021215	AAGAGC	2	12	414938	414949	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_021215	AGGCGA	2	12	416387	416398	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_021215	GATGTG	2	12	418379	418390	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021215	CATGAT	2	12	419726	419737	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_021215	CTAATG	2	12	421572	421583	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_021215	TTGGCT	2	12	422109	422120	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_021215	ATAGCG	2	12	448261	448272	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_021215	GTTTAG	2	12	460564	460575	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021215	TTGAAT	2	12	460667	460678	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021215	GCGTTT	2	12	466228	466239	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_021215	AGCAAG	2	12	467672	467683	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_021215	GATTGA	2	12	472883	472894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021215	TTAGAT	2	12	486815	486826	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021215	TTTGGA	2	12	498124	498135	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021215	AAAATA	2	12	499703	499714	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021215	TAAAAA	2	12	513302	513313	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021215	ATAAGG	2	12	520255	520266	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021215	AAAATC	2	12	520940	520951	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_021215	TATTAG	2	12	522651	522662	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021215	ATAAAA	2	12	524246	524257	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021215	ATTTTT	2	12	524709	524720	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021215	AACAGC	2	12	529085	529096	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_021215	TAATTC	2	12	536555	536566	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_021215	TATTTT	2	12	538252	538263	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021215	GAAAAA	2	12	549273	549284	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021215	AGAAAA	2	12	554989	555000	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021215	AGTTTT	2	12	576941	576952	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021215	TTTTTC	2	12	577106	577117	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_021215	TTTATG	2	12	583182	583193	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021215	ACAGGC	2	12	608565	608576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_021215	GCACAA	2	12	609953	609964	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_021215	TTAGCC	2	12	625744	625755	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_021215	TTTTTC	2	12	633069	633080	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_021215	GGCAGT	2	12	645728	645739	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_021215	CTCCCA	2	12	670641	670652	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_021215	CAAGCT	2	12	693088	693099	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_021215	AAACCA	2	12	712224	712235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_021215	GTTTGG	2	12	725245	725256	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021215	TCAATA	2	12	726230	726241	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_021215	GAGCGG	2	12	726300	726311	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_021215	TATCAC	2	12	727259	727270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_021215	AGCGCA	2	12	736831	736842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_021215	GCACCA	2	12	737300	737311	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
83	NC_021215	CTCATT	2	12	753730	753741	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_021215	TGGTAA	2	12	768632	768643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021215	GCCAAT	2	12	769596	769607	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_021215	TCAAAA	2	12	770041	770052	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_021215	AGAGCA	2	12	776982	776993	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_021215	TTTTGG	2	12	776999	777010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021215	AGCGAT	2	12	792089	792100	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_021215	TGCCAA	2	12	802418	802429	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_021215	TGGAAA	2	12	816954	816965	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021215	TTGGAA	2	12	816995	817006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021215	TCAAAA	2	12	824424	824435	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_021215	GCCCCC	2	12	826472	826483	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
95	NC_021215	TTTGAT	2	12	852647	852658	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021215	TTAAAA	2	12	859740	859751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021215	TATTTT	2	12	882748	882759	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021215	ATGCCC	2	12	890204	890215	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
99	NC_021215	TTTAAA	2	12	892861	892872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021215	ATTTCA	2	12	908592	908603	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_021215	ATTTTT	2	12	915424	915435	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021215	TGATTT	2	12	928318	928329	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021215	TCCAAA	2	12	941487	941498	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_021215	GCCATA	2	12	968558	968569	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_021215	ATTTAT	2	12	969121	969132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021215	ATCAAT	2	12	977224	977235	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_021215	AAAAAG	2	12	979006	979017	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021215	AAAGTG	2	12	1001326	1001337	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021215	TTGACT	2	12	1002353	1002364	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_021215	ATTATA	2	12	1002604	1002615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021215	TCAAGC	2	12	1002957	1002968	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_021215	ATTGAA	2	12	1010013	1010024	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021215	CTTCCA	2	12	1035219	1035230	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_021215	TAAAAT	2	12	1041553	1041564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021215	TATCCT	2	12	1049333	1049344	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_021215	TTAAAA	2	12	1059668	1059679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021215	TATGGG	2	12	1059729	1059740	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021215	CTGAAA	2	12	1070149	1070160	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_021215	CTAAAA	2	12	1086399	1086410	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_021215	AAAGCC	2	12	1105066	1105077	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_021215	TGAGCG	2	12	1134903	1134914	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_021215	ATTAAA	2	12	1138269	1138280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021215	GCCGTT	2	12	1144166	1144177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_021215	CCATGA	2	12	1152843	1152854	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_021215	TAGCGA	2	12	1160926	1160937	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_021215	TCAAAT	2	12	1188938	1188949	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_021215	TAGGGG	2	12	1219563	1219574	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021215	GAGTGG	2	12	1220936	1220947	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021215	ATAAAG	2	12	1225706	1225717	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021215	AGCTTG	2	12	1228458	1228469	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_021215	AGCGCA	2	12	1229594	1229605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_021215	TGAGCC	2	12	1242926	1242937	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_021215	TGCTCC	2	12	1254188	1254199	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
134	NC_021215	CAAACA	2	12	1254476	1254487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_021215	TTGTAT	2	12	1260868	1260879	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021215	ACTTAA	2	12	1278062	1278073	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_021215	TCATTT	2	12	1301634	1301645	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_021215	AAACTT	2	12	1301657	1301668	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_021215	AAAAAG	2	12	1316450	1316461	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021215	CTTAGC	2	12	1325495	1325506	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_021215	AAGGCG	2	12	1329330	1329341	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_021215	TGTTTT	2	12	1329684	1329695	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021215	ATTTTT	2	12	1332826	1332837	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021215	TAAAAA	2	12	1360916	1360927	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021215	AAGAAA	2	12	1391864	1391875	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021215	ATCCTT	2	12	1411769	1411780	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_021215	CAAATT	2	12	1412066	1412077	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
148	NC_021215	ATCCAA	2	12	1413153	1413164	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_021215	ATCCTA	2	12	1422747	1422758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_021215	TCTAAA	2	12	1423253	1423264	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
151	NC_021215	TTGATA	2	12	1423871	1423882	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021215	AGTTTT	2	12	1424368	1424379	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
153	NC_021215	AGCGGG	2	12	1436200	1436211	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
154	NC_021215	GTTTTA	2	12	1446389	1446400	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
155	NC_021215	TAAAAA	2	12	1447214	1447225	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_021215	ATAGGG	2	12	1460544	1460555	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
157	NC_021215	TGTTTA	2	12	1466954	1466965	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
158	NC_021215	TCAAAA	2	12	1501852	1501863	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
159	NC_021215	GATAAT	2	12	1503630	1503641	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
160	NC_021215	AAGCAA	2	12	1504108	1504119	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
161	NC_021215	AATAAG	2	12	1506792	1506803	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
162	NC_021215	CAAAAA	2	12	1507250	1507261	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
163	NC_021215	CATCAA	2	12	1514502	1514513	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_021215	ATTTTA	2	12	1517475	1517486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_021215	TTGATT	2	12	1547004	1547015	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
166	NC_021215	AAACCC	2	12	1547205	1547216	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
167	NC_021215	CAAAAT	2	12	1547386	1547397	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
168	NC_021215	TTTTTC	2	12	1547594	1547605	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
169	NC_021215	TAAGCC	2	12	1572033	1572044	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
170	NC_021215	TTGCTA	2	12	1589780	1589791	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
171	NC_021215	AGATGA	2	12	1596782	1596793	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.