MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Hyphomicrobium denitrificans 1NES1

Total Repeats: 1217

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021172	GGCC	2	8	1703	1710	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_021172	CCCA	2	8	9392	9399	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3	NC_021172	GACC	2	8	12866	12873	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4	NC_021172	GCAG	2	8	24489	24496	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_021172	TGCT	2	8	25113	25120	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_021172	GCCG	2	8	28270	28277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_021172	GCTT	2	8	30436	30443	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_021172	GCCG	2	8	30989	30996	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_021172	CAAG	2	8	41494	41501	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_021172	ATCA	2	8	51654	51661	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_021172	AGCA	2	8	54972	54979	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_021172	CCGT	2	8	57835	57842	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_021172	GCCG	2	8	63814	63821	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_021172	GCCG	2	8	63869	63876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_021172	CCTG	2	8	70685	70692	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_021172	TGGC	2	8	76815	76822	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_021172	TCAT	2	8	79270	79277	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_021172	ACAG	2	8	81491	81498	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_021172	GGCT	2	8	84545	84552	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_021172	GACA	2	8	87364	87371	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_021172	TCAA	2	8	87754	87761	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_021172	GACG	2	8	87842	87849	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_021172	GCGG	2	8	88135	88142	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
24	NC_021172	GGGA	2	8	91433	91440	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021172	CGAA	2	8	97377	97384	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_021172	ATAA	2	8	98404	98411	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021172	CGGG	2	8	98659	98666	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
28	NC_021172	AGCC	2	8	100360	100367	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_021172	AAGC	2	8	100613	100620	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_021172	TTTG	2	8	100646	100653	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021172	AGGT	2	8	107072	107079	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021172	AATA	2	8	107171	107178	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021172	TTCA	2	8	109712	109719	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_021172	TGCC	2	8	109736	109743	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_021172	GCGA	2	8	110509	110516	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_021172	GTTG	2	8	110613	110620	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021172	GAAA	2	8	110699	110706	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021172	GGTC	2	8	113990	113997	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_021172	ACGT	2	8	115357	115364	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_021172	GAAA	2	8	117069	117076	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021172	TGGC	2	8	119109	119116	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_021172	CGGC	2	8	119140	119147	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_021172	CGTG	2	8	130550	130557	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_021172	AGAA	2	8	133273	133280	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021172	CCGA	2	8	134603	134610	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
46	NC_021172	TCAG	2	8	136765	136772	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_021172	CAGG	2	8	136855	136862	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_021172	TGGC	2	8	137843	137850	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_021172	GGAG	2	8	140612	140619	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021172	GAAT	2	8	141011	141018	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021172	AGGC	2	8	141601	141608	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_021172	CTGA	2	8	141724	141731	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_021172	GCGA	2	8	142607	142614	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_021172	AGCT	2	8	144840	144847	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_021172	TCGA	2	8	146826	146833	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_021172	TCAT	2	8	148129	148136	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_021172	AAAT	2	8	148168	148175	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021172	AGGA	2	8	148188	148195	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021172	GGCC	2	8	149185	149192	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_021172	GACA	2	8	152099	152106	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_021172	GGGC	2	8	153933	153940	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
62	NC_021172	GGAA	2	8	155287	155294	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021172	TGGC	2	8	156433	156440	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_021172	ATTA	2	8	158833	158840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021172	AGTC	2	8	162845	162852	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_021172	ACTG	2	8	166088	166095	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_021172	AGGG	2	8	177798	177805	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021172	TTAT	2	8	180257	180264	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021172	CCCG	2	8	185347	185354	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
70	NC_021172	GGCA	2	8	185411	185418	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_021172	ACTC	2	8	193648	193655	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_021172	GTGC	2	8	197124	197131	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_021172	GAGC	2	8	197137	197144	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_021172	GAGG	2	8	199349	199356	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021172	GCGG	2	8	207654	207661	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
76	NC_021172	GCGG	2	8	217772	217779	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
77	NC_021172	TTTG	2	8	218482	218489	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021172	CTTT	2	8	221745	221752	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_021172	CAGA	2	8	222824	222831	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_021172	TGCC	2	8	224553	224560	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_021172	GCCG	2	8	224955	224962	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_021172	GGAC	2	8	224966	224973	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_021172	CCGT	2	8	248665	248672	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_021172	GACC	2	8	264752	264759	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_021172	AGCC	2	8	265162	265169	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_021172	ACGG	2	8	272508	272515	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_021172	GGCC	2	8	278197	278204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_021172	GCCG	2	8	282849	282856	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_021172	CCTT	2	8	287819	287826	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_021172	GGCG	2	8	290341	290348	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
91	NC_021172	AGTC	2	8	291796	291803	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_021172	CTAA	2	8	295932	295939	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_021172	TTTC	2	8	297803	297810	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_021172	TGAT	2	8	299313	299320	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021172	CCGG	2	8	309904	309911	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_021172	TATT	2	8	310830	310837	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021172	GGTC	2	8	313025	313032	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_021172	CATT	2	8	319267	319274	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_021172	GTCG	2	8	324935	324942	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_021172	ATGA	2	8	325040	325047	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021172	TTCA	2	8	325062	325069	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_021172	CGGA	2	8	325586	325593	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
103	NC_021172	CGAT	2	8	325665	325672	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_021172	AGGA	2	8	328838	328845	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021172	CCAA	2	8	338206	338213	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_021172	TGTT	2	8	339102	339109	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021172	CTTT	2	8	349136	349143	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_021172	GACA	2	8	350829	350836	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_021172	GCCG	2	8	350889	350896	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_021172	CGTC	2	8	351261	351268	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
111	NC_021172	GCGG	2	8	352928	352935	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
112	NC_021172	AATA	2	8	353244	353251	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021172	ACGG	2	8	353728	353735	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_021172	GGGC	2	8	360780	360787	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
115	NC_021172	GAAC	2	8	361656	361663	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_021172	GAAG	2	8	362239	362246	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021172	GATG	2	8	362247	362254	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021172	GCCG	2	8	373965	373972	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_021172	TCGC	2	8	374209	374216	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_021172	CGGA	2	8	374568	374575	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_021172	GAGC	2	8	376327	376334	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_021172	GCTC	2	8	376350	376357	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_021172	AATT	2	8	387936	387943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021172	GCTG	2	8	393277	393284	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_021172	GCTT	2	8	395597	395604	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_021172	GATA	2	8	397656	397663	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021172	GCCG	2	8	397897	397904	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_021172	TTCT	2	8	416516	416523	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_021172	ATTT	2	8	416622	416629	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021172	CGGG	2	8	419560	419567	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
131	NC_021172	CCGG	2	8	419791	419798	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_021172	CTCC	2	8	419879	419886	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
133	NC_021172	TGCG	2	8	438633	438640	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_021172	AACT	2	8	443253	443260	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_021172	TATT	2	8	443376	443383	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021172	ATGT	2	8	445739	445746	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021172	CGAG	2	8	448296	448303	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_021172	CTAA	2	8	451852	451859	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_021172	GATC	2	8	453741	453748	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_021172	GCGA	2	8	453872	453879	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_021172	GGCA	2	8	468629	468636	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_021172	TGGC	2	8	475100	475107	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_021172	CGTG	2	8	481573	481580	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_021172	CGTC	2	8	483911	483918	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
145	NC_021172	TAAA	2	8	488377	488384	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021172	TTTA	2	8	488395	488402	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021172	GGCT	2	8	488497	488504	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_021172	TCCC	2	8	494323	494330	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
149	NC_021172	CCGG	2	8	496881	496888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_021172	CGAT	2	8	496921	496928	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_021172	AAGT	2	8	501173	501180	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021172	AGGC	2	8	501846	501853	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
153	NC_021172	TTCC	2	8	506235	506242	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_021172	GCTT	2	8	506286	506293	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
155	NC_021172	GAGC	2	8	507263	507270	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
156	NC_021172	GCTT	2	8	520438	520445	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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162	NC_021172	TCAT	2	8	549093	549100	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
163	NC_021172	TGGA	2	8	555888	555895	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_021172	CATG	2	8	626229	626236	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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176	NC_021172	CCCG	2	8	630646	630653	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
177	NC_021172	ACGC	2	8	641298	641305	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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192	NC_021172	GGTA	2	8	688728	688735	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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490	NC_021172	GTTG	2	8	1634090	1634097	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
491	NC_021172	TCGC	2	8	1634112	1634119	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
492	NC_021172	AGCG	2	8	1634943	1634950	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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494	NC_021172	CCGG	2	8	1648342	1648349	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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500	NC_021172	CCGC	2	8	1674987	1674994	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding

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