MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Hyphomicrobium denitrificans 1NES1

Total Repeats: 8572

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_021172	AAAG	2	8	3795447	3795454	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8502	NC_021172	GCA	2	6	3795537	3795542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8503	NC_021172	AAG	2	6	3795639	3795644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8504	NC_021172	TCC	2	6	3795658	3795663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8505	NC_021172	GT	3	6	3795776	3795781	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8506	NC_021172	GCA	2	6	3795789	3795794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8507	NC_021172	GTT	2	6	3795796	3795801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8508	NC_021172	ACG	3	9	3796053	3796061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8509	NC_021172	AGAGG	2	10	3796098	3796107	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
8510	NC_021172	CGG	2	6	3796137	3796142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8511	NC_021172	CA	3	6	3796235	3796240	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8512	NC_021172	GGT	2	6	3796355	3796360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8513	NC_021172	ACC	2	6	3796409	3796414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8514	NC_021172	ATCCGG	2	12	3796448	3796459	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8515	NC_021172	TGG	2	6	3796469	3796474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8516	NC_021172	CCT	2	6	3796496	3796501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8517	NC_021172	GGT	2	6	3796632	3796637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8518	NC_021172	TGA	2	6	3796693	3796698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8519	NC_021172	CGT	2	6	3796722	3796727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8520	NC_021172	TCA	2	6	3796747	3796752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8521	NC_021172	TGG	2	6	3796920	3796925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8522	NC_021172	TGT	2	6	3796929	3796934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8523	NC_021172	CAG	2	6	3796948	3796953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8524	NC_021172	ACC	2	6	3797042	3797047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8525	NC_021172	TAA	2	6	3797100	3797105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8526	NC_021172	TTGT	2	8	3797147	3797154	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8527	NC_021172	CCG	2	6	3797268	3797273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8528	NC_021172	ATCG	2	8	3797437	3797444	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8529	NC_021172	CGC	2	6	3797455	3797460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8530	NC_021172	GT	3	6	3797527	3797532	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8531	NC_021172	AGC	2	6	3797545	3797550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8532	NC_021172	CT	3	6	3798622	3798627	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8533	NC_021172	GA	3	6	3798650	3798655	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8534	NC_021172	GCG	2	6	3798692	3798697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8535	NC_021172	GGT	2	6	3798708	3798713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8536	NC_021172	ATT	2	6	3798736	3798741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8537	NC_021172	GC	3	6	3798751	3798756	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8538	NC_021172	GCG	2	6	3798780	3798785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8539	NC_021172	TAA	2	6	3798815	3798820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8540	NC_021172	CAG	2	6	3799362	3799367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8541	NC_021172	ACG	2	6	3799449	3799454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8542	NC_021172	TTG	2	6	3799493	3799498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8543	NC_021172	CTTT	2	8	3801316	3801323	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8544	NC_021172	CG	3	6	3801354	3801359	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8545	NC_021172	CGC	2	6	3801362	3801367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8546	NC_021172	GTC	2	6	3801471	3801476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8547	NC_021172	GTC	2	6	3803435	3803440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8548	NC_021172	AG	3	6	3803454	3803459	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8549	NC_021172	CGC	2	6	3803500	3803505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8550	NC_021172	ACA	2	6	3803566	3803571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8551	NC_021172	CGG	2	6	3803592	3803597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8552	NC_021172	TCC	2	6	3803932	3803937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8553	NC_021172	GAA	2	6	3803942	3803947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8554	NC_021172	A	6	6	3803946	3803951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8555	NC_021172	TTC	3	9	3803952	3803960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8556	NC_021172	GTG	2	6	3804015	3804020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8557	NC_021172	TC	3	6	3804870	3804875	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8558	NC_021172	C	6	6	3807040	3807045	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8559	NC_021172	CCG	2	6	3807122	3807127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8560	NC_021172	AGCG	2	8	3807172	3807179	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8561	NC_021172	CGG	2	6	3807191	3807196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8562	NC_021172	GGC	2	6	3807293	3807298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8563	NC_021172	CAG	2	6	3807315	3807320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8564	NC_021172	GTT	2	6	3807680	3807685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8565	NC_021172	T	6	6	3807684	3807689	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8566	NC_021172	GAG	2	6	3807741	3807746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8567	NC_021172	T	7	7	3807864	3807870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8568	NC_021172	GCC	2	6	3807928	3807933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8569	NC_021172	GTTA	2	8	3807983	3807990	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8570	NC_021172	GCGT	2	8	3808042	3808049	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8571	NC_021172	ATAA	2	8	3808098	3808105	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8572	NC_021172	CTG	3	9	3808130	3808138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.