MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Hydrogenobaculum sp. SN

Total Repeats: 148

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020814	CGCCT	2	10	52154	52163	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
2	NC_020814	TTTTA	2	10	54153	54162	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020814	TAAAA	2	10	58646	58655	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020814	ATAAA	2	10	62829	62838	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020814	TATAA	2	10	73552	73561	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020814	TATTT	2	10	81804	81813	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020814	ACAAA	2	10	86516	86525	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_020814	GATAA	2	10	87693	87702	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020814	TATCA	2	10	92773	92782	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_020814	TGATT	2	10	97458	97467	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020814	AACTT	2	10	111670	111679	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_020814	TTATA	2	10	115794	115803	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020814	TATTT	2	10	120253	120262	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020814	TTTAT	2	10	127967	127976	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020814	AAAAT	2	10	128035	128044	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020814	CAAAA	4	20	128816	128835	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_020814	ATATA	2	10	130451	130460	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020814	ACTAA	2	10	138472	138481	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_020814	ATAAA	2	10	199750	199759	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020814	ATATA	2	10	219457	219466	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020814	GTTTT	2	10	219723	219732	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020814	ATATA	2	10	255303	255312	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020814	ATTAT	2	10	262805	262814	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020814	TTTTC	2	10	270091	270100	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_020814	TGGAA	2	10	274046	274055	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020814	TAGCA	2	10	277959	277968	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_020814	TAATA	2	10	278571	278580	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020814	TAAAA	2	10	299124	299133	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020814	TTTCT	2	10	336156	336165	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_020814	AAATC	2	10	338638	338647	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_020814	TGTTT	2	10	340548	340557	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020814	ATATA	2	10	340957	340966	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020814	TATCC	2	10	347513	347522	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
34	NC_020814	AATCA	2	10	363962	363971	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_020814	ACACA	2	10	364129	364138	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_020814	TTATA	2	10	393644	393653	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020814	TTAAA	2	10	394345	394354	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020814	AAAGA	2	10	411646	411655	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020814	GCTTG	2	10	411679	411688	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_020814	GAGAT	2	10	411842	411851	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020814	AATAT	2	10	430706	430715	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020814	TATAA	2	10	435457	435466	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020814	TTTTA	2	10	454211	454220	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020814	TAAAA	2	10	460443	460452	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020814	ATAAA	2	10	460468	460477	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020814	TTTTA	2	10	461868	461877	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020814	TAAAA	2	10	486125	486134	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020814	AAACC	2	10	490171	490180	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
49	NC_020814	TATAA	2	10	514003	514012	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020814	ATAAA	2	10	541455	541464	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020814	ATTTT	2	10	565956	565965	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020814	ATAGT	2	10	577848	577857	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020814	AAATT	2	10	591801	591810	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020814	ATTAT	2	10	620181	620190	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020814	TCTTA	2	10	623215	623224	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_020814	GATAT	2	10	626052	626061	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020814	TTTGC	2	10	631817	631826	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_020814	AAAAT	2	10	631881	631890	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020814	AGGGG	2	10	634128	634137	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020814	GGGAT	2	10	637363	637372	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020814	TAATA	2	10	663309	663318	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020814	ATCTT	2	10	672741	672750	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_020814	TTTTA	2	10	672834	672843	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020814	CAAAA	2	10	701766	701775	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_020814	ATTAA	2	10	730619	730628	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020814	ATTTT	2	10	730699	730708	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020814	ATAAA	2	10	742853	742862	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020814	TATAA	2	10	748699	748708	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020814	ATGAT	2	10	752656	752665	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020814	TTTAT	2	10	765442	765451	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020814	TTTCC	2	10	775191	775200	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
72	NC_020814	CTGAC	2	10	776032	776041	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
73	NC_020814	TTTTA	2	10	801335	801344	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020814	GAAAA	2	10	813475	813484	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020814	ATTTT	2	10	831917	831926	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020814	TATTT	2	10	846978	846987	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020814	TCTTT	2	10	869289	869298	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_020814	GATAT	2	10	869309	869318	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020814	AAAAG	2	10	874502	874511	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020814	AGATA	2	10	886756	886765	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020814	GAGAT	2	10	886950	886959	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020814	TATAA	2	10	916105	916114	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020814	GAAAA	2	10	928615	928624	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020814	TATAT	2	10	941401	941410	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020814	ATATT	2	10	956048	956057	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020814	TATTT	2	10	970717	970726	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020814	ATTAA	2	10	977819	977828	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020814	TAAAT	2	10	989299	989308	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020814	GTTAT	2	10	998100	998109	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020814	TTTAT	2	10	998120	998129	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020814	TAAAG	2	10	1002374	1002383	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020814	ATATT	2	10	1015676	1015685	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020814	ATCTG	2	10	1019435	1019444	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_020814	CCAAA	2	10	1020982	1020991	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_020814	TATAA	2	10	1024624	1024633	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020814	AAAAT	2	10	1024851	1024860	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020814	TAAAA	2	10	1036084	1036093	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020814	TAAAA	2	10	1048965	1048974	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020814	AATAT	2	10	1080542	1080551	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020814	GAAAA	2	10	1081958	1081967	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020814	ATATA	2	10	1088412	1088421	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020814	GAAAA	2	10	1095322	1095331	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020814	GGCAA	2	10	1095814	1095823	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_020814	AAGGA	2	10	1096027	1096036	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020814	TATAT	2	10	1118808	1118817	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020814	TATAT	2	10	1126583	1126592	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020814	TTTAT	2	10	1131382	1131391	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020814	AAAAT	2	10	1146114	1146123	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020814	TAAAA	2	10	1163778	1163787	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020814	ATTTT	2	10	1183801	1183810	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020814	TTTGT	2	10	1187335	1187344	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020814	TTATA	2	10	1192698	1192707	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020814	AAAAT	2	10	1199113	1199122	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020814	TTTAA	2	10	1215517	1215526	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020814	GCTTT	2	10	1231492	1231501	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_020814	TTTCC	2	10	1243446	1243455	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
117	NC_020814	CTGAC	2	10	1244287	1244296	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_020814	AGCAT	2	10	1245687	1245696	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_020814	ATATA	2	10	1245708	1245717	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020814	TTAAA	2	10	1249314	1249323	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020814	TATAT	2	10	1254040	1254049	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020814	TAATA	2	10	1255866	1255875	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020814	CAAAA	2	10	1261788	1261797	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_020814	TAAAA	2	10	1271010	1271019	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020814	TAATA	2	10	1295007	1295016	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020814	AAAAC	2	10	1305126	1305135	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_020814	CATTT	2	10	1305439	1305448	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_020814	AAATA	2	10	1305704	1305713	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020814	AAGAA	2	10	1306028	1306037	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020814	TTTTC	2	10	1317443	1317452	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_020814	TAAAT	2	10	1334651	1334660	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020814	GCAGA	2	10	1353729	1353738	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
133	NC_020814	ATTTT	2	10	1353817	1353826	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020814	TCCTA	2	10	1355033	1355042	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
135	NC_020814	TTTAT	2	10	1370873	1370882	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_020814	TATAA	2	10	1380645	1380654	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020814	CTTAT	2	10	1393261	1393270	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_020814	GTTTT	2	10	1405541	1405550	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020814	CTCAC	2	10	1419904	1419913	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
140	NC_020814	TAAAA	2	10	1419941	1419950	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020814	GAGAT	2	10	1460521	1460530	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020814	CCCTT	2	10	1465027	1465036	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
143	NC_020814	CTTTT	2	10	1475499	1475508	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_020814	ATATC	2	10	1519278	1519287	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_020814	ACTAT	2	10	1519715	1519724	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_020814	ATTAT	2	10	1520425	1520434	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020814	GTATA	2	10	1537391	1537400	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020814	ATATT	2	10	1545791	1545800	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.