MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter cinaedi ATCC BAA-847 DNA

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020555	TCAGAT	2	12	23431	23442	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_020555	AAGATT	2	12	58696	58707	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020555	TTTTGC	2	12	79145	79156	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_020555	GAATCT	2	12	90208	90219	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_020555	CTTTTA	2	12	110774	110785	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_020555	TGGCGT	2	12	147499	147510	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_020555	GTTTAA	2	12	154576	154587	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020555	CTTAAA	2	12	179501	179512	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_020555	GCAATG	2	12	214165	214176	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_020555	TTATTT	2	12	231102	231113	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020555	ATTCTT	2	12	238818	238829	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_020555	CTTTTT	2	12	243255	243266	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_020555	TAAAAT	2	12	243279	243290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020555	GCCCAA	2	12	254917	254928	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
15	NC_020555	TATTTT	2	12	259006	259017	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020555	TCAATG	2	12	283303	283314	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_020555	TTATAA	2	12	283374	283385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020555	GTTTAT	2	12	304474	304485	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020555	CATTGG	2	12	311786	311797	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_020555	CCTTAT	2	12	409204	409215	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_020555	TATAAG	2	12	431811	431822	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020555	TAAACT	2	12	451325	451336	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_020555	TATCTT	2	12	474309	474320	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_020555	GTTTAA	2	12	550430	550441	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020555	AGGATA	2	12	602462	602473	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020555	GCCAAA	2	12	632821	632832	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_020555	ATTTTA	2	12	664553	664564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020555	GAGTAA	2	12	745023	745034	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020555	ATTTAA	2	12	755656	755667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020555	CATAAG	2	12	764124	764135	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_020555	AAAAGC	2	12	793216	793227	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_020555	GAAGCA	2	12	798401	798412	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_020555	TTATTT	2	12	888017	888028	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020555	TCTTAG	2	12	898012	898023	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_020555	CTTATA	2	12	919582	919593	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_020555	AGCATT	2	12	945363	945374	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_020555	TTTTAG	2	12	969761	969772	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020555	TGCCAT	2	12	994503	994514	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_020555	TTTTGA	2	12	1007300	1007311	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020555	CTTTTA	2	12	1041903	1041914	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_020555	CAGATT	2	12	1058371	1058382	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_020555	AAAACA	2	12	1114721	1114732	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_020555	TGAGCG	2	12	1179560	1179571	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_020555	AGCACA	2	12	1227944	1227955	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_020555	GATTTG	2	12	1287045	1287056	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020555	TATTGA	2	12	1322657	1322668	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020555	TTTGTT	2	12	1361821	1361832	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020555	AGTCGT	2	12	1363482	1363493	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_020555	TTTTCT	2	12	1364476	1364487	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_020555	TAAGTA	2	12	1384786	1384797	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020555	GATTAA	2	12	1428376	1428387	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020555	TAAAAA	2	12	1428802	1428813	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020555	AAACAA	2	12	1451874	1451885	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_020555	GATACT	2	12	1456950	1456961	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_020555	AAACAA	2	12	1469524	1469535	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_020555	AAAGAC	2	12	1469587	1469598	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_020555	AAACAA	2	12	1474065	1474076	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_020555	TAAATT	2	12	1484103	1484114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020555	CTTTTT	2	12	1494270	1494281	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_020555	ATAGTG	2	12	1526753	1526764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020555	TATGAA	2	12	1555353	1555364	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020555	AAGCCT	2	12	1578044	1578055	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_020555	CAAAAG	2	12	1579915	1579926	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_020555	TCTGCA	2	12	1584220	1584231	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_020555	TTTTAT	2	12	1617514	1617525	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020555	TCCGTT	2	12	1723289	1723300	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_020555	CAAAAG	2	12	1737368	1737379	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_020555	CACAAA	2	12	1740174	1740185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_020555	GCCAAC	2	12	1756686	1756697	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
70	NC_020555	TGCAAA	2	12	1772427	1772438	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_020555	TAATTT	2	12	1833115	1833126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020555	TAATTT	2	12	1833226	1833237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020555	GTTTTA	2	12	1881271	1881282	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020555	AGATTG	2	12	1898090	1898101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020555	TAAATT	2	12	2017955	2017966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020555	GCACCC	2	12	2044247	2044258	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_020555	AAACTT	2	12	2047348	2047359	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_020555	GCGTGG	2	12	2103226	2103237	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_020555	ATTTTG	2	12	2110498	2110509	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020555	AAAACG	2	12	2140729	2140740	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_020555	TAATCA	2	12	2144431	2144442	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.