MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter cinaedi ATCC BAA-847 DNA

Total Repeats: 245

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020555	TTTAA	2	10	1363	1372	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020555	GTAGT	2	10	1410	1419	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020555	AGCAT	2	10	29278	29287	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_020555	TCAAA	2	10	29433	29442	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_020555	ATTTG	2	10	32660	32669	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020555	TACAA	2	10	34354	34363	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_020555	ATTTG	2	10	55390	55399	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020555	TAAAA	2	10	55426	55435	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020555	CTTGT	2	10	58614	58623	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_020555	TTGCT	2	10	58741	58750	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_020555	TTGGA	2	10	89496	89505	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020555	TGCAA	2	10	98054	98063	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_020555	GCTTT	2	10	119708	119717	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_020555	TAAAA	2	10	139588	139597	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020555	TCTCT	2	10	148419	148428	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_020555	AGTTA	2	10	148695	148704	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020555	AGTCA	2	10	149604	149613	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_020555	TCGTG	2	10	150087	150096	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_020555	TATTG	2	10	151230	151239	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020555	TTCTA	2	10	152674	152683	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_020555	AGATG	2	10	153293	153302	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020555	TTGAA	2	10	153525	153534	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020555	GTTTA	2	10	154977	154986	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020555	GTTTG	2	10	155654	155663	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020555	TTTTA	2	10	155682	155691	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020555	AAAAT	2	10	192728	192737	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020555	TTTAT	2	10	204874	204883	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020555	ACAAA	2	10	208153	208162	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_020555	TCCGC	2	10	214570	214579	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
30	NC_020555	ACAAT	2	10	214943	214952	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_020555	AATTT	2	10	216768	216777	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020555	TTTTG	2	10	220057	220066	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020555	CGTGG	2	10	223487	223496	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
34	NC_020555	AGTGT	2	10	227486	227495	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020555	AGAGT	2	10	235515	235524	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020555	ATATA	2	10	236511	236520	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020555	CAAAA	2	10	236649	236658	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_020555	TGTTT	2	10	238740	238749	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020555	TTTTG	2	10	240011	240020	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020555	TGCAA	2	10	242176	242185	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_020555	TGATT	2	10	243511	243520	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020555	TACAT	2	10	259062	259071	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_020555	GAAAA	2	10	259315	259324	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020555	TAAAA	2	10	265936	265945	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020555	ACAAA	2	10	281491	281500	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_020555	CAAGT	2	10	291449	291458	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_020555	TTTTA	2	10	294829	294838	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020555	TTAAT	2	10	304874	304883	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020555	CTTTC	2	10	329853	329862	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
50	NC_020555	ATTCC	2	10	373915	373924	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
51	NC_020555	GAGAA	2	10	375590	375599	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020555	ATTTT	2	10	398735	398744	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020555	TTTAT	2	10	401625	401634	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020555	GACAA	2	10	452140	452149	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_020555	CTTTC	2	10	472404	472413	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
56	NC_020555	ACACA	2	10	474356	474365	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
57	NC_020555	GAAAA	2	10	488680	488689	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020555	AGTGT	2	10	490341	490350	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020555	GTTGG	2	10	494382	494391	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020555	TTGTG	2	10	506185	506194	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020555	TTTGC	2	10	515195	515204	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_020555	TTTTA	2	10	515211	515220	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020555	TAAAG	2	10	520906	520915	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020555	TGGGG	2	10	544150	544159	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020555	AGTTA	2	10	544599	544608	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020555	AGTCA	2	10	545458	545467	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_020555	TCGTG	2	10	545941	545950	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_020555	TATTG	2	10	547084	547093	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020555	TTCTA	2	10	548528	548537	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_020555	AGATG	2	10	549147	549156	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020555	TTGAA	2	10	549379	549388	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020555	GTTTA	2	10	550831	550840	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020555	TACTT	2	10	599580	599589	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_020555	TTTAT	2	10	616677	616686	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020555	AGGCT	2	10	618444	618453	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_020555	TGATT	2	10	620950	620959	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020555	AGTTT	2	10	632333	632342	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020555	TTTTG	2	10	634898	634907	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020555	CAAAA	2	10	666716	666725	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_020555	TCTCA	2	10	728278	728287	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
81	NC_020555	CTTTG	2	10	757402	757411	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_020555	TAAAA	2	10	762679	762688	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020555	ATTTT	2	10	762777	762786	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020555	TTGTG	2	10	783413	783422	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020555	CCATA	2	10	793078	793087	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
86	NC_020555	GTAGG	2	10	829621	829630	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020555	CTAAG	2	10	836267	836276	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_020555	GTTAA	2	10	843024	843033	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020555	ACCGC	2	10	851423	851432	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
90	NC_020555	TAGGT	2	10	853142	853151	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020555	AGGAA	2	10	861199	861208	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020555	TAGCA	2	10	870436	870445	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_020555	TAGAT	2	10	870762	870771	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020555	CTTTC	2	10	895365	895374	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_020555	TATTT	2	10	900527	900536	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020555	CTGCA	2	10	905804	905813	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
97	NC_020555	ATGCG	2	10	916940	916949	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
98	NC_020555	AATTT	2	10	919907	919916	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020555	AGGCT	2	10	929416	929425	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_020555	ACAAA	2	10	929529	929538	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_020555	AGAAT	2	10	951410	951419	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020555	AAATG	2	10	964599	964608	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020555	ATAAG	2	10	964643	964652	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020555	ATTTT	2	10	977586	977595	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020555	GCCTT	2	10	986579	986588	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_020555	TAAAA	2	10	987504	987513	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020555	ATTTT	2	10	996480	996489	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020555	CCCCT	2	10	1013555	1013564	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
109	NC_020555	AGATT	2	10	1030671	1030680	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020555	ACACA	2	10	1054794	1054803	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
111	NC_020555	ACTTT	2	10	1054863	1054872	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_020555	TAAAA	2	10	1072402	1072411	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020555	CAAAA	2	10	1083410	1083419	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_020555	CTGCC	2	10	1083474	1083483	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
115	NC_020555	GCCAC	2	10	1086715	1086724	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
116	NC_020555	ACCCA	2	10	1086741	1086750	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
117	NC_020555	TCCAT	2	10	1087170	1087179	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
118	NC_020555	CAATT	2	10	1104925	1104934	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_020555	GCAAG	2	10	1104993	1105002	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_020555	TCAAT	2	10	1112168	1112177	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_020555	ATTTG	2	10	1120316	1120325	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020555	TTTAA	2	10	1120331	1120340	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020555	TTTCA	2	10	1134484	1134493	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_020555	TATAA	2	10	1157964	1157973	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020555	AATAC	2	10	1166008	1166017	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_020555	TAACT	2	10	1178278	1178287	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_020555	AATTT	2	10	1179770	1179779	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020555	AAATT	2	10	1190538	1190547	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020555	AAGTT	2	10	1190551	1190560	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020555	AAAAT	2	10	1193114	1193123	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020555	CTAAG	2	10	1214071	1214080	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_020555	CTAGC	2	10	1223819	1223828	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
133	NC_020555	AGCAA	2	10	1227923	1227932	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_020555	CAATG	2	10	1242428	1242437	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_020555	GCCCT	2	10	1247893	1247902	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
136	NC_020555	ACTTT	2	10	1262501	1262510	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_020555	CTTTT	2	10	1262912	1262921	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_020555	TACTC	2	10	1296900	1296909	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
139	NC_020555	CAAAT	2	10	1301094	1301103	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_020555	ACAGA	2	10	1302838	1302847	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
141	NC_020555	TTAAA	2	10	1305958	1305967	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020555	TTTGA	2	10	1317565	1317574	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020555	GAAAT	2	10	1342893	1342902	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020555	CAGCC	2	10	1346596	1346605	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
145	NC_020555	GTTTT	2	10	1347445	1347454	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020555	CTATC	2	10	1361805	1361814	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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192	NC_020555	TGCCT	2	10	1772229	1772238	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.