MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori OK310 DNA

Total Repeats: 195

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020509	TTTGT	2	10	2424	2433	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020509	TAAAA	2	10	4993	5002	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020509	ATAAA	2	10	5011	5020	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020509	GCTTT	2	10	13607	13616	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_020509	AAATT	2	10	30067	30076	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020509	TTAAA	2	10	71621	71630	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020509	ACAAA	2	10	71638	71647	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_020509	CAAAA	2	10	85411	85420	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_020509	TTTTA	2	10	88358	88367	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020509	TTACA	2	10	90243	90252	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_020509	TAAGA	2	10	102336	102345	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020509	TAAAA	2	10	102407	102416	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020509	AATTT	2	10	111504	111513	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020509	CAAAA	2	10	118195	118204	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_020509	TTAAT	2	10	126480	126489	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020509	CAAAT	2	10	166306	166315	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_020509	ATAAA	2	10	173501	173510	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020509	CAAAA	2	10	173580	173589	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_020509	TTTAA	2	10	189918	189927	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020509	ATCGG	2	10	195012	195021	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_020509	ATTCA	2	10	202994	203003	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_020509	AATGA	2	10	205653	205662	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020509	AAACA	2	10	214181	214190	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_020509	AAAAC	2	10	221175	221184	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_020509	TTGGT	2	10	221528	221537	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020509	AAACC	2	10	233452	233461	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_020509	CTTAA	2	10	239962	239971	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_020509	TAAAA	2	10	247476	247485	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020509	CAAAA	2	10	248997	249006	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_020509	AAATT	2	10	258346	258355	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020509	CATTT	2	10	273982	273991	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_020509	AAATA	2	10	286098	286107	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020509	GTTTT	2	10	291711	291720	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020509	TTAAT	2	10	300883	300892	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020509	TTATA	2	10	335027	335036	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020509	AAGTT	2	10	341689	341698	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020509	AATTA	2	10	347516	347525	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020509	TTGTG	2	10	349885	349894	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020509	AAAAC	2	10	370523	370532	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_020509	GTAAA	2	10	386910	386919	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020509	TTGAT	2	10	418191	418200	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020509	TAAAG	2	10	431944	431953	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020509	TTAAT	2	10	433564	433573	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020509	TCTTG	2	10	438396	438405	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_020509	ATAAA	2	10	443767	443776	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020509	AAAAT	2	10	443800	443809	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020509	GTTTT	2	10	451866	451875	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020509	TAACA	2	10	464566	464575	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_020509	TACAA	2	10	464578	464587	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_020509	AATAA	2	10	465955	465964	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020509	TAAAA	2	10	466049	466058	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020509	AAAAT	2	10	470682	470691	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020509	TATCC	2	10	480945	480954	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
54	NC_020509	GGATT	2	10	487361	487370	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020509	AAAAT	2	10	491279	491288	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020509	TTAAA	2	10	495982	495991	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020509	TTTTA	2	10	518923	518932	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020509	TAAAA	2	10	518969	518978	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020509	TTTAA	2	10	527400	527409	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020509	ATTTT	2	10	527479	527488	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020509	AAATA	2	10	527686	527695	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020509	ACAAA	2	10	570309	570318	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_020509	ATAAA	2	10	576186	576195	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020509	TGAGA	2	10	576221	576230	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020509	TAAAA	2	10	585442	585451	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020509	TTAAA	2	10	595102	595111	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020509	TACTA	2	10	637124	637133	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_020509	TAAAT	2	10	638978	638987	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020509	CACAT	2	10	639446	639455	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
70	NC_020509	TTGAT	2	10	644597	644606	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020509	TTTAA	2	10	644752	644761	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020509	GTTCT	2	10	686447	686456	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_020509	TAAAT	3	15	693385	693399	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020509	AAAAC	2	10	696595	696604	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_020509	TTCTA	2	10	707113	707122	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_020509	AATAA	2	10	707166	707175	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020509	GGAAT	2	10	716026	716035	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020509	ATTAA	2	10	722323	722332	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020509	TTAAA	2	10	745996	746005	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020509	AAATC	2	10	750501	750510	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_020509	TTGTT	2	10	750902	750911	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020509	ATACT	2	10	751116	751125	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_020509	AAGCG	2	10	778077	778086	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_020509	CCTTA	2	10	778189	778198	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
85	NC_020509	TCGTT	2	10	799788	799797	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_020509	ACAAG	2	10	808147	808156	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_020509	TACAA	2	10	813857	813866	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_020509	ATTTG	2	10	814070	814079	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020509	ATTAA	2	10	819597	819606	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020509	AAAAC	2	10	835948	835957	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_020509	CAGAT	2	10	838234	838243	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_020509	TTGTT	2	10	840661	840670	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020509	TTAAA	2	10	840769	840778	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020509	TTGAA	2	10	867033	867042	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020509	AGCCT	2	10	872558	872567	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
96	NC_020509	AGTTA	2	10	880840	880849	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020509	CTAAA	2	10	889325	889334	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_020509	TATAA	2	10	891782	891791	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020509	ATTGA	2	10	905338	905347	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020509	TAAAA	2	10	905763	905772	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020509	AAATC	2	10	906026	906035	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_020509	TAAAA	2	10	911926	911935	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020509	ATGAT	2	10	920260	920269	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020509	TCAAG	2	10	943600	943609	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_020509	TTAGT	2	10	987054	987063	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020509	TTCAA	2	10	998885	998894	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_020509	CTCAT	2	10	999115	999124	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
108	NC_020509	TCACT	2	10	1000593	1000602	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
109	NC_020509	TACTT	2	10	1000891	1000900	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_020509	AAAAT	2	10	1027296	1027305	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020509	ATAAA	2	10	1048697	1048706	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020509	TAAAA	2	10	1059697	1059706	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020509	TGAAA	2	10	1073879	1073888	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020509	GTCTT	2	10	1087172	1087181	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_020509	AAATC	2	10	1089279	1089288	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_020509	AAAAC	2	10	1094113	1094122	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_020509	TAAAT	2	10	1094137	1094146	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020509	AAAAC	2	10	1104492	1104501	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_020509	TTCAT	2	10	1104772	1104781	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_020509	GATTT	2	10	1123385	1123394	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020509	AATTT	2	10	1123421	1123430	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020509	AAACA	2	10	1123864	1123873	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_020509	AAAAC	2	10	1124013	1124022	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_020509	CACGA	2	10	1124743	1124752	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
125	NC_020509	TTACC	2	10	1125541	1125550	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
126	NC_020509	TTAAA	2	10	1134029	1134038	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020509	AAAAG	2	10	1135620	1135629	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020509	TTAAT	2	10	1160882	1160891	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020509	TATTT	2	10	1160918	1160927	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020509	AAATC	2	10	1166715	1166724	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_020509	TTCTA	2	10	1171657	1171666	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_020509	CAATC	2	10	1175509	1175518	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
133	NC_020509	ACTTT	2	10	1179368	1179377	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_020509	AATCC	2	10	1192599	1192608	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
135	NC_020509	CTAGA	2	10	1193151	1193160	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_020509	CCTCC	2	10	1195408	1195417	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
137	NC_020509	TAATA	2	10	1197509	1197518	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020509	ATAGT	2	10	1201079	1201088	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020509	ATTTA	2	10	1203363	1203372	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020509	CAACA	2	10	1203537	1203546	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
141	NC_020509	TCAAA	2	10	1203576	1203585	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_020509	ATTAG	2	10	1204617	1204626	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_020509	ATGAG	2	10	1223795	1223804	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020509	AACAA	2	10	1223824	1223833	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_020509	TTAAA	2	10	1236571	1236580	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020509	TAAGC	2	10	1268363	1268372	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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192	NC_020509	TAAAA	2	10	1589771	1589780	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.