MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori OK113 DNA

Total Repeats: 3531

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020508	TTTGT	2	10	2424	2433	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020508	TTC	2	6	2460	2465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_020508	GGT	2	6	4086	4091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020508	TAT	2	6	4134	4139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020508	TAT	2	6	4143	4148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020508	TGG	2	6	4187	4192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020508	ATGC	2	8	4284	4291	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_020508	TGG	2	6	4300	4305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020508	GTG	2	6	4416	4421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020508	ACC	2	6	4448	4453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_020508	GGT	2	6	4461	4466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020508	T	7	7	4600	4606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020508	AAT	2	6	4621	4626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020508	A	6	6	4695	4700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020508	GTT	2	6	4752	4757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020508	A	6	6	4782	4787	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020508	ATT	2	6	4816	4821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020508	T	6	6	4834	4839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020508	A	6	6	4844	4849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020508	A	6	6	4860	4865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020508	TGT	2	6	4899	4904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020508	TTTTA	2	10	4923	4932	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020508	TC	3	6	4968	4973	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_020508	A	6	6	5002	5007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020508	T	7	7	5012	5018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020508	ACTA	2	8	5054	5061	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_020508	A	6	6	5066	5071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020508	AGT	2	6	5135	5140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020508	AAAAAG	2	12	5151	5162	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020508	C	6	6	5169	5174	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
31	NC_020508	A	7	7	5188	5194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020508	A	6	6	5205	5210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020508	A	6	6	7277	7282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020508	GA	8	16	7316	7331	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020508	T	7	7	7341	7347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020508	T	6	6	7353	7358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020508	TGT	2	6	7470	7475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020508	A	9	9	7479	7487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020508	T	6	6	7490	7495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020508	T	7	7	7513	7519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020508	GTCTT	2	10	7544	7553	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_020508	TAT	2	6	7556	7561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020508	TAA	3	9	9293	9301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020508	ATAA	2	8	9684	9691	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020508	TTA	2	6	9708	9713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020508	TAA	2	6	9774	9779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020508	ATT	2	6	9793	9798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020508	TTA	2	6	9819	9824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020508	CAA	2	6	9861	9866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_020508	T	6	6	9870	9875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020508	AG	3	6	9925	9930	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020508	A	6	6	12717	12722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020508	T	6	6	12744	12749	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020508	AGG	2	6	12750	12755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020508	GCTTT	2	10	13608	13617	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_020508	T	6	6	13615	13620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020508	AC	3	6	13638	13643	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_020508	T	7	7	13676	13682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020508	ATA	2	6	13686	13691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020508	TTAA	2	8	13705	13712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020508	AAG	2	6	16647	16652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020508	GTTTT	2	10	16656	16665	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020508	CA	3	6	16712	16717	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_020508	CTG	2	6	16733	16738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_020508	A	7	7	16868	16874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020508	A	6	6	18308	18313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020508	AAACAC	2	12	18348	18359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_020508	ATCA	2	8	22757	22764	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_020508	T	6	6	22825	22830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020508	TTG	2	6	22839	22844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020508	TGT	2	6	22864	22869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020508	TTTCTT	2	12	22979	22990	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_020508	TGA	2	6	23009	23014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020508	A	6	6	23029	23034	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020508	A	6	6	23071	23076	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020508	C	6	6	23084	23089	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
77	NC_020508	T	6	6	25254	25259	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020508	CTT	2	6	25266	25271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_020508	GATT	2	8	25279	25286	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020508	ATTA	2	8	25375	25382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020508	A	20	20	25400	25419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020508	GTT	2	6	25481	25486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020508	AATC	2	8	25951	25958	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_020508	T	6	6	25978	25983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020508	GGA	2	6	26014	26019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020508	ATT	3	9	26030	26038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020508	ACA	2	6	26054	26059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_020508	GTT	2	6	26090	26095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020508	ACA	2	6	26194	26199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_020508	ATT	2	6	26216	26221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020508	TC	3	6	29576	29581	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_020508	AAATT	2	10	30288	30297	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020508	T	6	6	30319	30324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020508	T	6	6	30331	30336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020508	AAT	2	6	30347	30352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020508	TCCA	2	8	30504	30511	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_020508	CAT	2	6	30520	30525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_020508	ATA	2	6	30588	30593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020508	TTTAG	2	10	30601	30610	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020508	T	6	6	30669	30674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020508	AGCG	2	8	31156	31163	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_020508	T	6	6	31190	31195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020508	AG	3	6	35999	36004	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020508	TTA	2	6	42055	42060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020508	TTA	2	6	46598	46603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020508	A	6	6	49174	49179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020508	TCAAT	2	10	49279	49288	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_020508	TGA	2	6	50244	50249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020508	AAT	2	6	50301	50306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020508	GTTA	2	8	50327	50334	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020508	ATG	2	6	52148	52153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020508	ACA	2	6	52224	52229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_020508	AGA	2	6	52272	52277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020508	TCA	2	6	52285	52290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_020508	A	6	6	52304	52309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020508	AAC	2	6	52323	52328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_020508	AAT	2	6	52340	52345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020508	G	6	6	52359	52364	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020508	TGCCT	2	10	52418	52427	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
120	NC_020508	TGT	2	6	52540	52545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020508	TGAA	2	8	52567	52574	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020508	TAGA	2	8	52595	52602	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020508	A	6	6	52611	52616	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020508	TTCT	2	8	52639	52646	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_020508	GTG	2	6	52661	52666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020508	TAA	2	6	56632	56637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020508	TTTA	2	8	56660	56667	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020508	TAAA	2	8	56696	56703	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020508	GTT	2	6	60674	60679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020508	T	6	6	60878	60883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020508	TTCA	2	8	60904	60911	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_020508	T	6	6	63956	63961	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020508	TCA	2	6	64056	64061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_020508	T	6	6	64212	64217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_020508	TC	3	6	65334	65339	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_020508	TTGA	2	8	66215	66222	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020508	GTT	2	6	66230	66235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020508	ATT	2	6	66243	66248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020508	AAAT	2	8	66254	66261	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020508	CAA	2	6	66289	66294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_020508	AAG	2	6	66326	66331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020508	CAA	2	6	66343	66348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_020508	T	6	6	66359	66364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020508	TCA	2	6	66424	66429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_020508	TTTA	2	8	71637	71644	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020508	TAA	2	6	71698	71703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020508	GTT	2	6	71720	71725	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020508	ATT	2	6	71745	71750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020508	T	7	7	71759	71765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020508	ATT	2	6	71776	71781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_020508	T	6	6	71809	71814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020508	AAAT	2	8	71848	71855	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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438	NC_020508	TTGA	2	8	184826	184833	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
439	NC_020508	CAT	2	6	185079	185084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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