MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Hydrogenobaculum sp. HO

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020411	TAAAAT	2	12	2841	2852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020411	TAAGTT	2	12	50685	50696	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020411	TATAAA	3	18	51361	51378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020411	TTTGTA	2	12	63443	63454	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020411	AAAAAT	2	12	68525	68536	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020411	AGAAAG	2	12	86491	86502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020411	AGGTAT	2	12	86851	86862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020411	AAGAAA	2	12	88042	88053	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020411	AAAATT	2	12	92138	92149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020411	AAATTT	2	12	120927	120938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020411	GATAAA	2	12	151566	151577	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020411	TAGTAT	2	12	171378	171389	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020411	TTTAGC	2	12	199411	199422	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_020411	TTTAGC	2	12	199566	199577	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_020411	TTATAT	2	12	253282	253293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020411	AAATAT	2	12	254673	254684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020411	TAAGCT	2	12	338473	338484	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_020411	GAGATA	2	12	338810	338821	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020411	AAGAAA	2	12	347148	347159	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020411	TACCAT	2	12	366243	366254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_020411	ATATTT	2	12	385786	385797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020411	ATTGGG	2	12	411183	411194	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020411	ATTTAT	2	12	439495	439506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020411	GCAAAA	2	12	519851	519862	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_020411	TAAATT	2	12	541198	541209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020411	ATTAAT	2	12	589901	589912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020411	ATATAA	2	12	591534	591545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020411	TTTATA	2	12	620112	620123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020411	AATATT	2	12	626095	626106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020411	CCAAAA	2	12	626249	626260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_020411	GTTTAA	2	12	647315	647326	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020411	AAACTT	2	12	742004	742015	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_020411	TGATAT	2	12	742688	742699	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020411	AATTTT	2	12	768231	768242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020411	AGCTTG	2	12	775990	776001	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_020411	ATTTTG	2	12	859170	859181	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020411	GGCTTT	2	12	876234	876245	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_020411	AATTGG	2	12	886285	886296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020411	AATTTA	2	12	886409	886420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020411	TTTTCT	2	12	928148	928159	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_020411	TTTATA	2	12	955689	955700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020411	AACACA	2	12	967943	967954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_020411	TGACAA	2	12	1006874	1006885	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_020411	TATTTT	2	12	1022547	1022558	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020411	TATAAA	2	12	1046538	1046549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020411	ATTTTT	2	12	1070301	1070312	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020411	TAAAAA	2	12	1105094	1105105	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020411	AAAACT	2	12	1125582	1125593	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_020411	TTCTTT	2	12	1205501	1205512	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_020411	GTTTAA	2	12	1224921	1224932	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020411	GCTTTG	2	12	1225174	1225185	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_020411	TAAATA	2	12	1227022	1227033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020411	AGCTTG	2	12	1244248	1244259	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_020411	TGAAAA	2	12	1304814	1304825	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020411	GTTTAT	2	12	1305304	1305315	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020411	TGGTGA	2	12	1371294	1371305	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020411	TAAAAA	2	12	1371613	1371624	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020411	AATTGG	2	12	1459866	1459877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020411	TCTATG	2	12	1475737	1475748	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_020411	TCTCTT	2	12	1476255	1476266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_020411	TAATAC	2	12	1476414	1476425	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_020411	TTATGT	2	12	1492629	1492640	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020411	TCTTTT	2	12	1520265	1520276	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.