MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Hydrogenobaculum sp. HO

Total Repeats: 302

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020411	ATTA	2	8	10856	10863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020411	CAAA	2	8	10926	10933	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_020411	ATTT	2	8	11560	11567	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020411	TGTT	2	8	11668	11675	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020411	TTTA	2	8	20047	20054	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020411	ATTT	2	8	20081	20088	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020411	TAAA	2	8	23300	23307	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020411	TTTA	2	8	30637	30644	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020411	AAAT	2	8	40019	40026	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020411	CAAA	2	8	50532	50539	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_020411	AAAC	2	8	57798	57805	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_020411	TGGT	2	8	57907	57914	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020411	GACG	2	8	58041	58048	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_020411	GTAA	2	8	62992	62999	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020411	ATGT	2	8	63596	63603	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020411	AGCC	2	8	63890	63897	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_020411	ATCT	2	8	68552	68559	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_020411	CTCC	3	12	75681	75692	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
19	NC_020411	AACT	2	8	78393	78400	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_020411	AAGA	2	8	87411	87418	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020411	ACTA	2	8	87811	87818	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_020411	GTAT	2	8	111789	111796	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020411	TAAG	2	8	112110	112117	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020411	CTTT	2	8	115766	115773	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_020411	AAGA	2	8	115780	115787	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020411	GATA	2	8	118195	118202	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020411	GAAA	2	8	125451	125458	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020411	CTCC	2	8	130569	130576	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
29	NC_020411	GTTT	2	8	180660	180667	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020411	TTTA	2	8	180706	180713	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020411	TATT	2	8	184209	184216	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020411	ATTA	2	8	197565	197572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020411	AAAT	2	8	197803	197810	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020411	ACTA	2	8	198916	198923	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_020411	CTAT	2	8	199402	199409	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_020411	GCTT	2	8	233644	233651	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_020411	CGTT	2	8	256578	256585	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_020411	AAAC	2	8	262807	262814	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_020411	TAGT	2	8	262864	262871	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020411	TAAC	2	8	273931	273938	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_020411	CTTA	2	8	278495	278502	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_020411	AAGC	2	8	278548	278555	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_020411	GATT	2	8	278644	278651	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020411	TAAA	2	8	288976	288983	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020411	AAAC	2	8	295111	295118	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_020411	TAAT	2	8	309837	309844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020411	ATTT	2	8	338912	338919	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020411	TTTG	2	8	340654	340661	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020411	ACGC	2	8	340746	340753	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_020411	ATTT	2	8	341174	341181	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020411	CTTT	2	8	341319	341326	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_020411	TCTT	2	8	342125	342132	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_020411	TAAC	2	8	342155	342162	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_020411	TTCT	2	8	342260	342267	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_020411	AGTT	2	8	343709	343716	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020411	ACAT	2	8	346406	346413	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_020411	AATT	2	8	346767	346774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020411	GTAA	2	8	347488	347495	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020411	ACAA	2	8	363843	363850	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_020411	TTTA	2	8	364053	364060	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020411	TTTA	2	8	364217	364224	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020411	TTCA	2	8	364399	364406	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_020411	TAAA	2	8	364781	364788	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020411	TAAA	2	8	380566	380573	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020411	TCTT	2	8	380737	380744	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_020411	CTAA	2	8	382347	382354	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_020411	AAGG	2	8	384314	384321	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020411	AACT	2	8	385853	385860	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_020411	ATTT	2	8	386263	386270	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020411	ATTT	2	8	394238	394245	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020411	GTAT	2	8	394253	394260	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020411	GGTT	2	8	394397	394404	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020411	TTAA	2	8	410894	410901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020411	ACCT	2	8	410909	410916	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_020411	TTTG	2	8	411757	411764	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020411	ATCT	2	8	412430	412437	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_020411	TAAT	2	8	415182	415189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020411	AAAG	2	8	416465	416472	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020411	GAGC	2	8	418608	418615	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_020411	CGCT	2	8	418674	418681	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_020411	CTTC	2	8	427423	427430	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_020411	GGTG	2	8	444653	444660	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020411	TATC	2	8	460384	460391	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_020411	TATC	2	8	460401	460408	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_020411	ATAC	2	8	481482	481489	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_020411	TTCT	2	8	481494	481501	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_020411	GAAA	2	8	481511	481518	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020411	CAAA	2	8	492693	492700	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_020411	TATT	2	8	500583	500590	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020411	GTAG	2	8	507122	507129	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020411	CATA	2	8	507220	507227	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_020411	CCCA	2	8	513789	513796	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
93	NC_020411	GTAG	2	8	513857	513864	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020411	AATA	2	8	524327	524334	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020411	TAAA	2	8	524374	524381	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020411	TTAA	2	8	536312	536319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020411	AAGA	2	8	541187	541194	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020411	TCCA	2	8	543645	543652	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_020411	TTAT	2	8	548351	548358	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020411	TGTC	2	8	588870	588877	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_020411	ATAA	2	8	589792	589799	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020411	AAAT	2	8	590007	590014	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020411	TTAT	2	8	590016	590023	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020411	GAAA	2	8	590337	590344	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020411	TAAA	2	8	590480	590487	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020411	ATTT	2	8	590658	590665	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020411	GTAT	2	8	590962	590969	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020411	AATT	2	8	591232	591239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020411	ATAA	2	8	591470	591477	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020411	AAAT	2	8	592381	592388	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020411	GACT	2	8	598985	598992	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_020411	TATT	2	8	620074	620081	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020411	TTAC	2	8	626228	626235	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_020411	TTTA	2	8	634218	634225	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020411	CTAT	2	8	647033	647040	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_020411	CATA	2	8	647466	647473	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_020411	ATCT	2	8	647682	647689	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_020411	TTTA	2	8	654133	654140	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020411	AAAG	2	8	699155	699162	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020411	TTTA	2	8	709968	709975	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020411	CTAA	2	8	713325	713332	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_020411	TTAT	2	8	727749	727756	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020411	TAGC	2	8	742048	742055	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_020411	ATTT	2	8	742210	742217	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020411	GTTT	2	8	742427	742434	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020411	TTTA	2	8	742568	742575	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020411	GTAA	2	8	752715	752722	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020411	TTTA	2	8	752768	752775	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020411	TTTA	2	8	752806	752813	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020411	TAAA	2	8	772311	772318	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020411	TGTC	2	8	773036	773043	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_020411	CGGC	2	8	773486	773493	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_020411	ATCT	2	8	774092	774099	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_020411	ACTG	2	8	774422	774429	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_020411	TCGC	2	8	775193	775200	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_020411	TCCT	2	8	776085	776092	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_020411	CATC	2	8	776448	776455	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_020411	GAGT	2	8	777191	777198	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020411	AAAG	2	8	784246	784253	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020411	AGTT	2	8	801389	801396	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020411	TAAA	2	8	808018	808025	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020411	CACC	2	8	808130	808137	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
143	NC_020411	ATGT	2	8	808156	808163	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020411	GGGT	2	8	808177	808184	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020411	TCTT	2	8	808199	808206	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_020411	AAAT	2	8	831876	831883	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_020411	AATA	2	8	831962	831969	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020411	ATAA	2	8	847315	847322	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020411	GGAG	2	8	852534	852541	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
150	NC_020411	ACAA	2	8	868116	868123	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_020411	TTAC	2	8	868636	868643	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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294	NC_020411	CCAG	2	8	1516339	1516346	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
295	NC_020411	TAAT	2	8	1516475	1516482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
296	NC_020411	AATA	2	8	1519535	1519542	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
297	NC_020411	TCTA	2	8	1519908	1519915	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
298	NC_020411	CAAA	2	8	1520026	1520033	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
299	NC_020411	ATTT	2	8	1520057	1520064	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
300	NC_020411	CTTT	2	8	1520334	1520341	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
301	NC_020411	AGCT	2	8	1521144	1521151	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
302	NC_020411	TTTG	2	8	1521196	1521203	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.