MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Halobacteroides halobius DSM 5150

Total Repeats: 158

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019978	AAGCGA	2	12	17891	17902	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_019978	CTGGAG	2	12	19770	19781	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_019978	AATATT	2	12	22764	22775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019978	TAATTA	2	12	38855	38866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_019978	AATTTA	2	12	47063	47074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019978	AACCAA	2	12	79669	79680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_019978	ATTTTA	2	12	108299	108310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_019978	TATAAG	2	12	118982	118993	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019978	GATCAT	2	12	127571	127582	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_019978	AAATAA	2	12	153627	153638	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019978	AAGCGA	2	12	156207	156218	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_019978	CTGGAG	2	12	158086	158097	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_019978	ATTTTT	2	12	158954	158965	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019978	TTTTAT	2	12	241955	241966	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019978	ATTATA	2	12	295343	295354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019978	TAAATT	2	12	295608	295619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019978	TCAAAT	2	12	299078	299089	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_019978	TTCCAG	2	12	323255	323266	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_019978	AATATT	2	12	325868	325879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019978	TAAAGC	2	12	330014	330025	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_019978	ATCCTA	2	12	338007	338018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_019978	AGGAAA	2	12	398113	398124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_019978	TTGAAT	2	12	435824	435835	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019978	TAGAAA	2	12	435936	435947	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019978	AAATTA	2	12	460100	460111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019978	AACCAA	2	12	465826	465837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_019978	GATATA	2	12	487083	487094	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019978	GGGTAT	2	12	488914	488925	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019978	TCAATT	2	12	492748	492759	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_019978	TTTTTA	2	12	507632	507643	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019978	TATAAG	2	12	507669	507680	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019978	ATTATA	2	12	566455	566466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_019978	ATGATA	2	12	597398	597409	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019978	ATTTTA	2	12	605410	605421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019978	AGGTGA	2	12	605454	605465	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019978	ATTATA	2	12	643064	643075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_019978	GTTTTA	2	12	704280	704291	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019978	TTTGGT	2	12	719823	719834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019978	AATTAA	2	12	730571	730582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019978	TATAAT	2	12	763652	763663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019978	TTTTCA	2	12	764679	764690	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_019978	ACTAGT	2	12	765197	765208	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_019978	AATGAT	2	12	775607	775618	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019978	GTTATT	2	12	775692	775703	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019978	TTGATT	2	12	788307	788318	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019978	ATTTTT	2	12	806969	806980	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019978	ATTAAA	2	12	810936	810947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019978	GATATA	2	12	811328	811339	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019978	ATAAAA	2	12	846754	846765	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019978	AAGCGA	2	12	884262	884273	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_019978	CTGGAG	2	12	886141	886152	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_019978	AAATTA	2	12	886918	886929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_019978	AAATTT	2	12	932497	932508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_019978	GATCAT	2	12	937032	937043	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_019978	TAAAGC	2	12	948462	948473	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_019978	TAAAAG	2	12	982282	982293	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_019978	TTAGTA	2	12	988721	988732	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_019978	AAATGA	2	12	992682	992693	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_019978	GTAAAA	2	12	998222	998233	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_019978	AAATGA	2	12	998401	998412	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019978	TAAAGA	2	12	1000203	1000214	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019978	AGTAAG	2	12	1047800	1047811	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019978	TTAGTT	2	12	1058440	1058451	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_019978	TGTAAA	2	12	1060265	1060276	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_019978	TATAAT	2	12	1109618	1109629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019978	AATTTA	2	12	1109799	1109810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_019978	GTGGAG	2	12	1127092	1127103	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019978	AATATT	2	12	1155972	1155983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019978	TTTTTC	2	12	1174428	1174439	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_019978	GTATAA	2	12	1190734	1190745	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019978	TTTAGA	2	12	1195608	1195619	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_019978	AATTAG	2	12	1222184	1222195	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_019978	AGTAAT	2	12	1222227	1222238	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_019978	GTGTGG	2	12	1236914	1236925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_019978	AATTAA	2	12	1255434	1255445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_019978	ACAAGG	2	12	1261850	1261861	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_019978	TTTAGC	2	12	1287511	1287522	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_019978	TATTTT	2	12	1322094	1322105	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_019978	ATTTTT	2	12	1383767	1383778	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019978	AATTAA	2	12	1398652	1398663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_019978	CAAAAA	2	12	1406540	1406551	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_019978	ATATTT	2	12	1414300	1414311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_019978	TATAAT	2	12	1419185	1419196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_019978	TTAGTT	2	12	1452922	1452933	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_019978	TAATTT	2	12	1459617	1459628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_019978	TCATTT	2	12	1472962	1472973	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_019978	TCATTT	2	12	1479279	1479290	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_019978	TCATTT	2	12	1481240	1481251	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_019978	CTATCA	2	12	1483511	1483522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_019978	TTTTAA	2	12	1483806	1483817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_019978	ACTAAT	2	12	1500113	1500124	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_019978	ATTTTT	2	12	1526692	1526703	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_019978	TTTTCA	2	12	1530366	1530377	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_019978	TTAATT	2	12	1534759	1534770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019978	ATCTAA	2	12	1535089	1535100	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_019978	CTACTC	2	12	1535157	1535168	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_019978	TCAAAA	2	12	1575790	1575801	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_019978	ATTTTT	2	12	1603020	1603031	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019978	TTATTT	2	12	1612189	1612200	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_019978	ATTTTA	2	12	1668651	1668662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_019978	TTTAAA	2	12	1675607	1675618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_019978	TAAATT	2	12	1699221	1699232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_019978	TCTAGT	2	12	1714654	1714665	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_019978	AAAATC	2	12	1748596	1748607	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_019978	TTAAAA	2	12	1779370	1779381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019978	TTAAAC	2	12	1786647	1786658	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_019978	AGATGA	2	12	1811680	1811691	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019978	TTATAA	2	12	1812673	1812684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019978	GCTCCA	2	12	1827208	1827219	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
110	NC_019978	TCGCTT	2	12	1829088	1829099	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_019978	TACTTT	2	12	1857629	1857640	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_019978	TAAAAT	2	12	1888232	1888243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019978	ATAAAA	2	12	1891428	1891439	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_019978	ACCTAT	2	12	1949269	1949280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_019978	TTAATT	2	12	1961169	1961180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_019978	ATAAAA	2	12	1962162	1962173	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_019978	TAATTA	2	12	1968135	1968146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019978	TAATCA	2	12	1973026	1973037	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_019978	CTTTTT	2	12	1975736	1975747	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_019978	TAAAAA	2	12	1977310	1977321	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_019978	AAATTA	2	12	2003631	2003642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019978	AATAAA	2	12	2021647	2021658	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019978	TTAAAA	2	12	2051425	2051436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019978	GCAAAT	2	12	2058937	2058948	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_019978	TAAAAA	2	12	2069231	2069242	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_019978	ATATAA	2	12	2079249	2079260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_019978	GCTCCA	2	12	2080160	2080171	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
128	NC_019978	TCGCTT	2	12	2082040	2082051	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_019978	TAGTCT	2	12	2091584	2091595	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.